Ionový kanál - Ion channel - Wikipedia
Iontové kanály tvoří póry membránové proteiny které umožňují ionty projít póry kanálu. Mezi jejich funkce patří založení a klidový membránový potenciál,[1] tvarování akční potenciály a další elektrické signály pomocí vrata tok ionty přes buněčná membrána, řízení toku iontů napříč sekretářka a epitelové buňky a regulační buňka objem. Iontové kanály jsou přítomny v membránách všech buněk.[2][3] Ionové kanály jsou jednou ze dvou tříd ionoforický proteiny, druhá bytost iontové transportéry.[4]
Studium iontových kanálů často zahrnuje biofyzika, elektrofyziologie, a farmakologie, při použití technik včetně napěťová svorka, svorka, imunohistochemie, Rentgenová krystalografie, fluoroskopie, a RT-PCR. Jejich klasifikace jako molekul se označuje jako channelomics.
Základní vlastnosti
Existují dva charakteristické rysy iontových kanálů, které je odlišují od jiných typů iontových transportních proteinů:[4]
- Rychlost přenosu iontů kanálem je velmi vysoká (často 106 ionty za sekundu nebo vyšší).
- Iony procházejí kanály dolů jejich elektrochemický gradient, což je funkce koncentrace iontů a membránového potenciálu, „z kopce“, bez vstupu (nebo pomoci) metabolické energie (např. ATP, společná přeprava mechanismy, nebo aktivní transport mechanismy).
Ionové kanály jsou umístěny uvnitř membrána všech excitabilních buněk,[3] a mnoha intracelulárních organely. Oni jsou často popisováni jako úzké, vodou naplněné tunely, které umožňují průchod pouze ionty určité velikosti a / nebo náboje. Tato vlastnost se nazývá selektivní propustnost. Pór archetypálního kanálu má v nejužším bodě šířku jen jednoho nebo dvou atomů a je selektivní pro specifické druhy iontů, jako jsou sodík nebo draslík. Některé kanály však mohou být propustné pro průchod více než jednoho typu iontů, obvykle sdílejících společný náboj: kladný (kationty ) nebo negativní (anionty ). Iony se často pohybují segmenty pórů kanálu v jediném souboru téměř tak rychle, jak se ionty pohybují volným řešením. V mnoha iontových kanálech je průchod póry řízen „bránou“, kterou lze otevřít nebo zavřít v reakci na chemické nebo elektrické signály, teplotu nebo mechanickou sílu.
Iontové kanály jsou integrální membránové proteiny, obvykle vytvořené jako sestavy několika jednotlivých proteinů. Takový „multi-podjednotka "sestavy obvykle zahrnují kruhové uspořádání identických nebo homologní proteiny těsně zabalené kolem pórů naplněných vodou rovinou membrány nebo lipidová dvojvrstva.[5][6] Pro většinu napěťově řízené iontové kanály, podjednotky vytvářející póry se nazývají podjednotky α, zatímco pomocné podjednotky se označují β, γ atd.
Biologická role
Protože kanály jsou základem nervový impuls a protože kanály „aktivované vysílačem“ zprostředkovávají vedení přes synapse, kanály jsou obzvláště prominentní součásti nervový systém. Vskutku, četné toxiny že organismy se vyvinuly pro uzavření nervové soustavy predátorů a kořisti (např. jedy produkované pavouky, štíry, hady, rybami, včelami, mořskými šneky a dalšími) fungují modulací vodivosti a / nebo kinetiky iontových kanálů. Iontové kanály jsou navíc klíčovými složkami v celé řadě biologických procesů, které zahrnují rychlé změny v buňkách, jako je např srdeční, kosterní, a hladký sval kontrakce, epiteliální transport živin a iontů, T-buňka aktivace a pankreatické beta-buňka inzulín uvolnění. Při hledání nových léků jsou častým cílem iontové kanály.[7][8][9]
Rozmanitost
V buňkách vnitřního ucha je více než 300 typů iontových kanálů.[10] Iontové kanály lze klasifikovat podle jejich povahy vrata, druh iontů procházející těmito branami, počet bran (pórů) a lokalizace proteinů.
Další heterogenita iontových kanálů vzniká, když jsou kanály s různou konstitutivitou podjednotky vést k určitému druhu proudu.[11] Absence nebo mutace jednoho nebo více přispívajících typů podjednotek kanálu může mít za následek ztrátu funkce a potenciálně základ neurologických onemocnění.
Klasifikace bránou
Iontové kanály lze klasifikovat hradlováním, tj. Tím, co kanály otevírá a zavírá. Například napěťově řízené iontové kanály se otevírají nebo uzavírají v závislosti na gradientu napětí na plazmatické membráně, zatímco iontové kanály řízené ligandem se otevírají nebo uzavírají v závislosti na vazbě ligandy na kanál.
Napěťově řízené
Napěťově řízené iontové kanály se otevírají a zavírají v reakci na membránový potenciál.
- Napěťově řízené sodíkové kanály: Tato rodina má nejméně 9 členů a je z velké části zodpovědná za akční potenciál tvorba a propagace. Podjednotky α tvořící póry jsou velmi velké (až 4 000 aminokyseliny ) a sestávají ze čtyř homologních opakujících se domén (I-IV), z nichž každá obsahuje šest transmembránových segmentů (S1-S6) pro celkem 24 transmembránových segmentů. Členové této rodiny také spolupracují s pomocnými β podjednotkami, z nichž každá jednou překlenuje membránu. Podjednotky α i β jsou značně rozšířené glykosylovaný.
- Napěťově řízené vápníkové kanály: Tato rodina obsahuje 10 členů, i když je známo, že spolupracují s α2δ, β a γ podjednotky. Tyto kanály hrají důležitou roli jak v propojení svalové excitace s kontrakcí, tak v neuronální excitaci s uvolněním vysílače. Podjednotky α mají celkovou strukturální podobnost s podjednotkami sodíkových kanálů a jsou stejně velké.
- Kationtové kanály spermií: Tato malá skupina kanálů, obvykle označovaná jako kanály Catsper, souvisí s kanály s dvěma póry a vzdáleně souvisí s Kanály TRP.
- Napěťově řízené draselné kanály (K.PROTI): Tato rodina obsahuje téměř 40 členů, kteří jsou dále rozděleni do 12 podskupin. Tyto kanály jsou známé hlavně pro svou roli při repolarizaci buněčné membrány akční potenciály. Α podjednotky mají šest transmembránových segmentů, homologních k jedné doméně sodíkových kanálů. Odpovídajícím způsobem se shromažďují jako tetramery produkovat fungující kanál.
- Nějaký přechodné kanály potenciálního receptoru: Tato skupina kanálů, obvykle označovaná jednoduše jako kanály TRP, je pojmenována podle jejich role v Drosophila fototransdukce. Tato rodina, která má nejméně 28 členů, je neuvěřitelně různorodá ve způsobu aktivace. Některé kanály TRP se zdají být konstitutivně otevřené, zatímco jiné jsou brány bránou Napětí, intracelulární Ca.2+, pH, redoxní stav, osmolarita a mechanické roztažení. Tyto kanály se také liší podle iontů, které procházejí, některé jsou selektivní pro Ca2+ zatímco jiné jsou méně selektivní a působí jako kationické kanály. Tato rodina je rozdělena do 6 podskupin na základě homologie: klasická (TRPC ), vaniloidní receptory (TRPV ), melastatin (TRPM ), polycystiny (TRPP ), mukolipiny (TRPML ), a ankyrinový transmembránový protein 1 (TRPA ).
- Hyperpolarizace aktivována kanály řízené cyklickými nukleotidy: Otevření těchto kanálů je způsobeno hyperpolarizace spíše než depolarizace požadovaná pro jiné kanály řízené cyklickými nukleotidy. Tyto kanály jsou také citlivé na cyklické nukleotidy tábor a cGMP, které mění napěťovou citlivost otevření kanálu. Tyto kanály jsou propustné pro jednomocné kationty K.+ a Na+. Existují 4 členové této rodiny, z nichž všichni tvoří tetramery šesti transmembránových podjednotek α. Protože se tyto kanály otevírají za podmínek hyperpolarizace, fungují jako kardiostimulace kanály v srdci, zejména Uzel SA.
- Napěťově řízené protonové kanály: Napěťově řízené protonové kanály se otevírají depolarizací, ale silně citlivě na pH. Výsledkem je, že tyto kanály se otevírají pouze tehdy, když je elektrochemický gradient směrem ven, takže jejich otevření umožní protonům pouze opustit buňky. Jejich funkcí se tedy zdá být vytlačování kyselin z buněk. Další důležitá funkce se vyskytuje ve fagocytech (např. eosinofily, neutrofily, makrofágy ) během „respiračního výbuchu“. Když jsou bakterie nebo jiné mikroby pohlceny fagocyty, enzymem NADPH oxidáza se shromáždí v membráně a začne produkovat reaktivní formy kyslíku (ROS), které pomáhají zabíjet bakterie. NADPH oxidáza je elektrogenní, pohybuje se elektrony přes membránu a protonové kanály se otevírají, aby tok protonů umožňoval elektricky vyrovnat pohyb elektronů.
Ligand-bránou (neurotransmiter)
Také známý jako ionotropní receptory se tato skupina kanálů otevírá v reakci na specifické molekuly ligandu vázající se na extracelulární doménu receptorového proteinu. Vazba ligandu způsobí konformační změnu ve struktuře kanálového proteinu, která nakonec vede k otevření brány kanálu a následnému toku iontů přes plazmatickou membránu. Mezi příklady takových kanálů patří kation propustný „nikotinový“ acetylcholinový receptor, ionotropní receptory řízené glutamátem, iontové kanály snímající kyselinu (ASIC ),[12] P2P receptory s ATP bránou, a anion-propustná kyselina y-aminomáselná s bránou GABAA receptor.
Ionové kanály aktivované druhými posly mohou být také zařazeny do této skupiny ligandy a druzí poslové se jinak navzájem odlišují.
Lipidové brány
Tato skupina kanálů se otevírá v reakci na konkrétní lipid molekuly vázající se na transmembránovou doménu kanálu typicky blízko vnitřního letáku plazmatické membrány.[13] Fosfatidylinositol 4,5-bisfosfát (PIP2 ) a kyselina fosfatidová (PA ) jsou nejlépe charakterizované lipidy, které brání těmto kanálům.[14][15][16] Mnoho z únikových draslíkových kanálů je řízeno lipidy, včetně dovnitř usměrňující draselné kanály a dva draslíkové kanály domény pórů TREK-1 a TRAAK. Rodina draselných kanálů KCNQ jsou brány pomocí PIP2.[17] Napěťově aktivovaný draslíkový kanál (Kv) je regulován PA. Jeho střed aktivace se posune o 50 mV při hydrolýze PA, téměř v klidových membránových potenciálech.[18] To naznačuje, že Kv by mohlo být otevřeno lipidovou hydrolýzou nezávisle na napětí a může tento kanál kvalifikovat jako duální lipidový a napěťově řízený kanál.
Ostatní brány
Součástí brány je také aktivace a deaktivace pomocí druhí poslové zevnitř buněčná membrána - spíše než zvnějšku buňky, jako v případě ligandů.
- Některé draslíkové kanály:
- Vnitřní kanály usměrňovače draslíku: Tyto kanály umožňují, aby ionty draslíku proudily do buňky způsobem „směřujícím dovnitř“: draslík proudí účinněji do buňky než z buňky ven. Tato rodina se skládá z 15 oficiálních a 1 neoficiálního člena a je dále rozdělena do 7 podskupin na základě homologie. Tyto kanály jsou ovlivněny intracelulárně ATP, PIP2, a G-protein βγ podjednotky. Podílejí se na důležitých fyziologických procesech, jako je činnost kardiostimulátoru v srdci, uvolňování inzulínu a absorpce draslíku gliové buňky. Obsahují pouze dva transmembránové segmenty, které odpovídají segmentům jádra tvořícím póry K.PROTI a K.Ca. kanály. Jejich α podjednotky tvoří tetramery.
- Vápníkem aktivované draselné kanály: Tato rodina kanálů je aktivována intracelulárním Ca2+ a obsahuje 8 členů.
- Draselný kanál v doméně tandemových pórů: Tato rodina 15 členů tvoří to, co je známé jako únikové kanály a zobrazí se Goldman-Hodgkin-Katz (otevřeno) náprava. Na rozdíl od jejich běžného názvu „draslíkové kanály se dvěma póry v doméně“ mají tyto kanály pouze jednu pórovou, ale dvě pórovou doménu na podjednotku.[19][20]
- Kanály se dvěma póry zahrnují kanály s ligátovými a napěťově řízenými kationty, tzv. protože obsahují dvě podjednotky tvořící póry. Jak naznačuje jejich název, mají dva póry.[21][22][23][24][25]
- Kanály se světelnou bránou jako channelrhodopsin jsou přímo otevřeny fotony.
- Mechanosenzitivní iontové kanály otevřít pod vlivem roztažení, tlaku, smyku a posunutí.
- Kanály řízené cyklickými nukleotidy: Tato nadrodina kanálů obsahuje dvě rodiny: kanály s cyklickými nukleotidy (CNG) a kanály s hyperpolarizací aktivované, kanály s cyklickými nukleotidy (HCN). Toto seskupení je spíše funkční než evoluční.
- Kanály řízené cyklickými nukleotidy: Tato skupina kanálů je charakterizována aktivací buď intracelulárně tábor nebo cGMP. Tyto kanály jsou primárně propustné pro jednomocné kationty, jako je K.+ a Na+. Jsou také propustné pro Ca2+, i když jedná o jejich uzavření. Existuje 6 členů této rodiny, která je rozdělena do 2 podskupin.
- Hyperpolarizace aktivována kanály řízené cyklickými nukleotidy
- Teplotně řízené kanály: Členové přechodný receptorový potenciální iontový kanál nadčeleď, jako např TRPV1 nebo TRPM8, se otevírají horkými nebo studenými teplotami.
Klasifikace podle typu iontů
- Chloridové kanály: Tato nadrodina kanálů se skládá z přibližně 13 členů. Zahrnují ClC, CLIC, Bestrophins a CFTR. Tyto kanály jsou neselektivní pro malé anionty; nicméně chlorid je nejhojnější anion, a proto jsou známé jako chloridové kanály.
- Draselné kanály
- Napěťově řízené draselné kanály např. Kvs, Kirs atd.
- Vápníkem aktivované draselné kanály např. BKCa nebo MaxiK, SK atd.
- Vnitřní kanály usměrňovače draslíku
- Dvouporézní draselné kanály: Tato rodina 15 členů tvoří to, co je známé jako únikové kanály a zobrazí se Goldman-Hodgkin-Katz (otevřeno) náprava.
- Sodné kanály
- Vápníkové kanály (CaV)
- Protonové kanály
- Neselektivní kanály kationtů: Tyto neselektivně umožňují mnoho druhů kationtů, zejména Na+, K.+ a Ca2+prostřednictvím kanálu.
Klasifikace podle buněčné lokalizace
Ionové kanály jsou také klasifikovány podle jejich subcelulární lokalizace. Plazmatická membrána tvoří přibližně 2% celkové membrány v buňce, zatímco intracelulární organely obsahují 98% buněčné membrány. Hlavní intracelulární oddíly jsou endoplazmatické retikulum, Golgiho aparát, a mitochondrie. Na základě lokalizace jsou iontové kanály klasifikovány jako:
- Kanály plazmové membrány
- Příklady: Napěťově řízené draselné kanály (Kv), sodíkové kanály (Nav), vápníkové kanály (Cav) a chloridové kanály (ClC)
- Intracelulární kanály, které se dále dělí na různé organely
- Endoplazmatické retikulum kanály: RyR, SERCA, ORAi
- Mitochondriální kanály: mPTP, KATP, BK, IK, CLIC5, Kv7.4 na vnitřní membráně a VDAC a CLIC4 jako vnější membránové kanály.
Další klasifikace
Některé iontové kanály jsou klasifikovány podle doby jejich reakce na podněty:
- Potenciální kanály přechodného receptoru: Tato skupina kanálů, obvykle označovaná jednoduše jako kanály TRP, je pojmenována podle jejich role v Drosophila vizuální fototransdukce. Tato rodina, která má nejméně 28 členů, má různé mechanismy aktivace. Některé kanály TRP zůstávají konstitutivně otevřené, zatímco jiné jsou brány Napětí, intracelulární Ca2+, pH, redox Stát, osmolarita, a mechanické roztažení. Tyto kanály se také liší podle iontů, které procházejí, některé jsou selektivní pro Ca2+ zatímco jiné jsou méně selektivní kationové kanály. Tato rodina je rozdělena do 6 podrodin založených na homologii: kanonický TRP (TRPC ), vaniloidní receptory (TRPV ), melastatin (TRPM ), polycystiny (TRPP ), mukolipiny (TRPML ), a ankyrinový transmembránový protein 1 (TRPA ).
Podrobná struktura
Kanály se liší vzhledem k iontu, který propustí (například Na+, K.+, Cl− ), způsoby, kterými mohou být regulovány, počet podjednotek, z nichž jsou složeny, a další aspekty struktury.[27] Kanály patřící k největší třídě, které zahrnují napěťově řízené kanály, které jsou základem nervového impulsu, se skládají ze čtyř podjednotek se šesti transmembránové šroubovice každý. Při aktivaci se tyto šroubovice pohybují a otevírají póry. Dvě z těchto šesti šroubovic jsou odděleny smyčkou, která lemuje póry a je primárním determinantem iontové selektivity a vodivosti v této třídě kanálu a některých dalších. Existenci a mechanismus iontové selektivity poprvé postuloval koncem 60. let 20. století Bertil Hille a Clay Armstrong.[28][29][30][31][32] Myšlenka iontové selektivity pro draslíkové kanály spočívala v tom, že karbonylové kyslíky proteinových páteří „selektivního filtru“ (pojmenované Bertil Hille ) mohl účinně nahradit molekuly vody, které normálně chrání ionty draslíku, ale že ionty sodíku byly menší a nelze je úplně dehydratovat, aby umožnily takové stínění, a proto nemohly projít. Tento mechanismus byl nakonec potvrzen, když byla objasněna první struktura iontového kanálu. Jako model pro studium permeability a selektivity iontových kanálů v Mackinnonově laboratoři byl použit bakteriální draselný kanál KcsA, který se skládá pouze z filtru selektivity, smyčky „P“ a dvou transmembránových šroubovic. Stanovení molekulární struktury KcsA pomocí Roderick MacKinnon použitím Rentgenová krystalografie získal podíl z roku 2003 Nobelova cena za chemii.[33]
Vzhledem k jejich malé velikosti a obtížnosti krystalizace integrálních membránových proteinů pro rentgenovou analýzu je teprve nedávno vědci schopni přímo zkoumat, jak kanály „vypadají“. Zejména v případech, kdy krystalografie vyžadovala odstranění kanálů z jejich membrán detergentem, mnozí vědci považují snímky, které byly získány, za předběžné. Příkladem je dlouho očekávaná krystalová struktura napěťově řízeného draslíkového kanálu, která byla uvedena v květnu 2003.[34][35] Jedna nevyhnutelná nejednoznačnost těchto struktur souvisí se silným důkazem, že kanály mění konformaci, když pracují (například se otevírají a zavírají), takže struktura v krystalu může představovat kterýkoli z těchto provozních stavů. Většina z toho, co vědci odvodili o provozu kanálu, doposud vytvořili elektrofyziologie, biochemie, gen porovnání sekvence a mutageneze.
Kanály mohou mít jednu (CLIC) až více transmembránových (K kanály, P2X receptory, Na kanály) domény, které překlenují plazmatickou membránu a vytvářejí póry. Pór může určit selektivitu kanálu. Brána může být vytvořena uvnitř nebo vně oblasti pórů.
Farmakologie
Chemické látky mohou modulovat aktivitu iontových kanálů, například jejich blokováním nebo aktivací.
Blokátory iontových kanálů
Různé blokátory iontových kanálů (anorganické a organické molekuly) mohou modulovat aktivitu a vodivost iontových kanálů. Některé běžně používané blokátory zahrnují:
- Tetrodotoxin (TTX), používaný puffer ryby a některé typy Mloci pro obranu. Blokuje sodíkové kanály.
- Saxitoxin vyrábí společnost a dinoflagellate také známý jako "červený příliv Blokuje sodíkové kanály závislé na napětí.
- Konotoxin je používán šnečí šišky lovit kořist.
- Lidokain a Novokain patří do třídy lokální anestetika které blokují sodíkové iontové kanály.
- Dendrotoxin vyrábí mamba hadi a blokuje draslíkové kanály.
- Iberiotoxin vyrábí společnost Buthus tamulus (Východní indický štír) a blokuje draslíkové kanály.
- Heteropodatoxin vyrábí Heteropoda venatoria (hnědý lovec pavouk nebo laya) a blokuje draslíkové kanály.
Aktivátory iontových kanálů
Je známo několik sloučenin, které podporují otevírání nebo aktivaci specifických iontových kanálů. Jsou klasifikovány podle kanálu, na kterém jednají:
- Otevírače vápníkových kanálů, jako Bay K8644
- Otevírače chloridových kanálů, jako fenanthrolin
- Otvírače draslíkových kanálů, jako minoxidil
- Otvírače sodíkových kanálů, jako DDT
Nemoci
Existuje řada poruch, které narušují normální fungování iontových kanálů a mají katastrofální následky pro organismus. Genetické a autoimunitní poruchy iontových kanálů a jejich modifikátory jsou známé jako channelopatie. Vidět Kategorie: Channelopatie pro úplný seznam.
- Shaker gen mutace způsobují poruchu napěťově řízených iontových kanálů a zpomalují repolarizaci buňky.
- Koně hyperkalemická periodická paralýza stejně jako lidská hyperkalemická periodická paralýza (HyperPP) jsou způsobeny vadou napěťově závislých sodíkových kanálů.
- Paramyotonia congenita (PC) a draslíkem zhoršené myotonie (PAM)
- Generalizovaná epilepsie s febrilními záchvaty plus (GEFS +)
- Epizodická ataxie (EA), charakterizovaný sporadickými záchvaty silné diskoordinace s nebo bez myokymie, a může být vyprovokován stresem, vyděšením nebo silnou námahou, jako je cvičení.
- Familiární hemiplegická migréna (FHM)
- Spinocerebelární ataxie typu 13
- Syndrom dlouhého QT je komorové arytmie syndrom zapříčiněno mutace v jednom nebo více ze současných deseti různých geny, z nichž většina jsou draslíkové kanály a všechny ovlivňují srdce repolarizace.
- Brugadův syndrom je další ventrikulární arytmie způsobená napěťově řízený sodíkový kanál genové mutace.
- Polymicrogyria je vývojová malformace mozku způsobená napěťově řízený sodíkový kanál a NMDA receptor genové mutace.[36]
- Cystická fibróza je způsobena mutacemi v genu CFTR, což je chloridový kanál.
- Mukolipidóza typu IV je způsobena mutacemi v genu kódujícím TRPML1 kanál
- Mutace a nadměrná exprese iontových kanálů jsou důležitými událostmi v rakovinných buňkách. v Glioblastoma multiforme Upregulace draslíkových kanálů gBK a chloridových kanálů ClC-3 umožňuje migraci buněk glioblastomu v mozku, což může vést k difúznímu růstu těchto nádorů.[37]
Dějiny
Britové analyzovali základní vlastnosti proudů zprostředkovaných iontovými kanály biofyzici Alan Hodgkin a Andrew Huxley jako součást jejich Nobelova cena -výherní výzkum na akční potenciál, publikované v roce 1952. Vycházely z práce dalších fyziologů, jako byl Cole a Bakerův výzkum pólů membrány s napětím od roku 1941.[38][39] Existenci iontových kanálů potvrdila v 70. letech 20. století Bernard Katz a Ricardo Miledi pomocí analýzy šumu. To bylo pak zobrazeno více přímo s elektrická záznamová technika známý jakosvorka “, což vedlo k Nobelově ceně za Erwin Neher a Bert Sakmann, vynálezci této techniky. Stovky, ne-li tisíce vědců, pokračují v podrobnějším porozumění fungování těchto proteinů. V posledních letech byl vývoj automatická upínací zařízení pomohl výrazně zvýšit propustnost při screeningu iontových kanálů.
Nobelova cena za chemii za rok 2003 byla udělena Roderick MacKinnon za studium fyzikálně-chemických vlastností struktury a funkce iontových kanálů, včetně rentgenové krystalografické struktura studie.
Kultura
Roderick MacKinnon do provozu Zrození nápadu, 5 stop (1,5 m) vysoká socha založená na KcsA draslíkový kanál.[40] Předloha obsahuje drátěný předmět představující vnitřek kanálu s objektem z foukaného skla představujícím hlavní dutinu struktury kanálu.
Viz také
- Alfa šroubovice
- Rodina iontových kanálů jak je definováno v Pfam a InterPro
- K.i Databáze
- Iontové kanály lipidové dvouvrstvy
- Transport hořčíku
- Neurotoxin
- Pasivní doprava
- Syntetické iontové kanály
- Transmembránový receptor
Reference
- ^ Abdul Kadir L, Stacey M, Barrett-Jolley R (2018). „Rozvíjející se role membránového potenciálu: Akce nad rámec akčního potenciálu“. Hranice ve fyziologii. 9: 1661. doi:10.3389 / fphys.2018.01661. PMC 6258788. PMID 30519193.
- ^ Alexander SP, Mathie A, Peters JA (listopad 2011). „Ion Channels“. British Journal of Pharmacology. 164 (Suppl 1): S137 – S174. doi:10.1111 / j.1476-5381.2011.01649_5.x. PMC 3315630.
- ^ A b „Ion Channel“. Upravitelné. 2014. Citováno 2019-05-28.
- ^ A b Hille B (2001) [1984]. Iontové kanály vzrušivých membrán (3. vyd.). Sunderland, Massachusetts: Sinauer Associates, Inc. str. 5. ISBN 978-0-87893-321-1.
- ^ Purves D, Augustine GJ, Fitzpatrick D, Katz LC, LaMantia A, McNamara JO, Williams SM, eds. (2001). „Kapitola 4: Kanály a transportéry“. Neurovědy (2. vyd.). Sinauer Associates Inc. ISBN 978-0-87893-741-7.
- ^ Hille B, Catterall WA (1999). „Kapitola 6: Elektrická vzrušivost a iontové kanály“. In Siegel GJ, Agranoff BW, Albers RW, Fisher SK, Uhler MD (eds.). Základní neurochemie: molekulární, buněčné a lékařské aspekty. Philadelphia: Lippincott-Raven. ISBN 978-0-397-51820-3.
- ^ Camerino DC, Tricarico D, Desaphy JF (duben 2007). „Farmakologie iontových kanálů“. Neuroterapeutika. 4 (2): 184–98. doi:10.1016 / j.nurt.2007.01.013. PMID 17395128.
- ^ Verkman AS, Galietta LJ (únor 2009). „Chloridové kanály jako lékové cíle“. Recenze přírody. Objev drog. 8 (2): 153–71. doi:10.1038 / nrd2780. PMC 3601949. PMID 19153558.
- ^ Camerino DC, Desaphy JF, Tricarico D, Pierno S, Liantonio A (2008). Terapeutické přístupy k onemocněním iontových kanálů. Pokroky v genetice. 64. 81–145. doi:10.1016 / S0065-2660 (08) 00804-3. ISBN 978-0-12-374621-4. PMID 19161833.
- ^ Gabashvili IS, Sokolowski BH, Morton CC, Giersch AB (září 2007). "Genová exprese iontového kanálu ve vnitřním uchu". Časopis Asociace pro výzkum v otolaryngologii. 8 (3): 305–28. doi:10.1007 / s10162-007-0082-r. PMC 2538437. PMID 17541769.
- ^ Vicini S (duben 1999). "Nové pohledy na funkční roli heterogenity kanálu GABA (A)". Molekulární neurobiologie. 19 (2): 97–110. doi:10.1007 / BF02743656. PMID 10371465. S2CID 5832189.
- ^ Hanukoglu I (únor 2017). „Sodné kanály typu ASIC a ENaC: konformační stavy a struktury iontových selektivních filtrů“. FEBS Journal. 284 (4): 525–545. doi:10.1111 / febs.13840. PMID 27580245. S2CID 24402104.
- ^ Hansen SB (květen 2015). „Lipidový agonismus: PIP2 paradigma iontových kanálů řízených ligandem“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - molekulární a buněčná biologie lipidů. 1851 (5): 620–8. doi:10.1016 / j.bbalip.2015.01.011. PMC 4540326. PMID 25633344.
- ^ Hansen SB, Tao X, MacKinnon R (srpen 2011). "Strukturální základ aktivace PIP2 klasického dovnitř usměrňovače K + kanál Kir2.2". Příroda. 477 (7365): 495–8. Bibcode:2011Natur.477..495H. doi:10.1038 / příroda10370. PMC 3324908. PMID 21874019.
- ^ Gao Y, Cao E, Julius D, Cheng Y (červen 2016). „Struktury TRPV1 v nanodiscích odhalují mechanismy působení ligandu a lipidů“. Příroda. 534 (7607): 347–51. Bibcode:2016Natur.534..347G. doi:10.1038 / příroda17964. PMC 4911334. PMID 27281200.
- ^ Cabanos C, Wang M, Han X, Hansen SB (srpen 2017). „2 Antagonismus kanálů TREK-1“. Zprávy buněk. 20 (6): 1287–1294. doi:10.1016 / j.celrep.2017.07.034. PMC 5586213. PMID 28793254.
- ^ Brown DA, Passmore GM (duben 2009). „Neural KCNQ (Kv7) kanály“. British Journal of Pharmacology. 156 (8): 1185–95. doi:10.1111 / j.1476-5381.2009.00111.x. PMC 2697739. PMID 19298256.
- ^ Hite RK, Butterwick JA, MacKinnon R (říjen 2014). "Modulace fosfatidové kyseliny na funkci snímače napětí kanálu Kv". eLife. 3. doi:10,7554 / eLife.04366. PMC 4212207. PMID 25285449.
- ^ „Dva kanály draslíku v doméně P“. Průvodce farmakologií. Citováno 2019-05-28.
- ^ Rang HP (2003). Farmakologie (8. vydání). Edinburgh: Churchill Livingstone. p.59. ISBN 978-0-443-07145-4.
- ^ Kintzer AF, Stroud RM (březen 2016). "Struktura, inhibice a regulace dvoupólového kanálu TPC1 z Arabidopsis thaliana". Příroda. 531 (7593): 258–62. Bibcode:2016Natur.531..258K. bioRxiv 10.1101/041400. doi:10.1038 / příroda17194. PMC 4863712. PMID 26961658.
Kromě kanálů Ca2 + a Na +, které jsou tvořeny čtyřmi intramolekulárními repeticemi, které společně tvoří póry tetramerního kanálu, měl nový kanál jen dvě Shakerova opakování, z nichž každá byla vybavena jednou doménou pórů. Kvůli této neobvyklé topologii byl tento kanál přítomný u zvířat i rostlin pojmenován Two Pore Channel1 (TPC1).
- ^ Spalding EP, Harper JF (prosinec 2011). „Vstupy a výstupy buněčného transportu Ca (2+)“. Aktuální názor na biologii rostlin. 14 (6): 715–20. doi:10.1016 / j.pbi.2011.08.001. PMC 3230696. PMID 21865080.
Nejlepším kandidátem na vakuolární uvolňovací kanál Ca2 + je TPC1, homolog savčího napěťově řízeného kanálu Ca2 +, který má dva póry a dvanáct rozpětí membrány.
- ^ Brown BM, Nguyen HM, Wulff H (2019-01-30). „Nedávný pokrok v našem chápání struktury a funkce neobvyklejších kationtových kanálů“. F1000Výzkum. 8: 123. doi:10.12688 / F1000Research.17163.1. PMC 6354322. PMID 30755796.
Organelární dvoupórovité kanály (TPC) jsou zajímavým typem kanálu, který, jak název napovídá, má dva póry.
- ^ Jammes F, Hu HC, Villiers F, Bouten R, Kwak JM (listopad 2011). "Kanály propustné pro vápník v rostlinných buňkách". FEBS Journal. 278 (22): 4262–76. doi:10.1111 / j.1742-4658.2011.08369.x. PMID 21955583. S2CID 205884593.
Předpokládá se, že dvoupórový kanál Arabidopsis (AtTPC1) má 12 transmembránových šroubovic a dva póry (červené čáry).
- ^ Hooper R (září 2011). Molekulární charakterizace dvoupórových kanálů s bránou NAADP (PDF) (Teze).
Předpokládá se, že TPC se svými dvěma póry dimerizují a tvoří funkční kanál.
- ^ Hanukoglu I, Hanukoglu A (duben 2016). „Rodina epitelových sodíkových kanálů (ENaC): fylogeneze, struktura-funkce, distribuce tkání a související dědičná onemocnění“. Gen. 579 (2): 95–132. doi:10.1016 / j.gene.2015.12.061. PMC 4756657. PMID 26772908.
- ^ Lim C, Dudev T (2016). "Selektivita draslíku versus sodíku v monovalentních filtrech selektivity iontových kanálů". V Sigel A, Sigel H, Sigel R (eds.). Ionty alkalických kovů: jejich role pro život. Kovové ionty v biologických vědách. 16. Springer. s. 325–47. doi:10.1007/978-3-319-21756-7_10. ISBN 978-3-319-21755-0. PMID 26860306.
- ^ Hille B (Prosinec 1971). „Propustnost sodíkového kanálu pro organické kationty v myelinizovaném nervu“. The Journal of General Physiology. 58 (6): 599–619. doi:10.1085 / jgp.58.6.599. PMC 2226049. PMID 5315827.
- ^ Bezanilla F, Armstrong CM (listopad 1972). „Negativní vodivost způsobená vstupem iontů sodíku a cesia do draslíkových kanálů chobotnicových axonů“. The Journal of General Physiology. 60 (5): 588–608. doi:10,1085 / jgp.60.5.588. PMC 2226091. PMID 4644327.
- ^ Hille B (Červen 1973). „Draslíkové kanály v myelinovaném nervu. Selektivní permeabilita pro malé kationty“. The Journal of General Physiology. 61 (6): 669–86. doi:10.1085 / jgp.61.6.669. PMC 2203488. PMID 4541077.
- ^ Hille B (Listopad 1975). „Iontová selektivita, saturace a blokování v sodíkových kanálech. Model se čtyřmi bariéry“. The Journal of General Physiology. 66 (5): 535–60. doi:10.1085 / jgp.66.5.535. PMC 2226224. PMID 1194886.
- ^ Hille B (Březen 2018). "Journal of General Physiology: Membrane permeation and ion selectivity". The Journal of General Physiology. 150 (3): 389–400. doi:10.1085 / jgp.201711937. PMC 5839722. PMID 29363566.
- ^ Doyle DA, Morais Cabral J, Pfuetzner RA, Kuo A, Gulbis JM, Cohen SL a kol. (Duben 1998). "Struktura draslíkového kanálu: molekulární základ vedení K + a selektivita". Věda. 280 (5360): 69–77. Bibcode:1998Sci ... 280 ... 69D. doi:10.1126 / science.280.5360.69. PMID 9525859.
- ^ Jiang Y, Lee A, Chen J, Ruta V, Cadene M, Chait BT, MacKinnon R (květen 2003). "Rentgenová struktura kanálu K + závislého na napětí". Příroda. 423 (6935): 33–41. Bibcode:2003 Natur.423 ... 33J. doi:10.1038 / nature01580. PMID 12721618. S2CID 4347957.
- ^ Lunin VV, Dobrovetsky E, Khutoreskaya G, Zhang R, Joachimiak A, Doyle DA a kol. (Duben 2006). "Krystalová struktura transportéru CorA Mg2 +". Příroda. 440 (7085): 833–7. Bibcode:2006 Natur.440..833L. doi:10.1038 / nature04642. PMC 3836678. PMID 16598263.
- ^ Smith RS, Walsh CA (únor 2020). „Funkce iontového kanálu v raném vývoji mozku“. Trendy v neurovědách. 43 (2): 103–114. doi:10.1016 / j.tins.2019.12.004. PMC 7092371. PMID 31959360.
- ^ Molenaar RJ (2011). "Ion kanály v glioblastomu". ISRN neurologie. 2011: 590249. doi:10.5402/2011/590249. PMC 3263536. PMID 22389824.
- ^ Pethig R, Kell DB (srpen 1987). „Pasivní elektrické vlastnosti biologických systémů: jejich význam ve fyziologii, biofyzice a biotechnologii“ (PDF). Fyzika v medicíně a biologii. 32 (8): 933–70. Bibcode:1987PMB .... 32..933P. doi:10.1088/0031-9155/32/8/001. PMID 3306721.
Rozsáhlý přehled bioelektrických charakteristik z roku 1987 ... pozorování indukčnosti (záporné kapacity) Cole a Baker (1941) během měření střídavých elektrických vlastností axonů chobotnic vedlo přímo k konceptu pórů membrány s napětím, jak je ztělesněno oslavovanou Hodgkin-Huxleyovou (1952) léčbou (Cole 1972, Jack er a1 1975), jako klíčový mechanismus neurotransmise.
- ^ Cole KS, Baker RF (červenec 1941). „Podélná impedance chobotnice obrovského axonu“. The Journal of General Physiology. Rockefeller University Press. 24 (6): 771–88. doi:10.1085 / jgp.24.6.771. PMC 2238007. PMID 19873252.
Popisuje, co se stane, když nalepíte a obří chobotnice axon s elektrodami a projít střídavým proudem, a pak si všimněte, že někdy napětí stoupá s časem, a někdy klesá. Indukční reaktance je vlastností axonu a vyžaduje, aby obsahovala indukční strukturu. Variace impedance s interpolární vzdáleností naznačuje, že indukčnost je v membráně
- ^ Ples P (březen 2008). „Kelímek: Umění inspirované vědou by mělo být víc než jen pěkný obrázek“. Chemický svět. 5 (3): 42–43. Citováno 2009-01-12.
externí odkazy
- „Napěťově řízené iontové kanály“. Databáze IUPHAR receptorů a iontových kanálů. Mezinárodní unie základní a klinické farmakologie.
- „TRIP Database“. ručně upravená databáze interakcí protein-protein pro savčí TRP kanály.
- Ionové kanály v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)