ARHGDIA - ARHGDIA - Wikipedia

ARHGDIA
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1CC0, 1FSO, 1FST, 1FT0, 1FT3, 1HH4, 1 km, 1QVY, 1RHO, 2BXW, 2JHS, 2JHT, 2JHU, 2JHV, 2JHW, 2JHX, 2JHY, 2JHZ, 2JI0, 2N80
Identifikátory
Aliasy	ARHGDIA, GDIA1, HEL-S-47e, NPHS8, RHOGDI, RHOGDI-1, Rho GDP disociační inhibitor alfa
Externí ID	OMIM: 601925 MGI: 2178103 HomoloGene: 908 Genové karty: ARHGDIA
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	81,871,378 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	120,581,624 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Aktivátor aktivity GTPázy; • Aktivita inhibitoru Rho GDP-disociace; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Rac GTPase vazba;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • extracelulární exosom; • cytoskelet; • membrána;
Biologický proces	• negativní regulace buněčné adheze; • regulace reorganizace aktinového cytoskeletu; • pohyb buňky nebo subcelulární složky; • negativní regulace apoptotického procesu; • pozitivní regulace axonogeneze; • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 pozitivní regulace aktivity GTPázy; • negativní regulace axonogeneze; • regulace přenosu signálu proteinu Rho; • regulace přenosu signálu zprostředkovaného malou GTPázou; • semaforin-plexinová signální dráha; • GO: 0048552 regulace katalytické aktivity; • Rho proteinová signální transdukce;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	396
	192662
	ENSG00000141522
	ENSMUSG00000025132
	P52565
	Q99PT1
NM_001185077; NM_001185078; NM_001301240; NM_001301241; NM_001301242;
	NM_001301243; NM_004309
	NM_133796; NM_001363425
NP_001172006; NP_001172007; NP_001288169; NP_001288170; NP_001288171;
	NP_001288172; NP_004300
	NP_598557; NP_001350354
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Inhibitor Rho GDP-disociace 1 je protein že u lidí je kódován ARHGDIA gen.^[5]^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že ARHGDIA komunikovat s:

CDC42,^[7]^[8]
RAC1,^[7]^[8]^[9]^[10]^[11]^[12]
RHOA,^[7]^[8]^[9]^[13]^[14]
Rac2,^[8]^[9] a
RhoH.^[9]^[15]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000141522 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025132 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Wagner T, Tommerup N, Wirth J, Leffers H, Zimmer J, Back E, Weissenbach J, Scherer G (červenec 1997). "Hybridní panel somatických buněk pro distální 17q: GDIA1 se mapuje na 17q25.3". Cytogenet Cell Genet. 76 (3–4): 172–5. doi:10.1159/000134538. PMID 9186513.
^ „Entrezův gen: ARHGDIA Rho GDP disociační inhibitor (GDI) alfa“.
^ ^A ^b ^C Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3: 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
^ ^A ^b ^C ^d Gorvel JP, Chang TC, Boretto J, Azuma T, Chavrier P (leden 1998). "Diferenciální vlastnosti D4 / LyGDI versus RhoGDI: fosforylace a selektivita rho GTPázy". FEBS Lett. 422 (2): 269–73. doi:10.1016 / s0014-5793 (98) 00020-9. PMID 9490022. S2CID 10817327.
^ ^A ^b ^C ^d Fauré J, Dagher MC (květen 2001). "Interakce mezi Rho GTPázami a Rho GDP disociačním inhibitorem (Rho-GDI)". Biochimie. 83 (5): 409–14. doi:10.1016 / s0300-9084 (01) 01263-9. PMID 11368848.
^ Grizot S, Fauré J, Fieschi F, Vignais PV, Dagher MC, Pebay-Peyroula E (srpen 2001). "Krystalová struktura komplexu Rac1-RhoGDI zapojeného do aktivace nadph oxidázy". Biochemie. 40 (34): 10007–13. doi:10.1021 / bi010288k. PMID 11513578.
^ Lian LY, Barsukov I, Golovanov AP, Hawkins DI, Badii R, Sze KH, Keep NH, Bokoch GM, Roberts GC (leden 2000). "Mapování vazebného místa pro GTP-vazebný protein Rac-1 na jeho inhibitoru RhoGDI-1". Struktura. 8 (1): 47–55. doi:10.1016 / s0969-2126 (00) 00080-0. PMID 10673424.
^ Di-Poï N, Fauré J, Grizot S, Molnár G, Pick E, Dagher MC (srpen 2001). "Mechanismus aktivace NADPH oxidázy komplexem Rac / Rho-GDI". Biochemie. 40 (34): 10014–22. doi:10.1021 / bi010289c. PMID 11513579.
^ Gajate C, Mollinedo F (březen 2005). „Cytoskeletonem zprostředkovaný receptor smrti a koncentrace ligandu v lipidových raftech tvoří v chemoterapii rakoviny shluky podporující apoptózu“. J. Biol. Chem. 280 (12): 11641–7. doi:10,1074 / jbc.M411781200. PMID 15659383.
^ Michaelson D, Silletti J, Murphy G, D'Eustachio P, Rush M, Philips MR (leden 2001). „Diferenciální lokalizace Rho GTPáz v živých buňkách: regulace hypervariabilními oblastmi a vazba RhoGDI“. J. Cell Biol. 152 (1): 111–26. doi:10.1083 / jcb.152.1.111. PMC 2193662. PMID 11149925.
^ Li X, Bu X, Lu B, Avraham H, Flavell RA, Lim B (únor 2002). „Protein RhoH vázající se na GOP vázající se na hematopoézu je deficitem GTPázy a inhibiční funkcí moduluje aktivity dalších Rho GTPáz“. Mol. Buňka. Biol. 22 (4): 1158–71. doi:10.1128 / mcb.22.4.1158-1171.2002. PMC 134637. PMID 11809807.

externí odkazy

Člověk ARHGDIA umístění genomu a ARHGDIA stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Leffers H, Nielsen MS, Andersen AH, Honoré B, Madsen P, Vandekerckhove J, Celis JE (1994). „Identifikace dvou lidských proteinů inhibitoru disociace Rho GDP, jejichž nadměrná exprese vede k narušení aktinového cytoskeletu“. Exp. Cell Res. 209 (2): 165–74. doi:10.1006 / excr.1993.1298. PMID 8262133.
Keep NH, Barnes M, Barsukov I, Badii R, Lian LY, Segal AW, Moody PC, Roberts GC (1997). „Modulátor rho rodiny G proteinů, rhoGDI, váže tyto G proteiny prostřednictvím domény podobné imunoglobulinu a flexibilního N-koncového ramene“. Struktura. 5 (5): 623–33. doi:10.1016 / S0969-2126 (97) 00218-9. PMID 9195882.
Takahashi K, Sasaki T, Mammoto A, Takaishi K, Kameyama T, Tsukita S, Takai Y (1997). „Přímá interakce inhibitoru disociace Rho GDP s ezrinem / radixinem / moesinem zahajuje aktivaci malého G proteinu Rho“. J. Biol. Chem. 272 (37): 23371–5. doi:10.1074 / jbc.272.37.23371. PMID 9287351.
Gorvel JP, Chang TC, Boretto J, Azuma T, Chavrier P (1998). "Diferenciální vlastnosti D4 / LyGDI versus RhoGDI: fosforylace a selektivita rho GTPázy". FEBS Lett. 422 (2): 269–73. doi:10.1016 / S0014-5793 (98) 00020-9. PMID 9490022. S2CID 10817327.
Takahashi K, Sasaki T, Mammoto A, Hotta I, Takaishi K, Imamura H, Nakano K, Kodama A, Takai Y (1998). "Interakce radixinu s Rho malým G proteinem GDP / GTP výměnný protein Dbl". Onkogen. 16 (25): 3279–84. doi:10.1038 / sj.onc.1201874. PMID 9681826. S2CID 21445282.
Newcombe AR, Stockley RW, Hunter JL, Webb MR (1999). „Interakce mezi rac1 a jeho disociačním inhibitorem guaninového nukleotidu (GDI), monitorována jediným fluorescenčním kumarinem připojeným k GDI“. Biochemie. 38 (21): 6879–86. doi:10.1021 / bi9829837. PMID 10346909.
Groysman M, Russek CS, Katzav S (2000). „Vav, faktor výměny nukleotidů GDP / GTP, interaguje s GDI, proteiny, které inhibují disociaci GDP / GTP“. FEBS Lett. 467 (1): 75–80. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 01121-2. PMID 10664460. S2CID 40103095.
Lian LY, Barsukov I, Golovanov AP, Hawkins DI, Badii R, Sze KH, Keep NH, Bokoch GM, Roberts GC (2000). "Mapování vazebného místa pro GTP-vazebný protein Rac-1 na jeho inhibitoru RhoGDI-1". Struktura. 8 (1): 47–55. doi:10.1016 / S0969-2126 (00) 00080-0. PMID 10673424.
Hoffman GR, Nassar N, Cerione RA (2000). "Struktura Rho rodiny GTP-vázajícího proteinu Cdc42 v komplexu s multifunkčním regulátorem RhoGDI". Buňka. 100 (3): 345–56. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80670-4. PMID 10676816. S2CID 17115337.
Matarrese P, Conti L, Varano B, Gauzzi MC, Belardelli F, Gessani S, Malorni W (2000). „Protein HIV-1 vpr indukuje rezistenci na anoikis modulací procesu buněčné adheze a sestavování systému mikrofilamentů“. Buněčná smrt se liší. 7 (1): 25–36. doi:10.1038 / sj.cdd.4400616. PMID 10713718.
Michaelson D, Silletti J, Murphy G, D'Eustachio P, Rush M, Philips MR (2001). „Diferenciální lokalizace Rho Gtpáz v živých buňkách: regulace hypervariabilními oblastmi a Rhogdiho vazba“. J. Cell Biol. 152 (1): 111–26. doi:10.1083 / jcb.152.1.111. PMC 2193662. PMID 11149925.
Longenecker KL, Garrard SM, Sheffield PJ, Derewenda ZS (2001). „Proteinová krystalizace racionální mutagenezí povrchových zbytků: Mutace Lys na Ala podporují krystalizaci RhoGDI“. Acta Crystallogr. D. 57 (Pt 5): 679–88. doi:10.1107 / S0907444901003122. PMID 11320308.
Grizot S, Fauré J, Fieschi F, Vignais PV, Dagher MC, Pebay-Peyroula E (2001). "Krystalová struktura komplexu Rac1-RhoGDI zapojeného do aktivace nadph oxidázy". Biochemie. 40 (34): 10007–13. doi:10.1021 / bi010288k. PMID 11513578.
Di-Poï N, Fauré J, Grizot S, Molnár G, Pick E, Dagher MC (2001). "Mechanismus aktivace NADPH oxidázy komplexem Rac / Rho-GDI". Biochemie. 40 (34): 10014–22. doi:10.1021 / bi010289c. PMID 11513579.
DerMardirossian C, Schnelzer A, Bokoch GM (2004). "Fosforylace RhoGDI pomocí Pak1 zprostředkovává disociaci Rac GTPázy". Mol. Buňka. 15 (1): 117–27. doi:10.1016 / j.molcel.2004.05.019. PMID 15225553.
Dransart E, Morin A, Cherfils J, Olofsson B (2005). "Odpojení inhibičních a převáděcích funkcí inhibitorů disociace rho GDP". J. Biol. Chem. 280 (6): 4674–83. doi:10,1074 / jbc.M409741200. PMID 15513926.
Gajate C, Mollinedo F (2005). „Cytoskeletonem zprostředkovaný receptor smrti a koncentrace ligandu v lipidových raftech tvoří v chemoterapii rakoviny shluky podporující apoptózu“. J. Biol. Chem. 280 (12): 11641–7. doi:10,1074 / jbc.M411781200. PMID 15659383.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000141522 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025132 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9186513-5] Wagner T, Tommerup N, Wirth J, Leffers H, Zimmer J, Back E, Weissenbach J, Scherer G (červenec 1997). "Hybridní panel somatických buněk pro distální 17q: GDIA1 se mapuje na 17q25.3". Cytogenet Cell Genet. 76 (3–4): 172–5. doi:10.1159/000134538. PMID 9186513.

[entrez-6] „Entrezův gen: ARHGDIA Rho GDP disociační inhibitor (GDI) alfa“.

[pmid17353931-7] A ^b ^C Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3: 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

[pmid9490022-8] A ^b ^C ^d Gorvel JP, Chang TC, Boretto J, Azuma T, Chavrier P (leden 1998). "Diferenciální vlastnosti D4 / LyGDI versus RhoGDI: fosforylace a selektivita rho GTPázy". FEBS Lett. 422 (2): 269–73. doi:10.1016 / s0014-5793 (98) 00020-9. PMID 9490022. S2CID 10817327.

[pmid11368848-9] A ^b ^C ^d Fauré J, Dagher MC (květen 2001). "Interakce mezi Rho GTPázami a Rho GDP disociačním inhibitorem (Rho-GDI)". Biochimie. 83 (5): 409–14. doi:10.1016 / s0300-9084 (01) 01263-9. PMID 11368848.

[pmid11513578-10] Grizot S, Fauré J, Fieschi F, Vignais PV, Dagher MC, Pebay-Peyroula E (srpen 2001). "Krystalová struktura komplexu Rac1-RhoGDI zapojeného do aktivace nadph oxidázy". Biochemie. 40 (34): 10007–13. doi:10.1021 / bi010288k. PMID 11513578.

[pmid10673424-11] Lian LY, Barsukov I, Golovanov AP, Hawkins DI, Badii R, Sze KH, Keep NH, Bokoch GM, Roberts GC (leden 2000). "Mapování vazebného místa pro GTP-vazebný protein Rac-1 na jeho inhibitoru RhoGDI-1". Struktura. 8 (1): 47–55. doi:10.1016 / s0969-2126 (00) 00080-0. PMID 10673424.

[pmid11513579-12] Di-Poï N, Fauré J, Grizot S, Molnár G, Pick E, Dagher MC (srpen 2001). "Mechanismus aktivace NADPH oxidázy komplexem Rac / Rho-GDI". Biochemie. 40 (34): 10014–22. doi:10.1021 / bi010289c. PMID 11513579.

[pmid15659383-13] Gajate C, Mollinedo F (březen 2005). „Cytoskeletonem zprostředkovaný receptor smrti a koncentrace ligandu v lipidových raftech tvoří v chemoterapii rakoviny shluky podporující apoptózu“. J. Biol. Chem. 280 (12): 11641–7. doi:10,1074 / jbc.M411781200. PMID 15659383.

[pmid11149925-14] Michaelson D, Silletti J, Murphy G, D'Eustachio P, Rush M, Philips MR (leden 2001). „Diferenciální lokalizace Rho GTPáz v živých buňkách: regulace hypervariabilními oblastmi a vazba RhoGDI“. J. Cell Biol. 152 (1): 111–26. doi:10.1083 / jcb.152.1.111. PMC 2193662. PMID 11149925.

[pmid11809807-15] Li X, Bu X, Lu B, Avraham H, Flavell RA, Lim B (únor 2002). „Protein RhoH vázající se na GOP vázající se na hematopoézu je deficitem GTPázy a inhibiční funkcí moduluje aktivity dalších Rho GTPáz“. Mol. Buňka. Biol. 22 (4): 1158–71. doi:10.1128 / mcb.22.4.1158-1171.2002. PMC 134637. PMID 11809807.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]