Eadie – Hofsteeův diagram - Eadie–Hofstee diagram

Tento článek má několik problémů. Prosím pomozte vylepši to nebo diskutovat o těchto problémech na internetu diskusní stránka. (Zjistěte, jak a kdy tyto zprávy ze šablony odebrat) tento článek poskytuje nedostatečný kontext pro ty, kteří danému tématu nejsou obeznámeni. Prosím pomozte vylepšit článek podle poskytuje čtenáři více kontextu. (Říjen 2018) (Zjistěte, jak a kdy odstranit tuto zprávu šablony) tento článek může být pro většinu čtenářů příliš technická na to, aby tomu rozuměli. Prosím pomozte to vylepšit na aby to bylo srozumitelné pro neodborníky, aniž by byly odstraněny technické podrobnosti. (Říjen 2018) (Zjistěte, jak a kdy odstranit tuto zprávu šablony) (Zjistěte, jak a kdy odstranit tuto zprávu šablony)

v biochemie, an Eadie – Hofsteeův diagram (taky Woolf – Eadie – Augustinsson – Hofstee nebo Eadie – Augustinssonova zápletka) je grafické znázornění kinetika enzymů.

Popis

V diagramu rychlost reakce je vynesen jako a funkce poměru mezi sazbou a Podklad koncentrace:

${ displaystyle v = -K_ {M} {v nad [S]} + V _ { max}}$

kde proti představuje rychlost reakce, K._M je Michaelis – Mentenova konstanta, [S] je koncentrace substrátu a PROTI_max je maximální rychlost reakce.

To lze odvodit z rovnice Michaelis – Menten takto:

${ displaystyle v = {{V _ { max} {} [S]} nad {K_ {M} + [S]}}}$

invertovat a množit se ${ displaystyle V _ { max}}$:

${ displaystyle {V _ { max} přes v} = {{V _ { max} {} (K_ {M} + [S])} přes {V _ { max} {} [S]}} = {{K_ {M} + [S]} přes {[S]}}}$

Uspořádání:

${ displaystyle V _ { max} = {{{vK_ {M}} nad {[S]}} + {{v [S]} nad {[S]}}} = {{vK_ {M}} přes {[S]}} + v}$

Izolovat v:

${ displaystyle v = -K_ {M} {v nad {[S]}} + V _ { max}}$

Děj v proti proti/ [S] bude tedy výnos PROTI_max jako průsečík y, PROTI_max/ K._M jako x-intercept, a K._M jako záporný sklon.

Používání

Stejně jako jiné techniky, které linearizují Michaelis – Mentenova rovnice, děj Eadie – Hofstee byl historicky použit pro rychlou identifikaci důležitých kinetických termínů jako K._M a PROTI_max, ale byl nahrazen nelineární regrese metody, které jsou výrazně přesnější a již nejsou výpočetně nepřístupné. Je také odolnější proti chybám náchylným datům než Lineweaver – Burkův graf, zejména proto, že dává stejnou váhu datovým bodům v jakémkoli rozsahu koncentrace substrátu nebo rychlosti reakce. (Graf Lineweaver – Burk nerovnoměrně váží takové body.) Oba grafy zůstávají užitečné jako prostředek ke grafické prezentaci dat.

Nevýhoda

Jednou z nevýhod přístupu Eadie – Hofstee je, že ani jedna ordinovat ani úsečka zastupovat nezávislé proměnné: oba jsou závislé na rychlosti reakce. Jakákoli experimentální chyba bude tedy přítomna v obou osách. Také experimentální chyba nebo nejistota se bude šířit nerovnoměrně a zvětšovat se nad úsečka čímž přikládají větší váhu menším hodnotám proti/ [S]. Proto je typické měřítko dobroty vhodné pro lineární regrese, korelační koeficient R, není použitelné.

Viz také

• Michaelis – Mentenova rovnice
• Lineweaver – Burkův graf
• Hanes – Woolfův děj

Reference

• Eadie, GS (1942). "Inhibice cholinesterázy fyzostigminem a prostigminem". Journal of Biological Chemistry. 146: 85–93.
• Hofstee, BHJ (1959). "Neinvertované versus invertované grafy v kinetice enzymu". Příroda. 184 (4695): 1296–1298. Bibcode:1959 Natur.184.1296H. doi:10.1038 / 1841296b0. PMID  14402470. S2CID  4251436.
• Dowd, JE; Riggs, DS (1965). „Srovnání odhadů kinetických konstant Michaelis – Menten z různých lineárních transformací“. Journal of Biological Chemistry. 240: 863–869. PMID  14275146.
• Atkins, GL; Nimmo, IA (1975). „Srovnání sedmi metod pro přizpůsobení rovnice Michaelis – Menten“. Biochemical Journal. 149 (3): 775–777. doi:10.1042 / bj1490775. PMC  1165686. PMID  1201002.