Korepresor jaderného receptoru 1 - Nuclear receptor co-repressor 1

NCOR1
Protein NCOR1 PDB 2EQR.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyNCOR1, N-CoR, N-CoR1, PPP1R109, TRAC1, hN-CoR, jaderný receptorový corepresor 1
Externí IDOMIM: 600849 MGI: 1349717 HomoloGene: 38166 Genové karty: NCOR1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 17 (lidský)
Chr.Chromozom 17 (lidský)[1]
Chromozom 17 (lidský)
Genomic location for NCOR1
Genomic location for NCOR1
Kapela17p12-p11.2Start16,029,157 bp[1]
Konec16,218,185 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE NCOR1 200856 x at fs.png

PBB GE NCOR1 200854 at fs.png

PBB GE NCOR1 200855 at fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

9611

20185

Ensembl

ENSG00000141027

ENSMUSG00000018501

UniProt

O75376

Q60974

RefSeq (mRNA)

NM_001190438
NM_001190440
NM_006311

NM_001252313
NM_011308
NM_177229

RefSeq (protein)

NP_001177367
NP_001177369
NP_006302

n / a

Místo (UCSC)Chr 17: 16,03 - 16,22 MbChr 11: 62,32 - 62,46 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

The korepresor jaderného receptoru 1 známý také jako korepresor 1 spojený s hormonem štítné žlázy a kyselinou retinovou (TRAC-1) je protein že u lidí je kódován NCOR1 gen.[5][6]

NCOR1 je transkripční koregulační protein, který obsahuje několik jaderný receptor interagující domény. Navíc se zdá, že NCOR1 získává histonové deacetylázy do oblastí promotoru DNA. NCOR1 tedy pomáhá jaderným receptorům při snižování regulace genové exprese.[5][7]

Ztráta funkce tohoto proteinu významně zvyšuje sílu a sílu myších svalů.[8]

Rodina

Je členem rodiny nuklepresorů jaderných receptorů; druhý lidský protein, který je členem této rodiny, je Kopresor jaderného receptoru 2.[9]

Interakce

Bylo prokázáno, že ko-represor 1 jaderného receptoru komunikovat s:

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000141027 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000018501 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ A b Hörlein AJ, Näär AM, Heinzel T, Torchia J, Gloss B, Kurokawa R, Ryan A, Kamei Y, Söderström M, Glass CK (říjen 1995). „Na ligandu nezávislá represe receptorem hormonu štítné žlázy zprostředkovaná korepresorem jaderného receptoru“. Příroda. 377 (6548): 397–404. Bibcode:1995 Natur.377..397H. doi:10.1038 / 377397a0. PMID  7566114. S2CID  4230850.
  6. ^ Wang J, Hoshino T, Redner RL, Kajigaya S, Liu JM (září 1998). „ETO, fúzní partner v t (8; 21) akutní myeloidní leukémie, potlačuje transkripci interakcí s lidským komplexem N-CoR / mSin3 / HDAC1“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (18): 10860–5. Bibcode:1998PNAS ... 9510860W. doi:10.1073 / pnas.95.18.10860. PMC  27986. PMID  9724795.
  7. ^ Wang J, Hoshino T, Redner RL, Kajigaya S, Liu JM (1998). „ETO, fúzní partner t (8; 21) akutní myeloidní leukémie, potlačuje transkripci interakcí s lidským komplexem N-CoR / mSin3 / HDAC1“. Proc Natl Acad Sci USA. 95 (18): 10860–5. Bibcode:1998PNAS ... 9510860W. doi:10.1073 / pnas.95.18.10860. PMC  27986. PMID  9724795.
  8. ^ Yamamoto H, Williams EG, Mouchiroud L, Cantó C, Fan W, Downes M, Héligon C, Barish GD, Desvergne B, Evans RM, Schoonjans K, Auwerx J (2011). „NCoR1 je konzervovaný fyziologický modulátor svalové hmoty a oxidační funkce“. Buňka. 147 (4): 827–839. doi:10.1016 / j.cell.2011.10.017. PMC  3225739. PMID  22078881.
  9. ^ UniProt Rodina nuklepresorů nukleárních receptorů Stránka zobrazena 26. června 2016
  10. ^ Masiello D, Chen SY, Xu Y, Verhoeven MC, Choi E, Hollenberg AN, Balk SP (říjen 2004). „Nábor beta-kateninu divokým nebo mutantním androgenním receptorem koreluje s ligandem stimulovaným růstem buněk rakoviny prostaty.“. Mol. Endokrinol. 18 (10): 2388–401. doi:10.1210 / me.2003-0436. PMID  15256534.
  11. ^ Song LN, Coghlan M, Gelmann EP (leden 2004). „Antiandrogenní účinky mifepristonu na interakce koaktivátoru a korpresoru s androgenovým receptorem“. Mol. Endokrinol. 18 (1): 70–85. doi:10.1210 / me.2003-0189. PMID  14593076.
  12. ^ Cheng S, Brzostek S, Lee SR, Hollenberg AN, Balk SP (červenec 2002). "Inhibice dihydrotestosteronem aktivovaného androgenního receptoru jaderným receptorem corepressor". Mol. Endokrinol. 16 (7): 1492–501. doi:10.1210 / oprava.16.7.0870. PMID  12089345.
  13. ^ Hodgson MC, Astapova I, Cheng S, Lee LJ, Verhoeven MC, Choi E, Balk SP, Hollenberg AN (únor 2005). „Androgenní receptor rekrutuje jaderný receptor CoRepressor (N-CoR) v přítomnosti mifepristonu prostřednictvím svých N a C konců, což odhaluje nový molekulární mechanismus pro antagonisty androgenových receptorů“. J. Biol. Chem. 280 (8): 6511–9. doi:10,1074 / jbc.M408972200. PMID  15598662.
  14. ^ Tai HH, Geisterfer M, Bell JC, Moniwa M, Davie JR, Boucher L, McBurney MW (srpen 2003). „CHD1 se asociuje s NCoR a histon-deacetylázou i s proteiny sestřihu RNA“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 308 (1): 170–6. doi:10.1016 / s0006-291x (03) 01354-8. PMID  12890497.
  15. ^ Puccetti E, Obradovic D, Beissert T, Bianchini A, Washburn B, Chiaradonna F, Boehrer S, Hoelzer D, Ottmann OG, Pelicci PG, Nervi C, Ruthardt M (prosinec 2002). „Produkty translokace spojené s AML blokují diferenciaci indukovanou vitaminem D (3) sekvestrací receptoru vitaminu D (3)“. Cancer Res. 62 (23): 7050–8. PMID  12460926.
  16. ^ Tagami T, Lutz WH, Kumar R, Jameson JL (prosinec 1998). "Interakce receptoru vitaminu D s jádrovými receptory a koaktivátory". Biochem. Biophys. Res. Commun. 253 (2): 358–63. doi:10.1006 / bbrc.1998.9799. PMID  9878542.
  17. ^ A b C d E Zhang J, Kalkum M, Chait BT, Roeder RG (březen 2002). „Komplex nuklepresorových jaderných receptorů N-CoR-HDAC3 inhibuje dráhu JNK přes integrovanou podjednotku GPS2“. Mol. Buňka. 9 (3): 611–23. doi:10.1016 / s1097-2765 (02) 00468-9. PMID  11931768.
  18. ^ A b C d Yoon HG, Chan DW, Reynolds AB, Qin J, Wong J (září 2003). „N-CoR zprostředkovává represi závislou na methylaci DNA prostřednictvím proteinu Kaiso vázajícího methyl CpG“. Mol. Buňka. 12 (3): 723–34. doi:10.1016 / j.molcel.2003.08.008. PMID  14527417.
  19. ^ A b C d Yoon HG, Chan DW, Huang ZQ, Li J, Fondell JD, Qin J, Wong J (březen 2003). „Čištění a funkční charakterizace lidského komplexu N-CoR: role HDAC3, TBL1 a TBLR1“. EMBO J.. 22 (6): 1336–46. doi:10.1093 / emboj / cdg120. PMC  151047. PMID  12628926.
  20. ^ Stevens A, Garside H, Berry A, Waters C, White A, Ray D (květen 2003). „Disociace koaktivátoru steroidních receptorů 1 a náboru jádrového receptoru jaderného receptoru na lidský glukokortikoidový receptor modifikací rozhraní ligand-receptor: role tyrosinu 735“. Mol. Endokrinol. 17 (5): 845–59. doi:10.1210 / me.2002-0320. PMID  12569182.
  21. ^ Schulz M, Eggert M, Baniahmad A, Dostert A, Heinzel T, Renkawitz R (červenec 2002). „Agonismus glukokortikoidových receptorů indukovaný RU486 je řízen N-koncem receptoru a vazbou na jádro. J. Biol. Chem. 277 (29): 26238–43. doi:10,1074 / jbc.M203268200. PMID  12011091.
  22. ^ A b Fischle W, Dequiedt F, Fillion M, Hendzel MJ, Voelter W, Verdin E (září 2001). „Aktivita lidské HDAC7 histon-deacetylázy je spojena s HDAC3 in vivo“. J. Biol. Chem. 276 (38): 35826–35. doi:10,1074 / jbc.M104935200. PMID  11466315.
  23. ^ A b Li J, Wang J, Wang J, Nawaz Z, Liu JM, Qin J, Wong J (srpen 2000). „Jak corepresorové proteiny SMRT, tak N-CoR existují ve velkých proteinových komplexech obsahujících HDAC3“. EMBO J.. 19 (16): 4342–50. doi:10.1093 / emboj / 19.16.4342. PMC  302030. PMID  10944117.
  24. ^ A b Fischle W, Dequiedt F, Hendzel MJ, Guenther MG, Lazar MA, Voelter W, Verdin E (leden 2002). „Enzymatická aktivita spojená s HDAC třídy II závisí na multiproteinovém komplexu obsahujícím HDAC3 a SMRT / N-CoR“. Mol. Buňka. 9 (1): 45–57. doi:10.1016 / s1097-2765 (01) 00429-4. hdl:11858 / 00-001M-0000-002C-9FF9-9. PMID  11804585.
  25. ^ A b Underhill C, Qutob MS, Yee SP, Torchia J (prosinec 2000). „Nový komplex nuklepresorů nukleárních receptorů, N-CoR, obsahuje složky savčího komplexu SWI / SNF a corepresorů KAP-1“. J. Biol. Chem. 275 (51): 40463–70. doi:10,1074 / jbc.M007864200. PMID  11013263.
  26. ^ A b Huang EY, Zhang J, Miska EA, Guenther MG, Kouzarides T, Lazar MA (leden 2000). „Corepresory jaderných receptorů spolupracují s histonovými deacetylázami třídy II v represivní cestě nezávislé na Sin3“. Genes Dev. 14 (1): 45–54. PMC  316335. PMID  10640275.
  27. ^ Petrie K, Guidez F, Howell L, Healy L, Waxman S, Greaves M, Zelent A (květen 2003). „Gen histon-deacetylázy 9 kóduje více izoforem proteinů“. J. Biol. Chem. 278 (18): 16059–72. doi:10,1074 / jbc.M212935200. PMID  12590135.
  28. ^ Iso T, Sartorelli V, Poizat C, Iezzi S, Wu HY, Chung G, Kedes L, Hamamori Y (září 2001). „HERP, nový heterodimerový partner HES / E (spl) v signalizaci Notch“. Mol. Buňka. Biol. 21 (17): 6080–9. doi:10.1128 / mcb.21.17.6080-6089.2001. PMC  87325. PMID  11486045.
  29. ^ Baek SH, Ohgi KA, Rose DW, Koo EH, Glass CK, Rosenfeld MG (červenec 2002). „Výměna N-CoR korepresoru a komplexů koaktivátoru Tip60 spojuje genovou expresi pomocí NF-kappaB a prekurzorového proteinu beta-amyloidu“. Buňka. 110 (1): 55–67. doi:10.1016 / S0092-8674 (02) 00809-7. PMID  12150997. S2CID  17679498.
  30. ^ Kokura K, Kaul SC, Wadhwa R, Nomura T, Khan MM, Shinagawa T, Yasukawa T, Colmenares C, Ishii S (září 2001). „Rodina proteinů Ski je vyžadována pro transkripční represi zprostředkovanou MeCP2“. J. Biol. Chem. 276 (36): 34115–21. doi:10,1074 / jbc.M105747200. PMID  11441023.
  31. ^ A b C Dowell P, Ishmael JE, Avram D, Peterson VJ, Nevrivy DJ, Leid M (květen 1999). „Identifikace jádrového receptoru jaderného receptoru jako proteinu interagujícího s receptorem aktivovaným proliferátorem peroxisomu“. J. Biol. Chem. 274 (22): 15901–7. doi:10.1074 / jbc.274.22.15901. PMID  10336495.
  32. ^ Khan MM, Nomura T, Kim H, Kaul SC, Wadhwa R, Shinagawa T, Ichikawa-Iwata E, Zhong S, Pandolfi PP, Ishii S (červen 2001). "Role PML a PML-RARalfa v šíření zprostředkovaném transkripční represí". Mol. Buňka. 7 (6): 1233–43. doi:10.1016 / s1097-2765 (01) 00257-x. PMID  11430826.
  33. ^ Amann JM, Nip J, Strom DK, Lutterbach B, Harada H, Lenny N, Downing JR, Meyers S, Hiebert SW (říjen 2001). „ETO, cíl t (8; 21) u akutní leukémie, vytváří zřetelné kontakty s více histonovými deacetylázami a váže mSin3A prostřednictvím své oligomerizační domény“. Mol. Buňka. Biol. 21 (19): 6470–83. doi:10.1128 / mcb.21.19.6470-6483.2001. PMC  99794. PMID  11533236.
  34. ^ Zhang J, Hug BA, Huang EY, Chen CW, Gelmetti V, Maccarana M, Minucci S, Pelicci PG, Lazar MA (leden 2001). „Oligomerizace ETO je pro interakci s corepressorem povinná“. Mol. Buňka. Biol. 21 (1): 156–63. doi:10.1128 / MCB.21.1.156-163.2001. PMC  88789. PMID  11113190.
  35. ^ Guidez F, Ivins S, Zhu J, Söderström M, Waxman S, Zelent A (duben 1998). "Snížená citlivost na kyselinu retinovou na vazebný jádrový receptor jaderného receptoru na PML a PLZF-RARalfa je základem molekulární patogeneze a léčby akutní promyelocytární leukémie". Krev. 91 (8): 2634–42. doi:10,1182 / krev. V91.8.2634.2634_2634_2642. PMID  9531570.
  36. ^ Laherty CD, Billin AN, Lavinsky RM, Yochum GS, Bush AC, Sun JM, Mullen TM, Davie JR, Rose DW, Glass CK, Rosenfeld MG, Ayer DE, Eisenman RN (červenec 1998). „SAP30, součást komplexu mSin3 corepressor zapojeného do N-CoR zprostředkované represi specifickými transkripčními faktory“. Mol. Buňka. 2 (1): 33–42. doi:10.1016 / s1097-2765 (00) 80111-2. PMID  9702189.
  37. ^ Guenther MG, Lane WS, Fischle W, Verdin E, Lazar MA, Shiekhattar R (květen 2000). „Jádrový komplex SMRT corepressor obsahující HDAC3 a TBL1, protein WD40-repeat spojený s hluchotou“. Genes Dev. 14 (9): 1048–57. doi:10.1101 / gad.14.9.1048 (neaktivní 2020-10-04). PMC  316569. PMID  10809664.CS1 maint: DOI neaktivní od října 2020 (odkaz)

Další čtení

externí odkazy