CBFA2T3 - CBFA2T3

CBFA2T3
Identifikátory
Aliasy	CBFA2T3, ETO2, MTG16, MTGR2, ZMYND4, RUNX1T3, CBFA2 / RUNX1 translokační partner 3, CBFA2 / RUNX1 partnerský transkripční korepresor 3
Externí ID	OMIM: 603870 MGI: 1338013 HomoloGene: 74543 Genové karty: CBFA2T3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 16 (lidský)
Konec	88,977,207 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	122,699,109 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů; • GO: Aktivita transkripčního corepresoru 0001106;
Buněčná složka	• Golgiho membrána; • Golgiho aparát; • jádro; • membrána; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• regulace aerobního dýchání; • diferenciace buněk; • buněčná proliferace; • negativní regulace glykolytického procesu; • reakce na hypoxii; • diferenciace granulocytů; • regulace transkripce, DNA-šablony; • pozitivní regulace katabolického procesu proteinu závislého na proteinu závislém na ubikvitinu; • transkripce, chráněná DNA; • negativní regulace buněčné proliferace; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	863
	12398
	ENSG00000129993
	ENSMUSG00000006362
	O75081
	O54972
	NM_005187; NM_175931
	NM_001109873; NM_009824; NM_177289
	NP_005178; NP_787127
	NP_001103343; NP_033954; NP_796263
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein CBFA2T3 (faktor vazby na jádro, runt doména, alfa podjednotka 2; translokovaný do, 3) je protein že u lidí je kódován CBFA2T3 gen.^[5]^[6]

Funkce

Translokace t (16; 21) (q24; q22) je vzácná, ale opakující se chromozomální abnormalita spojená s myeloidními malignitami souvisejícími s léčbou. Translokace produkuje chimérický gen tvořený z 5'-oblasti AML1 gen fúzovaný s 3'-oblastí tohoto genu. Tento gen je navíc domnělým supresorem nádoru prsu. Byly nalezeny dvě varianty transkriptu kódující různé izoformy pro tento gen a a brefeldin A -citlivá asociace RII-alfa proteinu s jednou z izoforem byla prokázána v Golgiho aparát.^[6]

Interakce

CBFA2T3 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000129993 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000006362 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Calabi F, Cilli V (prosinec 1998). „CBFA2T1 (vazebný faktor pro jádro, runt doména, alfa podjednotka 2; translokovaný do, 3), gen přeskupený v lidské leukémii, je členem multigenní rodiny.“ Genomika. 52 (3): 332–41. doi:10.1006 / geno.1998.5429. PMID 9790752.
^ ^A ^b "Entrez Gene: CBFA2T3 core-binding factor, runt domain, alpha subunit 2; translocated to, 3".
^ ^A ^b ^C Hoogeveen AT, Rossetti S, Stoyanova V, Schonkeren J, Fenaroli A, Schiaffonati L, van Unen L, Sacchi N (září 2002). „Transkripční corepresor MTG16a obsahuje novou nukleolární zacilující sekvenci rozloženou na t (16; 21) -pozitivní myeloidní malignity“. Onkogen. 21 (43): 6703–12. doi:10.1038 / sj.onc.1205882. PMID 12242670.
^ ^A ^b Amann JM, Nip J, Strom DK, Lutterbach B, Harada H, Lenny N, Downing JR, Meyers S, Hiebert SW (říjen 2001). „ETO, cíl t (8; 21) u akutní leukémie, vytváří zřetelné kontakty s více histonovými deacetylázami a váže mSin3A prostřednictvím své oligomerizační domény“. Mol. Buňka. Biol. 21 (19): 6470–83. doi:10.1128 / mcb.21.19.6470-6483.2001. PMC 99794. PMID 11533236.
^ ^A ^b ^C Goardon N, Lambert JA, Rodriguez P, Nissaire P, Herblot S, Thibault P, Dumenil D, Strouboulis J, Romeo PH, Hoang T (leden 2006). „ETO2 koordinuje buněčnou proliferaci a diferenciaci během erytropoézy“. EMBO J.. 25 (2): 357–66. doi:10.1038 / sj.emboj.7600934. PMC 1383517. PMID 16407974.
^ Schillace RV, Andrews SF, Liberty GA, Davey MP, Carr DW (únor 2002). "Identifikace a charakterizace myeloidního translokačního genu 16b jako nového proteinu kotujícího kinázu v T lymfocytech". J. Immunol. 168 (4): 1590–9. doi:10,4049 / jimmunol.168.4.1590. PMID 11823486.
^ Lindberg SR, Olsson A, Persson AM, Olsson I (prosinec 2003). "Interakce mezi leukemií asociovanými ETO homology proteinů nukleárního represoru". Eur. J. Haematol. 71 (6): 439–47. doi:10.1046 / j.0902-4441.2003.00166.x. PMID 14703694. S2CID 23106882.

Další čtení

Kitabayashi I, Ida K, Morohoshi F, Yokoyama A, Mitsuhashi N, Shimizu K, Nomura N, Hayashi Y, Ohki M (1998). „AML1-MTG8 leukemický fúzní protein tvoří komplex s novým členem rodiny MTG8 (ETO / CDR), MTGR1“. Mol. Buňka. Biol. 18 (2): 846–58. doi:10.1128 / MCB.18.2.846. PMC 108796. PMID 9447981.
Gamou T, Kitamura E, Hosoda F, Shimizu K, Shinohara K, Hayashi Y, Nagase T, Yokoyama Y, Ohki M (1998). „Partnerský gen AML1 u t (16; 21) myeloidních malignit je novým členem rodiny MTG8 (ETO)“. Krev. 91 (11): 4028–37. doi:10.1182 / krev.V91.11.4028. PMID 9596646.
Schillace RV, Andrews SF, Liberty GA, Davey MP, Carr DW (2002). "Identifikace a charakterizace myeloidního translokačního genu 16b jako nového proteinu kotujícího kinázu v T lymfocytech". J. Immunol. 168 (4): 1590–9. doi:10,4049 / jimmunol.168.4.1590. PMID 11823486.
Kondoh K, Nakata Y, Furuta T, Hosoda F, Gamou T, Kurosawa Y, Kinoshita A, Ohki M, Tomita Y, Mori T (2003). „Pediatrický případ sekundární leukémie spojené s t (16; 21) (q24; q22) vykazující chimérický gen AML1-MTG16“. Leuku. Lymfom. 43 (2): 415–20. doi:10.1080/10428190290006242. PMID 11999578. S2CID 23133496.
Kochetkova M, McKenzie OL, Bais AJ, Martin JM, Secker GA, Seshadri R, Powell JA, Hinze SJ, Gardner AE, Spendlove HE, O'Callaghan NJ, Cleton-Jansen AM, Cornelisse C, Whitmore SA, Crawford J, Kremmidiotis G, Sutherland GR, Callen DF (2002). „CBFA2T3 (MTG16) je domnělý gen potlačující tumor prsu ze ztráty karcinomu prsu v heterozygotní oblasti v 16q24.3“. Cancer Res. 62 (16): 4599–604. PMID 12183414.
Powell JA, Gardner AE, Bais AJ, Hinze SJ, Baker E, Whitmore S, Crawford J, Kochetkova M, Spendlove HE, Doggett NA, Sutherland GR, Callen DF, Kremmidiotis G (2003). „Sekvenování, identifikace transkriptu a kvantitativní profilování genové exprese ve ztrátě rakoviny prsu v heterozygotní oblasti 16q24.3 odhalují tři potenciální geny potlačující nádor“. Genomika. 80 (3): 303–10. doi:10.1006 / geno.2002.6828. PMID 12213200.
Hoogeveen AT, Rossetti S, Stoyanova V, Schonkeren J, Fenaroli A, Schiaffonati L, van Unen L, Sacchi N (2002). „Transkripční corepresor MTG16a obsahuje novou nukleolární zacilující sekvenci rozloženou na t (16; 21) -pozitivní myeloidní malignity“. Onkogen. 21 (43): 6703–12. doi:10.1038 / sj.onc.1205882. PMID 12242670.
Lindberg SR, Olsson A, Persson AM, Olsson I (2004). "Interakce mezi leukemií asociovanými ETO homology proteinů nukleárního represoru". Eur. J. Haematol. 71 (6): 439–47. doi:10.1046 / j.0902-4441.2003.00166.x. PMID 14703694. S2CID 23106882.
Ibañez V, Sharma A, Buonamici S, Verma A, Kalakonda S, Wang J, Kadkol S, Saunthararajah Y (2004). „AML1-ETO snižuje interakce ETO-2 (MTG16) s jádrovým receptorem jádra, což je účinek, který zhoršuje diferenciaci granulocytů“. Cancer Res. 64 (13): 4547–54. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-03-3689. PMID 15231665.
Kumar R, Manning J, Spendlove HE, Kremmidiotis G, McKirdy R, Lee J, Millband DN, Cheney KM, Stampfer MR, Dwivedi PP, Morris HA, Callen DF (2006). „ZNF652, nový protein se zinkovým prstem, interaguje s domnělým supresorem nádoru prsu CBFA2T3 a potlačuje transkripci“. Mol. Cancer Res. 4 (9): 655–65. doi:10.1158 / 1541-7786.MCR-05-0249. PMID 16966434.

externí odkazy

CBFA2T3 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
Člověk CBFA2T3 umístění genomu a CBFA2T3 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 16 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000129993 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000006362 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9790752-5] Calabi F, Cilli V (prosinec 1998). „CBFA2T1 (vazebný faktor pro jádro, runt doména, alfa podjednotka 2; translokovaný do, 3), gen přeskupený v lidské leukémii, je členem multigenní rodiny.“ Genomika. 52 (3): 332–41. doi:10.1006 / geno.1998.5429. PMID 9790752.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: CBFA2T3 core-binding factor, runt domain, alpha subunit 2; translocated to, 3".

[pmid12242670-7] A ^b ^C Hoogeveen AT, Rossetti S, Stoyanova V, Schonkeren J, Fenaroli A, Schiaffonati L, van Unen L, Sacchi N (září 2002). „Transkripční corepresor MTG16a obsahuje novou nukleolární zacilující sekvenci rozloženou na t (16; 21) -pozitivní myeloidní malignity“. Onkogen. 21 (43): 6703–12. doi:10.1038 / sj.onc.1205882. PMID 12242670.

[pmid11533236-8] A ^b Amann JM, Nip J, Strom DK, Lutterbach B, Harada H, Lenny N, Downing JR, Meyers S, Hiebert SW (říjen 2001). „ETO, cíl t (8; 21) u akutní leukémie, vytváří zřetelné kontakty s více histonovými deacetylázami a váže mSin3A prostřednictvím své oligomerizační domény“. Mol. Buňka. Biol. 21 (19): 6470–83. doi:10.1128 / mcb.21.19.6470-6483.2001. PMC 99794. PMID 11533236.

[pmid16407974-9] A ^b ^C Goardon N, Lambert JA, Rodriguez P, Nissaire P, Herblot S, Thibault P, Dumenil D, Strouboulis J, Romeo PH, Hoang T (leden 2006). „ETO2 koordinuje buněčnou proliferaci a diferenciaci během erytropoézy“. EMBO J.. 25 (2): 357–66. doi:10.1038 / sj.emboj.7600934. PMC 1383517. PMID 16407974.

[pmid11823486-10] Schillace RV, Andrews SF, Liberty GA, Davey MP, Carr DW (únor 2002). "Identifikace a charakterizace myeloidního translokačního genu 16b jako nového proteinu kotujícího kinázu v T lymfocytech". J. Immunol. 168 (4): 1590–9. doi:10,4049 / jimmunol.168.4.1590. PMID 11823486.

[pmid14703694-11] Lindberg SR, Olsson A, Persson AM, Olsson I (prosinec 2003). "Interakce mezi leukemií asociovanými ETO homology proteinů nukleárního represoru". Eur. J. Haematol. 71 (6): 439–47. doi:10.1046 / j.0902-4441.2003.00166.x. PMID 14703694. S2CID 23106882.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]