NACHT doména - NACHT domain
NACHT doména | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikátory | |||||||||
Symbol | NACHT | ||||||||
Pfam | PF05729 | ||||||||
InterPro | IPR007111 | ||||||||
STRÁNKA | PS50837 | ||||||||
|
The NACHT doména je evolučně konzervovaný proteinová doména. Tento NTPáza doména se nachází v doméně apoptóza bílkoviny stejně jako osoby zapojené do MHC transkripce.[1] Jeho název odráží některé proteiny, které jej obsahují: NAIP (Apoptóza rodiny NLP inhibitorový protein ), CIITA (tj. C2TA nebo MHC třídy II aktivátor transkripce), HET-E (nekompatibilní lokusový protein z Podospora anserina) a TEP1 (tj. TP1 nebo protein spojený s telomerázou).
Doména NACHT obsahuje 300 až 400 aminokyseliny. Je to předvídáno nukleosid-trifosfatáza Doména (NTPase), která se nachází v doméně zvíře, plísňový a bakteriální bílkoviny. Nachází se ve spojení s jinými doménami, například CARD doména (InterPro: IPR001315 ), pyrinová doména (InterPro: IPR004020 ), HEAT opakovaná doména (InterPro: IPR004155 ), WD40 opakovat (InterPro: IPR001680 ), opakování bohaté na leucin (LRR) nebo BIR opakovat (InterPro: IPR001370 ).[1]
Doména NACHT se skládá ze sedmi odlišných konzervovaných motivů, včetně P smyčky specifické pro ATP / GTPázu, Mg2+-závazné místo (Walker A a B motivy a pět konkrétnějších motivů. Mezi jedinečné vlastnosti domény NACHT patří prevalence „drobných“ zbytků (glycin, alanin nebo serin) přímo na C-konci Mg2+-koordinující aspartát v motivu Walker B místo druhého kyselého zbytku převládajícího v jiných NTPázách. Druhý kyselý zbytek se obvykle nachází v proteinech obsahujících NACHT ve dvou pozicích po proudu. Distální motiv VII dále obsahuje konzervovaný vzor polárních, aromatických a hydrofobních zbytků, který není vidět v žádné jiné rodině NTPáz.[1]
Příklady
Lidské proteiny obsahující tuto doménu zahrnují:
- CIITA
- NAIP
- NLRC3, NLRC4, NLRC5
- NLRP1, NLRP2, NLRP3, NLRP4, NLRP5, NLRP6, NLRP7, NLRP8, NLRP9, NLRP10, NLRP11, NLRP12, NLRP13, NLRP14, NLRX1
- NOD1, NOD2
- NWD1
- TEP1
Reference
![]() | Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |