Doména BMC - BMC domain
| BMC | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 carboxysome shell protein ccmk2 | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | BMC | ||||||||
| Pfam | PF00936 | ||||||||
| InterPro | IPR000249 | ||||||||
| STRÁNKA | PDOC00876 | ||||||||
| CDD | cd06169 | ||||||||
| |||||||||
v molekulární biologie the Bakteriální mikrokompartmentová (BMC) doména je proteinová doména nalezené v různých proteinech skořápky, včetně CsoS1A, CsoS1B a CsoS1C z Thiobacillus neapolitanus (Halothiobacillus neapolitanus) a jejich ortology z jiných bakterií. Tyto skořápkové proteiny tvoří mnohostěnný struktura carboxysome a související struktury, které hrají v bakteriích metabolickou roli. Doména BMC se skládá z přibližně 90 aminokyselina zbytky, charakterizované motivem β-α-β spojeným β-vlásenkou.
Většina proteinů skořápky se skládá z jedné domény BMC v každé podjednotce a vytváří hexamerickou strukturu, která se sestavuje a tvoří ploché fazety polyedrického obalu.[1] Doposud bylo zjištěno, že dva skořápkové proteiny sestávají z tandemových domén BMC, z nichž tvoří trimerní strukturu, která dává pseudohexamerický vzhled.[2][3]
Reference
- ^ Kerfeld CA, Sawaya MR, Tanaka S, Nguyen CV, Phillips M, Beeby M, Yeates TO (srpen 2005). "Proteinové struktury tvořící obal primitivních bakteriálních organel". Věda. 309 (5736): 936–8. CiteSeerX 10.1.1.1026.896. doi:10.1126 / science.1113397. PMID 16081736. S2CID 24561197.
- ^ Heldt D, Frank S, Seyedarabi A, Ladikis D, Parsons JB, Warren MJ, Pickersgill RW (září 2009). "Struktura trimerního bakteriálního mikrokompartmentového skořápkového proteinu, EtuB, spojená s využitím ethanolu v Clostridium kluyveri". The Biochemical Journal. 423 (2): 199–207. doi:10.1042 / BJ20090780. PMID 19635047. S2CID 22548122.
- ^ Pang A, Warren MJ, Pickersgill RW (únor 2011). "Struktura PduT, trimerního bakteriálního mikrokompartmentového proteinu s vazebným místem klastru 4Fe-4S". Acta Crystallographica D. 67 (Pt 2): 91–6. doi:10.1107 / S0907444910050201. PMID 21245529.