TAF13 - TAF13
Faktor iniciace transkripce TFIID podjednotka 13 je protein že u lidí je kódován TAF13 gen.[4][5]
Funkce
Zahájení transkripce RNA polymerázou II vyžaduje aktivity více než 70 polypeptidů. Protein, který koordinuje tyto aktivity, je transkripční faktor IID (TFIID), který se váže na promotor jádra, aby správně umístil polymerázu, slouží jako kostra pro sestavení zbytku transkripčního komplexu a působí jako kanál pro regulační signály. TFIID se skládá z proteinu vázajícího TATA (TBP) a skupiny evolučně konzervovaných proteinů známých jako faktory spojené s TBP nebo TAF. TAF se mohou účastnit bazální transkripce, sloužit jako koaktivátory, fungovat při rozpoznávání promotoru nebo modifikovat obecné transkripční faktory (GTF), aby se usnadnilo složité sestavení a zahájení transkripce. Tento gen kóduje malou podjednotku spojenou s podskupinou komplexů TFIID. Tato podjednotka interaguje s TBP a se dvěma dalšími malými podjednotkami TFIID, TAF10 a TAF11. Na chromozomu 6 se nachází pseudogen.[5]
Interakce
Bylo prokázáno, že TAF13 komunikovat s TAF15,[6] TAF11,[4][7] TAF10[4] a Protein vázající TATA.[4]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000197780 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b C d Mengus G, květen M, Jacq X, Staub A, Tora L, Chambon P, Davidson I (květen 1995). "Klonování a charakterizace hTAFII18, hTAFII20 a hTAFII28: tři podjednotky lidského transkripčního faktoru TFIID". EMBO J.. 14 (7): 1520–31. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07138.x. PMC 398239. PMID 7729427.
- ^ A b „Entrez Gene: TAF13 TAF13 RNA polymeráza II, faktor spojený s proteinem vázajícím se na TATA box (TBP), 18 kDa“.
- ^ Bertolotti A, Melot T, Acker J, Vigneron M, Delattre O, Tora L (březen 1998). „EWS, ale ne EWS-FLI-1, je spojován s TFIID i RNA polymerázou II: interakce mezi dvěma členy rodiny TET, EWS a hTAFII68, a podjednotkami komplexů TFIID a RNA polymerázy II“. Mol. Buňka. Biol. 18 (3): 1489–97. doi:10.1128 / mcb.18.3.1489. PMC 108863. PMID 9488465.
- ^ Birck C, Poch O, Romier C, Ruff M, Mengus G, Lavigne AC, Davidson I, Moras D (červenec 1998). „Lidský TAF (II) 28 a TAF (II) 18 interagují histonovým záhybem kódovaným atypickými evolučními konzervativními motivy, které se také nacházejí v rodině SPT3. Buňka. 94 (2): 239–49. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81423-3. PMID 9695952.
Další čtení
- Zhou Q, Sharp PA (1995). „Nový mechanismus a faktor pro regulaci HIV-1 Tat“. EMBO J.. 14 (2): 321–8. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07006.x. PMC 398086. PMID 7835343.
- Parada CA, Yoon JB, Roeder RG (1995). „Nové omezení LBP-1 zprostředkované omezení transkripce HIV-1 na úrovni prodloužení in vitro“. J. Biol. Chem. 270 (5): 2274–83. doi:10.1074 / jbc.270.5.2274. PMID 7836461.
- Ou SH, Garcia-Martínez LF, Paulssen EJ, Gaynor RB (1994). "Role doprovodných motivů E boxu ve funkci elementu TATA viru lidské imunodeficience typu 1". J. Virol. 68 (11): 7188–99. doi:10.1128 / JVI.68.11.7188-7199.1994. PMC 237158. PMID 7933101.
- Kashanchi F, Piras G, Radonovich MF, Duvall JF, Fattaey A, Chiang CM, Roeder RG, Brady JN (1994). "Přímá interakce lidského TFIID s transaktivátorem HIV-1 tat". Příroda. 367 (6460): 295–9. doi:10.1038 / 367295a0. PMID 8121496.
- Wang Z, Morris GF, Rice AP, Xiong W, Morris CB (1996). „Mutanty divokého typu a defekty transaktivace defektního proteinu Tat viru lidské imunodeficience typu 1 se vážou na lidský protein vázající TATA in vitro“. J. Acquir. Imunitní deficit. Syndr. Hučení. Retrovirol. 12 (2): 128–38. doi:10.1097/00042560-199606010-00005. PMID 8680883.
- Pendergrast PS, Morrison D, Tansey WP, Hernandez N (1996). „Mutace v karboxyterminální doméně TBP ovlivňují syntézu viru lidské imunodeficience typu 1 v plné délce i v krátkých transkriptech podobně“. J. Virol. 70 (8): 5025–34. doi:10.1128 / JVI.70.8.5025-5034.1996. PMC 190456. PMID 8764009.
- Kashanchi F, Khleif SN, Duvall JF, Sadaie MR, Radonovich MF, Cho M, Martin MA, Chen SY, Weinmann R, Brady JN (1996). „Interakce viru lidské imunodeficience typu 1 Tat s jedinečným místem TFIID inhibuje negativní kofaktor Dr1 a stabilizuje komplex TFIID-TFIIA“. J. Virol. 70 (8): 5503–10. doi:10.1128 / JVI.70.8.5503-5510.1996. PMC 190508. PMID 8764062.
- Zhou Q, Sharp PA (1996). „Tat-SF1: kofaktor pro stimulaci transkripčního prodloužení HIV-1 Tat“. Věda. 274 (5287): 605–10. Bibcode:1996Sci ... 274..605Z. doi:10.1126 / science.274.5287.605. PMID 8849451.
- García-Martínez LF, Ivanov D, Gaynor RB (1997). „Sdružení Tat s vyčištěnými preiniciačními komplexy HIV-1 a HIV-2“. J. Biol. Chem. 272 (11): 6951–8. doi:10.1074 / jbc.272.11.6951. PMID 9054383.
- Dantonel JC, Murthy KG, Manley JL, Tora L (1997). "Transkripční faktor TFIID získává faktor CPSF pro tvorbu 3 'konce mRNA". Příroda. 389 (6649): 399–402. doi:10.1038/38763. PMID 9311784.
- Bertolotti A, Melot T, Acker J, Vigneron M, Delattre O, Tora L (1998). „EWS, ale ne EWS-FLI-1, je spojován s TFIID i RNA polymerázou II: interakce mezi dvěma členy rodiny TET, EWS a hTAFII68, a podjednotkami komplexů TFIID a RNA polymerázy II“. Mol. Buňka. Biol. 18 (3): 1489–97. doi:10.1128 / mcb.18.3.1489. PMC 108863. PMID 9488465.
- Birck C, Poch O, Romier C, Ruff M, Mengus G, Lavigne AC, Davidson I, Moras D (1998). „Lidský TAF (II) 28 a TAF (II) 18 interagují histonovým záhybem kódovaným atypickými evolučními konzervativními motivy, které se také nacházejí v rodině SPT3. Buňka. 94 (2): 239–49. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81423-3. PMID 9695952.
- Imabayashi H, Mori T, Gojo S, Kiyono T, Sugiyama T, Irie R, Isogai T, Hata J, Toyama Y, Umezawa A (2003). „Rediferenciace dediferencovaných chondrocytů a chondrogeneze lidských stromálních buněk kostní dřeně prostřednictvím tvorby chondrosféry s profilováním exprese pomocí analýzy velkého měřítka cDNA“. Exp. Cell Res. 288 (1): 35–50. doi:10.1016 / S0014-4827 (03) 00130-7. PMID 12878157.
externí odkazy
- Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q15543 (Transkripční iniciační faktor TFIID podjednotka 13) na PDBe-KB.
Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |