Inhibitor domény apoptózy - Inhibitor of apoptosis domain

Dostupné proteinové struktury:
Pfam	struktur / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	shrnutí struktury
PDB	1c9q, 1e31, 1f3h, 1f9x, 1g3f, 1g73, 1i3o, 1jd4, 1jd5, 1jd6, 1m4m, 1nw9, 1oxn, 1oxq, 1oy7, 1q4q, 1 qbh, 1 sdz, 1se0, 1tfq, 1 tft, 1tw6, 1xb0, 1xb1, 1xox, 2i3h, 2i3i

Inhibitor domény apoptózy
	NMR struktura řešení BIR domény člověka BIRC2 protein. Protein má duhový barevný kreslený diagram (N-konec = modrá, C-konec = červená), zatímco koordinovaný zinek je reprezentován šedou koulí.
Identifikátory
Symbol	BIR
Pfam	PF00653
InterPro	IPR001370
STRÁNKA	PS50143
SCOP2	1 qbh / Rozsah / SUPFAM
Dostupné proteinové struktury:
Pfam	struktur / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	shrnutí struktury
PDB	1c9q, 1e31, 1f3h, 1f9x, 1g3f, 1g73, 1i3o, 1jd4, 1jd5, 1jd6, 1m4m, 1nw9, 1oxn, 1oxq, 1oy7, 1q4q, 1 qbh, 1 sdz, 1se0, 1tfq, 1 tft, 1tw6, 1xb0, 1xb1, 1xox, 2i3h, 2i3i

The inhibitor domény apoptózy -- také známý jako Opakování IAP, Baculovirus Jáinhibitor proteinu apoptózy Repeatnebo BIR -- je strukturální motiv nalezen v bílkoviny s rolemi v apoptóza, cytokin výroba a segregace chromozomů.^[2] Proteiny obsahující BIR jsou známé jako inhibitor apoptózy proteiny (IAP) nebo proteiny obsahující BIR (BIRP nebo BIRC) a zahrnují BIRC1 (NAIP ), BIRC2 (cIAP1), BIRC3 (cIAP2), BIRC4 (xIAP ), BIRC5 (přežít ) a BIRC6.^[2]^[3]

Domény BIR patří do domény zinkový prst rodina domén a charakteristicky mají řadu neměnných aminokyselina zbytky, včetně 3 konzervovaných cysteiny a jeden konzervovaný histidin, které koordinují a zinek ion.^[4] Obvykle se skládají ze 4-5 alfa helixy a třípramenný beta list.

externí odkazy

Zdroj eukaryotického lineárního motivu třída motivů LIG_BIR_II_1
Zdroj eukaryotického lineárního motivu třída motivů LIG_BIR_III_1
Zdroj eukaryotického lineárního motivu třída motivů LIG_BIR_III_2
Zdroj eukaryotického lineárního motivu třída motivů LIG_BIR_III_3
Zdroj eukaryotického lineárního motivu třída motivů LIG_BIR_III_4

Reference

^ PDB: 1QBH;Hinds MG, Norton RS, Vaux DL, Day CL (červenec 1999). "Struktura roztoku bakulovirového inhibitoru opakování apoptózy (IAP)". Nat. Struct. Biol. 6 (7): 648–51. doi:10.1038/10701. PMID 10404221. S2CID 3194182.
^ ^A ^b Silke J, Vaux DL (květen 2001). "Dva druhy bílkovin obsahujících BIR - inhibitory apoptózy nebo potřebné pro mitózu". J. Cell Sci. 114 (Pt 10): 1821–7. PMID 11329368.
^ Verhagen AM, Coulson EJ, Vaux DL (2001). „Inhibitor proteinů apoptózy a jejich příbuzní: IAP a další BIRP“. Genome Biol. 2 (7): RECENZE 3009. doi:10.1186 / gb-2001-2-7-reviews3009. PMC 139420. PMID 11516343.
^ Birnbaum MJ, Clem RJ, Miller LK (duben 1994). „Gen inhibující apoptózu z viru nukleární polyedrosy kódující polypeptid s motivy sekvencí Cys / His“. J. Virol. 68 (4): 2521–8. doi:10.1128 / JVI.68.4.2521-2528.1994. PMC 236730. PMID 8139034.

Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR001370

[pmid10404221-1] PDB: 1QBH;Hinds MG, Norton RS, Vaux DL, Day CL (červenec 1999). "Struktura roztoku bakulovirového inhibitoru opakování apoptózy (IAP)". Nat. Struct. Biol. 6 (7): 648–51. doi:10.1038/10701. PMID 10404221. S2CID 3194182.

[pmid11329368-2] A ^b Silke J, Vaux DL (květen 2001). "Dva druhy bílkovin obsahujících BIR - inhibitory apoptózy nebo potřebné pro mitózu". J. Cell Sci. 114 (Pt 10): 1821–7. PMID 11329368.

[pmid11516343-3] Verhagen AM, Coulson EJ, Vaux DL (2001). „Inhibitor proteinů apoptózy a jejich příbuzní: IAP a další BIRP“. Genome Biol. 2 (7): RECENZE 3009. doi:10.1186 / gb-2001-2-7-reviews3009. PMC 139420. PMID 11516343.

[pmid8139034-4] Birnbaum MJ, Clem RJ, Miller LK (duben 1994). „Gen inhibující apoptózu z viru nukleární polyedrosy kódující polypeptid s motivy sekvencí Cys / His“. J. Virol. 68 (4): 2521–8. doi:10.1128 / JVI.68.4.2521-2528.1994. PMC 236730. PMID 8139034.

[1]

[2]

[3]

[4]