TAF7 - TAF7
7. Faktor iniciace transkripce TFIID podjednotka také známý jako TAFII55 je a protein že u lidí je kódován TAF7 gen.[5]
Funkce
Gen bez intronů pro tento transkripční koaktivátor je umístěn mezi shluky genů protocadherinu beta a gama na chromozomu 5. Protein kódovaný tímto genem je součástí proteinového komplexu TFIID, komplexu, který se váže na TATA box v promotorech třídy II a rekrutuje RNA polymeráza II a další faktory. Tato konkrétní podjednotka interaguje s největší podjednotkou TFIID, stejně jako s několika aktivátory transkripce. Protein je vyžadován pro transkripci promotory cílenými RNA polymerázou II.[6]
| TAFII55_N | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | TAFII55_N | ||||||||
| Pfam | PF04658 | ||||||||
| InterPro | IPR006751 | ||||||||
| |||||||||
Generál transkripce faktor, TFIID, se skládá z vazby TATA protein (TBP) spojené s řadou faktorů souvisejících s TBP (TAF), které se společně účastní shromáždění transkripce preiniciace komplex. TAFII55 váže na TAFII250 a inhibuje jeho aktivita acetyltransferázy. Přesná role TAFII55 není v současnosti známa, ale studie ukázaly, že interaguje s Cesta C-jun.[7] The konzervovaný Oblast se nachází směrem k N-konci proteinu.[8] Tato položka hovoří o N-terminál doména.
Krystalografické studie odhalily velmi významnou hydrofobní kapsu mezi TAF7 a TAF1, jeho hlavním vazebným partnerem. Vzhledem k neuvěřitelné hydrofobicitě této interakce je nepravděpodobné, že by se TAF1 mohl správně skládat bez přítomnosti TAF7. Je tedy možné, že pro správnou produkci TAF1 je vyžadován TAF7[9]
Interakce
Bylo prokázáno, že TAF7 komunikovat s:
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000178913 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000051316 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Chiang CM, Roeder RG (leden 1995). "Klonování vnitřní lidské podjednotky TFIID, která interaguje s více transkripčními aktivátory". Věda. 267 (5197): 531–6. doi:10.1126 / science.7824954. PMID 7824954. S2CID 21236901.
- ^ „Entrez Gene: TAF7 TAF7 RNA polymeráza II, faktor spojený s proteinem vázajícím se na TATA box (TBP), 55 kDa“.
- ^ Munz C, Psichari E, Mandilis D, Lavigne AC, Spiliotaki M, Oehler T, Davidson I, Tora L, Angel P, Pintzas A (červen 2003). „TAF7 (TAFII55) hraje roli v aktivaci transkripce c-červnem“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (24): 21510–6. doi:10,1074 / jbc.M212764200. PMID 12676957.
- ^ A b Gegonne A, Weissman JD, Singer DS (říjen 2001). „Vazba TAFII55 na TAFII250 inhibuje jeho aktivitu acetyltransferázy“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 98 (22): 12432–7. doi:10.1073 / pnas.211444798. PMC 60071. PMID 11592977.
- ^ Bhattacharya S, Lou X, Hwang P, Rajashankar KR, Wang X, Gustafsson JÅ, Fletterick RJ, Jacobson RH, Webb P (červen 2014). „Strukturální a funkční vhled do TAF1-TAF7, subkomplexu transkripčního faktoru II D“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 111 (25): 9103–8. doi:10.1073 / pnas.1408293111. PMC 4078864. PMID 24927529.
- ^ Bertolotti A, Melot T, Acker J, Vigneron M, Delattre O, Tora L (březen 1998). „EWS, ale ne EWS-FLI-1, je spojován s TFIID i RNA polymerázou II: interakce mezi dvěma členy rodiny TET, EWS a hTAFII68, a podjednotkami komplexů TFIID a RNA polymerázy II“. Molekulární a buněčná biologie. 18 (3): 1489–97. doi:10.1128 / mcb.18.3.1489. PMC 108863. PMID 9488465.
- ^ Pointud JC, Mengus G, Brancorsini S, Monako L, Parvinen M, Sassone-Corsi P, Davidson I (květen 2003). „Intracelulární lokalizace TAF7L, paralog transkripčního faktoru TFIID podjednotky TAF7, je vývojově regulována během diferenciace mužských zárodečných buněk“. Journal of Cell Science. 116 (Pt 9): 1847–1858. doi:10.1242 / jcs.00391. PMID 12665565.
- ^ Bellorini M, Lee DK, Dantonel JC, Zemzoumi K, Roeder RG, Tora L, Mantovani R (červen 1997). „CCAAT vazebné interakce NF-Y-TBP: NF-YB a NF-YC vyžadují krátké domény sousedící s jejich histonovými skládacími motivy pro asociaci s TBP bazickými zbytky“. Výzkum nukleových kyselin. 25 (11): 2174–81. doi:10.1093 / nar / 25.11.2174. PMC 146709. PMID 9153318.
Další čtení
- Zhou Q, Sharp PA (leden 1995). „Nový mechanismus a faktor pro regulaci HIV-1 Tat“. Časopis EMBO. 14 (2): 321–8. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07006.x. PMC 398086. PMID 7835343.
- Parada CA, Yoon JB, Roeder RG (únor 1995). „Nové omezení LBP-1 zprostředkované omezení transkripce HIV-1 na úrovni prodloužení in vitro“. The Journal of Biological Chemistry. 270 (5): 2274–83. doi:10.1074 / jbc.270.5.2274. PMID 7836461.
- Ou SH, Garcia-Martínez LF, Paulssen EJ, Gaynor RB (listopad 1994). "Role doprovodných motivů E boxu ve funkci elementu TATA viru lidské imunodeficience typu 1". Journal of Virology. 68 (11): 7188–99. doi:10.1128 / JVI.68.11.7188-7199.1994. PMC 237158. PMID 7933101.
- Cross SH, Charlton JA, Nan X, Bird AP (březen 1994). "Čištění ostrovů CpG pomocí methylované DNA vazebné kolony". Genetika přírody. 6 (3): 236–44. doi:10.1038 / ng0394-236. PMID 8012384. S2CID 12847618.
- Kashanchi F, Piras G, Radonovich MF, Duvall JF, Fattaey A, Chiang CM, Roeder RG, Brady JN (leden 1994). "Přímá interakce lidského TFIID s transaktivátorem HIV-1 tat". Příroda. 367 (6460): 295–9. doi:10.1038 / 367295a0. PMID 8121496. S2CID 4362048.
- Wang Z, Morris GF, Rice AP, Xiong W, Morris CB (červen 1996). „Mutanty divokého typu a defekty transaktivace defektního proteinu Tat viru lidské imunodeficience typu 1 se vážou na lidský protein vázající TATA in vitro“. Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes and Human Retrovirology. 12 (2): 128–38. doi:10.1097/00042560-199606010-00005. PMID 8680883.
- Lavigne AC, Mengus G, květen M, Dubrovskaya V, Tora L, Chambon P, Davidson I (srpen 1996). "Vícenásobné interakce mezi hTAFII55 a jinými podjednotkami TFIID. Požadavky na tvorbu stabilních ternárních komplexů mezi hTAFII55 a proteinem vázajícím TATA". The Journal of Biological Chemistry. 271 (33): 19774–80. doi:10.1074 / jbc.271.33.19774. PMID 8702684.
- Pendergrast PS, Morrison D, Tansey WP, Hernandez N (srpen 1996). „Mutace v karboxyterminální doméně TBP ovlivňují syntézu viru lidské imunodeficience typu 1 v plné délce i v krátkých transkriptech podobně“. Journal of Virology. 70 (8): 5025–34. doi:10.1128 / JVI.70.8.5025-5034.1996. PMC 190456. PMID 8764009.
- Kashanchi F, Khleif SN, Duvall JF, Sadaie MR, Radonovich MF, Cho M, Martin MA, Chen SY, Weinmann R, Brady JN (srpen 1996). „Interakce viru lidské imunodeficience typu 1 Tat s jedinečným místem TFIID inhibuje negativní kofaktor Dr1 a stabilizuje komplex TFIID-TFIIA“. Journal of Virology. 70 (8): 5503–10. doi:10.1128 / JVI.70.8.5503-5510.1996. PMC 190508. PMID 8764062.
- Rowlands JC, McEwan IJ, Gustafsson JA (září 1996). „Trans-aktivace lidským aryl-uhlovodíkovým receptorem a aryl-uhlovodíkovým receptorem pro nukleární translokátorové proteiny: přímé interakce s bazálními transkripčními faktory“. Molekulární farmakologie. 50 (3): 538–48. PMID 8794892.
- Zhou Q, Sharp PA (říjen 1996). „Tat-SF1: kofaktor pro stimulaci transkripčního prodloužení HIV-1 Tat“. Věda. 274 (5287): 605–10. Bibcode:1996Sci ... 274..605Z. doi:10.1126 / science.274.5287.605. PMID 8849451. S2CID 13266489.
- García-Martínez LF, Ivanov D, Gaynor RB (březen 1997). „Sdružení Tat s vyčištěnými preiniciačními komplexy HIV-1 a HIV-2“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (11): 6951–8. doi:10.1074 / jbc.272.11.6951. PMID 9054383.
- Dantonel JC, Murthy KG, Manley JL, Tora L (září 1997). "Transkripční faktor TFIID získává faktor CPSF pro tvorbu 3 'konce mRNA". Příroda. 389 (6649): 399–402. doi:10.1038/38763. PMID 9311784. S2CID 4413324.
- Bertolotti A, Melot T, Acker J, Vigneron M, Delattre O, Tora L (březen 1998). „EWS, ale ne EWS-FLI-1, je spojován s TFIID i RNA polymerázou II: interakce mezi dvěma členy rodiny TET, EWS a hTAFII68, a podjednotkami komplexů TFIID a RNA polymerázy II“. Molekulární a buněčná biologie. 18 (3): 1489–97. doi:10.1128 / mcb.18.3.1489. PMC 108863. PMID 9488465.
- Fraser RA, Heard DJ, Adam S, Lavigne AC, Le Douarin B, Tora L, Losson R, Rochette-Egly C, Chambon P (červen 1998). „Předpokládaný kofaktor TIF1alfa je protein kináza, která je hyperfosforylovaná při interakci s ligandovanými jadernými receptory“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (26): 16199–204. doi:10.1074 / jbc.273.26.16199. PMID 9632676.
- Furukawa T, Tanese N (září 2000). „Sestavení parciálních komplexů TFIID v savčích buňkách odhaluje odlišné aktivity spojené s jednotlivými faktory souvisejícími s TATA box-binding protein“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (38): 29847–56. doi:10,1074 / jbc.M002989200. PMID 10896937.
- Yuan CX, Gurley WB (červenec 2000). „Potenciální cíle pro HSF1 v rámci preiniciačního komplexu“. Stres buněk a chaperony. 5 (3): 229–42. doi:10.1379 / 1466-1268 (2000) 005 <0229: PTFHWT> 2.0.CO; 2. PMC 312889. PMID 11005381.
- Wu Q, Zhang T, Cheng JF, Kim Y, Grimwood J, Schmutz J, Dickson M, Noonan JP, Zhang MQ, Myers RM, Maniatis T (březen 2001). „Srovnávací analýza sekvencí DNA myší a lidských protocadherinových genových klastrů“. Výzkum genomu. 11 (3): 389–404. doi:10,1101 / gr. 167301. PMC 311048. PMID 11230163.
- Zhou T, Chiang CM (červenec 2001). „Lidský gen TAF (II) 55 bez intronů a bez TATA obsahuje funkční iniciátor a následný promotorový prvek“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (27): 25503–11. doi:10,1074 / jbc.M102875200. PMID 11340078.