TAF8 - TAF8

TAF8
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4WV6, 5ŠTĚR
Identifikátory
Aliasy	TAF8, 43, II, TAF, TAFII-43, TAFII43, TBN, faktor 8 související s proteinem vázajícím se na TATA, TAF (II) 43
Externí ID	OMIM: 609514 MGI: 1926879 HomoloGene: 11094 Genové karty: TAF8
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	42,087,461 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	47,502,292 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita heterodimerizace proteinu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • perinukleární oblast cytoplazmy; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • transkripční faktor TFIID komplex;
Biologický proces	• pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • vývoj mnohobuněčných organismů; • diferenciace buněk; • regulace transkripce, DNA-šablony; • regulace diferenciace tukových buněk; • transkripce, chráněná DNA; • udržování umístění bílkovin v jádru; • proliferace buněk vnitřní hmoty; • transkripce snRNA z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	129685
	63856
	ENSG00000137413
	ENSMUSG00000023980
	Q7Z7C8
	Q9EQH4
	NM_138572
	NM_022015; NM_001356290
	NP_612639
	NP_071298; NP_001343219
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Faktor iniciace transkripce TFIID podjednotka 8 je protein že u lidí je kódován TAF8 gen.^[5]

Tento gen kóduje jeden z několika faktorů (TAF) asociovaných s proteinem vázajícím se na TATA (TBP), které jsou nedílnou podjednotkou komplexu TFIID komplexu s obecným transkripčním faktorem. TFIID rozpoznává hlavní promotor mnoha genů a nukleuje sestavením transkripčního preiniciačního komplexu obsahujícího RNA polymerázu II a další iniciační faktory. Protein kódovaný tímto genem obsahuje histonovou fold doménu podobnou H4 a interaguje s několika podjednotkami TFIID včetně TBP a histonově foldovaného proteinu TAF10. Alternativně byly popsány sestřihové varianty transkriptu, ale jejich biologická platnost nebyla stanovena.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000137413 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000023980 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b "Entrez Gene: TBN taube nuss homolog (myš)".

Další čtení

Zhou Q, Sharp PA (1995). „Nový mechanismus a faktor pro regulaci HIV-1 Tat“. EMBO J.. 14 (2): 321–8. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07006.x. PMC 398086. PMID 7835343.
Parada CA, Yoon JB, Roeder RG (1995). „Nové omezení LBP-1 zprostředkované omezení transkripce HIV-1 na úrovni prodloužení in vitro“. J. Biol. Chem. 270 (5): 2274–83. doi:10.1074 / jbc.270.5.2274. PMID 7836461.
Ou SH, Garcia-Martínez LF, Paulssen EJ, Gaynor RB (1994). "Role doprovodných motivů E boxu ve funkci elementu TATA viru lidské imunodeficience typu 1". J. Virol. 68 (11): 7188–99. doi:10.1128 / JVI.68.11.7188-7199.1994. PMC 237158. PMID 7933101.
Kashanchi F, Piras G, Radonovich MF a kol. (1994). "Přímá interakce lidského TFIID s transaktivátorem HIV-1 tat". Příroda. 367 (6460): 295–9. doi:10.1038 / 367295a0. PMID 8121496. S2CID 4362048.
Wang Z, Morris GF, Rice AP a kol. (1996). „Mutanty divokého typu a defekty transaktivace defektního proteinu Tat viru lidské imunodeficience typu 1 se vážou na lidský protein vázající TATA in vitro“. J. Acquir. Imunitní deficit. Syndr. Hučení. Retrovirol. 12 (2): 128–38. doi:10.1097/00042560-199606010-00005. PMID 8680883.
Pendergrast PS, Morrison D, Tansey WP, Hernandez N (1996). „Mutace v karboxyterminální doméně TBP ovlivňují syntézu viru lidské imunodeficience typu 1 v plné délce i v krátkých transkriptech podobně“. J. Virol. 70 (8): 5025–34. doi:10.1128 / JVI.70.8.5025-5034.1996. PMC 190456. PMID 8764009.
Kashanchi F, Khleif SN, Duvall JF a kol. (1996). „Interakce viru lidské imunodeficience typu 1 Tat s jedinečným místem TFIID inhibuje negativní kofaktor Dr1 a stabilizuje komplex TFIID-TFIIA“. J. Virol. 70 (8): 5503–10. doi:10.1128 / JVI.70.8.5503-5510.1996. PMC 190508. PMID 8764062.
Zhou Q, Sharp PA (1996). „Tat-SF1: kofaktor pro stimulaci transkripčního prodloužení HIV-1 Tat“. Věda. 274 (5287): 605–10. Bibcode:1996Sci ... 274..605Z. doi:10.1126 / science.274.5287.605. PMID 8849451. S2CID 13266489.
García-Martínez LF, Ivanov D, Gaynor RB (1997). „Sdružení Tat s vyčištěnými preiniciačními komplexy HIV-1 a HIV-2“. J. Biol. Chem. 272 (11): 6951–8. doi:10.1074 / jbc.272.11.6951. PMID 9054383.
Purrello M, Di Pietro C, Viola A a kol. (1998). „Genomika a transkripční analýza lidského TFIID“. Onkogen. 16 (12): 1633–8. doi:10.1038 / sj.onc.1201673. PMID 9569032.
Guermah M, Tao Y, Roeder RG (2001). „Pozitivní a negativní funkce TAFII, které naznačují dynamickou strukturu TFIID a vyvolávají synergii s TRAP v transkripci vyvolané aktivátorem“. Mol. Buňka. Biol. 21 (20): 6882–94. doi:10.1128 / MCB.21.20.6882-6894.2001. PMC 99865. PMID 11564872.
Tora L (2002). „Jednotná nomenklatura pro faktory spojené s proteinem vázajícím se na TATA (TBP) (TAF) podílející se na transkripci RNA polymerázy II“. Genes Dev. 16 (6): 673–5. doi:10,1101 / gad.976402. PMID 11963920.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Guermah M, Ge K, Chiang CM, Roeder RG (2003). „TBN protein, který je nezbytný pro časný vývoj embryonálních myší, je indukovatelný TAFII zapojený do adipogeneze“. Mol. Buňka. 12 (4): 991–1001. doi:10.1016 / S1097-2765 (03) 00396-4. PMID 14580349.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Soutoglou E, Demény MA, Scheer E a kol. (2005). „Jaderný import TAF10 je regulován jedním z jejích tří interakčních partnerů obsahujících doménu skládající se z histonů“. Mol. Buňka. Biol. 25 (10): 4092–104. doi:10.1128 / MCB.25.10.4092-4104.2005. PMC 1087738. PMID 15870280.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000137413 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000023980 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b "Entrez Gene: TBN taube nuss homolog (myš)".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]