Doména BESS - BESS domain
| BESS | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | BESS | ||||||||
| Pfam | PF02944 | ||||||||
| InterPro | IPR004210 | ||||||||
| |||||||||
V molekulární biologii se Doména BESS je proteinová doména který byl pojmenován po třech bílkoviny který původně definoval doménu: BEAF (Boundary element associated factor 32),[1] Suvar (3) 7 [2] a Stonewall [3]). Doména BESS je 40 aminokyselina zbytky dlouhé a předpokládá se, že bude složen ze tří alfa šroubovic, takže by to mohlo souviset s myb /SANT HTH doména. Doména BESS řídí různé protein-protein interakce, včetně interakcí se sebou samými, s Dorsalem a s faktorem souvisejícím s TBP. Nachází se v jedné kopii v Drosophila bílkoviny a je často spojován s doménou MADF.[4][5][6]
Proteiny o kterých je známo, že obsahují doménu BESS, zahrnují:
- Drosophila Boundary element associated factor 32 (BEAF-32).
- Drosophila Supresor variegation proteinu 3-7 (Su (var) 3-7), který by mohl hrát roli v chromozóm kondenzace.
- Drosophila Ravus, což je homologní do C-koncové části Su (var) 3-7.[7]
- Drosophila Stonewall (Stwl), domnělý transkripční faktor nutné pro údržbu ženské zárodečné linie kmenové buňky stejně jako oocyt diferenciace.
- Drosophila Adf-1, a transkripční faktor poprvé identifikován na základě jeho interakce s alkohol dehydrogenáza promotér ale to váže the promotéři různorodé skupiny geny.[4]
- Drosophila Dorsálně interagující protein 3 (Dip3). Funguje to jako aktivátor vázat DNA v a sekvence konkrétním způsobem a koaktivátor stimulovat synergii aktivace autor: Dorsal and Twist.[5]
Reference
- ^ Zhao K, Hart CM, Laemmli UK (červen 1995). "Vizualizace chromozomálních domén s faktorem BEAF-32 spojeným s hraničními prvky". Buňka. 81 (6): 879–89. doi:10.1016 / 0092-8674 (95) 90008-X. PMID 7781065. S2CID 18999226.
- ^ Reuter G, Giarre M, Farah J, Gausz J, Spierer A, Spierer P (březen 1990). „Závislost pestrosti pozičního účinku u Drosophily na dávce genu kódujícího neobvyklý protein se zinkovým prstem“. Příroda. 344 (6263): 219–23. doi:10.1038 / 344219a0. PMID 2107402. S2CID 4321455.
- ^ Clark KA, McKearin DM (březen 1996). „Gen Drosophila stonewall kóduje domnělý transkripční faktor nezbytný pro vývoj zárodečných buněk“. Rozvoj. 122 (3): 937–50. PMID 8631271.
- ^ A b England BP, Admon A, Tjian R (leden 1992). „Klonování transkripčního faktoru Drosophila Adf-1 odhaluje homologii s Myb onkoproteiny“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 89 (2): 683–7. doi:10.1073 / pnas.89.2.683. PMC 48303. PMID 1731341.
- ^ A b Cutler G, Perry KM, Tjian R (duben 1998). „Adf-1 je nemodulární transkripční faktor, který obsahuje motiv podobný Myb vázajícímu TAF“. Mol. Buňka. Biol. 18 (4): 2252–61. doi:10.1128 / MCB.18.4.2252. PMC 121473. PMID 9528796.
- ^ Bhaskar V, Courey AJ (říjen 2002). „Faktor domény MADF-BESS Dip3 potencuje synergickou aktivaci pomocí Dorsal a Twist“. Gen. 299 (1–2): 173–84. doi:10.1016 / S0378-1119 (02) 01058-2. PMID 12459265.
- ^ Delattre M, Spierer A, Hulo N, Spierer P (leden 2002). „Nový gen v Drosophila melanogaster, Ravus, přízrak modifikátoru variace polohy s efektem polohy Su (var) 3-7.“ Int. J. Dev. Biol. 46 (1): 167–71. PMID 11902679.