BZIP maf - BZIP Maf

Dostupné proteinové struktury:
Pfam	struktur / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	shrnutí struktury

bZIP_Maf
	Krystalová struktura homodimeru MafA navázaného na DNA. Vstup PDB 3a5t
Identifikátory
Symbol	bZIP_Maf
Pfam	PF03131
Pfam klan	CL0018
InterPro	IPR004826
SCOP2	1k1v / Rozsah / SUPFAM
Dostupné proteinové struktury:
Pfam	struktur / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	shrnutí struktury

bZIP Maf je doména nalezená v Maf transkripční faktor bílkoviny. Obsahuje a leucinový zip (bZIP) doména, která zprostředkovává transkripční faktor dimerizace a DNA vazba vlastnosti. Oblast Maf extended homology (EHR) je přítomna na N-konci proteinu. Tato oblast (zobrazená žlutě na sousedním obrázku) existuje pouze v rodině Maf a umožňuje rodině rozpoznat delší motivy DNA než jiné leucinové zipy. Tyto motivy se nazývají Maf rozpoznávací prvek (MARE) a jsou 13 nebo 14 základní páry dlouho. Zejména dva zbytky na začátku spirála H2 jsou umístěny tak, aby rozpoznaly přilehlou oblast DNA.^[2] Malý maf bílkoviny heterodimerizovat s Fos a může působit jako konkurenční represory transkripčního faktoru NF2-E2.

U myši může Maf1 hrát ranou roli v axiálním vzorování. Vady těchto proteinů jsou příčinou autosomální dominantní retinitis pigmentosa. Neurální sítnice - specifické leucinové zipové proteiny patří do této rodiny.

Reference

^ Kurokawa, H .; Motohashi, H .; Sueno, S .; Kimura, M .; Takagawa, H .; Kanno, Y .; Yamamoto, M .; Tanaka, T. (2009). „Strukturální základ alternativního rozpoznávání DNA pomocí transkripčních faktorů Maf“. Molekulární a buněčná biologie. 29 (23): 6232–6244. doi:10.1128 / MCB.00708-09. PMC 2786689. PMID 19797082.
^ Kusunoki H, Motohashi H, Katsuoka F, Morohashi A, Yamamoto M, Tanaka T (duben 2002). "Struktura řešení domény vázající DNA MafG". Nat. Struct. Biol. 9 (4): 252–6. doi:10.1038 / nsb771. PMID 11875518. S2CID 23687470.

Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR004826

[1] Kurokawa, H .; Motohashi, H .; Sueno, S .; Kimura, M .; Takagawa, H .; Kanno, Y .; Yamamoto, M .; Tanaka, T. (2009). „Strukturální základ alternativního rozpoznávání DNA pomocí transkripčních faktorů Maf“. Molekulární a buněčná biologie. 29 (23): 6232–6244. doi:10.1128 / MCB.00708-09. PMC 2786689. PMID 19797082.

[pmid11875518-2] Kusunoki H, Motohashi H, Katsuoka F, Morohashi A, Yamamoto M, Tanaka T (duben 2002). "Struktura řešení domény vázající DNA MafG". Nat. Struct. Biol. 9 (4): 252–6. doi:10.1038 / nsb771. PMID 11875518. S2CID 23687470.

[1]

[2]