SNAI2 - SNAI2

SNAI2
Identifikátory
Aliasy	SNAI2, SLUG, SLUGH1, SNAIL2, WS2D, transkripční represor rodiny hlemýžďů 2, SLUGH
Externí ID	OMIM: 602150 MGI: 1096393 HomoloGene: 31127 Genové karty: SNAI2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 8 (lidský)
Konec	48,921,740 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 16 (myš)
Konec	14,709,385 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA; • vazba kovových iontů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba nukleové kyseliny; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 Aktivita transkripčního represoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • vazba chromatinu; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • aktivita transkripčního faktoru, vazba specifická pro sekvenci distálního zesilovače RNA polymerázy II; • Vazba e-boxu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • nukleární chromatin; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• Signální dráha zářezu; • negativní regulace signální dráhy receptoru vitaminu D.; • regulace transkripce, DNA-šablony; • vývoj buněk neurální lišty; • negativní regulace množení keratinocytů; • regulace sestavy těsného spojení dvoubuněčných buněk; • pozitivní regulace buněčné migrace; • negativní regulace vnitřní apoptotické signální dráhy v reakci na poškození DNA; • transkripce, chráněná DNA; • buněčná odpověď na stimul epidermálního růstového faktoru; • negativní regulace procesu biosyntézy vitaminu D.; • regulace produkce chemokinů; • vývoj mnohobuněčných organismů; • negativní regulace diferenciace chondrocytů; • negativní regulace reakce poškození DNA, transdukce signálu mediátorem třídy p53; • regulace diferenciace osteoblastů; • diferenciace osteoblastů; • kanonická signální cesta Wnt; • negativní regulace kanonické signální dráhy Wnt; • negativní regulace buněčné adheze zprostředkované integrinem; • negativní regulace anoikis; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • přechod mezi epitelem a mezenchymem; • přechod mezi epitelem a mezenchymem zapojený do tvorby endokardiálního polštáře; • buněčná migrace podílející se na tvorbě polštáře endokardu; • smyslové vnímání zvuku; • demontáž desmosomu; • pigmentace; • vývoj epitelu; • negativní regulace vnější apoptotické signální dráhy v nepřítomnosti ligandu; • morfogeneze aortální chlopně; • negativní regulace buněčné adheze podílející se na buněčné migraci vázané na substrát; • reakce na záření; • migrace buněk; • pozitivní regulace acetylace histonů; • negativní regulace apoptotického procesu; • pozitivní regulace diferenciace tukových buněk; • diferenciace bílých tukových buněk; • vývoj patra; • morfogeneze chrupavky; • regulace větvení podílejícího se na morfogenezi slinných žláz; • buněčná reakce na ionizující záření; • negativní regulace proliferace kmenových buněk; • Signalizace zářezu zapojená do vývoje srdce;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6591
	20583
	ENSG00000019549
	ENSMUSG00000022676
	O43623
	P97469
	NM_003068
	NM_011415
	NP_003059
	NP_035545
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein se zinkovým prstem SNAI2 je transkripční faktor že u lidí je kódován SNAI2 gen. Podporuje diferenciaci a migraci určitých buněk a má role při iniciaci gastrulace.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Tento gen kóduje člena superrodiny hlemýžďů typu C2H2 zinkový prst transkripční faktory. Kódovaný protein funguje jako a transkripční represor, který se váže na E-box motivy a pravděpodobně také potlačuje E-kadherin transkripce u karcinomu prsu. Tento protein je součástí epitelovo-mezenchymální přechody a má antiapoptotický aktivita. Reguluje diferenciaci a migraci neurální lišta buňky spolu s dalšími geny (např. FOXD3, SOX9 a SOX10, BMP ) v embryonálním životě. Mutace v tomto genu mohou být spojeny se sporadickými případy neurální trubice vady.^[7]^[8]

SNAI2 reguluje expresi E-kadherinu v premigrativních buňkách nervového hřebenu; SNAI2 tedy indukuje pevně vázané epiteliální buňky, aby se rozpadly na volný mezenchymální fenotyp, což umožňuje gastrulaci mezoderm ve vyvíjejícím se embryu.^[9]^[10] Strukturálně podobné antiapoptotice Ces-1 v C. elegansSLUG je negativní regulátor produktivní buněčné smrti u vyvíjejícího se embrya a dospělých.^[9]^[11]

Klinický význam

SLUG, široce exprimovaný v lidských tkáních, je nejvýznamnější v leukocytech periferní krve, játrech dospělých a mozkových tkáních plodu i dospělých.^[11] SLUG hraje roli v karcinomu prsu i leukémii snížením regulace E-kadherinu, který podporuje mezenchymální fenotyp přesunem exprese z profilu kadherinu typu I na typ II.^[11]^[12] Udržování mezenchymálního fenotypu umožňuje metastázy nádorových buněk, i když SLUG je exprimován v karcinomech bez ohledu na invazivitu.^[9]^[10]^[11] Vyřazovací model využívající kuřecí embrya také ukázal inhibici delaminace mezodermální a neurální lišty; kuřecí embryo Zdá se, že zisk funkce slimáka zvyšuje produkci nervového hřebenu.^[9] Mutace v Slimáku jsou spojeny se ztrátou těhotenství během gastrulace u některých zvířat.^[9]

Interakce

BMP předcházejí expresi SLUG a jsou podezřelé jako okamžité upstream induktory genové exprese.^[10]^[13]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000019549 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022676 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Rhim H, Savagner P, Thibaudeau G, Thiery JP, Pavan WJ (leden 1998). „Lokalizace transkripčního faktoru neurální lišty, Slug, do myšího chromozomu 16 a lidského chromozomu 8“. Savčí genom. 8 (11): 872–3. doi:10,1007 / s003359900601. PMID 9337409. S2CID 2177885.
^ Cohen ME, Yin M, Paznekas WA, Schertzer M, Wood S, Jabs EW (srpen 1998). "Organizace lidského SLUG genu, exprese a umístění chromozomové mapy na 8q". Genomika. 51 (3): 468–71. doi:10.1006 / geno.1998.5367. PMID 9721220.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SNAI2 snail homolog 2 (Drosophila)“.
^ Stegmann, K .; Boecker, J .; Kosan, C .; Ermert, A .; Kunz, J .; Koch, M. C. (srpen 1999). „Lidský transkripční faktor SLUG: analýza mutací u pacientů s defekty neurální trubice a identifikace missense mutace (D119E) v oblasti definující podrodinu Slugů“. Mutační výzkum. 406 (2–4): 63–69. doi:10.1016 / s1383-5726 (99) 00002-3. ISSN 0027-5107. PMID 10479723.
^ ^A ^b ^C ^d ^E Nieto MA (březen 2002). "Šnečí nadrodina transkripčních faktorů se zinkovým prstem". Nature Reviews Molecular Cell Biology. 3 (3): 155–66. doi:10.1038 / nrm757. PMID 11994736. S2CID 8330951.
^ ^A ^b ^C Carlson BM (2013). Embryologie člověka a vývojová biologie (5. vydání). Philadelphia, PA: Elsevier Health Sciences. 101–102, 106, 313, 362, 382. ISBN 978-1-4557-2794-0.
^ ^A ^b ^C ^d Inukai T, Inoue A, Kurosawa H, Goi K, Shinjyo T, Ozawa K, Mao M, Inaba T, Podívejte se na (září 1999). „SLUG, gen transkripčního faktoru se zinkovým prstem souvisejícím s ces-1 s antiapoptotickou aktivitou, je downstream cílem onkoproteinu E2A-HLF“. Molekulární buňka. 4 (3): 343–52. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80336-6. PMID 10518215.
^ Kalluri R, Weinberg RA (červen 2009). "Základy epiteliálně-mezenchymálního přechodu". The Journal of Clinical Investigation. 119 (6): 1420–8. doi:10.1172 / jci39104. PMC 2689101. PMID 19487818.
^ Sakai D, Wakamatsu Y (2005). "Regulační mechanismy pro tvorbu neurální lišty". Buňky Tkáňové orgány. 179 (1–2): 24–35. doi:10.1159/000084506. PMID 15942190. S2CID 1886380.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Savagner P, Yamada KM, Thiery JP (červen 1997). „Proteinový slimák se zinkovým prstem způsobuje disociaci desmosomu, počáteční a nezbytný krok pro přechod epiteliálně-mezenchymálním přechodem indukovaný růstovým faktorem.“. The Journal of Cell Biology. 137 (6): 1403–19. doi:10.1083 / jcb.137.6.1403. PMC 2132541. PMID 9182671.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Stegmann K, Boecker J, Kosan C, Ermert A, Kunz J, Koch MC (srpen 1999). „Lidský transkripční faktor SLUG: analýza mutací u pacientů s defekty neurální trubice a identifikace missense mutace (D119E) v oblasti definující podrodinu Slugů“. Mutační výzkum. 406 (2–4): 63–9. doi:10.1016 / S1383-5726 (99) 00002-3. PMID 10479723.
Inukai T, Inoue A, Kurosawa H, Goi K, Shinjyo T, Ozawa K, Mao M, Inaba T, Podívejte se na (září 1999). „SLUG, gen transkripčního faktoru se zinkovým prstem souvisejícím s ces-1 s antiapoptotickou aktivitou, je downstream cílem onkoproteinu E2A-HLF“. Molekulární buňka. 4 (3): 343–52. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80336-6. PMID 10518215.
Hemavathy K, Guru SC, Harris J, Chen JD, Ip YT (červenec 2000). „Human Slug je represor, který se lokalizuje na stránky s aktivní transkripcí“. Molekulární a buněčná biologie. 20 (14): 5087–95. doi:10.1128 / MCB.20.14.5087-5095.2000. PMC 85958. PMID 10866665.
Hajra KM, Chen DY, Fearon ER (březen 2002). „Protein SLUG se zinkovým prstem potlačuje E-kadherin u rakoviny prsu“. Výzkum rakoviny. 62 (6): 1613–8. PMID 11912130.
Sánchez-Martín M, Rodríguez-García A, Pérez-Losada J, Sagrera A, Read AP, Sánchez-García I (prosinec 2002). „Delece SLUG (SNAI2) u pacientů s Waardenburgovou chorobou“. Lidská molekulární genetika. 11 (25): 3231–6. doi:10,1093 / hmg / 11,25,3231. PMID 12444107.
Kajita M, McClinic KN, Wade PA (září 2004). „Aberantní exprese transkripčních faktorů hlemýžď a slimák mění reakci na genotoxický stres“. Molekulární a buněčná biologie. 24 (17): 7559–66. doi:10.1128 / MCB.24.17.7559-7566.2004. PMC 506998. PMID 15314165.
Catalano A, Rodilossi S, Rippo MR, Caprari P, Procopio A (listopad 2004). "Indukce transdukce signálu z faktoru kmenových buněk / c-Kit / slimák v multirezistentních maligních mezoteliomových buňkách". The Journal of Biological Chemistry. 279 (45): 46706–14. doi:10,1074 / jbc.M406696200. PMID 15337769.
Uchikado Y, Natsugoe S, Okumura H, Setoyama T, Matsumoto M, Ishigami S, Aikou T (únor 2005). „Slimácká exprese v nádorech konzervovaných E-kadherinem souvisí s prognózou u pacientů s karcinomem dlaždicových buněk jícnu“. Klinický výzkum rakoviny. 11 (3): 1174–80. PMID 15709186.
Tripathi MK, Misra S, Khedkar SV, Hamilton N, Irvin-Wilson C, Sharan C, Sealy L, Chaudhuri G (duben 2005). "Regulace exprese genu BRCA2 pomocí SLUG represorového proteinu v lidských buňkách prsu". The Journal of Biological Chemistry. 280 (17): 17163–71. doi:10,1074 / jbc.M501375200. PMC 3092429. PMID 15734731.
Tripathi MK, Misra S, Chaudhuri G (duben 2005). „Negativní regulace exprese cytokeratinů 8 a 19 pomocí SLUG represorového proteinu v lidských buňkách prsu“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 329 (2): 508–15. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.02.006. PMC 3086003. PMID 15737616.
Moody SE, Perez D, Pan TC, Sarkisian CJ, Portocarrero CP, Sterner CJ, Notorfrancesco KL, Cardiff RD, Chodosh LA (září 2005). "Transkripční represor Snail podporuje recidivu nádoru mléčné žlázy". Rakovinová buňka. 8 (3): 197–209. doi:10.1016 / j.ccr.2005.07.009. PMID 16169465.
Chen M, Chen LM, Chai KX (červen 2006). „Androgenní regulace exprese genu prostasinu je zprostředkována proteiny vázajícími sterol-regulační prvek a SLUG“. Prostata. 66 (9): 911–20. doi:10,1002 / klady 20325. PMID 16541421. S2CID 23036264.
Turner FE, Broad S, Khanim FL, Jeanes A, Talma S, Hughes S, Tselepis C, Hotchin NA (červenec 2006). „Slimák reguluje expresi integrinu a buněčnou proliferaci v lidských epidermálních keratinocytech“. The Journal of Biological Chemistry. 281 (30): 21321–31. doi:10,1074 / jbc.M509731200. PMID 16707493.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000019549 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022676 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9337409-5] Rhim H, Savagner P, Thibaudeau G, Thiery JP, Pavan WJ (leden 1998). „Lokalizace transkripčního faktoru neurální lišty, Slug, do myšího chromozomu 16 a lidského chromozomu 8“. Savčí genom. 8 (11): 872–3. doi:10,1007 / s003359900601. PMID 9337409. S2CID 2177885.

[pmid9721220-6] Cohen ME, Yin M, Paznekas WA, Schertzer M, Wood S, Jabs EW (srpen 1998). "Organizace lidského SLUG genu, exprese a umístění chromozomové mapy na 8q". Genomika. 51 (3): 468–71. doi:10.1006 / geno.1998.5367. PMID 9721220.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: SNAI2 snail homolog 2 (Drosophila)“.

[8] Stegmann, K .; Boecker, J .; Kosan, C .; Ermert, A .; Kunz, J .; Koch, M. C. (srpen 1999). „Lidský transkripční faktor SLUG: analýza mutací u pacientů s defekty neurální trubice a identifikace missense mutace (D119E) v oblasti definující podrodinu Slugů“. Mutační výzkum. 406 (2–4): 63–69. doi:10.1016 / s1383-5726 (99) 00002-3. ISSN 0027-5107. PMID 10479723.

[Nieto_2002-9] A ^b ^C ^d ^E Nieto MA (březen 2002). "Šnečí nadrodina transkripčních faktorů se zinkovým prstem". Nature Reviews Molecular Cell Biology. 3 (3): 155–66. doi:10.1038 / nrm757. PMID 11994736. S2CID 8330951.

[Carlson_2013-10] A ^b ^C Carlson BM (2013). Embryologie člověka a vývojová biologie (5. vydání). Philadelphia, PA: Elsevier Health Sciences. 101–102, 106, 313, 362, 382. ISBN 978-1-4557-2794-0.

[Inukai_1999-11] A ^b ^C ^d Inukai T, Inoue A, Kurosawa H, Goi K, Shinjyo T, Ozawa K, Mao M, Inaba T, Podívejte se na (září 1999). „SLUG, gen transkripčního faktoru se zinkovým prstem souvisejícím s ces-1 s antiapoptotickou aktivitou, je downstream cílem onkoproteinu E2A-HLF“. Molekulární buňka. 4 (3): 343–52. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80336-6. PMID 10518215.

[12] Kalluri R, Weinberg RA (červen 2009). "Základy epiteliálně-mezenchymálního přechodu". The Journal of Clinical Investigation. 119 (6): 1420–8. doi:10.1172 / jci39104. PMC 2689101. PMID 19487818.

[13] Sakai D, Wakamatsu Y (2005). "Regulační mechanismy pro tvorbu neurální lišty". Buňky Tkáňové orgány. 179 (1–2): 24–35. doi:10.1159/000084506. PMID 15942190. S2CID 1886380.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]