Transkripční faktor II H - Transcription factor II H

obecný transkripční faktor IIH, polypeptid 1, 62 kDa
Identifikátory
SymbolGTF2H1
Alt. symbolyBTF2
Gen NCBI2965
HGNC4655
OMIM189972
RefSeqNM_005316
UniProtP32780
Další údaje
MístoChr. 11 p15.1-p14
obecný transkripční faktor IIH, polypeptid 2, 44 kDa
Identifikátory
SymbolGTF2H2
Alt. symbolyBTF2, TFIIH, BTF2P44, T-BTF2P44
Gen NCBI2966
HGNC4656
OMIM601748
RefSeqNM_001515
UniProtQ13888
Další údaje
MístoChr. 5 q12.2-13.3
obecný transkripční faktor IIH, polypeptid 3, 34 kDa
Identifikátory
SymbolGTF2H3
Alt. symbolyBTF2, TFIIH
Gen NCBI2967
HGNC4657
OMIM601750
RefSeqNM_001516
UniProtQ13889
Další údaje
MístoChr. 12 q24,31

Transkripční faktor II Lidský (Transkripční faktor II H; TFIIH) je důležitý proteinový komplex, které mají role v transkripci různých genů kódujících proteiny a DNA oprava nukleotidové excize (NER) cesty. TFIIH poprvé vyšel najevo v roce 1989, kdy byl použit obecný transkripční faktor -5 nebo bazický transkripční faktor 2 byl charakterizován jako nepostradatelný transkripční faktor in vitro. Tento faktor byl také izolován z kvasinek a nakonec byl v roce 1992 pojmenován jako TFIIH.[1][2]

TFIIH se skládá z deseti podjednotek, z nichž 7 (ERCC2 / XPD, ERCC3 / XPB, GTF2H1 / str. GTF2H4 / p52, GTF2H2 / str. GTF2H3 / str. 34 a GTF2H5 / TTDA) tvoří jádrový komplex. Cyklin aktivující kinázový subkomplex (CDK7, MAT1 a cyklin H) je spojen s jádrem prostřednictvím proteinu XPD.[3] Dvě z podjednotek, ERCC2 / XPD a ERCC3 /XPB, mít helikáza a ATPáza aktivity a pomáhají vytvářet transkripční bublina. Ve zkumavce jsou tyto podjednotky vyžadovány pro transkripci, pouze pokud DNA šablona ještě není denaturovaný nebo pokud ano nadšroubovicový.

Dvě další podjednotky TFIIH, CDK7 a cyklin H, fosforylát serin aminokyseliny na RNA polymeráze II C-terminál doména a případně další proteiny zapojené do buněčný cyklus. Vedle vitální funkce při iniciaci transkripce je také zapojen TFIIH oprava nukleotidové excize.

Historie TFIIH

Předtím, než jej TFIIH identifikoval, měl několik jmen: tento faktor nejprve v roce 1989 izoloval z jater krysy známý ten čas jako transkripce faktoru delta to také izoloval z rakovinných buněk známých jako Základní transkripční faktor 2 Také se izoluje z kvasinek známý transkripční faktor B. Nakonec v roce 1992 známý jako TFIIH.[4]

Struktura TFIIH

TFIIH se skládá ze dvou hlavních částí, s nimiž jádro je jádro, které má XPB tyto podjednotky p62, p52, str. 44, str a p8 a CAK ve složení CDK7, cyklin H a MAT1. Jednotka, která spojuje jádro s CAK, se nazývá XPD.[5]

Funkce

Obecná funkce TFIIH:

  1. Zahajovací transkripce genu kódujícího protein.[6]
  2. Oprava nukleotidů DNA.[6]

(NER) TFIIH je obecný transkripční faktor, který slouží k náboru RNA Pol II k promotorům genů. Funguje jako helikáza, která odvíjí DNA. Rovněž odvíjí DNA poté, co byla léze DNA rozpoznána buď cestou globální opravy genomu (GGR), nebo cestou opravy transkripce spojené (TCR) NER.[7][8] Purifikovaný TFIIH má také roli při tvorbě RNA aktivací enzymu a-amanitinu.

Trichothiodystrofie

Mutace v genech ERCC3/XPB, ERCC2 /XPD nebo TTDA způsobit trichothiodystrofie, stav charakterizovaný fotocitlivost, ichtyóza, křehké vlasy a nehty, poškození intelektu, snížená plodnost a / nebo nízký vzrůst.[9]

Choroba

Je známo, že genetické polymorfismy genů, které kódují podjednotky TFIIH, jsou spojeny se zvýšenou náchylností k rakovině v mnoha tkáních, např .; kožní tkáň, prsní tkáň a plicní tkáň. Mutace v podjednotkách (jako XPD a XPB) mohou vést k řadě nemocí, včetně xeroderma pigmentosum (XP) nebo XP v kombinaci s Cockaynův syndrom.[10] Kromě genetických variací cílí viry kódované proteiny také na TFIIH.[11]

Oprava DNA

TFIIH se účastní oprava nukleotidové excize (NER) otevřením DNA dvojitá šroubovice po zjištění poškození. NER je vícestupňová cesta, která odstraňuje širokou škálu různých poškození, která narušují normální párování bází, včetně objemných chemických poškození a poškození způsobeného UV zářením. Jedinci s mutačními defekty v genech specifikujících proteinové složky, které katalyzují dráhu NER, včetně složek TFIIH, často vykazují znaky předčasného stárnutí[9][12] (vidět Teorie poškození DNA stárnutí ).

Mechanismus TFIIH opravy sekvence poškozené DNA

Mechanismus TFIIH opravy sekvence poškozené DNA

Reference

  1. ^ Flores O, Lu H, Reinberg D (únor 1992). "Faktory podílející se na specifické transkripci savčí RNA polymerázou II. Identifikace a charakterizace faktoru IIH". The Journal of Biological Chemistry. 267 (4): 2786–93. PMID  1733973.
  2. ^ Kim TK, Ebright RH, Reinberg D (květen 2000). "Mechanismus tání promotoru závislého na ATP transkripčním faktorem IIH". Věda. 288 (5470): 1418–22. Bibcode:2000 sci ... 288,1418 tis. doi:10.1126 / science.288.5470.1418. PMID  10827951.
  3. ^ Lee TI, Young RA (2000). "Transkripce genů kódujících eukaryotický protein". Výroční přehled genetiky. 34: 77–137. doi:10.1146 / annurev.genet.34.1.77. PMID  11092823.
  4. ^ Rimel JK, Taatjes DJ (červen 2018). „Základní a multifunkční komplex TFIIH“. Věda o bílkovinách. 27 (6): 1018–1037. doi:10,1002 / pro.3424. PMC  5980561. PMID  29664212.
  5. ^ Drapkin R, Reardon JT, Ansari A, Huang JC, Zawel L, Ahn K, Sancar A, Reinberg D (duben 1994). „Dvojí role TFIIH při opravě excize DNA a při transkripci RNA polymerázou II“. Příroda. 368 (6473): 769–72. Bibcode:1994 Natur.368..769D. doi:10.1038 / 368769a0. PMID  8152490. S2CID  4363484.
  6. ^ A b Compe E, Egly JM (květen 2012). "TFIIH: když transkripce narazila na opravu DNA". Recenze přírody. Molekulární buněčná biologie. 13 (6): 343–54. doi:10.1038 / nrm3350. PMID  22572993. S2CID  29077515.
  7. ^ Hoogstraten D, Nigg AL, Heath H, Mullenders LH, van Driel R, Hoeijmakers JH, Vermeulen W, Houtsmuller AB (listopad 2002). „Rychlé přepínání TFIIH mezi transkripcí RNA polymerázy I a II a opravou DNA in vivo“. Molekulární buňka. 10 (5): 1163–74. doi:10.1016 / s1097-2765 (02) 00709-8. PMID  12453423.
  8. ^ Assfalg R, Lebedev A, Gonzalez OG, Schelling A, Koch S, Iben S (leden 2012). „TFIIH je elongační faktor RNA polymerázy I“. Výzkum nukleových kyselin. 40 (2): 650–9. doi:10.1093 / nar / gkr746. PMC  3258137. PMID  21965540.
  9. ^ A b Theil AF, Hoeijmakers JH, Vermeulen W (listopad 2014). „TTDA: velký dopad malého proteinu“. Experimentální výzkum buněk. 329 (1): 61–8. doi:10.1016 / j.yexcr.2014.07.008. PMID  25016283.
  10. ^ Oh KS, Khan SG, Jaspers NG, Raams A, Ueda T, Lehmann A, Friedmann PS, Emmert S, Gratchev A, Lachlan K, Lucassan A, Baker CC, Kraemer KH (listopad 2006). „Fenotypová heterogenita v genu XPB DNA helikázy (ERCC3): xeroderma pigmentosum bez a s Cockayneovým syndromem“. Lidská mutace. 27 (11): 1092–103. doi:10.1002 / humu.20392. PMID  16947863. S2CID  22852219.
  11. ^ Le May N, Dubaele S, Proietti De Santis L, Billecocq A, Bouloy M, Egly JM (únor 2004). „Transkripční faktor TFIIH, cíl viru hemoragické horečky v údolí Rift“. Buňka. 116 (4): 541–50. doi:10.1016 / s0092-8674 (04) 00132-1. PMID  14980221. S2CID  14312462.
  12. ^ Edifizi D, Schumacher B (srpen 2015). „Nestabilita genomu ve vývoji a stárnutí: poznatky z opravy nukleotidové excize u lidí, myší a červů“. Biomolekuly. 5 (3): 1855–69. doi:10,3390 / biom5031855. PMC  4598778. PMID  26287260.

externí odkazy