TAF4B - TAF4B

TAF4B
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1H3O, 2P6V
Identifikátory
Aliasy	TAF4B, SPGF13, TAF2C2, TAFII105, faktor 4b asociovaný s proteinem vázajícím se na TATA
Externí ID	OMIM: 601689 MGI: 2152345 HomoloGene: 28266 Genové karty: TAF4B
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 18 (lidský)
Konec	26,391,685 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • Vazba DNA; • Vazba NF-kappaB; • aktivita heterodimerizace proteinu; • GO: Aktivita transkripčního koaktivátoru 0001105; • vazba transkripčního faktoru; • GO: 0000983 Obecná aktivita iniciačního transkripčního faktoru RNA polymerázy II;
Buněčná složka	• cytoplazma; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • fibrilární centrum; • transkripční faktor TFIID komplex;
Biologický proces	• Transkripce s templátem DNA, zahájení; • diferenciace buněk; • iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • spermatogeneze; • transkripce, chráněná DNA; • oogeneze; • regulace přenosu signálu mediátorem třídy p53; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • Sestava transkripčního preiniciačního komplexu RNA polymeráza II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6875
	72504
	ENSG00000141384
	ENSMUSG00000054321
	Q92750
	G5E8Z2
	NM_001293725; NM_005640
	NM_001100449; NM_001369357; NM_001369358
	NP_001280654; NP_005631
	NP_001093919; NP_001356286; NP_001356287
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Faktor iniciace transkripce TFIID podjednotka 4B je protein že u lidí je kódován TAF4B gen.^[4]^[5]^[6]

Funkce

Faktory asociované s proteinem vázajícím TATA (TAF) se podílejí s proteinem vázajícím TATA (TBP; MIM 600075) na tvorbě proteinového komplexu TFIID (viz MIM 313650), který se podílí na zahájení transkripce genu RNA polymerázou II ( viz MIM 180660). [dodává OMIM]^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že TAF4B komunikovat s RELA.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000141384 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Dikstein R, Zhou S, Tjian R (listopad 1996). „Humánní TAFII 105 je TFIID podjednotka specifická pro daný buněčný typ související s hTAFII130.“ Buňka. 87 (1): 137–46. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81330-6. PMID 8858156. S2CID 10194253.
^ Yamit-Hezi A, Nir S, Wolstein O, Dikstein R (červenec 2000). „Interakce TAFII105 s vybranými dimery p65 / RelA je spojena s aktivací podskupiny genů NF-kappa B“. J. Biol. Chem. 275 (24): 18180–7. doi:10.1074 / jbc.275.24.18180. PMID 10849440.
^ ^A ^b „Entrez Gene: TAF4B TAF4b RNA polymeráza II, faktor asociovaný s TATA box binding protein (TBP), 105 kDa“.
^ Yamit-Hezi A, Dikstein R (září 1998). „TAFII105 zprostředkovává aktivaci antiapoptotických genů pomocí NF-kappaB“. EMBO J.. 17 (17): 5161–9. doi:10.1093 / emboj / 17.17.5161. PMC 1170844. PMID 9724652.

Další čtení

Liu WL, Coleman RA, Grob P, King DS, Florens L, Washburn MP, Geles KG, Yang JL, Ramey V, Nogales E, Tjian R (2008). „Strukturální změny v TAF4b-TFIID korelují se selektivitou promotoru“. Mol. Buňka. 29 (1): 81–91. doi:10.1016 / j.molcel.2007.11.003. PMC 2486835. PMID 18206971.
Wu Y, Lu Y, Hu Y, Li R (2005). „Cyklická AMP-závislá modifikace gonádově selektivního TAF (II) 105 v lidské buněčné linii vaječníkových granulóz“. J. Cell. Biochem. 96 (4): 751–9. doi:10.1002 / jcb.20577. PMID 16088961. S2CID 23658728.
Shao H, Revach M, Moshonov S, Tzuman Y, Gazit K, Albeck S, Unger T, Dikstein R (2005). „Vazba promotoru jádra prostřednictvím komplexů TAF podobných histonu“. Mol. Buňka. Biol. 25 (1): 206–19. doi:10.1128 / MCB.25.1.206-219.2005. PMC 538770. PMID 15601843.
Rashevsky-Finkel A, Silkov A, Dikstein R (2001). „Složený signál exportu jaderné energie do faktoru TAFII105 souvisejícího s TBP“. J. Biol. Chem. 276 (48): 44963–9. doi:10,1074 / jbc.M106112200. PMID 11567023.
Wolstein O, Silkov A, Revach M, Dikstein R (2000). „Specifická interakce TAFII105 s OCA-B se účastní aktivace transkripce závislé na oktameru“. J. Biol. Chem. 275 (22): 16459–65. doi:10.1074 / jbc.275.22.16459. PMID 10828057.
Yamit-Hezi A, Dikstein R (1998). „TAFII105 zprostředkovává aktivaci antiapoptotických genů pomocí NF-kappaB“. EMBO J.. 17 (17): 5161–9. doi:10.1093 / emboj / 17.17.5161. PMC 1170844. PMID 9724652.

Tento článek o gen na lidský chromozom 18 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000141384 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8858156-4] Dikstein R, Zhou S, Tjian R (listopad 1996). „Humánní TAFII 105 je TFIID podjednotka specifická pro daný buněčný typ související s hTAFII130.“ Buňka. 87 (1): 137–46. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81330-6. PMID 8858156. S2CID 10194253.

[pmid10849440-5] Yamit-Hezi A, Nir S, Wolstein O, Dikstein R (červenec 2000). „Interakce TAFII105 s vybranými dimery p65 / RelA je spojena s aktivací podskupiny genů NF-kappa B“. J. Biol. Chem. 275 (24): 18180–7. doi:10.1074 / jbc.275.24.18180. PMID 10849440.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: TAF4B TAF4b RNA polymeráza II, faktor asociovaný s TATA box binding protein (TBP), 105 kDa“.

[pmid9724652-7] Yamit-Hezi A, Dikstein R (září 1998). „TAFII105 zprostředkovává aktivaci antiapoptotických genů pomocí NF-kappaB“. EMBO J.. 17 (17): 5161–9. doi:10.1093 / emboj / 17.17.5161. PMC 1170844. PMID 9724652.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]