TFAM - TFAM
Mitochondriální transkripční faktor A., zkráceně jako TFAM nebo mtTFA, je protein že u lidí je kódován TFAM gen.[5][6]
Funkce
Tento gen kóduje a mitochondriální transkripční faktor to je klíčový aktivátor mitochondriální transkripce a účastník replikace mitochondriálního genomu. TFAM váže mitochondriální promotor DNA na podporu transkripce mitochondriálního genomu. Studie na myších prokázaly, že tento genový produkt je nutný k regulaci počtu kopií mitochondriálního genomu a je pro něj nezbytný embryonální vývoj. Model myši pro Kearns – Sayreův syndrom byl produkován, když byla exprese tohoto genu eliminována cíleným narušením srdce a svalových buněk.[6]
TFAM je dvojitý box Skupina s vysokou mobilitou Protein vázající a ohýbající DNA.[7] Tato ohýbací akce je důležitá pro iniciaci mitochondriální transkripce u savců, ale ne u kvasinek s homologem Abf2. TFAM se může také podílet na balení mitochondriálního genomu, protože jeho vazebná aktivita je nesekvenčně specifická. [8]
Interakce
Ukázalo se, že TFAM komunikovat s TFB1M a[9] TFB2M.[10]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000108064 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000003923 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Tiranti V, Rossi E, Ruiz-Carrillo A, Rossi G, Rocchi M, DiDonato S, Zuffardi O, Zeviani M (červenec 1995). „Chromozomální lokalizace mitochondriálního transkripčního faktoru A (TCF6), jednořetězcového proteinu vázajícího DNA (SSBP) a endonukleázy G (ENDOG), tři lidské úklidové geny podílející se na mitochondriální biogenezi.“ Genomika. 25 (2): 559–64. doi:10.1016 / 0888-7543 (95) 80058-T. PMID 7789991.
- ^ A b „Entrez Gene: transkripční faktor TFAM A, mitochondriální“.
- ^ Murugesapillai D, McCauley MJ, Maher LJ, Williams MC (15. listopadu 2016). „Jednomolekulární studie architektonických proteinů ohýbajících DNA skupiny B s vysokou mobilitou“. Biofyzikální recenze. 9 (1): 17–40. doi:10.1007 / s12551-016-0236-4. PMC 5331113. PMID 28303166.
- ^ Ngo, HB; Kaiser, JT; Chan, DC (30. října 2011). „Faktor mitochondriální transkripce a balení Tfam vnáší obrat do mitochondriální DNA“. Přírodní strukturní a molekulární biologie. 18 (11): 1290–6. doi:10.1038 / nsmb.2159. PMC 3210390. PMID 22037171.
- ^ McCulloch V, Shadel GS (srpen 2003). „Lidský mitochondriální transkripční faktor B1 interaguje s C-koncovou aktivační oblastí h-mtTFA a stimuluje transkripci nezávisle na své aktivitě RNA methyltransferázy“. Mol. Buňka. Biol. 23 (16): 5816–24. doi:10.1128 / MCB.23.16.5816-5824.2003. PMC 166325. PMID 12897151.
- ^ Hillen, HS; Morozov, YI; Sarfallah, A; Temiakov, D; Cramer, P (16. listopadu 2017). "Strukturální základ zahájení mitochondriální transkripce". Buňka. 171 (5): 1072–1081.e10. doi:10.1016 / j.cell.2017.10.036. PMC 6590061. PMID 29149603.
Další čtení
- Tominaga K, Akiyama S, Kagawa Y, Ohta S (1992). "Upstream oblast genomového genu pro lidský mitochondriální transkripční faktor 1". Biochim. Biophys. Acta. 1131 (2): 217–9. doi:10.1016 / 0167-4781 (92) 90082-b. PMID 1610904.
- Fisher RP, Lisowsky T, Parisi MA, Clayton DA (1992). "DNA obalení a ohnutí mitochondriálním vysoce mobilním skupinovým transkripčním aktivátorovým proteinem". J. Biol. Chem. 267 (5): 3358–67. PMID 1737790.
- Parisi MA, Clayton DA (1991). "Podobnost lidského mitochondriálního transkripčního faktoru 1 s proteiny skupiny s vysokou mobilitou". Věda. 252 (5008): 965–9. Bibcode:1991Sci ... 252..965P. doi:10.1126 / science.2035027. PMID 2035027.
- Tominaga K, Hayashi J, Kagawa Y, Ohta S (1993). „Menší izoforma lidského mitochondriálního transkripčního faktoru 1: jeho široká distribuce a produkce alternativním sestřihem“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 194 (1): 544–51. doi:10.1006 / bbrc.1993.1854. PMID 8333869.
- Larsson NG, Oldfors A, Garman JD, Barsh GS, Clayton DA (1997). "Down-regulace mitochondriálního transkripčního faktoru A během spermatogeneze u lidí". Hučení. Mol. Genet. 6 (2): 185–91. doi:10,1093 / hmg / 6.2.185. PMID 9063738.
- Lezza AM, Pesce V, Cormio A, Fracasso F, Vecchiet J, Felzani G, Cantatore P, Gadaleta MN (2001). "Zvýšená exprese mitochondriálního transkripčního faktoru A a nukleárního respiračního faktoru-1 v kosterním svalu od starých lidských subjektů". FEBS Lett. 501 (1): 74–8. doi:10.1016 / S0014-5793 (01) 02628-X. PMID 11457459. S2CID 45160010.
- Takamatsu C, Umeda S, Ohsato T, Ohno T, Abe Y, Fukuoh A, Shinagawa H, Hamasaki N, Kang D (2002). „Regulace mitochondriálních D-smyček transkripčním faktorem A a jednořetězcovým proteinem vázajícím DNA“. EMBO Rep. 3 (5): 451–6. doi:10.1093 / embo-reports / kvf099. PMC 1084112. PMID 11964388.
- Falkenberg M „Gaspari M, Rantanen A, Trifunovic A, Larsson NG, Gustafsson CM (2002). "Mitochondriální transkripční faktory B1 a B2 aktivují transkripci lidské mtDNA". Nat. Genet. 31 (3): 289–94. doi:10.1038 / ng909. PMID 12068295. S2CID 11164308.
- Reyes A, Mezzina M, Gadaleta G (2002). "Lidský mitochondriální transkripční faktor A (mtTFA): genová struktura a charakterizace příbuzných pseudogenů". Gen. 291 (1–2): 223–32. doi:10.1016 / S0378-1119 (02) 00600-5. PMID 12095695.
- Yoshida Y, Izumi H, Ise T, Uramoto H, Torigoe T, Ishiguchi H, Murakami T, Tanabe M, Nakayama Y, Itoh H, Kasai H, Kohno K (2002). „Lidský mitochondriální transkripční faktor A se přednostně váže na oxidačně poškozenou DNA“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 295 (4): 945–51. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 00757-X. PMID 12127986.
- Garrido N, Griparic L, Jokitalo E, Wartiovaara J, van der Bliek AM, Spelbrink JN (2003). "Složení a dynamika lidských mitochondriálních nukleoidů". Mol. Biol. Buňka. 14 (4): 1583–96. doi:10,1091 / mbc.E02-07-0399. PMC 153124. PMID 12686611.
- Yoshida Y, Izumi H, Torigoe T, Ishiguchi H, Itoh H, Kang D, Kohno K (2003). „P53 fyzicky interaguje s mitochondriálním transkripčním faktorem A a odlišně reguluje vazbu na poškozenou DNA“. Cancer Res. 63 (13): 3729–34. PMID 12839966.
- McCulloch V, Shadel GS (2003). „Lidský mitochondriální transkripční faktor B1 interaguje s C-koncovou aktivační oblastí h-mtTFA a stimuluje transkripci nezávisle na své aktivitě RNA methyltransferázy“. Mol. Buňka. Biol. 23 (16): 5816–24. doi:10.1128 / MCB.23.16.5816-5824.2003. PMC 166325. PMID 12897151.
- Deschauer M, Kiefer R, Blakely EL, He L, Zierz S, Turnbull DM, Taylor RW (2003). "Nová mutace genu Twinkle v autosomálně dominantní progresivní externí oftalmoplegii". Neuromuskul. Disord. 13 (7–8): 568–72. doi:10.1016 / S0960-8966 (03) 00071-3. PMID 12921794. S2CID 23020569.
- Günther C, von Hadeln K, Müller-Thomsen T, Alberici A, Binetti G, Hock C, Nitsch RM, Stoppe G, Reiss J, Gal A, Finckh U (2005). „Možná asociace genotypu mitochondriálního transkripčního faktoru A (TFAM) se sporadickou Alzheimerovou chorobou“. Neurosci. Lett. 369 (3): 219–23. doi:10.1016 / j.neulet.2004.07.070. PMID 15464268. S2CID 25710306.
- Kanki T, Ohgaki K, Gaspari M, Gustafsson CM, Fukuoh A, Sasaki N, Hamasaki N, Kang D (2004). „Architektonická role mitochondriálního transkripčního faktoru A při udržování lidské mitochondriální DNA“. Mol. Buňka. Biol. 24 (22): 9823–34. doi:10.1128 / MCB.24.22.9823-9834.2004. PMC 525493. PMID 15509786.
- Cam H, Balciunaite E, Blais A, Spektor A, Scarpulla RC, Young R, Kluger Y, Dynlacht BD (2004). "Společná sada regulačních sítí genů spojuje metabolismus a inhibici růstu". Mol. Buňka. 16 (3): 399–411. doi:10.1016 / j.molcel.2004.09.037. PMID 15525513.
externí odkazy
- Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q00059 (Transkripční faktor A, mitochondriální) na PDBe-KB.
Tento článek o gen na lidský chromozom 10 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |