Oprava nukleotidové excize - Nucleotide excision repair

Schéma drah TC-NER a GG-NER. Tyto dvě cesty se liší pouze v počátečním rozpoznání poškození DNA.[1]

Oprava nukleotidové excize je Oprava DNA mechanismus.[2] DNA k poškození dochází neustále kvůli chemikáliím (např. interkalační činidla ), záření a další mutageny. Existují tři cesty excizní opravy k opravě poškození jednoho řetězce DNA: Nucleotide excision repair (NER), oprava základní excize (BER) a Oprava nesouladu DNA (MMR). Zatímco cesta BER může rozpoznat specifické objemné léze v DNA může opravit pouze poškozené báze, které jsou odstraněny specifické glykosylázy. Podobně dráha MMR cílí pouze na neodpovídající Watson-Crick základní páry.

Nucleotide excision repair (NER) je obzvláště důležitý excitační mechanismus, který odstraňuje poškození DNA vyvolané ultrafialové světlo (UV). Výsledkem poškození UV DNA je objemnost DNA adukty - tyto adukty jsou většinou dimery tyminu a 6,4-fotoprodukty. Rozpoznání poškození vede k odstranění krátkého jednovláknového segmentu DNA, který obsahuje lézi. Nepoškozená jednovláknová DNA zůstává a DNA polymeráza používá to jako šablonu pro syntézu krátkého doplňková sekvence. Konečná ligace k dokončení NER a vytvoření dvouvláknové DNA se provádí pomocí DNA ligáza. NER lze rozdělit na dvě subcesty: globální genomový NER (GG-NER nebo GGR) a transkripčně spojený NER (TC-NER nebo TCR). Tyto dvě subpathways se liší v tom, jak rozpoznávají poškození DNA, ale sdílejí stejný proces pro incizi léze, opravu a ligaci.

O důležitosti NER svědčí závažná lidská onemocnění, která jsou výsledkem vrozených genetických mutací proteinů NER. Xeroderma pigmentosum a Cockaynův syndrom jsou dva příklady nemocí souvisejících s NER.

U eukaryot

Oprava nukleotidové excize je složitější eukaryoty než prokaryoty, ale obecný princip je podobný. V buňkách savců se NER účastní 9 hlavních proteinů. Nedostatky určitých bílkovin vedou k onemocnění; názvy proteinů jsou spojeny s onemocněním. XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF a XPG vše pochází z хeroderma pigmentosum a CSA a CSB představují proteiny spojené s Cockayneovým syndromem. Navíc proteiny ERCC1, RPA, RAD23A, RAD23B a další se také účastní opravy excize nukleotidů. Úplnější seznam proteinů zapojených do NER je níže.

Eukaryotickou opravu excize nukleotidů lze rozdělit na dvě subcesty: globální genomový NER (GG-NER) a transkripčně spojený NER (TC-NER). Tři různé sady proteinů se podílejí na rozpoznávání poškození DNA pro každou subcestu. Po rozpoznání poškození se tři dílčí cesty sbíhají pro kroky dvojího řezu, opravy a ligace.

Rozpoznání poškození

Globální genomový NER (GG-NER)

Schéma znázorňuje vazbu proteinů zapojených do GG-NER.[3]

Globální genomová NER opravuje poškození jak transkribovaných, tak nepřepisovaných řetězců DNA v aktivních a neaktivních genech v celém genomu. Tento proces není závislý na transkripci. Tato dráha využívá několik proteinů „snímajících poškození“, včetně komplexů vázajících poškození DNA (DDB) a komplexů XPC-Rad23B, které neustále skenují genom a rozpoznávají zkroucení šroubovice: XPC -Rad23B komplex je zodpovědný za rozpoznávání zkreslení, zatímco DDB1 a DDB2 (XPE ) také dokáže rozpoznat některé typy poškození způsobených UV zářením. XPA navíc provádí funkci v rozpoznávání poškození, která je dosud špatně definována. Po identifikaci poškozeného místa se následné poškozené proteiny rekrutují do poškozené DNA, aby se ověřila přítomnost poškození DNA, vyřízne se poškozená DNA obklopující lézi a poté se vyplní opravná náplast.

Nemoci spojené s GG-NER

Mutace v mechanismu GG-NER jsou zodpovědné za mnoho genetických poruch, včetně:

  • Xeroderma pigmentosum (XP): těžká fotocitlivost, vysoká míra rakoviny v oblastech těla vystavených slunci (např. Pokožce)

Oprava spojené s transkripcí (TC-NER)

Schéma znázorňuje vazbu proteinů zapojených do TC-NER.[3]

V daném okamžiku většina genomu v organismu nepodléhá transkripci; existuje rozdíl v účinnosti NER mezi transkripčně tichými a transkripčně aktivními oblastmi genomu. U mnoha typů lézí NER opravuje transkribované řetězce transkripčně aktivních genů rychleji, než opravuje nepřepisované řetězce a transkripčně tichou DNA.

TC-NER a GG-NER se liší pouze v počátečních krocích rozpoznání poškození DNA. Hlavní rozdíl mezi TC-NER a GG-NER spočívá v tom, že TC-NER nevyžaduje pro rozpoznání zkreslení v savčích buňkách proteiny XPC nebo DDB. Místo toho TC-NER zahájí, když RNA polymeráza zastaví se v lézi v DNA: blokovaná RNA polymeráza slouží jako signál pro rozpoznání poškození, který nahrazuje potřebu vlastností rozpoznávání zkreslení komplexů XPC-RAD23B a DDB. CS proteiny (CSA a CSB) vážou místo XPC-Rad23B některé typy poškození DNA.

Jiné opravné mechanismy jsou možné, ale méně přesné a účinné.

Nemoci související s TC-NER

TC-NER iniciuje, když se RNA polymeráza zastaví v lézi v DNA, načež proteinové komplexy pomohou posunout polymerázu dozadu. Mutace v mechanismu TC-NER jsou zodpovědné za mnoho genetických poruch, včetně:

Duální řez

Transkripční faktor II H (TFIIH) je klíčový enzym zapojený do dvojí excize. TFIIH a XPG jsou nejprve přijati na místo poškození DNA (XPG stabilizuje TFIIH). TFIIH podjednotky XPD a XPB působí jako 5'-3 'a 3'-5' helikáza - pomáhají uvolnit DNA a vytvořit spojení mezi dvouvláknovou a jednovláknovou DNA kolem transkripční bublina. Kromě stabilizace TFIIH má také XPG endonukleáza aktivita; snižuje poškození DNA na 3' boční zatímco XPF –ERCC1 heterodimerní proteinové řezy na 5 'straně. Duální řez vede k odstranění ssDNA s mezerou s jedním vláknem 25 ~ 30 nukleotidů. Malé, vystřižené, DNA obsahující poškození (sedDNA) oligonukleotidy se zpočátku uvolňují z duplexu v komplexu s TFIIH, ale poté disociují způsobem závislým na ATP a navazují se na replikační protein A (RPA). Inhibice syntézy a ligace vyplňující mezeru vede k akumulaci sedDNA vázaných na RPA v buňce.

Replikační protein A (RPA) a XPA jsou poslední dva proteiny spojené s hlavním komplexem opravy NER. Tyto dva proteiny jsou přítomny před vazbou TFIIH, protože se podílejí na ověřování poškození DNA. Mohou také chránit jednořetězcovou DNA. Po ověření je proveden 5 'boční řez a oprava DNA začíná před 3' bočním řezem. To pomáhá snížit exponovanou jednovláknovou DNA během procesu opravy.

Opravy a ligace

Replikační faktor C (RFC ) načte Jaderný antigen proliferujících buněk (PCNA) na řetězec DNA. To umožňuje DNA polymerázám zapojeným do opravy (δ, ε a / nebo κ) kopírovat nepoškozené vlákno pomocí translokace. DNA ligáza I a Klapková endonukleáza 1 nebo Komplex ligáza-III-XRCC1 těsnění zářezy k dokončení NER.

U prokaryot: Uvr proteiny

Další informace: Endonukleáza UvrABC
Schematické znázornění modelů pro cestu opravy excize nukleotidů řízenou proteiny Uvr.[4]

Proces opravy excize nukleotidů je kontrolován Escherichia coli podle Endonukleáza UvrABC enzymový komplex, který se skládá ze čtyř Uvr proteinů: UvrA, UvrB, UvrC a DNA helikáza II (v tomto komplexu někdy také známý jako UvrD). Nejprve komplex UvrA-UvrB skenuje DNA, přičemž podjednotka UvrA rozpoznává zkroucení ve šroubovici způsobené například pyrimidinové dimery. Když komplex rozpozná takové zkreslení, podjednotka UvrA odejde a přijde protein UvrC, který se váže na monomer UvrB, a proto tvoří nový UvrBC dimer. UvrB štěpí a fosfodiesterová vazba 4 nukleotidy za poškozením DNA a UvrC štěpí fosfodiesterovou vazbu 8 nukleotidů před poškozením DNA a vytvořil segment vyříznutý 12 nukleotidy. DNA helikáza II (někdy nazývaná UvrD) poté přijde a odstraní vystřižený segment aktivním porušením vodíkových vazeb mezi komplementárními bázemi. Výsledná mezera se poté vyplní pomocí DNA polymerázy I a DNA ligázy. Základní proces excize je ve vyšších buňkách velmi podobný, ale tyto buňky obvykle zahrnují mnohem více proteinů - E-coli je jednoduchý příklad.[5]

TC-NER existuje také v bakteriích a je zprostředkován TRCF (MFD) protein. TRCF je SF2 ATPáza který využívá hydrolýzu ATP k translokaci na dsDNA před transkripční bublinou a dopředu translokáci RNA polymerázy, čímž iniciuje disociaci komplexu ternární elongace RNA polymerázy. TRCF také rekrutuje stroje pro opravu excize nukleotidů Uvr (A) BC přímou fyzickou interakcí s podjednotkou UvrA.

Rakovina

Dráhy excize DNA fungují v tandemu k opravě Poškození DNA. Neopravené poškození nebo nefunkční proteiny spojené s opravou excize mohou vést k neregulovanému buněčnému růstu a rakovině.[6]

Ačkoli historické studie ukázaly nekonzistentní výsledky, může to ovlivnit genetické variace nebo mutace genů pro opravu excize nukleotidů rakovina riziko ovlivněním účinnosti opravy. Jednonukleotidové polymorfismy (SNP) a nesynonymní kódující SNP (nsSNP) jsou v lidské populaci přítomny na velmi nízkých úrovních (> 1%).[7] Pokud se nacházejí v genech NER nebo regulačních sekvencích, mohou takové mutace negativně ovlivnit Oprava DNA kapacita vedoucí ke zvýšení pravděpodobnosti vývoje rakoviny. Zatímco funkční dopad všech polymorfismů nebyl charakterizován, některé polymorfismy v DNA opravných genech nebo jejich regulačních sekvencích indukují fenotypový se podílejí na vývoji rakoviny.[8] Studie o rakovina plic případy nalezly mírnou souvislost mezi NER specifickými polymorfismy SNP a rizikem rakoviny plic.[9] Výsledky naznačují, že některé zděděné polymorfní variace v genech NER mohou mít za následek predispozici k rakovině plic a potenciálně k dalším stavům rakoviny.

Dysfunkce NER je výsledkem polymorfismu DNA

Dva důležité geny v dráze NER, u nichž polymorfismus prokázal funkční a fenotypový dopad, jsou: XPD a XPC geny.[10] XPD, také známý jako ERCC2, slouží k otevření DNA v místě poškození během NER, kromě dalších transkripčních aktivit. Studie ukázaly, že polymorfismy na Exonu 10 (G> A) (Asp312Asn) a Exonu 23 (A> T) (Lys751Gln) jsou spojeny s genetickou predispozicí k několika typům rakoviny.[11][12] Gen XPC je zodpovědný za protein, který rozpoznává DNA během rané fáze dráhy NER. Tento gen může mít polymorfismy na Intronu 9 a SNP v Exonu 15, které také korelovaly s rizikem rakoviny. Výzkum ukázal, že polymorfismus inzerce / delece bialelického poly (AT) v Intron 9 XPC je spojen se zvýšeným rizikem rakoviny kůže, prsu a prostaty,[12][13][14] zejména v severoindických populacích.

Dopad na prognózu rakoviny

Studie dědičné rakoviny xeroderma pigmentosum pomohla identifikovat několik genů, které kódují proteiny v dráze NER, z nichž dva jsou XPC a XPD. XP je způsoben homozygotním nedostatkem opravy poškození DNA UV (GG-NER), který zvyšuje riziko rakoviny kůže u pacientů až 1000krát. U heterozygotních pacientů je riziko rakoviny sporadické, ale lze jej předpovědět na základě analytického posouzení polymorfismů v genech pro opravu DNA souvisejících s XP purifikovaných z lymfocyty.[15] Ve studii relapsů vysoce rizikových stadií II a III kolorektálního karcinomu byl XPD (ERCC2) polymorfismus 2251A> C významně korelován s časným relapsem po chemoterapeutické léčbě.[16] Studie ukázaly, že účinky polymorfních genů NER jsou aditivní, s větší frekvencí variant a vyšším rizikem rakoviny.[15][16][17]

Stárnutí

U lidí a myší zárodečná mutace v genech použitých v NER způsobují předčasné stárnutí. Tyto geny a jejich odpovídající proteiny zahrnují ERCC1(ERCC1 ), ERCC2 (XPD), ERCC3(XPB ), ERCC4 (XPF), ERCC5 (XPG), ERCC6 (CSB) a ERCC8 (CSA).

Nedostatek opravy DNA ERCC1 mutantní myši vykazují vlastnosti zrychleného stárnutí a mají omezenou životnost.[18] Zrychlené stárnutí u mutanta zahrnuje mnoho orgánů.

Mutace v ERCC2Gen (XPD) může vést k různým syndromům xeroderma pigmentosum (XP), trichothiodystrofie (TTD) nebo kombinace XP a TTD (XPTTD) nebo kombinace XP a Cockaynův syndrom (XPCS).[19] TTD a CS vykazují vlastnosti předčasného stárnutí. Tyto funkce mohou zahrnovat senzorineurální hluchota, degenerace sítnice, hypomethylace bílé hmoty, kalcifikace centrálního nervového systému, snížený vzrůst a kachexie (ztráta podkožní tukové tkáně).[19][20] Fibroblasty XPCS a TTD z ERCC2(XPD) mutantní člověk a myš vykazují důkazy o defektní opravě poškození oxidační DNA, které může být základem symptomů segmentálního progeroidu (předčasné stárnutí)[21] (vidět Teorie poškození DNA stárnutí ).

Mutace v ERCC3Gen (XPB) může u lidí vést k xeroderma pigmentosum (XP) nebo XP v kombinaci s Cockaynův syndrom (XPCS).[22]

Nedostatek ERCC4(XPF) u lidí má za následek různé podmínky včetně zrychleného stárnutí.[23]

U lidí mutační vady v ERCC5Gen (XPG) může způsobit buď stav náchylný k rakovině xeroderma pigmentosum (XP) samostatně nebo v kombinaci s těžkou neurovývojovou poruchou Cockaynův syndrom (CS) nebo infantilní letální cerebro-okulo-facio-skeletální syndrom.[24] An ERCC5(XPG) model mutantní myši představuje vlastnosti předčasného stárnutí včetně kachexie a osteoporóza s výraznými degenerativními fenotypy v játrech i mozku.[24] U těchto mutovaných myší se vyvinul multisystémový předčasný stárnutí degenerativního fenotypu, který zjevně posiluje vazbu mezi nimi Poškození DNA a stárnutí.[24](vidět Teorie poškození DNA stárnutí ).

Cockayneův syndrom (CS) vzniká zárodečná linie mutace v jednom ze dvou geny ERCC8(CSA) nebo ERCC6(CSB). ERCC8Mutace (CSA) obecně vedou k mírnější formě CS než ERCC6(CSB) mutace.[25] Mutace v genu CSA tvoří asi 20% případů CS.[26] Jedinci s CSA a CSB se vyznačují silným postnatálním růstem a mentální retardací a zrychleným stárnutím vedoucím k předčasné smrti ve věku 12 až 16 let.[27]

Pokles v NER se stárnutím

Jak přezkoumali Gorbunova et al.,[28] studie NER v různých buňkách a tkáních od mladých i starých jedinců často ukázaly pokles kapacity NER se zvyšujícím se věkem. Tento pokles může být způsoben sníženými konstitutivními hladinami proteinů použitých v dráze NER.[29]

Geny spojené s NER

Lidský gen (protein)Myš OrthologDroždí OrthologSubpathwayFunkce v NERGenové karty Vstup
CCNH (Cyclin H )CcnhCCL1ObaPodjednotka aktivátoru kinázy CDK (CAK)CCNH
CDK7 (Cyklin závislá kináza (CDK) 7) )CDK7KIN28ObaCAK podjednotkaCDK7
CETN2 (Centrin-2)Cetn2NeznámýGGRRozpoznání poškození; tvoří komplex s XPCCETN2
DDB1 (DDB1 )Ddb1NeznámýGGRRozpoznání poškození; tvoří komplex s DDB2DDB1
DDB2 (DDB2 )Ddb2 / XpeNeznámýGGRRozpoznání poškození; rekrutuje XPCDDB2
ERCC1 (ERCC1 )Ercc1RAD10ObaPodílí se na řezu na 3 'straně poškození; tvoří komplex s XPFERCC1
ERCC2 (XPD )Ercc2RAD3ObaAktivita ATPázy a helikázy; transkripční faktor II H (TFIIH) podjednotkaERCC2
ERCC3 (XPB )Ercc3RAD25ObaAktivita ATPázy a helikázy; transkripční faktor II H (TFIIH) podjednotkaERCC3
ERCC4 (XPF )Ercc4RAD1ObaPodílí se na řezu na 3 'straně poškození; strukturně specifická endonukleázaERCC4
ERCC5 (XPG )Ercc5RAD2ObaPodílí se na řezu na 5 'straně poškození; stabilizuje TFIIH; strukturně specifická endonukleázaERCC5
ERCC6 (CSB )Ercc6RAD26TC-NERFaktor prodloužení transkripce; podílí se na transkripční vazbě a remodelaci chromatinuERCC6
ERCC8 (CSA )Ercc8RAD28TC-NERKomplex ubikvitin ligázy; interaguje s CSB a p44 TFIIHERCC8
LIG1 (DNA ligáza I )Lig1CDC9ObaZávěrečná ligaceLIG1
MNAT1 (MNAT1 )Mnat1TFB3ObaStabilizuje komplex CAKMNAT1
MMS19 (MMS19 )Mms19MET18ObaInterakce s podjednotkami XPD a XPB helikáz TFIIHMMS19
RAD23A (RAD23A )Rad23aRAD23GGRRozpoznání poškození; tvoří komplex s XPCRAD23A
RAD23B (RAD23B )Rad23bRAD23GGRRozpoznávání poškození je u XPC složitéRAD23B
RPA1 (RPA1 )Rpa1RFA1ObaPodjednotka komplexu RFARPA1
RPA2 (RPA2 )Rpa2RFA2ObaPodjednotka komplexu RFARPA2
TFIIH (Transkripční faktor II H )Gtf2h1-3Tfb1 SSL1 Tfb4ObaPodílí se na řezu a tvoří kolem léze komplexGTF2H1 GTF2H2 GTF2H3
XAB2 (XAB2 )Xab2SYF1TC-NERRozpoznání poškození; interaguje s XPA, CSA a CSBXAB2
XPA (XPA )XpaRAD14ObaRozpoznání poškozeníXPA
XPC (XPC )XpcRAD4GGRRozpoznání poškozeníXPC

Viz také

Reference

  1. ^ Fuss JO, Cooper PK (červen 2006). „Oprava DNA: dynamičtí zastánci rakoviny a stárnutí“. PLoS Biology. 4 (6): e203. doi:10.1371 / journal.pbio.0040203. PMC  1475692. PMID  16752948. otevřený přístup
  2. ^ Carroll SB; Wessler SR; Griffiths AJFl; Lewontin RC (2008). Úvod do genetické analýzy. New York: W.H. Freeman and Co. p. 534. ISBN  978-0-7167-6887-6.
  3. ^ A b Le May N, Egly JM, Coin F (2010). „Pravdivé lži: dvojitý život faktorů opravy excize nukleotidů při transkripci a opravě DNA“. Journal of Nucleic Acids. 2010: 1–10. doi:10.4061/2010/616342. PMC  2915888. PMID  20725631.
  4. ^ Morita R, Nakane S, Shimada A a kol. (2010). „Molekulární mechanismy celého systému pro opravu DNA: srovnání bakteriálních a eukaryotických systémů“. Journal of Nucleic Acids. 2010: 1–32. doi:10.4061/2010/179594. PMC  2957137. PMID  20981145.
  5. ^ Truglio JJ, Croteau DL, Van Houten B, Kisker C (únor 2006). Msgstr "Oprava excize prokaryotických nukleotidů: systém UvrABC". Chemické recenze. 106 (2): 233–252. doi:10.1021 / cr040471u. PMID  16464004.
  6. ^ Zhang Y, Rohde LH, Wu H (červen 2009). "Zapojení mechanismů excize nukleotidů a nesouladů do opravy dvouvláknových zlomů". Současná genomika. 10 (4): 250–258. doi:10.2174/138920209788488544. PMC  2709936. PMID  19949546.
  7. ^ Kwok PY, Gu Z (prosinec 1999). „Knihovny polymorfismu s jedním nukleotidem: proč a jak je budujeme?“. Molekulární medicína dnes. 5 (12): 538–543. doi:10.1016 / S1357-4310 (99) 01601-9. PMID  10562720.
  8. ^ Karahalil B, Bohr V, Wilson D (říjen 2012). „Dopad polymorfismů DNA v klíčových proteinech pro opravu excize DNA báze na riziko rakoviny“. Lidská a experimentální toxikologie. 31 (10): 981–1005. doi:10.1177/0960327112444476. PMC  4586256. PMID  23023028.
  9. ^ Sakoda LC, Loomis MM, Doherty JA, Julianto L, Barnett MJ, Neuhouser ML, Thornquist MD, Weiss NS, Goodman GE, Chen C (2012). „Variace zárodečné linie v genech pro excizi nukleotidů a riziko rakoviny plic u kuřáků“. International Journal of Molecular Epidemiology and Genetics. 3 (1): 1–17. PMC  3316453. PMID  22493747.
  10. ^ Hou SM, Fält S, Angelini S, Yang K, Nyberg F, Lambert B, Hemminki K (duben 2002). „Varianty alely XPD jsou spojeny se zvýšenou hladinou aduktu aromatické DNA a rizikem rakoviny plic“. Karcinogeneze. 23 (4): 599–603. doi:10.1093 / carcin / 23.4.599. PMID  11960912.
  11. ^ Wang M, Gu D, Zhang Z, Zhou J, Zhang Z (2009). „Polymorfismy XPD, kouření cigaret a riziko rakoviny močového měchýře: metaanalýza“. Journal of Toxicology and Environmental Health Part A. 72 (11–12): 698–705. doi:10.1080/15287390902841029. PMID  19492231.
  12. ^ A b Mittal RD, Mandal RK (leden 2012). „Genetická variace genů pro opravu dráhy excize nukleotidů ovlivňují citlivost rakoviny prostaty a močového měchýře v severoindické populaci“. Indian Journal of Human Genetics. 18 (1): 47–55. doi:10.4103/0971-6866.96648. PMC  3385179. PMID  22754221.
  13. ^ Blankenburg S, König IR, Moessner R, Laspe P, Thoms KM, Krueger U, Khan SG, Westphal G, Berking C, Volkenandt M, Reich K, Neumann C, Ziegler A, Kraemer KH, Emmert S (červen 2005). „Hodnocení polymorfismů genu 3 xeroderma pigmentosum skupiny C a rizika kožního melanomu: případová kontrolní studie“. Karcinogeneze. 26 (6): 1085–1090. doi:10.1093 / carcin / bgi055. PMID  15731165.
  14. ^ Shore RE, Zeleniuch-Jacquotte A, Currie D, Mohrenweiser H, Afanasyeva Y, Koenig KL, Arslan AA, Toniolo P, Wirgin I (květen 2008). „Polymorfismy v genech XPC a ERCC2, riziko kouření a rakoviny prsu“. International Journal of Cancer. 122 (9): 2101–2105. doi:10.1002 / ijc.23361. PMID  18196582.
  15. ^ A b Qiao Y, Spitz MR, Guo Z, Hadeyati M, Grossman L, Kraemer KH, Wei Q (listopad 2002). „Rychlé vyhodnocení opravy poškození ultrafialového záření pomocí modifikovaného testu reaktivace hostitelských buněk s použitím reportérového genu luciferázy a korelace s polymorfismy genů pro opravu DNA v normálních lidských lymfocytech.“ Mutační výzkum. 509 (1–2): 165–174. doi:10.1016 / S0027-5107 (02) 00219-1. PMID  12427537.
  16. ^ A b Huang MY, Fang WY, Lee SC, Cheng TL, Wang JY, Lin SR (2008). „Genetický polymorfismus ERCC2 2251A> C vysoce koreloval s časným relapsem u vysoce rizikových pacientů s kolorektálním karcinomem ve stadiu II a III: předběžná studie“. Rakovina BMC. 8: 50. doi:10.1186/1471-2407-8-50. PMC  2262891. PMID  18267032. otevřený přístup
  17. ^ Spitz MR, Wu X, Wang Y, Wang LE, Shete S, Amos CI, Guo Z, Lei L, Mohrenweiser H, Wei Q (únor 2001). „Modulace kapacity opravy excize nukleotidů polymorfizmy XPD u pacientů s rakovinou plic“. Výzkum rakoviny. 61 (4): 1354–1357. PMID  11245433.
  18. ^ Vermeij WP, Dollé ME, Reiling E, Jaarsma D, Payan-Gomez C, Bombardieri CR, Wu H, Roks AJ, Botter SM, van der Eerden BC, Youssef SA, Kuiper RV, Nagarajah B, van Oostrom CT, Brandt RM, Barnhoorn S, Imholz S, Pennings JL, de Bruin A, Gyenis Á, Pothof J, Vijg J, van Steeg H, Hoeijmakers JH (2016). „Omezená strava zpomaluje zrychlené stárnutí a genomový stres u myší s nedostatkem opravy DNA“. Příroda. 537 (7620): 427–431. doi:10.1038 / příroda19329. PMC  5161687. PMID  27556946.
  19. ^ A b Andressoo JO, Hoeijmakers JH, Mitchell JR (2006). „Poruchy opravy excizí nukleotidů a rovnováha mezi rakovinou a stárnutím“. Buněčný cyklus. 5 (24): 2886–8. doi:10,4161 / cc. 5,24.3565. PMID  17172862.
  20. ^ Fuss JO, Tainer JA (2011). „Helikázy XPB a XPD v TFIIH organizují otevření duplexu DNA a ověření poškození za účelem koordinace opravy s transkripcí a buněčným cyklem prostřednictvím CAK kinázy“. Oprava DNA (Amst.). 10 (7): 697–713. doi:10.1016 / j.dnarep.2011.04.028. PMC  3234290. PMID  21571596.
  21. ^ Andressoo JO, Mitchell JR, de Wit J, Hoogstraten D, Volker M, Toussaint W, Speksnijder E, Beems RB, van Steeg H, Jans J, de Zeeuw CI, Jaspers NG, Raams A, Lehmann AR, Vermeulen W, Hoeijmakers JH , van der Horst GT (2006). „Myší model Xpd pro kombinovaný syndrom xeroderma pigmentosum / Cockaynův syndrom vykazující jak predispozici k rakovině, tak segmentální progerii“. Rakovinová buňka. 10 (2): 121–32. doi:10.1016 / j.ccr.2006.05.027. PMID  16904611.
  22. ^ Oh KS, Khan SG, Jaspers NG, Raams A, Ueda T, Lehmann A, Friedmann PS, Emmert S, Gratchev A, Lachlan K, Lucassan A, Baker CC, Kraemer KH (2006). „Fenotypová heterogenita v genu XPB DNA helikázy (ERCC3): xeroderma pigmentosum bez a s Cockayneovým syndromem“. Hučení. Mutat. 27 (11): 1092–103. doi:10.1002 / humu.20392. PMID  16947863.
  23. ^ Gregg SQ, Robinson AR, Niedernhofer LJ (2011). „Fyziologické důsledky defektů v endonukleázě pro opravu DNA ERCC1-XPF“. Oprava DNA (Amst.). 10 (7): 781–91. doi:10.1016 / j.dnarep.2011.04.026. PMC  3139823. PMID  21612988.
  24. ^ A b C Barnhoorn S, Uittenboogaard LM, Jaarsma D, Vermeij WP, Tresini M, Weymaere M, Menoni H, Brandt RM, de Waard MC, Botter SM, Sarker AH, Jaspers NG, van der Horst GT, Cooper PK, Hoeijmakers JH, van der Pluijm I (2014). „Buněčné autonomní změny progeroidů v podmíněných myších modelech pro opravu deficitu endonukleázy XPG“. PLoS Genet. 10 (10): e1004686. doi:10.1371 / journal.pgen.1004686. PMC  4191938. PMID  25299392.
  25. ^ Iyama T, Wilson DM (2016). „Prvky, které regulují reakci DNA na poškození proteinů defektních u Cockaynova syndromu“. J. Mol. Biol. 428 (1): 62–78. doi:10.1016 / j.jmb.2015.11.020. PMC  4738086. PMID  26616585.
  26. ^ Koch S, Garcia Gonzalez O, Assfalg R, Schelling A, Schäfer P, Scharffetter-Kochanek K, Iben S (2014). „Protein A podle Cockayneova syndromu je transkripčním faktorem RNA polymerázy I a stimuluje ribozomální biogenezi a růst.“. Buněčný cyklus. 13 (13): 2029–37. doi:10,4161 / cc.29018. PMC  4111694. PMID  24781187.
  27. ^ Edifizi D, Schumacher B (2015). „Nestabilita genomu ve vývoji a stárnutí: poznatky z opravy nukleotidové excize u lidí, myší a červů“. Biomolekuly. 5 (3): 1855–69. doi:10,3390 / biom5031855. PMC  4598778. PMID  26287260.
  28. ^ Gorbunova V, Seluanov A, Mao Z, Hine C (2007). „Změny v opravě DNA během stárnutí“. Nucleic Acids Res. 35 (22): 7466–74. doi:10.1093 / nar / gkm 756. PMC  2190694. PMID  17913742.
  29. ^ Goukassian D, Gad F, Yaar M, Eller MS, Nehal USA, Gilchrest BA (2000). "Mechanismy a důsledky stárnutí souvisejícího s opravnou kapacitou DNA". FASEB J. 14 (10): 1325–34. doi:10.1096 / fj.14.10.1325. PMID  10877825.

Další čtení

externí odkazy