Kopresor jaderného receptoru 2 - Nuclear receptor co-repressor 2

NCOR2
Protein NCOR2 PDB 1xc5.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyNCOR2, CTG26, N-CoR2, SMAP270, SMRT, SMRTE, SMRTE-tau, TNRC14, TRAC, TRAC-1, TRAC1, jaderný receptor corepressor 2
Externí IDOMIM: 600848 MGI: 1337080 HomoloGene: 31370 Genové karty: NCOR2
Umístění genu (člověk)
Chromozom 12 (lidský)
Chr.Chromozom 12 (lidský)[1]
Chromozom 12 (lidský)
Genomické umístění pro NCOR2
Genomické umístění pro NCOR2
Kapela12q24.31Start124,324,415 bp[1]
Konec124,567,589 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE NCOR2 208888 s na fs.png

PBB GE NCOR2 207760 s na fs.png

PBB GE NCOR2 208889 s na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

9612

20602

Ensembl

ENSG00000196498

ENSMUSG00000029478

UniProt

Q9Y618

Q9WU42

RefSeq (mRNA)

NM_006312
NM_001077261
NM_001206654

NM_001253904
NM_001253905
NM_011424

RefSeq (protein)

NP_001070729
NP_001193583
NP_006303
NP_001193583.1

NP_001240833
NP_001240834
NP_035554

Místo (UCSC)Chr 12: 124,32 - 124,57 MbChr 5: 125,02 - 125,18 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

The korepresor jaderného receptoru 2 (NCOR2 ) je transkripční koregulační protein, který obsahuje několik jaderný receptor -interagující domény. Navíc se zdá, že NCOR2 získává histonové deacetylázy do oblastí promotoru DNA. Proto NCOR2 pomáhá jaderným receptorům při pádu nařízení exprese cílového genu.[5][6] NCOR2 se také označuje jako tlumič hluku pro receptory retinoidů nebo hormonů štítné žlázy (SMRT)[5] nebo T3 kofaktor spojující receptory 1 (TRAC-1).[6]

Funkce

NCOR2 / SMRT je transkripční koregulační protein, který obsahuje několik modulačních funkčních domén včetně několika autonomních represivních domén a také dvě nebo tři C-terminál domény interagující s jaderným receptorem.[5] NCOR2 / SMRT slouží jako represivní regulační faktor (corepressor ) pro více transkripční faktor cesty. V tomto ohledu funguje NCOR2 / SMRT jako platformový protein, který usnadňuje nábor histonové deacetylázy na promotory DNA vázané svými interagujícími transkripčními faktory.[7]

Rodina

Je členem rodiny nuklepresorů jaderných receptorů; druhý lidský protein, který je členem této rodiny, je Korepresor jaderného receptoru 1.[8]

Objev

SMRT byl původně klonován a charakterizován v laboratoři Dr. Ronald M. Evans na Salkově institutu pro biologická studia.[5] V dalším časném zkoumání této molekuly byly podobné nálezy hlášeny u varianty označované jako TRAC-1.[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že ko-represor 2 jaderného receptoru komunikovat s:

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000196498 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000029478 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ A b C d Chen JD, Evans RM (říjen 1995). "Transkripční korepresor, který interaguje s nukleárními receptory hormonů". Příroda. 377 (6548): 454–7. Bibcode:1995 Natur.377..454C. doi:10.1038 / 377454a0. PMID  7566127. S2CID  4361329.
  6. ^ A b C Sande S, Privalsky ML (červenec 1996). „Identifikace TRAC (kofaktorů asociovaných s receptorem T3), rodiny kofaktorů, které se sdružují s a modulují aktivitu jaderných hormonálních receptorů“. Molekulární endokrinologie. 10 (7): 813–25. doi:10.1210 / já 10.7.813. PMID  8813722.
  7. ^ Nagy L, Kao HY, Chakravarti D, Lin RJ, Hassig CA, Ayer DE, Schreiber SL, Evans RM (květen 1997). „Represe jaderného receptoru zprostředkovaná komplexem obsahujícím SMRT, mSin3A a histon-deacetylázu“. Buňka. 89 (3): 373–80. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80218-4. PMID  9150137. S2CID  14686941.
  8. ^ UniProt Rodina nuklepresorů nukleárních receptorů Stránka zobrazena 26. června 2016
  9. ^ Liao G, Chen LY, Zhang A, Godavarthy A, Xia F, Ghosh JC, Li H, Chen JD (únor 2003). "Regulace aktivity androgenního receptoru pomocí jádrového receptoru corepresoru SMRT". The Journal of Biological Chemistry. 278 (7): 5052–61. doi:10,1074 / jbc.M206374200. PMID  12441355.
  10. ^ Song LN, Coghlan M, Gelmann EP (leden 2004). „Antiandrogenní účinky mifepristonu na interakce koaktivátoru a korpresoru s androgenovým receptorem“. Molekulární endokrinologie. 18 (1): 70–85. doi:10.1210 / me.2003-0189. PMID  14593076.
  11. ^ Dotzlaw H, Moehren U, Mink S, Cato AC, Iñiguez Lluhí JA, Baniahmad A (duben 2002). „Amino-konec lidského AR je terčem pro působení korpresoru a antihormonového agonismu.“. Molekulární endokrinologie. 16 (4): 661–73. doi:10.1210 / mě.16.4.661. PMID  11923464.
  12. ^ A b Wong CW, Privalsky ML (říjen 1998). „Komponenty komplexu corepressorů SMRT vykazují výrazné interakce s onkoproteiny v doméně POZ PLZF, PLZF-RARalpha a BCL-6“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (42): 27695–702. doi:10.1074 / jbc.273.42.27695. PMID  9765306.
  13. ^ Huynh KD, Fischle W, Verdin E, Bardwell VJ (červenec 2000). „BCoR, nový corepresor podílející se na represi BCL-6“. Geny a vývoj. 14 (14): 1810–23. doi:10.1101 / gad.14.14.1810 (neaktivní 12. 10. 2020). PMC  316791. PMID  10898795.CS1 maint: DOI neaktivní od října 2020 (odkaz)
  14. ^ Deltour S, Guerardel C, Leprince D (prosinec 1999). „Nábor komplexů potlačujících SMRT / N-CoR-mSin3A-HDAC není obecným mechanismem pro transkripční represory BTB / POZ: případ HIC-1 a gammaFBP-B“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 96 (26): 14831–6. Bibcode:1999PNAS ... 9614831D. doi:10.1073 / pnas.96.26.14831. PMC  24733. PMID  10611298.
  15. ^ A b C d Lee SK, Kim JH, Lee YC, Cheong J, Lee JW (duben 2000). „Ztlumení mediátoru receptorů kyseliny retinové a hormonů štítné žlázy, jako nová transkripční molekula corepresoru aktivujícího protein-1, nukleární faktor-kappaB a sérový faktor odpovědi“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (17): 12470–4. doi:10.1074 / jbc.275.17.12470. PMID  10777532.
  16. ^ A b Fischer DD, Cai R, Bhatia U, Asselbergs FA, Song C, Terry R, ​​Trogani N, Widmer R, Atadja P, Cohen D (únor 2002). „Izolace a charakterizace nové histonové deacetylázy třídy II, HDAC10“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (8): 6656–66. doi:10,1074 / jbc.M108055200. PMID  11739383.
  17. ^ A b Underhill C, Qutob MS, Yee SP, Torchia J (prosinec 2000). „Nový komplex nuklepresorů nukleárních receptorů, N-CoR, obsahuje složky savčího komplexu SWI / SNF a corepresorů KAP-1“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (51): 40463–70. doi:10,1074 / jbc.M007864200. PMID  11013263.
  18. ^ A b C Li J, Wang J, Wang J, Nawaz Z, Liu JM, Qin J, Wong J (srpen 2000). „Jak corepresorové proteiny SMRT, tak N-CoR existují ve velkých proteinových komplexech obsahujících HDAC3“. Časopis EMBO. 19 (16): 4342–50. doi:10.1093 / emboj / 19.16.4342. PMC  302030. PMID  10944117.
  19. ^ A b Yoon HG, Chan DW, Huang ZQ, Li J, Fondell JD, Qin J, Wong J (březen 2003). „Čištění a funkční charakterizace lidského komplexu N-CoR: role HDAC3, TBL1 a TBLR1“. Časopis EMBO. 22 (6): 1336–46. doi:10.1093 / emboj / cdg120. PMC  151047. PMID  12628926.
  20. ^ A b Guenther MG, Yu J, Kao GD, Yen TJ, Lazar MA (prosinec 2002). „Sestavení represivního komplexu SMRT-histon-deacetyláza 3 vyžaduje kruhový komplex TCP-1“. Geny a vývoj. 16 (24): 3130–5. doi:10.1101 / gad.1037502. PMC  187500. PMID  12502735.
  21. ^ A b Guenther MG, Lane WS, Fischle W, Verdin E, Lazar MA, Shiekhattar R (květen 2000). „Jádrový komplex SMRT corepressor obsahující HDAC3 a TBL1, protein WD40-repeat spojený s hluchotou“. Geny a vývoj. 14 (9): 1048–57. doi:10.1101 / gad.14.9.1048 (neaktivní 12. 10. 2020). PMC  316569. PMID  10809664.CS1 maint: DOI neaktivní od října 2020 (odkaz)
  22. ^ A b Fischle W, Dequiedt F, Hendzel MJ, Guenther MG, Lazar MA, Voelter W, Verdin E (leden 2002). „Enzymatická aktivita spojená s HDAC třídy II závisí na multiproteinovém komplexu obsahujícím HDAC3 a SMRT / N-CoR“. Molekulární buňka. 9 (1): 45–57. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00429-4. hdl:11858 / 00-001M-0000-002C-9FF9-9. PMID  11804585.
  23. ^ Yoon HG, Chan DW, Reynolds AB, Qin J, Wong J (září 2003). „N-CoR zprostředkovává represi závislou na methylaci DNA prostřednictvím proteinu Kaiso vázajícího methyl CpG“. Molekulární buňka. 12 (3): 723–34. doi:10.1016 / j.molcel.2003.08.008. PMID  14527417.
  24. ^ A b C Huang EY, Zhang J, Miska EA, Guenther MG, Kouzarides T, Lazar MA (leden 2000). „Corepresory jaderných receptorů spolupracují s histonovými deacetylázami třídy II v represivní cestě nezávislé na Sin3“. Geny a vývoj. 14 (1): 45–54. PMC  316335. PMID  10640275.
  25. ^ Lyst MJ, Ekiert R, Ebert DH, Merusi C, Nowak J, Selfridge J, Guy J, Kastan NR, Robinson ND, de Lima Alves F, Rappsilber J, Greenberg ME, Bird A (červenec 2013). „Mutace Rettova syndromu ruší interakci MeCP2 s korepresorem NCoR / SMRT“. Přírodní neurovědy. 16 (7): 898–902. doi:10.1038 / č. 3434. PMC  3786392. PMID  23770565.
  26. ^ Sohn YC, Kwak E, Na Y, Lee JW, Lee SK (listopad 2001). „Ztlumení mediátoru receptorů retinoidů a hormonů štítné žlázy a aktivace signálního kointegrátoru-2 jako transkripčních koregulátorů osiřelého jaderného receptoru Nur77“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (47): 43734–9. doi:10,1074 / jbc.M107208200. PMID  11559707.
  27. ^ Kakizawa T, Miyamoto T, Ichikawa K, Takeda T, Suzuki S, Mori J, Kumagai M, Yamashita K, Hashizume K (březen 2001). „Tlumící mediátor pro receptory retinoidů a hormonů štítné žlázy interaguje s oktamerovým transkripčním faktorem-1 a působí jako transkripční represor“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (13): 9720–5. doi:10,1074 / jbc.M008531200. PMID  11134019.
  28. ^ Shi Y, Hon M, Evans RM (březen 2002). „Delta receptoru aktivovaného proliferátorem peroxisomu, integrátor transkripční represe a signalizace jaderného receptoru“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 99 (5): 2613–8. Bibcode:2002PNAS ... 99.2613S. doi:10.1073 / pnas.052707099. PMC  122396. PMID  11867749.
  29. ^ Giangrande PH, Kimbrel EA, Edwards DP, McDonnell DP (květen 2000). „Protichůdné transkripční aktivity dvou izoforem receptoru lidského progesteronu jsou způsobeny rozdílnou vazbou kofaktorů.“. Molekulární a buněčná biologie. 20 (9): 3102–15. doi:10.1128 / MCB.20.9.3102-3115.2000. PMC  85605. PMID  10757795.
  30. ^ Khan MM, Nomura T, Kim H, Kaul SC, Wadhwa R, Shinagawa T, Ichikawa-Iwata E, Zhong S, Pandolfi PP, Ishii S (červen 2001). "Role PML a PML-RARalfa v šíření zprostředkovaném transkripční represí". Molekulární buňka. 7 (6): 1233–43. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00257-X. PMID  11430826.
  31. ^ Hong SH, Yang Z, Privalsky ML (listopad 2001). „Oxid arsenitý je silným inhibitorem interakce koronororu SMRT s partnery transkripčního faktoru, včetně alfa onkoproteinu receptoru kyseliny PML-retinové nacházejícího se u lidské akutní promyelocytární leukémie.“. Molekulární a buněčná biologie. 21 (21): 7172–82. doi:10.1128 / MCB.21.21.7172-7182.2001. PMC  99892. PMID  11585900.
  32. ^ Beatus P, Lundkvist J, Oberg C, Pedersen K, Lendahl U (červen 2001). „Původ ankyrinové repetiční oblasti v intracelulárních doménách Notch je rozhodující pro regulaci aktivity HES promotoru“. Mechanismy rozvoje. 104 (1–2): 3–20. doi:10.1016 / S0925-4773 (01) 00373-2. PMID  11404076. S2CID  9526831.
  33. ^ Zhou S, Hayward SD (září 2001). „Jaderná lokalizace CBF1 je regulována interakcemi s komplexem corepressorů SMRT“. Molekulární a buněčná biologie. 21 (18): 6222–32. doi:10.1128 / MCB.21.18.6222-6232.2001. PMC  87339. PMID  11509665.
  34. ^ Espinosa L, Inglés-Esteve J, Robert-Moreno A, Bigas A (únor 2003). „IkappaBalpha a p65 regulují cytoplazmatické vypouštění jaderných jaderných kompresorů: vzájemné rozhovory mezi dráhami Notch a NFkappaB“. Molekulární biologie buňky. 14 (2): 491–502. doi:10,1091 / mbc.E02-07-0404. PMC  149987. PMID  12589049.
  35. ^ A b Takahashi S, McConnell MJ, Harigae H, Kaku M, Sasaki T, Melnick AM, Licht JD (červen 2004). „Interní mutant duplikace tandemu Flt3 inhibuje funkci transkripčních represorů blokováním interakcí s SMRT“. Krev. 103 (12): 4650–8. doi:10.1182 / krev-2003-08-2759. PMID  14982881.
  36. ^ Zhang J, Hug BA, Huang EY, Chen CW, Gelmetti V, Maccarana M, Minucci S, Pelicci PG, Lazar MA (leden 2001). „Oligomerizace ETO je pro interakci s corepressorem povinná“. Molekulární a buněčná biologie. 21 (1): 156–63. doi:10.1128 / MCB.21.1.156-163.2001. PMC  88789. PMID  11113190.
  37. ^ Dong S, Tweardy DJ (duben 2002). „Interakce STAT5b-RARalfa, nového fúzního proteinu akutní promyelocytární leukémie, s receptorem kyseliny retinové a signálními cestami STAT3“. Krev. 99 (8): 2637–46. doi:10,1182 / krev. V99.8.2637. PMID  11929748.
  38. ^ A b Hong SH, David G, Wong CW, Dejean A, Privalsky ML (srpen 1997). „Korpresor SMRT interaguje s PLZF a s receptorem alfa-PML-retinové kyseliny alfa (RARalfa) a onkoproteiny PLZF-RARalfa spojenými s akutní promyelocytární leukemií“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 94 (17): 9028–33. Bibcode:1997PNAS ... 94.9028H. doi:10.1073 / pnas.94.17.9028. PMC  23013. PMID  9256429.
  39. ^ Zhou S, Fujimuro M, Hsieh JJ, Chen L, Hayward SD (únor 2000). „Role SKIP v aktivaci EBNA2 promotorů potlačovaných CBF1“. Journal of Virology. 74 (4): 1939–47. doi:10.1128 / JVI.74.4.1939-1947.2000. PMC  111672. PMID  10644367.
  40. ^ Zhou S, Fujimuro M, Hsieh JJ, Chen L, Miyamoto A, Weinmaster G, Hayward SD (duben 2000). „SKIP, protein asociovaný s CBF1, interaguje s ankyrinovou repetiční doménou NotchIC k usnadnění funkce NotchIC“. Molekulární a buněčná biologie. 20 (7): 2400–10. doi:10.1128 / MCB.20.7.2400-2410.2000. PMC  85419. PMID  10713164.
  41. ^ Shi Y, Downes M, Xie W, Kao HY, Ordentlich P, Tsai CC, Hon M, Evans RM (květen 2001). „Sharp, indukovatelný kofaktor, který integruje represi a aktivaci jaderných receptorů“. Geny a vývoj. 15 (9): 1140–51. doi:10,1101 / gad. 871201. PMC  312688. PMID  11331609.
  42. ^ Liu Y, Takeshita A, Misiti S, Chin WW, Yen PM (říjen 1998). „Nedostatek interakce koaktivátorů může být mechanismem dominantní negativní aktivity mutantních receptorů hormonů štítné žlázy.“. Endokrinologie. 139 (10): 4197–204. doi:10.1210 / endo.139.10.6218. PMID  9751500.
  43. ^ A b Tagami T, Lutz WH, Kumar R, Jameson JL (prosinec 1998). "Interakce receptoru vitaminu D s jádrovými receptory a koaktivátory". Komunikace pro biochemický a biofyzikální výzkum. 253 (2): 358–63. doi:10.1006 / bbrc.1998.9799. PMID  9878542.
  44. ^ Ando S, Sarlis NJ, Krishnan J, Feng X, Refetoff S, Zhang MQ, Oldfield EH, Yen PM (září 2001). „Aberantní alternativní sestřih receptoru hormonu štítné žlázy v nádoru hypofýzy vylučující TSH je mechanismem hormonální rezistence“. Molekulární endokrinologie. 15 (9): 1529–38. doi:10.1210 / me.15.9.1529. PMID  11518802.
  45. ^ Puccetti E, Obradovic D, Beissert T, Bianchini A, Washburn B, Chiaradonna F, Boehrer S, Hoelzer D, Ottmann OG, Pelicci PG, Nervi C, Ruthardt M (prosinec 2002). „Produkty translokace spojené s AML blokují diferenciaci indukovanou vitaminem D (3) sekvestrací receptoru vitaminu D (3)“. Výzkum rakoviny. 62 (23): 7050–8. PMID  12460926.

Další čtení


externí odkazy