GTF2H1 - GTF2H1

GTF2H1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1PFJ, 2DII, 2RNR, 2RUK, 2RVB
Identifikátory
Aliasy	GTF2H1BTF2, P62, TFB1, TFIIH, obecná transkripční faktor IIH podjednotka 1
Externí ID	OMIM: 189972 MGI: 1277216 HomoloGene: 3885 Genové karty: GTF2H1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	18,367,045 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	46,823,800 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita proteinkinázy; • Aktivita ATPázy závislá na DNA; • vazba chromatinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Aktivita kinázy karboxyterminální domény RNA polymerázy II;
Buněčná složka	• nukleoplazma; • holo komplex TFIIH; • buněčné jádro; • GO: 0000441 jádrový komplex TFIIH;
Biologický proces	• ukončení transkripce RNA polymerázy I.; • regulace aktivity cyklin-dependentního proteinu serin / threonin kináza; • regulace transkripce, DNA-šablony; • iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy I.; • prodloužení transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • Uzávěr mRNA 7-methylguanosinu; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • oprava nukleotidů excizí globálního genomu; • oprava nukleotidů excizí spojená s transkripcí; • iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • oprava nukleotidovou excizí, řez DNA; • Oprava DNA; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • oprava nukleotidovou excizí, stabilizace preincision komplexu; • oprava nukleotidovou excizí; • oprava nukleotidovou excizí, řez DNA, 5'-k lézi; • oprava nukleotidovou excizí, preincision komplexní sestava; • transkripce z promotoru RNA polymerázy I.; • fosforylace C-terminální domény RNA polymerázy II; • oprava nukleotidovou excizí, odvíjení duplexu DNA; • oprava nukleotidovou excizí, řez DNA, 3'-k lézi; • prodloužení transkripce z promotoru RNA polymerázy I.;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	2965
	14884
	ENSG00000110768; ENSG00000288114
	ENSMUSG00000006599
	P32780
	Q9DBA9
	NM_001142307; NM_005316
	NM_001291075; NM_008186; NM_001360075; NM_001360076
	NP_001135779; NP_005307
	NP_001278004; NP_032212; NP_001347004; NP_001347005
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Obecná transkripční faktor IIH podjednotka 1 je protein že u lidí je kódován GTF2H1 gen.^[5]^[6]^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že GTF2H1 komunikovat s:

Cyklin-dependentní kináza 7,^[8]^[9]^[10]
E2F1,^[11]
ERCC2,^[8]^[12]
Estrogenový receptor alfa,^[13]
TCEA1,^[14]^[15] a
XPB.^[8]^[16]^[17]

Viz také

Transkripční faktor II H

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000288114 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000110768, ENSG00000288114 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000006599 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Fischer L, Gerard M, Chalut C, Lutz Y, Humbert S, Kanno M, Chambon P, Egly JM (říjen 1992). "Klonování 62kilodaltonové složky základního transkripčního faktoru BTF2". Věda. 257 (5075): 1392–5. Bibcode:1992Sci ... 257.1392F. doi:10.1126 / science.1529339. PMID 1529339.
^ Heng HH, Xiao H, Shi XM, Greenblatt J, Tsui LC (květen 1994). „Geny kódující obecné iniciační faktory pro transkripci RNA polymerázy II jsou rozptýleny v lidském genomu“. Hučení. Mol. Genet. 3 (1): 61–4. doi:10,1093 / hmg / 3,1,61. PMID 8162052.
^ „Entrez Gene: GTF2H1 obecný transkripční faktor IIH, polypeptid 1, 62 kDa“.
^ ^A ^b ^C Rossignol M, Kolb-Cheynel I, Egly JM (duben 1997). "Substrátová specificita cdk-aktivující kinázy (CAK) je změněna po asociaci s TFIIH". EMBO J.. 16 (7): 1628–37. doi:10.1093 / emboj / 16.7.1628. PMC 1169767. PMID 9130708.
^ Shiekhattar R, Mermelstein F, Fisher RP, Drapkin R, Dynlacht B, Wessling HC, Morgan DO, Reinberg D (březen 1995). „Komplex kinázy aktivující Cdk je součástí lidského transkripčního faktoru TFIIH“. Příroda. 374 (6519): 283–7. Bibcode:1995 Natur.374..283S. doi:10.1038 / 374283a0. PMID 7533895. S2CID 4282418.
^ Yee A, Nichols MA, Wu L, Hall FL, Kobayashi R, Xiong Y (prosinec 1995). "Molekulární klonování CDK7-asociované lidské MAT1, cyklin-dependentní kinázové aktivační kinázy (CAK), montážní faktor". Cancer Res. 55 (24): 6058–62. PMID 8521393.
^ Vandel L, Kouzarides T (srpen 1999). „Zbytky fosforylované TFIIH jsou potřebné pro degradaci E2F-1 během S-fáze“. EMBO J.. 18 (15): 4280–91. doi:10.1093 / emboj / 18.15.4280. PMC 1171504. PMID 10428966.
^ Drapkin R, Reardon JT, Ansari A, Huang JC, Zawel L, Ahn K, Sancar A, Reinberg D (duben 1994). „Dvojí role TFIIH při opravě excize DNA a při transkripci RNA polymerázou II“. Příroda. 368 (6473): 769–72. Bibcode:1994 Natur.368..769D. doi:10.1038 / 368769a0. PMID 8152490. S2CID 4363484.
^ Chen D, Riedl T, Washbrook E, Pace PE, Coombes RC, Egly JM, Ali S (červenec 2000). „Aktivace estrogenového receptoru alfa fosforylací S118 zahrnuje interakci závislou na ligandu s TFIIH a účast CDK7“. Mol. Buňka. 6 (1): 127–37. doi:10.1016 / s1097-2765 (00) 00014-9. PMID 10949034.
^ Archambault J, Pan G, Dahmus GK, Cartier M, Marshall N, Zhang S, Dahmus ME, Greenblatt J (říjen 1998). „FCP1, podjednotka interagující s RAP74 lidské proteinové fosfatázy, která defosforyluje karboxylterminální doménu RNA polymerázy IIO“. J. Biol. Chem. 273 (42): 27593–601. doi:10.1074 / jbc.273.42.27593. PMID 9765293.
^ Pan G, Aso T, Greenblatt J (září 1997). „Interakce elongačních faktorů TFIIS a elonginu A s holoenzymem lidské RNA polymerázy II schopným iniciace specifické pro promotor a reagující na transkripční aktivátory“. J. Biol. Chem. 272 (39): 24563–71. doi:10.1074 / jbc.272.39.24563. PMID 9305922.
^ Giglia-Mari G, Coin F, Ranish JA, Hoogstraten D, Theil A, Wijgers N, Jaspers NG, Raams A, Argentini M, van der Spek PJ, Botta E, Stefanini M, Egly JM, Aebersold R, Hoeijmakers JH, Vermeulen W (červenec 2004). „Nová, desátá podjednotka TFIIH je zodpovědná za trichothiodystrofickou skupinu se syndromem opravy DNA“. Nat. Genet. 36 (7): 714–9. doi:10.1038 / ng1387. PMID 15220921.
^ Marinoni JC, Roy R, Vermeulen W, Miniou P, Lutz Y, Weeda G, Seroz T, Gomez DM, Hoeijmakers JH, Egly JM (březen 1997). „Klonování a charakterizace p52, páté podjednotky jádra transkripčního / DNA opravného faktoru TFIIH“. EMBO J.. 16 (5): 1093–102. doi:10.1093 / emboj / 16.5.1093. PMC 1169708. PMID 9118947.

Další čtení

Jeang KT (1998). "Tat, kináza asociovaná s Tat a transkripce". J. Biomed. Sci. 5 (1): 24–7. doi:10.1007 / BF02253352. PMID 9570510.
Yankulov K, Bentley D (1998). "Kontrola transkripce: Tat kofaktory a transkripční prodloužení". Curr. Biol. 8 (13): R447-9. doi:10.1016 / S0960-9822 (98) 70289-1. PMID 9651670. S2CID 15480646.
Shiekhattar R, Mermelstein F, Fisher RP, Drapkin R, Dynlacht B, Wessling HC, Morgan DO, Reinberg D (1995). „Komplex kinázy aktivující Cdk je součástí lidského transkripčního faktoru TFIIH“. Příroda. 374 (6519): 283–7. Bibcode:1995 Natur.374..283S. doi:10.1038 / 374283a0. PMID 7533895. S2CID 4282418.
Tong X, Drapkin R, Reinberg D, Kieff E (1995). „62- a 80-kDa podjednotky transkripčního faktoru IIH zprostředkovávají interakci s jaderným proteinem viru Epstein-Barr 2“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 92 (8): 3259–63. Bibcode:1995PNAS ... 92.3259T. doi:10.1073 / pnas.92.8.3259. PMC 42145. PMID 7724549.
Fantes JA, Oghene K, Boyle S, Danes S, Fletcher JM, Bruford EA, Williamson K, Seawright A, Schedl A, Hanson I (1995). „Integrovaná fyzická, cytogenetická a genetická mapa lidského chromozomu 11 s vysokým rozlišením: distální p13 až proximální p15.1“. Genomika. 25 (2): 447–61. doi:10.1016 / 0888-7543 (95) 80045-N. PMID 7789978.
Xiao H, Pearson A, Coulombe B, Truant R, Zhang S, Regier JL, Triezenberg SJ, Reinberg D, Flores O, Ingles CJ (1994). "Vazba bazálního transkripčního faktoru TFIIH na kyselé aktivační domény VP16 a p53". Mol. Buňka. Biol. 14 (10): 7013–24. doi:10.1128 / mcb.14.10.7013. PMC 359231. PMID 7935417.
Schaeffer L, Moncollin V, Roy R, Staub A, Mezzina M, Sarasin A, Weeda G, Hoeijmakers JH, Egly JM (1994). „Opravný protein ERCC2 / DNA je spojen s transkripčním faktorem BTF2 / TFIIH třídy II“. EMBO J.. 13 (10): 2388–92. doi:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06522.x. PMC 395103. PMID 8194528.
Blau J, Xiao H, McCracken S, O'Hare P, Greenblatt J, Bentley D (1996). „Tři funkční třídy transkripční aktivační domény“. Mol. Buňka. Biol. 16 (5): 2044–55. doi:10.1128 / MCB.16.5.2044. PMC 231191. PMID 8628270.
Iyer N, Reagan MS, Wu KJ, Canagarajah B, Friedberg EC (1996). „Interakce zahrnující transkripční komplex pro opravu lidského RNA polymerázy II / nukleotidový excizní opravný komplex TFIIH, nukleotidový excizní opravný protein XPG a protein skupiny Cockayne syndromu B (CSB)“. Biochemie. 35 (7): 2157–67. doi:10.1021 / bi9524124. PMID 8652557.
Reardon JT, Ge H, Gibbs E, Sancar A, Hurwitz J, Pan ZQ (1996). „Izolace a charakterizace dvou komplexů souvisejících s lidským transkripčním faktorem IIH (TFIIH): ERCC2 / CAK a TFIIH“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93 (13): 6482–7. Bibcode:1996PNAS ... 93.6482R. doi:10.1073 / pnas.93.13.6482. PMC 39049. PMID 8692841.
Drapkin R, Le Roy G, Cho H, Akoulitchev S, Reinberg D (1996). „Lidská cyklin-dependentní kináza aktivující kináza existuje ve třech odlišných komplexech“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93 (13): 6488–93. Bibcode:1996PNAS ... 93.6488D. doi:10.1073 / pnas.93.13.6488. PMC 39050. PMID 8692842.
Zhou Q, Sharp PA (1996). „Tat-SF1: kofaktor pro stimulaci transkripčního prodloužení HIV-1 Tat“. Věda. 274 (5287): 605–10. Bibcode:1996Sci ... 274..605Z. doi:10.1126 / science.274.5287.605. PMID 8849451. S2CID 13266489.
Parada CA, Roeder RG (1996). „Enhanced processivity of RNA polymerase II triggered by Tat-vyvolaná fosforylace její karboxy-terminální domény“. Příroda. 384 (6607): 375–8. Bibcode:1996 Natur.384..375P. doi:10.1038 / 384375a0. PMID 8934526. S2CID 4278432.
García-Martínez LF, Ivanov D, Gaynor RB (1997). „Sdružení Tat s vyčištěnými preiniciačními komplexy HIV-1 a HIV-2“. J. Biol. Chem. 272 (11): 6951–8. doi:10.1074 / jbc.272.11.6951. PMID 9054383.
Marinoni JC, Roy R, Vermeulen W, Miniou P, Lutz Y, Weeda G, Seroz T, Gomez DM, Hoeijmakers JH, Egly JM (1997). „Klonování a charakterizace p52, páté podjednotky jádra transkripčního / DNA opravného faktoru TFIIH“. EMBO J.. 16 (5): 1093–102. doi:10.1093 / emboj / 16.5.1093. PMC 1169708. PMID 9118947.
Cujec TP, Cho H, Maldonado E, Meyer J, Reinberg D, Peterlin BM (1997). „Transaktivátor viru lidské imunodeficience Tat interaguje s holoenzymem RNA polymerázy II“. Mol. Buňka. Biol. 17 (4): 1817–23. doi:10.1128 / mcb.17.4.1817. PMC 232028. PMID 9121429.
Rossignol M, Kolb-Cheynel I, Egly JM (1997). "Substrátová specificita cdk-aktivující kinázy (CAK) je změněna po asociaci s TFIIH". EMBO J.. 16 (7): 1628–37. doi:10.1093 / emboj / 16.7.1628. PMC 1169767. PMID 9130708.
García-Martínez LF, Mavankal G, Neveu JM, Lane WS, Ivanov D, Gaynor RB (1997). „Purifikace kinázy spojené s Tat odhaluje komplex TFIIH, který moduluje transkripci HIV-1“. EMBO J.. 16 (10): 2836–50. doi:10.1093 / emboj / 16.10.2836. PMC 1169892. PMID 9184228.

externí odkazy

GTF2H1 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P32780 (Obecný transkripční faktor IIH podjednotka 1) na PDBe-KB.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000288114 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000110768, ENSG00000288114 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000006599 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1529339-5] Fischer L, Gerard M, Chalut C, Lutz Y, Humbert S, Kanno M, Chambon P, Egly JM (říjen 1992). "Klonování 62kilodaltonové složky základního transkripčního faktoru BTF2". Věda. 257 (5075): 1392–5. Bibcode:1992Sci ... 257.1392F. doi:10.1126 / science.1529339. PMID 1529339.

[pmid8162052-6] Heng HH, Xiao H, Shi XM, Greenblatt J, Tsui LC (květen 1994). „Geny kódující obecné iniciační faktory pro transkripci RNA polymerázy II jsou rozptýleny v lidském genomu“. Hučení. Mol. Genet. 3 (1): 61–4. doi:10,1093 / hmg / 3,1,61. PMID 8162052.

[entrez-7] „Entrez Gene: GTF2H1 obecný transkripční faktor IIH, polypeptid 1, 62 kDa“.

[pmid9130708-8] A ^b ^C Rossignol M, Kolb-Cheynel I, Egly JM (duben 1997). "Substrátová specificita cdk-aktivující kinázy (CAK) je změněna po asociaci s TFIIH". EMBO J.. 16 (7): 1628–37. doi:10.1093 / emboj / 16.7.1628. PMC 1169767. PMID 9130708.

[pmid7533895-9] Shiekhattar R, Mermelstein F, Fisher RP, Drapkin R, Dynlacht B, Wessling HC, Morgan DO, Reinberg D (březen 1995). „Komplex kinázy aktivující Cdk je součástí lidského transkripčního faktoru TFIIH“. Příroda. 374 (6519): 283–7. Bibcode:1995 Natur.374..283S. doi:10.1038 / 374283a0. PMID 7533895. S2CID 4282418.

[pmid8521393-10] Yee A, Nichols MA, Wu L, Hall FL, Kobayashi R, Xiong Y (prosinec 1995). "Molekulární klonování CDK7-asociované lidské MAT1, cyklin-dependentní kinázové aktivační kinázy (CAK), montážní faktor". Cancer Res. 55 (24): 6058–62. PMID 8521393.

[pmid10428966-11] Vandel L, Kouzarides T (srpen 1999). „Zbytky fosforylované TFIIH jsou potřebné pro degradaci E2F-1 během S-fáze“. EMBO J.. 18 (15): 4280–91. doi:10.1093 / emboj / 18.15.4280. PMC 1171504. PMID 10428966.

[pmid8152490-12] Drapkin R, Reardon JT, Ansari A, Huang JC, Zawel L, Ahn K, Sancar A, Reinberg D (duben 1994). „Dvojí role TFIIH při opravě excize DNA a při transkripci RNA polymerázou II“. Příroda. 368 (6473): 769–72. Bibcode:1994 Natur.368..769D. doi:10.1038 / 368769a0. PMID 8152490. S2CID 4363484.

[pmid10949034-13] Chen D, Riedl T, Washbrook E, Pace PE, Coombes RC, Egly JM, Ali S (červenec 2000). „Aktivace estrogenového receptoru alfa fosforylací S118 zahrnuje interakci závislou na ligandu s TFIIH a účast CDK7“. Mol. Buňka. 6 (1): 127–37. doi:10.1016 / s1097-2765 (00) 00014-9. PMID 10949034.

[pmid9765293-14] Archambault J, Pan G, Dahmus GK, Cartier M, Marshall N, Zhang S, Dahmus ME, Greenblatt J (říjen 1998). „FCP1, podjednotka interagující s RAP74 lidské proteinové fosfatázy, která defosforyluje karboxylterminální doménu RNA polymerázy IIO“. J. Biol. Chem. 273 (42): 27593–601. doi:10.1074 / jbc.273.42.27593. PMID 9765293.

[pmid9305922-15] Pan G, Aso T, Greenblatt J (září 1997). „Interakce elongačních faktorů TFIIS a elonginu A s holoenzymem lidské RNA polymerázy II schopným iniciace specifické pro promotor a reagující na transkripční aktivátory“. J. Biol. Chem. 272 (39): 24563–71. doi:10.1074 / jbc.272.39.24563. PMID 9305922.

[pmid15220921-16] Giglia-Mari G, Coin F, Ranish JA, Hoogstraten D, Theil A, Wijgers N, Jaspers NG, Raams A, Argentini M, van der Spek PJ, Botta E, Stefanini M, Egly JM, Aebersold R, Hoeijmakers JH, Vermeulen W (červenec 2004). „Nová, desátá podjednotka TFIIH je zodpovědná za trichothiodystrofickou skupinu se syndromem opravy DNA“. Nat. Genet. 36 (7): 714–9. doi:10.1038 / ng1387. PMID 15220921.

[pmid9118947-17] Marinoni JC, Roy R, Vermeulen W, Miniou P, Lutz Y, Weeda G, Seroz T, Gomez DM, Hoeijmakers JH, Egly JM (březen 1997). „Klonování a charakterizace p52, páté podjednotky jádra transkripčního / DNA opravného faktoru TFIIH“. EMBO J.. 16 (5): 1093–102. doi:10.1093 / emboj / 16.5.1093. PMC 1169708. PMID 9118947.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]