Cited1 - CITED1

Cited1
Identifikátory
Aliasy	Cited1, MSG1, Cbp / p300 interagující transaktivátor s karboxyterminální doménou bohatou na Glu / Asp 1
Externí ID	OMIM: 300149 MGI: 108023 HomoloGene: 3057 Genové karty: Cited1
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	72,307,187 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	X chromozom (myš)
Konec	102,252,181 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: Aktivita transkripčního koaktivátoru 0001105; • společná vazba SMAD; • aktivita homodimerizace proteinu; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • vazba chromatinu; • Vazba domény LBD; • vazba na C-konec proteinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• negativní regulace neuronového apoptotického procesu; • reakce na transformaci růstového faktoru beta; • pozitivní regulace signální dráhy receptoru beta transformujícího růstového faktoru; • diferenciace buněk; • reakce na cytokiny; • biosyntetický proces melaninu; • vývoj vrstvy spongiotrofoblastů; • reakce na interleukin-1; • regulace transkripce, DNA-šablony; • Transdukce signálu proteinu SMAD; • reakce na interleukin-4; • reakce na interferon-gama; • reakce na interleukin-6; • placentace; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • reakce na interleukin-2; • negativní regulace mezenchymálního přechodu k epitelu podílející se na morfogenezi metanephros; • vývoj labyrintové vrstvy; • reakce na interleukin-11; • negativní regulace signální dráhy Wnt; • specifikace embryonální osy; • negativní regulace diferenciace osteoblastů; • transkripce, chráněná DNA; • reakce na estrogen; • vaskulogeneze; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • reakce na inzulín; • vývoj mnohobuněčných organismů; • reakce na lipopolysacharid; • větvení zapojené do morfogeneze ureterálních pupenů; • vývoj mozku; • pozitivní regulace genové exprese; • reakce na parathormon; • nukleocytoplazmatický transport; • pigmentace; • reakce na cAMP; • buněčná proliferace; • vývoj metanephros; • diferenciace melanocytů; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • reakce na interleukin-9; • signální dráha transformujícího růstového faktoru beta receptoru; • přechod z mezenchymálního na epiteliální; • apoptotický proces; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace apoptotického procesu; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace proliferace mezenchymálních kmenových buněk;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4435
	12705
	ENSG00000125931
	ENSMUSG00000051159
	Q99966
	P97769
	NM_001144885; NM_001144886; NM_001144887; NM_004143
	NM_001276466; NM_001276473; NM_001276474; NM_007709
	NP_001138357; NP_001138358; NP_001138359; NP_004134
	NP_001263395; NP_001263402; NP_001263403; NP_031735
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Cbp / p300 interagující transaktivátor 1 je protein že u lidí je kódován Cited1 gen.^[5]^[6]^[7]

Interakce

CITED1 bylo prokázáno komunikovat s HSPA8^[8] a EP300.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000125931 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000051159 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Shioda T, Fenner MH, Isselbacher KJ (prosinec 1996). „msg1, nový gen specifický pro melanocyty, kóduje jaderný protein a je spojován s pigmentací“. Proc Natl Acad Sci U S A. 93 (22): 12298–303. Bibcode:1996PNAS ... 9312298S. doi:10.1073 / pnas.93.22.12298. PMC 37985. PMID 8901575.
^ Fenner MH, Parrish JE, Boyd Y, Reed V, MacDonald M, Nelson DL, Isselbacher KJ, Shioda T (říjen 1998). „MSG1 (gen 1 specifický pro melanocyty): mapování na chromozom Xq13.1, genomová organizace a analýza promotoru“. Genomika. 51 (3): 401–7. doi:10.1006 / geno.1998.5383. PMID 9721210.
^ „Entrez Gene: CITED1 Cbp / p300-interagující transaktivátor s karboxyterminální doménou bohatou na Glu / Asp, 1“.
^ ^A ^b Yahata, T; de Caestecker MP; Lechleider R J; Andriole S; Roberts AB; Isselbacher K J; Shioda T (březen 2000). „Transaktivátor MSG1, který se neváže na DNA, se váže na koaktivátory p300 / CBP, čímž zvyšuje jejich funkční vazbu na transkripční faktory Smad.“. J. Biol. Chem. SPOJENÉ STÁTY. 275 (12): 8825–34. doi:10.1074 / jbc.275.12.8825. ISSN 0021-9258. PMID 10722728.

externí odkazy

Člověk Cited1 umístění genomu a Cited1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Shioda T, Fenner MH, Isselbacher KJ (1998). "MSG1 a jeho příbuzný protein MRG1 sdílejí doménu aktivující transkripci". Gen. 204 (1–2): 235–41. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00551-9. PMID 9434189.
Li H, Ahmed NU, Fenner MH a kol. (1998). „Regulace exprese jaderného proteinu specifického pro melanocyty MSG1 v lidských melanocytech a melanomových buňkách“. Exp. Cell Res. 242 (2): 478–86. doi:10.1006 / excr.1998.4123. PMID 9683535.
Shioda T, Lechleider RJ, Dunwoodie SL a kol. (1998). "Aktivita transkripce aktivující Smad4: role SMAD hetero-oligomerizace a zvýšení přidruženým transaktivátorem". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (17): 9785–90. Bibcode:1998PNAS ... 95.9785S. doi:10.1073 / pnas.95.17.9785. PMC 21414. PMID 9707553.
Vachtenheim J, Novotná H (2000). „Exprese genů pro isoformy mikroftalmie, Pax3 a MSG1, v lidských melanomech“. Buňka. Mol. Biol. (Noisy-le-grand). 45 (7): 1075–82. PMID 10644012.
Yahata T, de Caestecker MP, Lechleider RJ, et al. (2000). „Transaktivátor MSG1, který se neváže na DNA, se váže na koaktivátory p300 / CBP, čímž zvyšuje jejich funkční vazbu na transkripční faktory Smad.“. J. Biol. Chem. 275 (12): 8825–34. doi:10.1074 / jbc.275.12.8825. PMID 10722728.
Ahmed NU, Shioda T, Coser KR a kol. (2001). "Aberantní exprese MSG1 transkripčního aktivátoru v lidském maligním melanomu in vivo". Pigment Cell Res. 14 (2): 140–3. PMID 11310794.
Iwasaki T, Chin WW, Ko L (2001). „Identifikace a charakterizace aktivátoru koaktivátoru obsahujícího RRM (CoAA) jako proteinu interagujícího s TRBP a jeho sestřihové varianty jako modulátoru koaktivátoru (CoAM)“. J. Biol. Chem. 276 (36): 33375–83. doi:10,1074 / jbc.M101517200. PMID 11443112.
Yahata T, Shao W, Endoh H a kol. (2001). „Selektivní koaktivace transkripce závislé na estrogenu proteinem vázajícím CITED1 CBP / p300“. Genes Dev. 15 (19): 2598–612. doi:10,1101 / gad.906301. PMC 312794. PMID 11581164.
Bragança J, Swingler T, Marques FI a kol. (2002). „Lidský CREB-vazebný protein / p300-interagující transaktivátor s ED-bohatým ocasem (CITED) 4, nový člen rodiny CITED, funguje jako koaktivátor transkripčního faktoru AP-2“. J. Biol. Chem. 277 (10): 8559–65. doi:10,1074 / jbc.M110850200. PMID 11744733.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Shi G, Boyle SC, Sparrow DB a kol. (2006). „Transkripční aktivita CITED1 je regulována fosforylací způsobem závislým na buněčném cyklu“. J. Biol. Chem. 281 (37): 27426–35. doi:10,1074 / jbc.M602631200. PMID 16864582.
Lovvorn HN, Westrup J, Opperman S a kol. (2007). "CITED1 exprese ve Wilmsově nádoru a embryonální ledvině". Neoplazie. 9 (7): 589–600. doi:10.1593 / neo.07358. PMC 1941694. PMID 17710162.

Tento článek o gen na člověka X chromozom a / nebo související protein je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000125931 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000051159 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8901575-5] Shioda T, Fenner MH, Isselbacher KJ (prosinec 1996). „msg1, nový gen specifický pro melanocyty, kóduje jaderný protein a je spojován s pigmentací“. Proc Natl Acad Sci U S A. 93 (22): 12298–303. Bibcode:1996PNAS ... 9312298S. doi:10.1073 / pnas.93.22.12298. PMC 37985. PMID 8901575.

[pmid9721210-6] Fenner MH, Parrish JE, Boyd Y, Reed V, MacDonald M, Nelson DL, Isselbacher KJ, Shioda T (říjen 1998). „MSG1 (gen 1 specifický pro melanocyty): mapování na chromozom Xq13.1, genomová organizace a analýza promotoru“. Genomika. 51 (3): 401–7. doi:10.1006 / geno.1998.5383. PMID 9721210.

[entrez-7] „Entrez Gene: CITED1 Cbp / p300-interagující transaktivátor s karboxyterminální doménou bohatou na Glu / Asp, 1“.

[pmid10722728-8] A ^b Yahata, T; de Caestecker MP; Lechleider R J; Andriole S; Roberts AB; Isselbacher K J; Shioda T (březen 2000). „Transaktivátor MSG1, který se neváže na DNA, se váže na koaktivátory p300 / CBP, čímž zvyšuje jejich funkční vazbu na transkripční faktory Smad.“. J. Biol. Chem. SPOJENÉ STÁTY. 275 (12): 8825–34. doi:10.1074 / jbc.275.12.8825. ISSN 0021-9258. PMID 10722728.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]