TFB2M - TFB2M

TFB2M
Identifikátory
Aliasy	TFB2M, Hkp1, mtTFB2, transkripční faktor B2, mitochondriální
Externí ID	OMIM: 607055 MGI: 107937 HomoloGene: 7362 Genové karty: TFB2M
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	246,566,261 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	179,546,267 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita methyltransferázy; • aktivita transferázy; • GO: Aktivita transkripčního koregulátoru 0001104; • aktivita rRNA methyltransferázy; • rRNA (adenin-N6, N6 -) - aktivita dimethyltransferázy; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• buněčné spojení; • mitochondriální nukleoid; • mitochondriální matice; • mitochondrie;
Biologický proces	• pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • zpracování rRNA; • methylace; • organizace mitochondrií; • regulace transkripce, DNA-šablony; • Methylace rRNA; • transkripce, chráněná DNA; • transkripce z mitochondriálního promotoru; • iniciace transkripce z mitochondriálního promotoru; • modifikace rRNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	64216
	15278
	ENSG00000162851
	ENSMUSG00000026492
	Q9H5Q4
	Q3TL26
	NM_022366
	NM_008249; NM_001331054; NM_001331055
	NP_071761
	NP_001317983; NP_001317984; NP_032275
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Dimethyladenosin transferáza 2; transkripční faktor B2, mitochondriální je enzym že u lidí je kódován TFB2M gen.^[5]

Tento protein je transkripčním iniciačním faktorem pro mitochondriální RNA polymerázu, POLRMT. Jeho paralog TFB1M může provádět podobnou funkci, ale pouze in vitro.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162851 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026492 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: TFB2M transkripční faktor B2, mitochondriální“.
^ Hillen, HS; Morozov, YI; Sarfallah, A; Temiakov, D; Cramer, P (16. listopadu 2017). "Strukturální základ zahájení mitochondriální transkripce". Buňka. 171 (5): 1072–1081.e10. doi:10.1016 / j.cell.2017.10.036. PMC 6590061. PMID 29149603.

Další čtení

Falkenberg M, Gaspari M, Rantanen A, et al. (2002). "Mitochondriální transkripční faktory B1 a B2 aktivují transkripci lidské mtDNA". Nat. Genet. 31 (3): 289–94. doi:10.1038 / ng909. PMID 12068295.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Rantanen A, Gaspari M, Falkenberg M a kol. (2003). "Charakterizace myších genů pro mitochondriální transkripční faktory B1 a B2". Mamm. Genom. 14 (1): 1–6. doi:10.1007 / s00335-002-2218-z. PMID 12532263.
McCulloch V, Shadel GS (2003). „Lidský mitochondriální transkripční faktor B1 interaguje s C-koncovou aktivační oblastí h-mtTFA a stimuluje transkripci nezávisle na své aktivitě RNA methyltransferázy“. Mol. Buňka. Biol. 23 (16): 5816–24. doi:10.1128 / MCB.23.16.5816-5824.2003. PMC 166325. PMID 12897151.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Gaspari M, Falkenberg M, Larsson NG, Gustafsson CM (2005). „Mitochondriální RNA polymeráza rozhodujícím způsobem přispívá ke specificitě promotoru v savčích buňkách“. EMBO J.. 23 (23): 4606–14. doi:10.1038 / sj.emboj.7600465. PMC 533051. PMID 15526033.
Gleyzer N, Vercauteren K, Scarpulla RC (2005). „Kontrola faktorů specificity mitochondriální transkripce (TFB1M a TFB2M) nukleárními respiračními faktory (NRF-1 a NRF-2) a koaktivátory rodiny PGC-1“. Mol. Buňka. Biol. 25 (4): 1354–66. doi:10.1128 / MCB.25.4.1354-1366.2005. PMC 548005. PMID 15684387.
Gregory SG, Barlow KF, McLay KE a kol. (2006). „Sekvence DNA a biologická anotace lidského chromozomu 1“. Příroda. 441 (7091): 315–21. doi:10.1038 / nature04727. PMID 16710414.
Cotney J, Shadel GS (2007). „Důkazy pro časnou duplikaci genů ve vývoji rodiny mitochondriálních transkripčních faktorů B a udržení aktivity rRNA methyltransferázy v lidských mtTFB1 a mtTFB2“. J. Mol. Evol. 63 (5): 707–17. doi:10.1007 / s00239-006-0075-1. PMID 17031457.
Cotney J, Wang Z, Shadel GS (2007). „Relativní početnost lidského mitochondriálního transkripčního systému a odlišné role pro h-mtTFB1 a h-mtTFF2 v mitochondriální biogenezi a genové expresi“. Nucleic Acids Res. 35 (12): 4042–54. doi:10,1093 / nar / gkm424. PMC 1919481. PMID 17557812.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162851 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026492 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: TFB2M transkripční faktor B2, mitochondriální“.

[polrmt-6] Hillen, HS; Morozov, YI; Sarfallah, A; Temiakov, D; Cramer, P (16. listopadu 2017). "Strukturální základ zahájení mitochondriální transkripce". Buňka. 171 (5): 1072–1081.e10. doi:10.1016 / j.cell.2017.10.036. PMC 6590061. PMID 29149603.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]