BTAF1 - BTAF1

BTAF1
Identifikátory
Aliasy	BTAF1, MOT1, TAF (II) 170, TAF172, TAFII170, B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1
Externí ID	OMIM: 605191 MGI: 2147538 HomoloGene: 31978 Genové karty: BTAF1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 10 (lidský)
Konec	92,030,325 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 19 (myš)
Konec	37,012,752 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • Vazba DNA; • vazba nukleotidů; • aktivita hydrolázy; • ATP vazba; • GO: Aktivita helikázy 0008026; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• intracelulární membránou vázaná organela; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • negativní regulace vazby chromatinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9044
	107182
	ENSG00000095564
	ENSMUSG00000040565
	O14981; Q2M1V9
	E9QAE3
	NM_003972
	NM_001080706
	NP_003963; NP_003963.1
	NP_001074175
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Faktor vázající se na TATA 172 je protein že u lidí je kódován BTAF1 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Zahájení transkripce RNA polymerázou II vyžaduje pomoc proteinu vázajícího se na TATA box (TBP; MIM 600075) a faktorů spojených s TBP nebo TAF (např. TAF2B; MIM 604912), ve 2 odlišných komplexech, TFIID a B-TFIID. Komplex TFIID se skládá z TBP a více než 8 TAF. Většina TBP je však přítomna v komplexu B-TFIID, který se skládá z TBP a TAFII170, také nazývaných TAF172, a má aktivitu DNA-dependentní ATPázy [dodáváno společností OMIM]^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že BTAF1 komunikovat s Protein vázající TATA.^[6]^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000095564 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040565 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ van der Knaap JA, Borst JW, van der Vliet PC, Gentz R, Timmers HT (prosinec 1997). „Klonování cDNA pro podjednotku faktoru II170 spojenou s proteinem TATA transkripčního faktoru B-TFIID odhaluje homologii s globálními regulátory transkripce v kvasinkách a Drosophile“. Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (22): 11827–32. doi:10.1073 / pnas.94.22.11827. PMC 23617. PMID 9342322.
^ ^A ^b Chicca JJ, Auble DT, Pugh BF (březen 1998). „Klonování a biochemická charakterizace TAF-172, lidského homologu kvasinek Mot1“. Mol Cell Biol. 18 (3): 1701–10. doi:10.1128 / MCB.18.3.1701. PMC 108885. PMID 9488487.
^ ^A ^b "Entrez Gene: BTAF1 BTAF1 RNA polymeráza II, asociovaný s transkripčním faktorem B-TFIID, 170 kDa (homolog Mot1, S. cerevisiae)".
^ Scully R, Anderson SF, Chao DM, Wei W, Ye L, Young RA, Livingston DM, Parvin JD (květen 1997). „BRCA1 je složkou holoenzymu RNA polymerázy II“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94 (11): 5605–10. doi:10.1073 / pnas.94.11.5605. PMC 20825. PMID 9159119.

externí odkazy

Člověk BTAF1 umístění genomu a BTAF1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Zhou Q, Sharp PA (1995). „Nový mechanismus a faktor pro regulaci HIV-1 Tat“. EMBO J.. 14 (2): 321–8. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07006.x. PMC 398086. PMID 7835343.
Parada CA, Yoon JB, Roeder RG (1995). „Nové omezení LBP-1 zprostředkované omezení transkripce HIV-1 na úrovni prodloužení in vitro“. J. Biol. Chem. 270 (5): 2274–83. doi:10.1074 / jbc.270.5.2274. PMID 7836461.
Ou SH, Garcia-Martínez LF, Paulssen EJ, Gaynor RB (1994). "Role doprovodných motivů E boxu ve funkci elementu TATA viru lidské imunodeficience typu 1". J. Virol. 68 (11): 7188–99. doi:10.1128 / JVI.68.11.7188-7199.1994. PMC 237158. PMID 7933101.
Kashanchi F, Piras G, Radonovich MF, Duvall JF, Fattaey A, Chiang CM, Roeder RG, Brady JN (1994). "Přímá interakce lidského TFIID s transaktivátorem HIV-1 tat". Příroda. 367 (6460): 295–9. doi:10.1038 / 367295a0. PMID 8121496. S2CID 4362048.
Wang Z, Morris GF, Rice AP, Xiong W, Morris CB (1996). „Mutanty divokého typu a defekty transaktivace defektního proteinu Tat viru lidské imunodeficience typu 1 se vážou na lidský protein vázající TATA in vitro“. J. Acquir. Imunitní deficit. Syndr. Hučení. Retrovirol. 12 (2): 128–38. doi:10.1097/00042560-199606010-00005. PMID 8680883.
Pendergrast PS, Morrison D, Tansey WP, Hernandez N (1996). „Mutace v karboxyterminální doméně TBP ovlivňují syntézu viru lidské imunodeficience typu 1 v plné délce i v krátkých transkriptech podobně“. J. Virol. 70 (8): 5025–34. doi:10.1128 / JVI.70.8.5025-5034.1996. PMC 190456. PMID 8764009.
Kashanchi F, Khleif SN, Duvall JF, Sadaie MR, Radonovich MF, Cho M, Martin MA, Chen SY, Weinmann R, Brady JN (1996). „Interakce viru lidské imunodeficience typu 1 Tat s jedinečným místem TFIID inhibuje negativní kofaktor Dr1 a stabilizuje komplex TFIID-TFIIA“. J. Virol. 70 (8): 5503–10. doi:10.1128 / JVI.70.8.5503-5510.1996. PMC 190508. PMID 8764062.
Zhou Q, Sharp PA (1996). „Tat-SF1: kofaktor pro stimulaci transkripčního prodloužení HIV-1 Tat“. Věda. 274 (5287): 605–10. Bibcode:1996Sci ... 274..605Z. doi:10.1126 / science.274.5287.605. PMID 8849451. S2CID 13266489.
García-Martínez LF, Ivanov D, Gaynor RB (1997). „Sdružení Tat s vyčištěnými preiniciačními komplexy HIV-1 a HIV-2“. J. Biol. Chem. 272 (11): 6951–8. doi:10.1074 / jbc.272.11.6951. PMID 9054383.
Scully R, Anderson SF, Chao DM, Wei W, Ye L, Young RA, Livingston DM, Parvin JD (1997). „BRCA1 je složkou holoenzymu RNA polymerázy II“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (11): 5605–10. doi:10.1073 / pnas.94.11.5605. PMC 20825. PMID 9159119.
Van Der Knaap JA, Van Den Boom V, Kuipers J, Van Eijk MJ, Van Der Vliet PC, Timmers HT (2000). „Gen pro lidský faktor TATA vázající se na protein spojený s proteinem (TAFII) 170: struktura, promotor a chromozomální lokalizace“. Biochem. J. 345 (3): 521–7. doi:10.1042/0264-6021:3450521. PMC 1220786. PMID 10642510.
Wadhwa R, Yaguchi T, Hasan MK, Taira K, Kaul SC (2003). „Mortalin-MPD (mevalonát pyrofosfát dekarboxyláza) interakce a jejich role v řízení buněčné proliferace“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 302 (4): 735–42. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 00226-2. PMID 12646231.
Pereira LA, Klejman MP, Ruhlmann C, Kavelaars F, Oulad-Abdelghani M, Timmers HT, Schultz P (2004). "Molekulární architektura bazálního transkripčního faktoru B-TFIID". J. Biol. Chem. 279 (21): 21802–7. doi:10,1074 / jbc.M313519200. PMID 14988402.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004PNAS..10112130B. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Klejman MP, Pereira LA, van Zeeburg HJ, Gilfillan S, Meisterernst M, Timmers HT (2004). „NC2α interaguje s BTAF1 a stimuluje jeho asociaci závislou na ATP s proteinem vázajícím TATA“. Mol. Buňka. Biol. 24 (22): 10072–82. doi:10.1128 / MCB.24.22.10072-10082.2004. PMC 525489. PMID 15509807.
Grob P, Cruse MJ, Inouye C, Peris M, Penczek PA, Tjian R, Nogales E (2006). „Studie kryoelektronové mikroskopie lidského TFIID: konformační dýchání v integraci genových regulačních podnětů“. Struktura. 14 (3): 511–20. doi:10.1016 / j.str.2005.11.020. PMID 16531235.

Tento článek o gen na lidský chromozom 10 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000095564 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040565 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9342322-5] van der Knaap JA, Borst JW, van der Vliet PC, Gentz R, Timmers HT (prosinec 1997). „Klonování cDNA pro podjednotku faktoru II170 spojenou s proteinem TATA transkripčního faktoru B-TFIID odhaluje homologii s globálními regulátory transkripce v kvasinkách a Drosophile“. Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (22): 11827–32. doi:10.1073 / pnas.94.22.11827. PMC 23617. PMID 9342322.

[pmid9488487-6] A ^b Chicca JJ, Auble DT, Pugh BF (březen 1998). „Klonování a biochemická charakterizace TAF-172, lidského homologu kvasinek Mot1“. Mol Cell Biol. 18 (3): 1701–10. doi:10.1128 / MCB.18.3.1701. PMC 108885. PMID 9488487.

[entrez-7] A ^b "Entrez Gene: BTAF1 BTAF1 RNA polymeráza II, asociovaný s transkripčním faktorem B-TFIID, 170 kDa (homolog Mot1, S. cerevisiae)".

[pmid9159119-8] Scully R, Anderson SF, Chao DM, Wei W, Ye L, Young RA, Livingston DM, Parvin JD (květen 1997). „BRCA1 je složkou holoenzymu RNA polymerázy II“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94 (11): 5605–10. doi:10.1073 / pnas.94.11.5605. PMC 20825. PMID 9159119.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]