PHOX2B - PHOX2B

PHOX2B
Identifikátory
Aliasy	PHOX2B, NBLST2, NBPhox, PMX2B, spárované jako homeobox 2b, CCHS
Externí ID	OMIM: 603851 MGI: 1100882 HomoloGene: 68371 Genové karty: PHOX2B
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 4 (lidský)
Konec	41,748,725 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	67,099,301 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • nukleární chromatin; • nukleoplazma;
Biologický proces	• negativní regulace buněčné proliferace; • diferenciace gliových buněk; • vývoj dýchacího systému; • pozitivní regulace G2 / M přechodu mitotického buněčného cyklu; • medulární vývoj retikulární formace; • transkripce, chráněná DNA; • vývoj parasympatického nervového systému; • regulace dýchací plynné výměny procesem neurologického systému; • vývoj noradrenergních neuronů; • buněčná odpověď na stimul BMP; • vývoj mnohobuněčných organismů; • migrace buněk nervového hřebenu podílející se na vývoji autonomního nervového systému; • tangenciální migrace buněk zadního mozku; • vývoj sympatického nervového systému; • diferenciace buněk kosterního svalstva; • vývoj enterálního nervového systému; • diferenciace neuronů retrotrapezoidního jádra; • regulace genové exprese; • pozitivní regulace neuronové diferenciace; • vývoj mozkového kmene; • vývoj vnitřního ucha; • negativní regulace zástavy buněčného cyklu; • vývoj buněk; • regulace transkripce, DNA-šablony; • vývoj sympatického ganglia; • negativní regulace neuronové diferenciace; • buněčná diferenciace v zadním mozku; • vývoj autonomního nervového systému; • vývoj eferentního axonu v laterálním liniovém nervu; • neuronová diferenciace; • migrace neuronů; • diferenciace dopaminergních neuronů; • diferenciace noradrenergních neuronů; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace termogeneze vyvolané chladem; • vývoj nervového systému;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8929
	18935
	ENSG00000109132
	ENSMUSG00000012520
	Q99453
	O35690
	NM_003924
	NM_008888
	NP_003915
	NP_032914
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Spárovaný homeobox 2b (PHOX2B), také známý jako neuroblastom Phox (NBPhox), je a protein že u lidí je kódován PHOX2B gen umístěný na chromozom 4.^[5]

Kóduje a homeodomain transkripční faktor. Vyjadřuje se výhradně v nervovém systému, ve většině neuronů, které řídí vnitřnosti (kardiovaskulární, zažívací a dýchací systém). Je také nutné pro jejich rozlišení.

Imunohistochemie

Transkripční faktor PHOX2B, který je nezbytný pro diferenciaci a přežití sympatických neuronů a chromafinových buněk, je vysoce specifický pro periferní autonomní nervový systém. Neuroblasty jsou odvozeny od sympatoadrenální linie buňky neurální lišty a proto vyžadují a konstitutivně vyjadřují PHOX2B. PHOX2B imunohistochemické barvení, jako marker derivace neurální lišty, se ukázal jako citlivý a specifický pro nediferencované neuroblastom, umožňující identifikaci, kde jiné markery nedokážou rozpoznat neuroblastom mezi různými různými malými kulatými nádory z modrých buněk v dětství.^[6]^[7]^[8]^[9]

Diagnostická užitečnost barvení PHOX2B sahá až do pozdějších stadií diferenciace. Jeho síla a specificita dokáže detekovat malá ložiska neuroblastických nádorů metastazujících do kostní dřeně, což je identifikace kritická pro stanovení stadia onemocnění. Barvení PHOX2B také překonává časté překážky detekce neuroblastomu ve vzorcích po ošetření, které často vykazují hustou fibrózu, výrazné zánětlivé infiltráty a / nebo difúzní kalcifikaci.^[10]

Patologie

Mutace u člověka PHOX2B způsobit vzácné onemocnění vnitřního nervového systému (dysautonomie): vrozený syndrom centrální hypoventilace (spojené se zástavou dýchání během spánku a občas s bdělostí), Hirschsprungova choroba (částečná ageneze střevní nervový systém ), ROHHAD a nádory sympatické ganglia U většiny lidí obsahuje Exon 3 genu sekvenci 20 polyalaninových opakování. Zvýšení počtu opakování je spojeno s vrozeným syndromem centrální hypoventilace. Dále mohou existovat další patogenní mutace dále podél genu.

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000109132 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000012520 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: spárovaný homeobox 2b“.
^ Bielle, Franck; Fréneaux, Paul; Jeanne-Pasquier, Corinne; Maran-Gonzalez, Aurélie; Rousseau, Audrey; Lamant, Laurence; Paříž, Régine; Pierron, Gaëlle; Nicolas, André Victor; Sastre-Garau, Xavier; Delattre, Olivier; Bourdeaut, Franck; Peuchmaur, Michel (2012). "Immunolabeling PHOX2B". American Journal of Surgical Pathology. 36 (8): 1141–1149. doi:10.1097 / PAS.0b013e31825a6895. PMID 22790854. S2CID 25924210.
^ Hata, Jessica L .; Correa, Hernan; Krishnan, Chandra; Esbenshade, Adam J .; Black, Jennifer O .; Chung, Dai H .; Mobley, Bret C. (2015). „Diagnostická využitelnost PHOX2B u primárního a léčeného neuroblastomu a u neuroblastomu metastatického do kostní dřeně“. Archivy patologie a laboratorní medicíny. 139 (4): 543–546. doi:10.5858 / arpa.2014-0255-OA. PMID 25822764.
^ Hung, Yin P .; Lee, John P .; Bellizzi, Andrew M .; Hornick, Jason L. (2017). „PHOX2B spolehlivě rozlišuje neuroblastom mezi malými kulatými nádory z modrých buněk“. Histopatologie. 71 (5): 786–794. doi:10.1111 / his.13288. PMID 28640941. S2CID 19123236.
^ Warren, Mikako; Matsuno, Ryosuke; Tran, Henry; Shimada, Hiroyuki (2018). "Využití imunohistochemického barvení Phox2b u nádorů neurálního lišty a nádorů neurálního lišty u pediatrických pacientů". Histopatologie. 72 (4): 685–696. doi:10.1111 / his.13412. PMID 28986989. S2CID 3302863.
^ Hata a kol. (2015).

Další čtení

Glas J, Seiderer J, Pasciuto G a kol. (2009). „rs224136 na chromozomu 10q21.1 a varianty v PHOX2B, NCF4 a FAM92B nejsou v německé populaci významnými genetickými rizikovými faktory pro citlivost na Crohnovu chorobu“. Dopoledne. J. Gastroenterol. 104 (3): 665–72. doi:10.1038 / ajg.2008.65. PMID 19262523. S2CID 7144509.
Gaultier C, Trang H, Dauger S, Gallego J (2005). „Pediatrické poruchy s autonomní dysfunkcí: jakou roli hraje PHOX2B?“. Pediatr. Res. 58 (1): 1–6. doi:10.1203 / 01.PDR.0000166755.29277.C4. PMID 15901893.
Liu CP, Li XG, Lou JT a kol. (2009). "Analýza asociace genu PHOX2B s Hirschsprungovou chorobou v čínské populaci Han jihovýchodní Číny". J. Pediatr. Surg. 44 (9): 1805–11. doi:10.1016 / j.jpedsurg.2008.12.009. PMID 19735829.
Repetto GM, Corrales RJ, Abara SG a kol. (2009). „Vrozený syndrom centrální hypoventilace s pozdějším nástupem v důsledku heterozygotní 24-polyalaninové repetiční expanzní mutace v genu PHOX2B“. Acta Paediatr. 98 (1): 192–5. doi:10.1111 / j.1651-2227.2008.01039.x. PMID 18798833. S2CID 4979994.
Fan Y, Huang J, Kieran N, Zhu MY (2009). "Účinky transkripčních faktorů Phox2 na expresi norepinefrinového transportéru a dopamin beta-hydroxylázy v SK-N-BE (2) C buňkách". J. Neurochem. 110 (5): 1502–13. doi:10.1111 / j.1471-4159.2009.06260.x. PMID 19573018.
McGaughey DM, Stine ZE, Huynh JL a kol. (2009). „Asymetrická distribuce nekonzervovaných regulačních sekvencí na PHOX2B se odráží v lokusech ENCODE a osvětluje možný trend v celém genomu.“. BMC Genomics. 10: 8. doi:10.1186/1471-2164-10-8. PMC 2630312. PMID 19128492.
Jennings LJ, Yu M, Zhou L a kol. (2010). „Srovnání testovacích metod PHOX2B v diagnostice vrozeného syndromu centrální hypoventilace a nositelů mozaiky“. Diagn. Mol. Pathol. 19 (4): 224–31. doi:10.1097 / PDM.0b013e3181eb92ff. PMID 21051998. S2CID 10071866.
Tu E, Bagnall RD, Duflou J a kol. (2010). „Postmortální patologické a genetické studie v případech„ syndromu mrtvého lůžka “u diabetes mellitus 1. typu. Hučení. Pathol. 41 (3): 392–400. doi:10.1016 / j.humpath.2009.08.020. PMID 20004937.
Janoueix-Lerosey I, Schleiermacher G, Delattre O (2010). "Molekulární patogeneze periferních neuroblastických nádorů". Onkogen. 29 (11): 1566–79. doi:10.1038 / dne 2009.518. PMID 20101209.
Longo L, Borghini S, Schena F a kol. (2008). „Geny PHOX2A a PHOX2B jsou vysoce koexprimovány v lidském neuroblastomu“. Int. J. Oncol. 33 (5): 985–91. doi:10,3892 / ijo_00000086. PMID 18949361.
Hammel M, Klein M, Trips T a kol. (2009). „Vrozený syndrom centrální hypoventilace způsobený defekty genu PHOX2b: dědičnost od asymptomatických rodičů“. Klin Padiatr. 221 (5): 286–9. doi:10.1055 / s-0029-1220941. PMID 19707990.
Arai H, Otagiri T, Sasaki A a kol. (2010). „Polyalaninová expanze PHOX2B u syndromu vrozené centrální hypoventilace: rs17884724: A> C je spojena s expanzí 7-alaninu“. J. Hum. Genet. 55 (1): 4–7. doi:10.1038 / jhg.2009.109. PMID 19881470.
Lee P, Su YN, Yu CJ a kol. (2009). „Vrozený syndrom centrální hypoventilace potvrzený mutací PHOX2B v čínské rodině: prezentace od novorozence po dospělost“. Hruď. 135 (2): 537–44. doi:10,1378 / hrudník.08-1664. PMID 19201717.
Wu HT, Su YN, Hung CC a kol. (2009). „Interakce mezi PHOX2B a CREBBP zprostředkovává synergickou aktivaci: mechanické důsledky mutantů PHOX2B“. Hučení. Mutat. 30 (4): 655–60. doi:10.1002 / humu.20929. PMID 19191321. S2CID 22257861.
Trochet D, Mathieu Y, Pontual L a kol. (2009). „In vitro studie nepoly alaninových mutací PHOX2B argumentují proti mechanismu ztráty funkce pro vrozenou centrální hypoventilaci“. Hučení. Mutat. 30 (2): E421-31. doi:10.1002 / humu.20923. PMID 19058226. S2CID 10167662.
Dubreuil V, Thoby-Brisson M, Rallu M a kol. (2009). „Vadná respirační rytmogeneze a ztráta centrální chemosenzitivity u mutantů Phox2b zaměřených na neurony jádra retrotrapezoidů“. J. Neurosci. 29 (47): 14836–46. doi:10.1523 / JNEUROSCI.2623-09.2009. PMC 6665996. PMID 19940179.
Serra A, Häberle B, König IR a kol. (2008). "Vzácný výskyt mutací PHOX2b ve sporadických neuroblastomech". J. Pediatr. Hematol. Oncol. 30 (10): 728–32. doi:10.1097 / MPH.0b013e3181772141. PMID 19011468. S2CID 32426671.
Rudzinski E, Kapur RP (2010). "Imunolokalizace PHOX2B kandidátského lidského retrotrapezoidního jádra". Pediatr. Dev. Pathol. 13 (4): 291–9. doi:10.2350 / 09-07-0682-OA.1. PMID 19888871. S2CID 34088649.
Larkin EK, Patel SR, Goodloe RJ a kol. (2010). „Kandidátská genová studie obstrukční spánkové apnoe u evropských a afroameričanů“. Dopoledne. J. Respir. Krit. Care Med. 182 (7): 947–53. doi:10,1164 / rccm.201002-0192OC. PMC 2970865. PMID 20538960.
Lee JJ, Essers JB, Kugathasan S, et al. (2010). „Sdružení poruchy lineárního růstu u dětské Crohnovy choroby a známého lokusu výšky: pilotní studie“. Ann. Hučení. Genet. 74 (6): 489–97. doi:10.1111 / j.1469-1809.2010.00606.x. PMC 2955808. PMID 20846217.

externí odkazy

GeneReviews / NCBI / NIH / UW záznam o syndromu vrozené centrální hypoventilace
Protein Phox2b + v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek o gen na lidský chromozom 4 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000109132 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000012520 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: spárovaný homeobox 2b“.

[6] Bielle, Franck; Fréneaux, Paul; Jeanne-Pasquier, Corinne; Maran-Gonzalez, Aurélie; Rousseau, Audrey; Lamant, Laurence; Paříž, Régine; Pierron, Gaëlle; Nicolas, André Victor; Sastre-Garau, Xavier; Delattre, Olivier; Bourdeaut, Franck; Peuchmaur, Michel (2012). "Immunolabeling PHOX2B". American Journal of Surgical Pathology. 36 (8): 1141–1149. doi:10.1097 / PAS.0b013e31825a6895. PMID 22790854. S2CID 25924210.

[7] Hata, Jessica L .; Correa, Hernan; Krishnan, Chandra; Esbenshade, Adam J .; Black, Jennifer O .; Chung, Dai H .; Mobley, Bret C. (2015). „Diagnostická využitelnost PHOX2B u primárního a léčeného neuroblastomu a u neuroblastomu metastatického do kostní dřeně“. Archivy patologie a laboratorní medicíny. 139 (4): 543–546. doi:10.5858 / arpa.2014-0255-OA. PMID 25822764.

[8] Hung, Yin P .; Lee, John P .; Bellizzi, Andrew M .; Hornick, Jason L. (2017). „PHOX2B spolehlivě rozlišuje neuroblastom mezi malými kulatými nádory z modrých buněk“. Histopatologie. 71 (5): 786–794. doi:10.1111 / his.13288. PMID 28640941. S2CID 19123236.

[9] Warren, Mikako; Matsuno, Ryosuke; Tran, Henry; Shimada, Hiroyuki (2018). "Využití imunohistochemického barvení Phox2b u nádorů neurálního lišty a nádorů neurálního lišty u pediatrických pacientů". Histopatologie. 72 (4): 685–696. doi:10.1111 / his.13412. PMID 28986989. S2CID 3302863.

[10] Hata a kol. (2015).

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]