TAF10 - TAF10
Faktor iniciace transkripce TFIID podjednotka 10 je protein že u lidí je kódován TAF10 gen.[5][6]
Funkce
Zahájení transkripce RNA polymerázou II vyžaduje aktivity více než 70 polypeptidů. Protein, který koordinuje tyto aktivity, je transkripční faktor IID (TFIID), který se váže na promotor jádra, aby správně umístil polymerázu, slouží jako kostra pro sestavení zbytku transkripčního komplexu a působí jako kanál pro regulační signály. TFIID se skládá z proteinu vázajícího TATA (TBP) a skupiny evolučně konzervovaných proteinů známých jako faktory spojené s TBP nebo TAF. TAF se mohou účastnit bazální transkripce, sloužit jako koaktivátory, fungovat při rozpoznávání promotoru nebo modifikovat obecné transkripční faktory (GTF), aby se usnadnilo komplexní sestavení a zahájení transkripce. Tento gen kóduje jednu z malých podjednotek TFIID, která je spojena s podskupinou komplexů TFIID. Studie s lidskými a savčími buňkami ukázaly, že tato podjednotka je nutná pro transkripční aktivaci estrogenovým receptorem, pro postup buněčným cyklem a může být také vyžadována pro určité programy buněčné diferenciace.[6]
Interakce
Bylo prokázáno, že TAF10 komunikovat s TAF9,[7] Homolog transkripčního iniciačního proteinu SPT3,[7][8] TAF13[9] a Protein vázající TATA.[10][11]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000166337 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000043866 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Jacq X, Brou C, Lutz Y, Davidson I, Chambon P, Tora L (listopad 1994). „Lidský TAFII30 je přítomen ve zřetelném komplexu TFIID a je vyžadován pro transkripční aktivaci estrogenovým receptorem.“ Buňka. 79 (1): 107–17. doi:10.1016/0092-8674(94)90404-9. PMID 7923369. S2CID 19698550.
- ^ A b „Entrez Gene: TAF10 TAF10 RNA polymeráza II, faktor spojený s proteinem vázajícím se na TATA box (TBP), 30 kDa“.
- ^ A b Martinez E, Palhan VB, Tjernberg A, Lymar ES, Gamper AM, Kundu TK, Chait BT, Roeder RG (říjen 2001). „Lidský komplex STAGA je transkripční koaktivátor acetylující chromatin, který interaguje s sestřihem pre-mRNA a faktory vázajícími poškození DNA in vivo“. Mol. Buňka. Biol. 21 (20): 6782–95. doi:10.1128 / MCB.21.20.6782-6795.2001. PMC 99856. PMID 11564863.
- ^ Značka M, Moggs JG, Oulad-Abdelghani M, Lejeune F, Dilworth FJ, Stevenin J, Almouzni G, Tora L (červen 2001). „Protein vázající DNA poškozený UV zářením v komplexu TFTC spojuje rozpoznávání poškození DNA s acetylací nukleosomů“. EMBO J.. 20 (12): 3187–96. doi:10.1093 / emboj / 20.12.3187. PMC 150203. PMID 11406595.
- ^ Mengus G, květen M, Jacq X, Staub A, Tora L, Chambon P, Davidson I (duben 1995). "Klonování a charakterizace hTAFII18, hTAFII20 a hTAFII28: tři podjednotky lidského transkripčního faktoru TFIID". EMBO J.. 14 (7): 1520–31. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07138.x. PMC 398239. PMID 7729427.
- ^ Bellorini M, Lee DK, Dantonel JC, Zemzoumi K, Roeder RG, Tora L, Mantovani R (červen 1997). „CCAAT vazebné interakce NF-Y-TBP: NF-YB a NF-YC vyžadují krátké domény sousedící s jejich histonovými skládacími motivy pro asociaci s TBP bazickými zbytky“. Nucleic Acids Res. 25 (11): 2174–81. doi:10.1093 / nar / 25.11.2174. PMC 146709. PMID 9153318.
- ^ Ruppert S, Wang EH, Tjian R (březen 1993). „Klonování a exprese lidského TAFII250: faktor spojený s TBP podílející se na regulaci buněčného cyklu“. Příroda. 362 (6416): 175–9. doi:10.1038 / 362175a0. PMID 7680771. S2CID 4364676.
Další čtení
- Mengus G, květen M, Jacq X, Staub A, Tora L, Chambon P, Davidson I (1995). "Klonování a charakterizace hTAFII18, hTAFII20 a hTAFII28: tři podjednotky lidského transkripčního faktoru TFIID". EMBO J.. 14 (7): 1520–31. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07138.x. PMC 398239. PMID 7729427.
- Zhou Q, Sharp PA (1995). „Nový mechanismus a faktor pro regulaci HIV-1 Tat“. EMBO J.. 14 (2): 321–8. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07006.x. PMC 398086. PMID 7835343.
- Parada CA, Yoon JB, Roeder RG (1995). „Nové omezení transkripce HIV-1 zprostředkované LBP-1 na úrovni prodloužení in vitro“. J. Biol. Chem. 270 (5): 2274–83. doi:10.1074 / jbc.270.5.2274. PMID 7836461.
- Ou SH, Garcia-Martínez LF, Paulssen EJ, Gaynor RB (1994). "Role doprovodných motivů E boxu ve funkci elementu TATA viru lidské imunodeficience typu 1". J. Virol. 68 (11): 7188–99. doi:10.1128 / JVI.68.11.7188-7199.1994. PMC 237158. PMID 7933101.
- Kashanchi F, Piras G, Radonovich MF, Duvall JF, Fattaey A, Chiang CM, Roeder RG, Brady JN (1994). "Přímá interakce lidského TFIID s transaktivátorem HIV-1 tat". Příroda. 367 (6460): 295–9. doi:10.1038 / 367295a0. PMID 8121496. S2CID 4362048.
- Scheer E, Mattei MG, Jacq X, Chambon P, Tora L (1995). „Organizace a chromozomální lokalizace genu (TAF2H) kódujícího lidský TBP asociovaný faktor II 30 (TAFII30)“. Genomika. 29 (1): 269–72. doi:10.1006 / geno.1995.1243. PMID 8530084.
- vom Baur E, Zechel C, Heery D, Heine MJ, Garnier JM, Vivat V, Le Douarin B, Gronemeyer H, Chambon P, Losson R (1996). „Diferenciální interakce závislé na ligandu mezi doménou jaderných receptorů aktivující AF-2 a domnělými transkripčními zprostředkujícími faktory mSUG1 a TIF1“. EMBO J.. 15 (1): 110–24. doi:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00339.x. PMC 449923. PMID 8598193.
- Wang Z, Morris GF, Rice AP, Xiong W, Morris CB (1996). „Mutanty divokého typu a defekty transaktivace defektního proteinu Tat viru lidské imunodeficience typu 1 se vážou na lidský protein vázající TATA in vitro“. J. Acquir. Imunitní deficit. Syndr. Hučení. Retrovirol. 12 (2): 128–38. doi:10.1097/00042560-199606010-00005. PMID 8680883.
- Pendergrast PS, Morrison D, Tansey WP, Hernandez N (1996). „Mutace v karboxyterminální doméně TBP ovlivňují syntézu viru lidské imunodeficience typu 1 v plné délce i v krátkých transkriptech podobně“. J. Virol. 70 (8): 5025–34. doi:10.1128 / JVI.70.8.5025-5034.1996. PMC 190456. PMID 8764009.
- Kashanchi F, Khleif SN, Duvall JF, Sadaie MR, Radonovich MF, Cho M, Martin MA, Chen SY, Weinmann R, Brady JN (1996). „Interakce viru lidské imunodeficience typu 1 Tat s jedinečným místem TFIID inhibuje negativní kofaktor Dr1 a stabilizuje komplex TFIID-TFIIA“. J. Virol. 70 (8): 5503–10. doi:10.1128 / JVI.70.8.5503-5510.1996. PMC 190508. PMID 8764062.
- Zhou Q, Sharp PA (1996). „Tat-SF1: kofaktor pro stimulaci transkripčního prodloužení HIV-1 Tat“. Věda. 274 (5287): 605–10. Bibcode:1996Sci ... 274..605Z. doi:10.1126 / science.274.5287.605. PMID 8849451. S2CID 13266489.
- García-Martínez LF, Ivanov D, Gaynor RB (1997). „Sdružení Tat s purifikovanými preiniciačními komplexy HIV-1 a HIV-2 transkripce“. J. Biol. Chem. 272 (11): 6951–8. doi:10.1074 / jbc.272.11.6951. PMID 9054383.
- Chéhensse V, Boulvin C, Luce S, Tora L, Junien C, Henry I (1997). "Přiřazení lidského genu TAFII30 (TAF2H) k lidskému chromozomovému pásu 11p15.3 s použitím hybridů somatických buněk". Cytogenet. Cell Genet. 76 (1–2): 41–2. doi:10.1159/000134510. PMID 9154123.
- Ogryzko VV, Kotani T, Zhang X, Schiltz RL, Howard T, Yang XJ, Howard BH, Qin J, Nakatani Y (1998). „Histonové TAF v komplexu PCAF histonacetylázy“. Buňka. 94 (1): 35–44. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81219-2. PMID 9674425. S2CID 18942972.
- Vassilev A, Yamauchi J, Kotani T, Prives C, Avantaggiati ML, Qin J, Nakatani Y (1998). „400 kDa podjednotka komplexu PCAF histonacetylázy patří do nadčeledi ATM“. Mol. Buňka. 2 (6): 869–75. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80301-9. PMID 9885574.
- Značka M, Yamamoto K, Staub A, Tora L (1999). „Identifikace komplexních podjednotek obsahujících TAFII bez proteinů vázajících TATA naznačuje roli v acetylaci nukleosomů a signální transdukci“. J. Biol. Chem. 274 (26): 18285–9. doi:10.1074 / jbc.274.26.18285. PMID 10373431.
- Metzger D, Scheer E, Soldatov A, Tora L (1999). „Savčí TAF (II) 30 je vyžadován pro progresi buněčného cyklu a specifické programy buněčné diferenciace.“. EMBO J.. 18 (17): 4823–34. doi:10.1093 / emboj / 18.17.4823. PMC 1171554. PMID 10469660.
- Značka M, Moggs JG, Oulad-Abdelghani M, Lejeune F, Dilworth FJ, Stevenin J, Almouzni G, Tora L (2001). „UV-poškozený protein vázající DNA v komplexu TFTC spojuje rozpoznávání poškození DNA s acetylací nukleosomů“. EMBO J.. 20 (12): 3187–96. doi:10.1093 / emboj / 20.12.3187. PMC 150203. PMID 11406595.
- Gangloff YG, Pointud JC, Thuault S, Carré L, Romier C, Muratoglu S, Brand M, Tora L, Couderc JL, Davidson I (2001). „Složky TFIID, lidské TAF (II) 140 a Drosophila BIP2 (TAF (II) 155), jsou nové metazoanové homology kvasinkového TAF (II) 47 obsahující histonový záhyb a prst PHD“. Mol. Buňka. Biol. 21 (15): 5109–21. doi:10.1128 / MCB.21.15.5109-5121.2001. PMC 87236. PMID 11438666.