TAF5 - TAF5
Faktor iniciace transkripce TFIID podjednotka 5 je protein že u lidí je kódován TAF5 gen.[5][6][7]
Funkce
Zahájení transkripce RNA polymerázou II vyžaduje aktivity více než 70 polypeptidů. Protein, který koordinuje tyto aktivity, je transkripční faktor IID (TFIID), který se váže na promotor jádra, aby správně umístil polymerázu, slouží jako kostra pro sestavení zbytku transkripčního komplexu a působí jako kanál pro regulační signály. TFIID se skládá z proteinu vázajícího TATA (TBP) a skupiny evolučně konzervovaných proteinů známých jako faktory spojené s TBP nebo TAF. TAF se mohou účastnit bazální transkripce, sloužit jako koaktivátory, fungovat při rozpoznávání promotoru nebo modifikovat obecné transkripční faktory (GTF), aby se usnadnilo složité sestavení a zahájení transkripce. Tento gen kóduje integrální podjednotku TFIID spojenou se všemi transkripčně kompetentními formami tohoto komplexu. Tato podjednotka silně interaguje se dvěma podjednotkami TFIID, které vykazují podobnost s histony H3 a H4, a může se podílet na tvorbě jádra podobného nukleosomu v komplexu TFIID.[7]
Interakce
Bylo prokázáno, že TAF5 komunikovat s:
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000148835 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025049 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Dubrovskaya V, Mattei MG, Tora L (únor 1997). „Lokalizace genu (TAF2D) kódujícího 100 kDa podjednotku (hTAFII100) lidského komplexu TFIID do pásma q24-q25.2 chromozomu 10“. Genomika. 36 (3): 556–7. doi:10.1006 / geno.1996.0509. PMID 8884287.
- ^ Tanese N, Saluja D, Vassallo MF, Chen JL, Admon A (leden 1997). „Molekulární klonování a analýza dvou podjednotek lidského komplexu TFIID: hTAFII130 a hTAFII100“. Proc Natl Acad Sci U S A. 93 (24): 13611–6. doi:10.1073 / pnas.93.24.13611. PMC 19367. PMID 8942982.
- ^ A b „Entrez Gene: TAF5 TAF5 RNA polymeráza II, faktor asociovaný s proteinem vázajícím se na TATA box (TBP), 100 kDa“.
- ^ A b C Tao Y, Guermah M, Martinez E, Oelgeschläger T, Hasegawa S, Takada R, Yamamoto T, Horikoshi M, Roeder RG (březen 1997). „Specifické interakce a potenciální funkce lidského TAFII100“. J. Biol. Chem. 272 (10): 6714–21. doi:10.1074 / jbc.272.10.6714. PMID 9045704.
- ^ Hsieh YJ, Kundu TK, Wang Z, Kovelman R, Roeder RG (listopad 1999). „TFIIIC90 podjednotka TFIIIC interaguje s více složkami mechanismu RNA polymerázy III a obsahuje aktivitu histonově specifické acetyltransferázy“. Mol. Buňka. Biol. 19 (11): 7697–704. doi:10,1128 / mcb.19.11.7697. PMC 84812. PMID 10523658.
- ^ Martinez E, Palhan VB, Tjernberg A, Lymar ES, Gamper AM, Kundu TK, Chait BT, Roeder RG (říjen 2001). „Lidský komplex STAGA je transkripční koaktivátor acetylující chromatin, který interaguje s sestřihem pre-mRNA a faktory vázajícími poškození DNA in vivo“. Mol. Buňka. Biol. 21 (20): 6782–95. doi:10.1128 / MCB.21.20.6782-6795.2001. PMC 99856. PMID 11564863.
- ^ Bertolotti A, Melot T, Acker J, Vigneron M, Delattre O, Tora L (březen 1998). „EWS, ale ne EWS-FLI-1, je spojován s TFIID i RNA polymerázou II: interakce mezi dvěma členy rodiny TET, EWS a hTAFII68, a podjednotkami komplexů TFIID a RNA polymerázy II“. Mol. Buňka. Biol. 18 (3): 1489–97. doi:10.1128 / mcb.18.3.1489. PMC 108863. PMID 9488465.
- ^ Bellorini M, Lee DK, Dantonel JC, Zemzoumi K, Roeder RG, Tora L, Mantovani R (červen 1997). „CCAAT vazebné interakce NF-Y-TBP: NF-YB a NF-YC vyžadují krátké domény sousedící s jejich histonovými skládacími motivy pro asociaci s TBP bazickými zbytky“. Nucleic Acids Res. 25 (11): 2174–81. doi:10.1093 / nar / 25.11.2174. PMC 146709. PMID 9153318.
- ^ Ruppert S, Wang EH, Tjian R (březen 1993). „Klonování a exprese lidského TAFII250: faktor spojený s TBP podílející se na regulaci buněčného cyklu“. Příroda. 362 (6416): 175–9. doi:10.1038 / 362175a0. PMID 7680771. S2CID 4364676.
Další čtení
- Zhou Q, Sharp PA (1995). „Nový mechanismus a faktor pro regulaci HIV-1 Tat“. EMBO J.. 14 (2): 321–8. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07006.x. PMC 398086. PMID 7835343.
- Parada CA, Yoon JB, Roeder RG (1995). „Nové omezení LBP-1 zprostředkované omezení transkripce HIV-1 na úrovni prodloužení in vitro“. J. Biol. Chem. 270 (5): 2274–83. doi:10.1074 / jbc.270.5.2274. PMID 7836461.
- Ou SH, Garcia-Martínez LF, Paulssen EJ, Gaynor RB (1994). "Role doprovodných motivů E boxu ve funkci elementu TATA viru lidské imunodeficience typu 1". J. Virol. 68 (11): 7188–99. doi:10.1128 / JVI.68.11.7188-7199.1994. PMC 237158. PMID 7933101.
- Kashanchi F, Piras G, Radonovich MF, Duvall JF, Fattaey A, Chiang CM, Roeder RG, Brady JN (1994). "Přímá interakce lidského TFIID s transaktivátorem HIV-1 tat". Příroda. 367 (6460): 295–9. doi:10.1038 / 367295a0. PMID 8121496. S2CID 4362048.
- Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Wang Z, Morris GF, Rice AP, Xiong W, Morris CB (1996). „Mutanty divokého typu a defekty transaktivace defektního proteinu Tat viru lidské imunodeficience typu 1 se vážou na lidský protein vázající TATA in vitro“. J. Acquir. Imunitní deficit. Syndr. Hučení. Retrovirol. 12 (2): 128–38. doi:10.1097/00042560-199606010-00005. PMID 8680883.
- Dubrovskaya V, Lavigne AC, Davidson I, Acker J, Staub A, Tora L (1996). „Zřetelné domény hTAFII100 jsou vyžadovány pro funkční interakci s transkripčním faktorem TFIIF beta (RAP30) a začlenění do komplexu TFIID“. EMBO J.. 15 (14): 3702–12. doi:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00740.x. PMC 452026. PMID 8758937.
- Pendergrast PS, Morrison D, Tansey WP, Hernandez N (1996). „Mutace v karboxyterminální doméně TBP ovlivňují syntézu viru lidské imunodeficience typu 1 v plné délce i v krátkých transkriptech podobně“. J. Virol. 70 (8): 5025–34. doi:10.1128 / JVI.70.8.5025-5034.1996. PMC 190456. PMID 8764009.
- Kashanchi F, Khleif SN, Duvall JF, Sadaie MR, Radonovich MF, Cho M, Martin MA, Chen SY, Weinmann R, Brady JN (1996). „Interakce viru lidské imunodeficience typu 1 Tat s jedinečným místem TFIID inhibuje negativní kofaktor Dr1 a stabilizuje komplex TFIID-TFIIA“. J. Virol. 70 (8): 5503–10. doi:10.1128 / JVI.70.8.5503-5510.1996. PMC 190508. PMID 8764062.
- Zhou Q, Sharp PA (1996). „Tat-SF1: kofaktor pro stimulaci transkripčního prodloužení HIV-1 Tat“. Věda. 274 (5287): 605–10. Bibcode:1996Sci ... 274..605Z. doi:10.1126 / science.274.5287.605. PMID 8849451. S2CID 13266489.
- Tao Y, Guermah M, Martinez E, Oelgeschläger T, Hasegawa S, Takada R, Yamamoto T, Horikoshi M, Roeder RG (1997). „Specifické interakce a potenciální funkce lidského TAFII100“. J. Biol. Chem. 272 (10): 6714–21. doi:10.1074 / jbc.272.10.6714. PMID 9045704.
- García-Martínez LF, Ivanov D, Gaynor RB (1997). „Sdružení Tat s vyčištěnými preiniciačními komplexy HIV-1 a HIV-2“. J. Biol. Chem. 272 (11): 6951–8. doi:10.1074 / jbc.272.11.6951. PMID 9054383.
- Dantonel JC, Murthy KG, Manley JL, Tora L (1997). "Transkripční faktor TFIID získává faktor CPSF pro tvorbu 3 'konce mRNA". Příroda. 389 (6649): 399–402. doi:10.1038/38763. PMID 9311784. S2CID 4413324.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Bertolotti A, Melot T, Acker J, Vigneron M, Delattre O, Tora L (1998). „EWS, ale ne EWS-FLI-1, je spojován s TFIID i RNA polymerázou II: interakce mezi dvěma členy rodiny TET, EWS a hTAFII68, a podjednotkami komplexů TFIID a RNA polymerázy II“. Mol. Buňka. Biol. 18 (3): 1489–97. doi:10.1128 / mcb.18.3.1489. PMC 108863. PMID 9488465.
- Značka M, Yamamoto K, Staub A, Tora L (1999). „Identifikace komplexních podjednotek obsahujících TAFII bez proteinů vázajících TATA naznačuje roli v acetylaci nukleosomů a signální transdukci“. J. Biol. Chem. 274 (26): 18285–9. doi:10.1074 / jbc.274.26.18285. PMID 10373431.
- Značka M, Moggs JG, Oulad-Abdelghani M, Lejeune F, Dilworth FJ, Stevenin J, Almouzni G, Tora L (2001). „Protein vázající DNA poškozený UV zářením v komplexu TFTC spojuje rozpoznávání poškození DNA s acetylací nukleosomů“. EMBO J.. 20 (12): 3187–96. doi:10.1093 / emboj / 20.12.3187. PMC 150203. PMID 11406595.
- Martinez E, Palhan VB, Tjernberg A, Lymar ES, Gamper AM, Kundu TK, Chait BT, Roeder RG (2001). „Lidský komplex STAGA je transkripční koaktivátor acetylující chromatin, který interaguje s sestřihem pre-mRNA a faktory vázajícími poškození DNA in vivo“. Mol. Buňka. Biol. 21 (20): 6782–95. doi:10.1128 / MCB.21.20.6782-6795.2001. PMC 99856. PMID 11564863.