PX doména - PX domain - Wikipedia
 PX doména NADH oxidázy (p40phox), vázaná na lipidy | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Symbol | PX | ||||||||
| Pfam | PF00787 | ||||||||
| InterPro | IPR001683 | ||||||||
| CHYTRÝ | PX | ||||||||
| STRÁNKA | PDOC50195 | ||||||||
| SCOP2 | 1h6h / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| OPM nadčeleď | 57 | ||||||||
| OPM protein | 1xte | ||||||||
| CDD | cd06093 | ||||||||
| |||||||||
The PX doména je fosfoinositid -vazba strukturální doména podílí se na cílení proteinů na buněčné membrány.
Tato doména byla poprvé nalezena v doménách P40phox a p47phox domény NADPH oxidáza (phox znamená fagocytickou oxidázu).[1][2] Byl také identifikován v mnoha dalších proteinech zapojených do přenosu membrán, včetně nexinů, Fosfolipáza D, a fosfoinositid -3-kinázy.
PX doména je strukturálně konzervována v eukaryoty, i když aminokyselinové sekvence vykazují malou podobnost.[3] PX domény interagují primárně s PtdIns (3) P lipidy.[4][5] Někteří z nich se však vážou kyselina fosfatidová, PtdIns (3,4) P2, PtdIns (3,5) P2, PtdIns (4,5) P2, a PtdIns (3,4,5) P3. PX-doména může také interagovat s jinými doménami a proteiny.
Lidské proteiny obsahující tuto doménu
Třídění nexinů obsahovat tuto doménu. Mezi další příklady patří:
- HS1BP3
- KIF16B (SNX23)
- NCF1; NCF1C; NCF4; NISCH
- PIK3C2A; PIK3C2B; PIK3C2G; PLD1; PLD2; PXK
- RPS6KC1
- SGK3; SH3PXD2A; SNAG1; SNX9
Reference
- ^ Ponting CP (listopad 1996). „Nové domény v podjednotkách oxidace NADPH, třídění nexinů a 3-kinázy PtdIns: vazební partneři domén SH3?“. Protein Sci. 5 (11): 2353–7. doi:10.1002 / pro.5560051122. PMC 2143296. PMID 8931154.
- ^ Wishart MJ, Taylor GS, Dixon JE (červen 2001). "Phoxy lipidy: odhalující PX domény jako moduly vázající fosfoinositid". Buňka. 105 (7): 817–20. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00414-7. PMID 11439176. S2CID 12622490.
- ^ Hiroaki H, Ago T, Ito T, Sumimoto H, Kohda D (červen 2001). Msgstr "Struktura řešení domény PX, cíl domény SH3". Nat. Struct. Biol. 8 (6): 526–30. doi:10.1038/88591. PMID 11373621. S2CID 27416988.
- ^ Karathanassis D, Stahelin RV, Bravo J, Perisic O, Pacold CM, Cho W, Williams RL (říjen 2002). „Vazba PX domény p47phox na fosfatidylinositol 3,4-bisfosfát a kyselinu fosfatidovou je maskována intramolekulární interakcí“. EMBO J.. 21 (19): 5057–68. doi:10.1093 / emboj / cdf519. PMC 129041. PMID 12356722.
- ^ Ago T, Kuribayashi F, Hiroaki H, Takeya R, Ito T, Kohda D, Sumimoto H (duben 2003). „Fosforylace p47phox směruje doménu phoxové homologie z domény SH3 na fosfoinositidy, což vede k aktivaci fagocytové NADPH oxidázy“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (8): 4474–9. doi:10.1073 / pnas.0735712100. PMC 153580. PMID 12672956.