Histon deacetyláza 5 - Histone deacetylase 5
Histon deacetyláza 5 je enzym že u lidí je kódován HDAC5 gen.[5][6][7]
Funkce
Histony hrají klíčovou roli v regulaci transkripce, progresi buněčného cyklu a vývojových událostech. Acetylace / deacetylace histonu se mění chromozóm struktura a ovlivňuje transkripční faktor přístup k DNA. Protein kódovaný tímto genem patří do rodiny histon deacetylázy / acuc / apha třídy II. Má to histon deacetyláza aktivita a potlačuje transkripci, když je uvázána na promotéru. Koimmunoprecipituje pouze s členem rodiny HDAC3 a může tvořit vícekomplexní proteiny. Interaguje také s proteiny faktoru 2 (MEF2) zesilujícími myocyty, což vede k represi genů závislých na MEF2. Předpokládá se, že tento gen je spojován s rakovinou tlustého střeva. Pro tento gen byly nalezeny dvě varianty transkriptu kódující různé izoformy.[7]
AMP-aktivovaná protein kináza regulace transportéru glukózy GLUT4 nastává fosforylace HDAC5.[8]
HDAC5 je zapojen do konsolidace paměti a navrhuje, aby vývoj více selektivní Inhibitory HDAC pro léčbu Alzheimerova choroba by se neměli zaměřovat na HDAC5.[9] Jeho funkce může být účinně zkoumána knoRowem siRNA na základě nezávislého ověření.[10]
Nadměrná exprese HDAC5 v uroteliální buněčné linie karcinomu inhibují dlouhodobou proliferaci, ale mohou podporovat přechod z epitelu na mezenchym (EMT )[11]
Interakce
Bylo prokázáno, že histon deacetyláza 5 komunikovat s:
Viz také
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000108840 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000008855 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b Grozinger CM, Hassig CA, Schreiber SL (duben 1999). „Tři proteiny definují třídu lidských histonových deacetyláz souvisejících s kvasinkami Hda1p“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 96 (9): 4868–73. doi:10.1073 / pnas.96.9.4868. PMC 21783. PMID 10220385.
- ^ Scanlan MJ, Chen YT, Williamson B, Gure AO, Stockert E, Gordan JD a kol. (Květen 1998). "Charakterizace lidských antigenů rakoviny tlustého střeva rozpoznávaných autologními protilátkami". International Journal of Cancer. 76 (5): 652–8. doi:10.1002 / (SICI) 1097-0215 (19980529) 76: 5 <652 :: AID-IJC7> 3.0.CO; 2-P. PMID 9610721.
- ^ A b "Entrez Gene: HDAC5 histon deacetyláza 5".
- ^ McGee SL, van Denderen BJ, Howlett KF, Mollica J, Schertzer JD, Kemp BE, Hargreaves M (duben 2008). „AMP-aktivovaná protein kináza reguluje transkripci GLUT4 fosforylací histon-deacetylázy 5“. Cukrovka. 57 (4): 860–7. doi:10.2337 / db07-0843. PMID 18184930. S2CID 17274354.
- ^ Agis-Balboa RC, Pavelka Z, Kerimoglu C, Fischer A (leden 2013). „Ztráta HDAC5 zhoršuje funkci paměti: důsledky pro Alzheimerovu chorobu“. Journal of Alzheimer's Disease. 33 (1): 35–44. doi:10.3233 / JAD-2012-121009. hdl:2434/223089. PMID 22914591.
- ^ Munkácsy G, Sztupinszki Z, Herman P, Bán B, Pénzváltó Z, Szarvas N, Győrffy B (září 2016). „Ověření účinnosti umlčování RNAi pomocí dat genového pole ukazuje 18,5% poruchovost ve 429 nezávislých experimentech“. Molekulární terapie. Nukleové kyseliny. 5 (9): e366. doi:10.1038 / mtna.2016.66. PMC 5056990. PMID 27673562.
- ^ Jaguva Vasudevan AA, Hoffmann MJ, Beck ML, Poschmann G, Petzsch P, Wiek C a kol. (Duben 2019). „Exprese HDAC5 v buněčných liniích uroteliálního karcinomu inhibuje dlouhodobou proliferaci, ale může podporovat přechod z epitelu na mezenchym.“. International Journal of Molecular Sciences. 20 (9): 2135. doi:10,3390 / ijms20092135. PMC 6539474. PMID 31052182.
- ^ A b Lemercier C, Brocard MP, Puvion-Dutilleul F, Kao HY, Albagli O, Khochbin S (červen 2002). „Histonové deacetylázy třídy II jsou přímo přijímány transkripčním represorem BCL6“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (24): 22045–52. doi:10,1074 / jbc.M201736200. PMID 11929873.
- ^ Zhang CL, McKinsey TA, Olson EN (říjen 2002). „Sdružení histonových deacetyláz třídy II s heterochromatinovým proteinem 1: potenciální role methylace histonu při kontrole diferenciace svalů“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (20): 7302–12. doi:10.1128 / MCB.22.20.7302-7312.2002. PMC 139799. PMID 12242305.
- ^ Watamoto K, Towatari M, Ozawa Y, Miyata Y, Okamoto M, Abe A a kol. (Prosinec 2003). „Změněná interakce HDAC5 s GATA-1 během diferenciace buněk MEL“. Onkogen. 22 (57): 9176–84. doi:10.1038 / sj.onc.1206902. PMID 14668799.
- ^ A b Zhang J, Kalkum M, Chait BT, Roeder RG (březen 2002). „Komplex nuklepresorových jaderných receptorů N-CoR-HDAC3 inhibuje dráhu JNK přes integrovanou podjednotku GPS2“. Molekulární buňka. 9 (3): 611–23. doi:10.1016 / S1097-2765 (02) 00468-9. PMID 11931768.
- ^ Fischle W, Dequiedt F, Hendzel MJ, Guenther MG, Lazar MA, Voelter W, Verdin E (leden 2002). „Enzymatická aktivita spojená s HDAC třídy II závisí na multiproteinovém komplexu obsahujícím HDAC3 a SMRT / N-CoR“. Molekulární buňka. 9 (1): 45–57. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00429-4. hdl:11858 / 00-001M-0000-002C-9FF9-9. PMID 11804585.
- ^ Grozinger CM, Schreiber SL (červenec 2000). „Regulace histon-deacetylázy 4 a 5 a transkripční aktivita prostřednictvím 14-3-3-dependentní buněčné lokalizace“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (14): 7835–40. doi:10.1073 / pnas.140199597. PMC 16631. PMID 10869435.
- ^ Koipally J, Georgopoulos K (srpen 2002). „Molekulární disekce represivních obvodů Ikarosu“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (31): 27697–705. doi:10,1074 / jbc.M201694200. PMID 12015313.
- ^ Lemercier C, Verdel A, Galloo B, Curtet S, Brocard MP, Khochbin S (květen 2000). „histondeacetyláza mHDA1 / HDAC5 interaguje s a potlačuje transkripční aktivitu MEF2A“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (20): 15594–9. doi:10,1074 / jbc.M908437199. PMID 10748098.
- ^ Castet A, Boulahtouf A, Versini G, Bonnet S, Augereau P, Vignon F a kol. (2004). „Více domén proteinu 140 interagujícího s receptory přispívá k inhibici transkripce“. Výzkum nukleových kyselin. 32 (6): 1957–66. doi:10.1093 / nar / gkh524. PMC 390375. PMID 15060175.
- ^ A b Huang EY, Zhang J, Miska EA, Guenther MG, Kouzarides T, Lazar MA (leden 2000). „Corepresory jaderných receptorů spolupracují s histonovými deacetylázami třídy II v represivní cestě nezávislé na Sin3“. Geny a vývoj. 14 (1): 45–54. PMC 316335. PMID 10640275.
- ^ Vega RB, Harrison BC, Meadows E, Roberts CR, Papst PJ, Olson EN, McKinsey TA (říjen 2004). „Proteinové kinázy C a D zprostředkovávají srdeční hypertrofii závislou na agonistovi prostřednictvím jaderného exportu histon-deacetylázy 5“. Molekulární a buněčná biologie. 24 (19): 8374–85. doi:10.1128 / MCB.24.19.8374-8385.2004. PMC 516754. PMID 15367659.
- ^ Chauchereau A, Mathieu M, de Saintignon J, Ferreira R, Pritchard LL, Mishal Z a kol. (Listopad 2004). „HDAC4 zprostředkovává transkripční represi proteinem PLZF spojeným s akutní promyelocytární leukémií“. Onkogen. 23 (54): 8777–84. doi:10.1038 / sj.onc.1208128. PMID 15467736.
Další čtení
- Verdin E, Dequiedt F, Kasler HG (květen 2003). „Histonové deacetylázy třídy II: univerzální regulátory“ (PDF). Trendy v genetice. 19 (5): 286–93. doi:10.1016 / S0168-9525 (03) 00073-8. PMID 12711221.
- Huang EY, Zhang J, Miska EA, Guenther MG, Kouzarides T, Lazar MA (leden 2000). „Corepresory jaderných receptorů spolupracují s histonovými deacetylázami třídy II v represivní cestě nezávislé na Sin3“. Geny a vývoj. 14 (1): 45–54. PMC 316335. PMID 10640275.
- Lemercier C, Verdel A, Galloo B, Curtet S, Brocard MP, Khochbin S (květen 2000). „histondeacetyláza mHDA1 / HDAC5 interaguje s a potlačuje transkripční aktivitu MEF2A“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (20): 15594–9. doi:10,1074 / jbc.M908437199. PMID 10748098.
- Grozinger CM, Schreiber SL (červenec 2000). „Regulace histon-deacetylázy 4 a 5 a transkripční aktivita prostřednictvím 14-3-3-dependentní buněčné lokalizace“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (14): 7835–40. doi:10.1073 / pnas.140199597. PMC 16631. PMID 10869435.
- Huynh KD, Fischle W, Verdin E, Bardwell VJ (červenec 2000). „BCoR, nový corepresor podílející se na represi BCL-6“. Geny a vývoj. 14 (14): 1810–23. doi:10.1101 / gad.14.14.1810 (neaktivní 9. 9. 2020). PMC 316791. PMID 10898795.CS1 maint: DOI neaktivní od září 2020 (odkaz)
- Mahlknecht U, Schnittger S, Ottmann OG, Schoch C, Mosebach M, Hiddemann W, Hoelzer D (říjen 2000). "Chromozomální organizace a lokalizace genu lidské histonové deacetylázy 5 (HDAC5)". Biochimica et Biophysica Acta. 1493 (3): 342–8. doi:10.1016 / S0167-4781 (00) 00191-3. PMID 11018260.
- Zhang CL, McKinsey TA, Lu JR, Olson EN (leden 2001). „Sdružení proteinu vázajícího se na COOH-terminál (CtBP) a transkripčního represoru interagujícího s MEF2 (MITR) přispívá k transkripční represi transkripčního faktoru MEF2“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (1): 35–9. doi:10,1074 / jbc.M007364200. PMID 11022042.
- McKinsey TA, Zhang CL, Lu J, Olson EN (listopad 2000). „Na signálu závislý jaderný export histon-deacetylázy reguluje diferenciaci svalů“. Příroda. 408 (6808): 106–11. doi:10.1038/35040593. PMC 4459600. PMID 11081517.
- McKinsey TA, Zhang CL, Olson EN (prosinec 2000). „Aktivace transkripčního faktoru faktoru 2 zesilovače myocytů vazbou 14-3-3 na histon-deacetylázu 5 stimulovanou na vápník / kalmodulin závislou proteinkinázou“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (26): 14400–5. doi:10.1073 / pnas.260501497. PMC 18930. PMID 11114197.
- Fischle W, Dequiedt F, Fillion M, Hendzel MJ, Voelter W, Verdin E (září 2001). „Aktivita lidské HDAC7 histon-deacetylázy je spojena s HDAC3 in vivo“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (38): 35826–35. doi:10,1074 / jbc.M104935200. PMID 11466315.
- McKinsey TA, Zhang CL, Olson EN (září 2001). "Identifikace signální reaktivní nukleární exportní sekvence ve třídě II histonových deacetyláz". Molekulární a buněčná biologie. 21 (18): 6312–21. doi:10.1128 / MCB.21.18.6312-6321.2001. PMC 87361. PMID 11509672.
- Ozawa Y, Towatari M, Tsuzuki S, Hayakawa F, Maeda T, Miyata Y a kol. (Říjen 2001). „Histon deacetyláza 3 se asociuje a potlačuje transkripční faktor GATA-2“. Krev. 98 (7): 2116–23. doi:10.1182 / krev. V98.7.2116. PMID 11567998.
- Potter GB, Beaudoin GM, DeRenzo CL, Zarach JM, Chen SH, Thompson CC (říjen 2001). „Bezsrstý gen mutovaný při vrozených poruchách vypadávání vlasů kóduje nový jaderný receptorový korepresor“. Geny a vývoj. 15 (20): 2687–701. doi:10,1101 / gad. 916701. PMC 312820. PMID 11641275.
- Fischle W, Dequiedt F, Hendzel MJ, Guenther MG, Lazar MA, Voelter W, Verdin E (leden 2002). „Enzymatická aktivita spojená s HDAC třídy II závisí na multiproteinovém komplexu obsahujícím HDAC3 a SMRT / N-CoR“. Molekulární buňka. 9 (1): 45–57. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00429-4. hdl:11858 / 00-001M-0000-002C-9FF9-9. PMID 11804585.
- Lemercier C, Brocard MP, Puvion-Dutilleul F, Kao HY, Albagli O, Khochbin S (červen 2002). „Histonové deacetylázy třídy II jsou přímo přijímány transkripčním represorem BCL6“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (24): 22045–52. doi:10,1074 / jbc.M201736200. PMID 11929873.
- Huang Y, Tan M, Gosink M, Wang KK, Sun Y (květen 2002). „Histon deacetyláza 5 není cílovým genem p53, ale její nadměrná exprese inhibuje růst nádorových buněk a vyvolává apoptózu.“ Výzkum rakoviny. 62 (10): 2913–22. PMID 12019172.
externí odkazy
- HDAC5 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.