DYNLL1 - DYNLL1

DYNLL1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1CMI, 3ZKE, 3 ZKF, 1F95, 1F3C, 1F96
Identifikátory
Aliasy	DYNLL1, DLC1, DLC8, DNCL1, DNCLC1, LC8, LC8a, PIN, hdlc1, dyneinový lehký řetězec LC8 typu 1
Externí ID	OMIM: 601562 MGI: 1861457 HomoloGene: 133063 Genové karty: DYNLL1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	120,498,493 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	115,300,999 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• specifické vazby na proteinovou doménu; • vazba na C-konec proteinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • buněčná motorická aktivita; • vazba cytoskeletálního proteinu; • Aktivita mikrotubulů závislá na ATP, směrovaná na konec; • dyneinová vazba mezi řetězci; • dyneinová lehká mezilehlá vazba; • vazba enzymu; • aktivita regulátoru syntázy oxidu dusnatého; • aktivita homodimerizace proteinu; • aktivita heterodimerizace proteinu; • vazba proteinu lešení;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • centrosome; • membrána; • buněčná membrána; • komplex spojený s mikrotubuly; • řasnatý hrot; • mitochondrie; • dyneinový komplex; • COP9 signalosom; • mitotické vřeteno; • mikrotubuly; • cytoskelet; • extracelulární exosom; • buněčné jádro; • kinetochore; • komplex cytoplazmatického dyneinu; • cilium; • membrána terciární granule; • granulovaná membrána bohatá na ficolin-1; • organizační centrum mikrotubulů; • sekreční granule; • axonová cytoplazma;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • vývoj substantia nigra; • zpracování antigenu a prezentace exogenního peptidového antigenu prostřednictvím MHC třídy II; • transkripce, chráněná DNA; • ER na transport zprostředkovaný vezikuly Golgi; • pozitivní regulace inzerce proteinu do mitochondriální membrány zapojené do apoptotické signální dráhy; • G2 / M přechod mitotického buněčného cyklu; • proces založený na mikrotubulích; • intraciliary retrográdní transport; • GO: virový proces 0022415; • negativní regulace fosforylace; • makroautofagie; • apoptotický proces; • intraciliary transport zapojený do shromáždění cilium; • degranulace neutrofilů; • pohyblivá sestava cilium; • dokování řasnatého bazálního těla; • pozitivní regulace nepohyblivé sestavy cilium; • transport podél mikrotubulů; • cilium morfogeneze; • pozitivní regulace aktivity mikrotubulů závislé na ATP, směrovaná plus-end; • soudržnost sesterských chromatid; • regulace přechodu G2 / M mitotického buněčného cyklu; • doprava; • vývoj spermatidů; • pozitivní regulace sekrece inzulínu podílející se na buněčné reakci na stimul glukózy;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8655
	56455
	ENSG00000088986
	ENSMUSG00000009013
	P63167
	P63168
	NM_003746; NM_001037494; NM_001037495
	NM_019682
	NP_001032583; NP_001032584; NP_003737
	NP_062656
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Dyneinový lehký řetězec 1, cytoplazmatický je protein že u lidí je kódován DYNLL1 gen.^[5]^[6]^[7]^[8]

Funkce

Cytoplazmatické dyneiny jsou velké enzymové komplexy s molekulovou hmotností asi 1200 kD. Obsahují dvě hlavy produkující sílu vytvořené primárně z dyneinových těžkých řetězců a stonky spojující hlavy s bazální doménou, která obsahuje různý počet pomocných mezilehlých řetězců. Komplex se účastní intracelulárního transportu a motility. Protein popsaný v tomto záznamu je lehký řetězec a existuje jako součást tohoto komplexu, ale také fyzicky interaguje s a inhibuje aktivitu neuronální syntázy oxidu dusnatého. Vazba tohoto proteinu destabilizuje dimer neuronové syntázy oxidu dusnatého, konformaci nezbytnou pro aktivitu, a může regulovat řadu biologických procesů prostřednictvím svých účinků na aktivitu syntázy oxidu dusnatého. Byly charakterizovány alternativní transkripční varianty sestřihu.^[8]

Interakce

DYNLL1 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000088986 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000009013 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Dick T, Ray K, Salz HK, Chia W (květen 1996). „Mutace cytoplazmatického dyneinu (ddlc1) způsobují morfogenetické defekty a apoptotickou buněčnou smrt u Drosophila melanogaster“. Molekulární a buněčná biologie. 16 (5): 1966–77. doi:10.1128 / mcb.16.5.1966. PMC 231184. PMID 8628263.
^ Jaffrey SR, Snyder SH (listopad 1996). "PIN: asociovaný proteinový inhibitor neuronální syntázy oxidu dusnatého". Věda. 274 (5288): 774–7. doi:10.1126 / science.274.5288.774. PMID 8864115. S2CID 46494691.
^ Pfister KK, Fisher EM, Gibbons IR, Hays TS, Holzbaur EL, McIntosh JR, Porter ME, Schroer TA, Vaughan KT, Witman GB, King SM, Vallee RB (listopad 2005). „Nomenklatura cytoplazmatického dyneinu“. The Journal of Cell Biology. 171 (3): 411–3. doi:10.1083 / jcb.200508078. PMC 2171247. PMID 16260502.
^ ^A ^b „Entrez Gene: DYNLL1 dynein, light chain, LC8-type 1“.
^ Den CL, Puthalakath H, Skea G, Strasser A, Barsukov I, Lian LY, Huang DC, Hinds MG (únor 2004). "Lokalizace dyneinových lehkých řetězců 1 a 2 a jejich pro-apoptotických ligandů". The Biochemical Journal. 377 (Pt 3): 597–605. doi:10.1042 / BJ20031251. PMC 1223895. PMID 14561217.
^ ^A ^b Vadlamudi RK, Bagheri-Yarmand R, Yang Z, Balasenthil S, Nguyen D, Sahin AA, den Hollander P, Kumar R (červen 2004). „Dyneinový lehký řetězec 1, substrát interagující s p21 aktivovanou kinázou 1, podporuje rakovinné fenotypy“. Rakovinová buňka. 5 (6): 575–85. doi:10.1016 / j.ccr.2004.05.022. PMID 15193260.
^ ^A ^b ^C Naisbitt S, Valtschanoff J, Allison DW, Sala C, Kim E, Craig AM, Weinberg RJ, Sheng M (červen 2000). „Interakce proteinového komplexu spojeného s doménou postsynaptické hustoty-95 / guanylátkinázové domény s lehkým řetězcem myosinu-V a dyneinu“. The Journal of Neuroscience. 20 (12): 4524–34. doi:10.1523 / JNEUROSCI.20-12-04524.2000. PMC 6772433. PMID 10844022.
^ Diefenbach RJ, Diefenbach E, Douglas MW, Cunningham AL (prosinec 2002). „Těžký řetězec konvenčního kinesinu interaguje s proteiny SNARE SNAP25 a SNAP23“. Biochemie. 41 (50): 14906–15. doi:10.1021 / bi026417u. PMID 12475239.
^ Crépieux P, Kwon H, Leclerc N, Spencer W, Richard S, Lin R, Hiscott J (prosinec 1997). „KappaB alfa fyzicky interaguji s proteinem spojeným s cytoskeletem prostřednictvím jeho domény signální odezvy“. Molekulární a buněčná biologie. 17 (12): 7375–85. doi:10.1128 / MCB.17.12.7375. PMC 232593. PMID 9372968.
^ Herzig RP, Andersson U, Scarpulla RC (prosinec 2000). „Dyneinový lehký řetězec interaguje s NRF-1 a EWG, strukturně a funkčně souvisejícími transkripčními faktory z člověka a drosophily.“ Journal of Cell Science. 113 (23): 4263–73. PMID 11069771.
^ Lo KW, Kan HM, Chan LN, Xu WG, Wang KP, Wu Z, Sheng M, Zhang M (březen 2005). „Lehký řetězec 8-kDa dyneinu se váže na protein vázající p53 1 a zprostředkovává jadernou akumulaci p53 způsobenou poškozením DNA“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (9): 8172–9. doi:10,1074 / jbc.M411408200. PMID 15611139.

Další čtení

Robertson NG, Khetarpal U, Gutiérrez-Espeleta GA, Bieber FR, Morton CC (září 1994). „Izolace nových a známých genů z knihovny lidského kochleárního cDNA pomocí subtraktivní hybridizace a diferenciálního screeningu“. Genomika. 23 (1): 42–50. doi:10.1006 / geno.1994.1457. PMID 7829101.
Crépieux P, Kwon H, Leclerc N, Spencer W, Richard S, Lin R, Hiscott J (prosinec 1997). „KappaB alfa fyzicky interaguji s proteinem spojeným s cytoskeletem prostřednictvím jeho domény signální odezvy“. Molekulární a buněčná biologie. 17 (12): 7375–85. doi:10.1128 / MCB.17.12.7375. PMC 232593. PMID 9372968.
Tochio H, Ohki S, Zhang Q, Li M, Zhang M (listopad 1998). "Struktura řešení proteinového inhibitoru neuronové syntázy oxidu dusnatého". Přírodní strukturní biologie. 5 (11): 965–9. doi:10.1038/2940. PMID 9808041. S2CID 28591803.
Rodríguez-Crespo I, Straub W, Gavilanes F, Ortiz de Montellano PR (listopad 1998). "Vazba dyneinového lehkého řetězce (PIN) na neuronální syntézu oxidu dusnatého v nepřítomnosti inhibice". Archivy biochemie a biofyziky. 359 (2): 297–304. doi:10.1006 / abbi.1998.0928. PMID 9808772.
Fan JS, Zhang Q, Li M, Tochio H, Yamazaki T, Shimizu M, Zhang M (prosinec 1998). „Proteinový inhibitor neuronální syntázy oxidu dusnatého, PIN, se váže na fragment zbytku enzymu se 17 aminokyselinami“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (50): 33472–81. doi:10.1074 / jbc.273.50.33472. PMID 9837926.
Puthalakath H, Huang DC, O'Reilly LA, King SM, Strasser A (březen 1999). „Proapoptotická aktivita člena rodiny Bcl-2 Bim je regulována interakcí s dyneinovým motorickým komplexem“. Molekulární buňka. 3 (3): 287–96. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80456-6. PMID 10198631.
Liang J, Jaffrey SR, Guo W, Snyder SH, Clardy J (srpen 1999). "Struktura PIN / LC8 dimeru s navázaným peptidem". Přírodní strukturní biologie. 6 (8): 735–40. doi:10.1038/11501. PMID 10426949. S2CID 30155673.
Epstein E, Sela-Brown A, Ringel I, Kilav R, King SM, Benashski SE, Yisraeli JK, Silver J, Naveh-Many T (únor 2000). „Vazba lehkého řetězce dyneinu na 3'-nepřekládanou sekvenci zprostředkovává asociaci mRNA parathormonu s mikrotubuly“. The Journal of Clinical Investigation. 105 (4): 505–12. doi:10,1172 / JCI8557. PMC 289163. PMID 10683380.
Naisbitt S, Valtschanoff J, Allison DW, Sala C, Kim E, Craig AM, Weinberg RJ, Sheng M (červen 2000). „Interakce proteinového komplexu spojeného s doménou postsynaptické hustoty-95 / guanylátkinázové domény s lehkým řetězcem myosinu-V a dyneinu“. The Journal of Neuroscience. 20 (12): 4524–34. doi:10.1523 / JNEUROSCI.20-12-04524.2000. PMC 6772433. PMID 10844022.
Jacob Y, Badrane H, Ceccaldi PE, Tordo N (listopad 2000). „Cytoplazmatický dynein LC8 interaguje s lyssavirovým fosfoproteinem“. Journal of Virology. 74 (21): 10217–22. doi:10.1128 / JVI.74.21.10217-10222.2000. PMC 102062. PMID 11024152.
Herzig RP, Andersson U, Scarpulla RC (prosinec 2000). „Dyneinový lehký řetězec interaguje s NRF-1 a EWG, strukturně a funkčně souvisejícími transkripčními faktory z člověka a drosophily.“ Journal of Cell Science. 113 (23): 4263–73. PMID 11069771.
Haraguchi K, Satoh K, Yanai H, Hamada F, Kawabuchi M, Akiyama T (listopad 2000). „Protein DAP asociovaný s hDLG interaguje s lehkým řetězcem dyneinu a neuronální syntézou oxidu dusnatého“. Geny do buněk. 5 (11): 905–911. doi:10.1046 / j.1365-2443.2000.00374.x. PMID 11122378. S2CID 37107139.
Lo KW, Naisbitt S, Fan JS, Sheng M, Zhang M (duben 2001). „Lehký řetězec 8-kDa dyneinu se váže na své cíle pomocí konzervovaného (K / R) XTQT motivu“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (17): 14059–66. doi:10,1074 / jbc.M010320200. PMID 11148209.
Yano H, Lee FS, Kong H, Chuang J, Arevalo J, Perez P, Sung C, Chao MV (únor 2001). "Sdružení neurotropinových receptorů Trk se složkami cytoplazmatického dyneinového motoru". The Journal of Neuroscience. 21 (3): RC125. doi:10.1523 / JNEUROSCI.21-03-j0003.2001. PMC 6762309. PMID 11157096.
Fan J, Zhang Q, Tochio H, Li M, Zhang M (únor 2001). „Strukturální základna různého sekvenčně závislého rozpoznávání cíle pomocí 8 kDa dyneinového lehkého řetězce. Journal of Molecular Biology. 306 (1): 97–108. doi:10.1006 / jmbi.2000.4374. PMID 11178896.
Bielli A, Thörnqvist PO, Hendrick AG, Finn R, Fitzgerald K, McCaffrey MW (březen 2001). „Malá GTPáza Rab4A interaguje s centrální oblastí cytoplazmatického lehkého meziproduktu dyneinu-1“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 281 (5): 1141–53. doi:10.1006 / bbrc.2001.4468. PMID 11243854.
Yu J, Yu L, Chen Z, Zheng L, Chen X, Wang X, Ren D, Zhao S (březen 2002). „Proteinový inhibitor neuronální syntázy oxidu dusnatého interaguje s inhibitory proteinkinázy A“. Výzkum mozku. Molekulární výzkum mozku. 99 (2): 145–9. doi:10.1016 / S0169-328X (02) 00104-3. PMID 11978406.
Fuhrmann JC, Kins S, Rostaing P, El Far O, Kirsch J, Sheng M, Triller A, Betz H, Kneussel M (červenec 2002). „Gephyrin interaguje s lehkými řetězci dyneinu 1 a 2, složkami komplexů motorických proteinů“. The Journal of Neuroscience. 22 (13): 5393–402. doi:10.1523 / JNEUROSCI.22-13-05393.2002. PMC 6758200. PMID 12097491.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P63167 (Dyneinový lehký řetězec 1, cytoplazmatický) na PDBe-KB.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000088986 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000009013 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8628263-5] Dick T, Ray K, Salz HK, Chia W (květen 1996). „Mutace cytoplazmatického dyneinu (ddlc1) způsobují morfogenetické defekty a apoptotickou buněčnou smrt u Drosophila melanogaster“. Molekulární a buněčná biologie. 16 (5): 1966–77. doi:10.1128 / mcb.16.5.1966. PMC 231184. PMID 8628263.

[pmid8864115-6] Jaffrey SR, Snyder SH (listopad 1996). "PIN: asociovaný proteinový inhibitor neuronální syntázy oxidu dusnatého". Věda. 274 (5288): 774–7. doi:10.1126 / science.274.5288.774. PMID 8864115. S2CID 46494691.

[pmid16260502-7] Pfister KK, Fisher EM, Gibbons IR, Hays TS, Holzbaur EL, McIntosh JR, Porter ME, Schroer TA, Vaughan KT, Witman GB, King SM, Vallee RB (listopad 2005). „Nomenklatura cytoplazmatického dyneinu“. The Journal of Cell Biology. 171 (3): 411–3. doi:10.1083 / jcb.200508078. PMC 2171247. PMID 16260502.

[entrez-8] A ^b „Entrez Gene: DYNLL1 dynein, light chain, LC8-type 1“.

[pmid14561217-9] Den CL, Puthalakath H, Skea G, Strasser A, Barsukov I, Lian LY, Huang DC, Hinds MG (únor 2004). "Lokalizace dyneinových lehkých řetězců 1 a 2 a jejich pro-apoptotických ligandů". The Biochemical Journal. 377 (Pt 3): 597–605. doi:10.1042 / BJ20031251. PMC 1223895. PMID 14561217.

[pmid15193260-10] A ^b Vadlamudi RK, Bagheri-Yarmand R, Yang Z, Balasenthil S, Nguyen D, Sahin AA, den Hollander P, Kumar R (červen 2004). „Dyneinový lehký řetězec 1, substrát interagující s p21 aktivovanou kinázou 1, podporuje rakovinné fenotypy“. Rakovinová buňka. 5 (6): 575–85. doi:10.1016 / j.ccr.2004.05.022. PMID 15193260.

[pmid10844022-11] A ^b ^C Naisbitt S, Valtschanoff J, Allison DW, Sala C, Kim E, Craig AM, Weinberg RJ, Sheng M (červen 2000). „Interakce proteinového komplexu spojeného s doménou postsynaptické hustoty-95 / guanylátkinázové domény s lehkým řetězcem myosinu-V a dyneinu“. The Journal of Neuroscience. 20 (12): 4524–34. doi:10.1523 / JNEUROSCI.20-12-04524.2000. PMC 6772433. PMID 10844022.

[pmid12475239-12] Diefenbach RJ, Diefenbach E, Douglas MW, Cunningham AL (prosinec 2002). „Těžký řetězec konvenčního kinesinu interaguje s proteiny SNARE SNAP25 a SNAP23“. Biochemie. 41 (50): 14906–15. doi:10.1021 / bi026417u. PMID 12475239.

[pmid9372968-13] Crépieux P, Kwon H, Leclerc N, Spencer W, Richard S, Lin R, Hiscott J (prosinec 1997). „KappaB alfa fyzicky interaguji s proteinem spojeným s cytoskeletem prostřednictvím jeho domény signální odezvy“. Molekulární a buněčná biologie. 17 (12): 7375–85. doi:10.1128 / MCB.17.12.7375. PMC 232593. PMID 9372968.

[pmid11069771-14] Herzig RP, Andersson U, Scarpulla RC (prosinec 2000). „Dyneinový lehký řetězec interaguje s NRF-1 a EWG, strukturně a funkčně souvisejícími transkripčními faktory z člověka a drosophily.“ Journal of Cell Science. 113 (23): 4263–73. PMID 11069771.

[pmid15611139-15] Lo KW, Kan HM, Chan LN, Xu WG, Wang KP, Wu Z, Sheng M, Zhang M (březen 2005). „Lehký řetězec 8-kDa dyneinu se váže na protein vázající p53 1 a zprostředkovává jadernou akumulaci p53 způsobenou poškozením DNA“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (9): 8172–9. doi:10,1074 / jbc.M411408200. PMID 15611139.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]