JARID1B - JARID1B
Lysin specifická demethyláza 5B také známý jako histon demethyláza JARID1B je demethyláza enzym že u lidí je kódován KDM5B gen.[5][6][7] JARID1B patří do alfa-ketoglutarát-dependentní hydroxyláza nadčeleď.
Funkce
Jarid1B (také známý jako KDM5B nebo PLU1) je v rodině genů JHDM. Ty jsou odpovědné za demetylaci tri- a di-methylovaných lysinů v poloze 4 histonu 3 (H3K4me3 a H3K4me2). Jarid1B je vícedoménový enzym, který je součástí podčeledi KDM5. Celá rodina Jarid1 je rodina proteinů, která má aktivitu histon demetylázy H3K4.[8]
Jarid1B se podílí na vývoji rakoviny prostaty, prsu a kůže a také je spojován s udržováním melanomu. Produkované vyřazené myši (Jarid1b - / -) jsou životaschopné v novorozeneckém životě. Tyto myši vykazují fenotyp předčasné úmrtnosti, snížené plodnosti u samic myší, snížení tělesné hmotnosti a narušení vývoje mléčné žlázy. Rovněž působil na snížení hladiny estrogenu v séru a způsobil sníženou proliferaci epiteliálních buněk mléčné žlázy v raných fázích puberty. Zdá se, že tyto myši Jarid1b - / - jsou značně ovlivněny mnoha regulátory vývoje vývoje mammy, jako jsou FOXA1 a estrogenový receptor α.[9] Jiní však prokázali, že knock-out embrya Jarid1B mají obvykle novorozeneckou letalitu kvůli selhání jejich dýchacího systému. Bylo také pozorováno, že vyřazovací embrya mají několik různých nervových vad, včetně: dezorganizovaných hlavových nervů, zvýšeného výskytu exencefalie a vad ve vývoji očí.[10]
Interakce
JARID1B bylo prokázáno komunikovat s FOXG1[11] a PAX9.[11]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000117139 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000042207 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Lahoud MH, Ristevski S, Venter DJ, Jermiin LS, Bertoncello I, Zavarsek S, Hasthorpe S, Drago J, de Kretser D, Hertzog PJ, Kola I (srpen 2001). „Genové cílení na Desrt, nový protein vázající DNA třídy ARID, způsobuje zpomalení růstu a abnormální vývoj reprodukčních orgánů“. Výzkum genomu. 11 (8): 1327–34. doi:10,1101 / gr.168801. PMID 11483573.
- ^ Zhu L, Hu J, Lin D, Whitson R, Itakura K, Chen Y (srpen 2001). „Dynamika domény vázající DNA Mrf-2 zdarma a v komplexu s DNA“. Biochemie. 40 (31): 9142–50. doi:10.1021 / bi010476a. PMID 11478881.
- ^ „Entrez Gene: JARID1B jumonji, AT bohatá interaktivní doména 1B“.
- ^ Kristensen LH, Nielsen AL, Helgstrand C, Lees M, Cloos P, Kastrup JS, Helin K, Olsen L, Gajhede M (červen 2012). „Studie demetylace H3K4me3 metodou KDM5B / Jarid1B / PLU1 odhalují silné rozpoznávání substrátu in vitro a identifikují kyselinu 2,4-pyridinkarboxylovou jako in vitro a v buněčném inhibitoru.“ FEBS Journal. 279 (11): 1905–14. doi:10.1111 / j.1742-4658.2012.08567.x. PMID 22420752.
- ^ Zou MR, Cao J, Liu Z, Huh SJ, Polyak K, Yan Q (červen 2014). „Histon demethyláza jumonji AT-bohatá interaktivní doména 1B (JARID1B) řídí vývoj mléčné žlázy regulací klíčových vývojových genů a genů specifikací linie“. The Journal of Biological Chemistry. 289 (25): 17620–33. doi:10.1074 / jbc.M114.570853. PMC 4067197. PMID 24802759.
- ^ Albert M, Schmitz SU, Kooistra SM, Malatesta M, Morales Torres C, Rekling JC, Johansen JV, Abarrategui I, Helin K (duben 2013). „Histon demetyláza Jarid1b zajišťuje věrný vývoj myší ochranou vývojových genů před nenormální H3K4me3“. Genetika PLOS. 9 (4): e1003461. doi:10.1371 / journal.pgen.1003461. PMC 3630093. PMID 23637629.
- ^ A b Tan K, Shaw AL, Madsen B, Jensen K, Taylor-Papadimitriou J, Freemont PS (červen 2003). „Lidská PLU-1 má transkripční represivní vlastnosti a interaguje s vývojovými transkripčními faktory BF-1 a PAX9.“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (23): 20507–13. doi:10,1074 / jbc.M301994200. PMID 12657635.
Další čtení
- Lu PJ, Sundquist K, Baeckstrom D, Poulsom R, Hanby A, Meier-Ewert S, Jones T, Mitchell M, Pitha-Rowe P, Freemont P, Taylor-Papadimitriou J (květen 1999). „Nový gen (PLU-1) obsahující vysoce konzervativní domnělé motivy vázající DNA / chromatin je u rakoviny prsu specificky up-regulován“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (22): 15633–45. doi:10.1074 / jbc.274.22.15633. PMID 10336460.
- Kashuba V, Protopopov A, Podowski R, Gizatullin R, Li J, Klein G, Wahlestedt C, Zabarovsky E (červen 2000). „Izolace a chromozomální lokalizace nového homologu 1a lidského retinoblastomu vázajícího protein 2a (RBBP2H1A)“. European Journal of Human Genetics. 8 (6): 407–13. doi:10.1038 / sj.ejhg.5200474. PMID 10878660.
- Barrett A, Madsen B, Copier J, Lu PJ, Cooper L, Scibetta AG, Burchell J, Taylor-Papadimitriou J (říjen 2002). „Jaderný protein PLU-1, který je nadměrně regulován u rakoviny prsu, vykazuje omezenou expresi v normálních lidských tkáních dospělých: nový antigen rakoviny / varlat?“. International Journal of Cancer. 101 (6): 581–8. doi:10.1002 / ijc.10644. PMID 12237901.
- Tan K, Shaw AL, Madsen B, Jensen K, Taylor-Papadimitriou J, Freemont PS (červen 2003). „Lidská PLU-1 má transkripční represivní vlastnosti a interaguje s vývojovými transkripčními faktory BF-1 a PAX9.“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (23): 20507–13. doi:10,1074 / jbc.M301994200. PMID 12657635.
- Patsialou A, Wilsker D, Moran E (2005). "Vlastnosti DNA vazebných proteinů rodiny ARID". Výzkum nukleových kyselin. 33 (1): 66–80. doi:10.1093 / nar / gki145. PMC 546134. PMID 15640446.
- Tzschach A, Lenzner S, Moser B, Reinhardt R, Chelly J, Fryns JP, Kleefstra T, Raynaud M, Turner G, Ropers HH, Kuss A, Jensen LR (duben 2006). „Nové mutace JARID1C / SMCX u pacientů s mentální retardací vázanou na X“. Lidská mutace. 27 (4): 389. doi:10,1002 / humu.9420. PMID 16541399.
- Yamane K, Tateishi K, Klose RJ, Fang J, Fabrizio LA, Erdjument-Bromage H, Taylor-Papadimitriou J, Tempst P, Zhang Y (březen 2007). „PLU-1 je H3K4 demetyláza podílející se na transkripční represi a proliferaci buněk rakoviny prsu“. Molekulární buňka. 25 (6): 801–12. doi:10.1016 / j.molcel.2007.03.001. PMID 17363312.
- Barrett A, Santangelo S, Tan K, Catchpole S, Roberts K, Spencer-Dene B, Hall D, Scibetta A, Burchell J, Verdin E, Freemont P, Taylor-Papadimitriou J (červenec 2007). „Transkripční represor spojený s rakovinou prsu PLU-1 / JARID1B interaguje přímo s histon-deacetylázami“. International Journal of Cancer. 121 (2): 265–75. doi:10.1002 / ijc.22673. PMID 17373667.
externí odkazy
- JARID1B + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.
 | Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |