BRF1 (gen) - BRF1 (gene)

BRF1
Identifikátory
Aliasy	BRF1, BRF, BRF-1, GTF3B, HEL-S-76p, TAF3B2, TAF3C, TAFIII90, TF3B90, TFIIIB90, hBRF, CFDS, RNA polymeráza III transkripční iniciační faktor 90 kDa podjednotka, RNA polymeráza III transkripční iniciační faktor, BRF1 RNA polymeráza III podjednotka faktoru iniciace transkripce
Externí ID	OMIM: 604902 MGI: 1919558 HomoloGene: 1161 Genové karty: BRF1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 14 (lidský)
Konec	105,315,589 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 12 (myš)
Konec	113,000,704 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba na protein třídy TBP; • vazba kovových iontů; • aktivita transkripčního faktoru, vazba jádrové RNA polymerázy III; • Vazba DNA specifické pro promotor RNA polymerázy III typu 3; • vazba transkripčního faktoru; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita faktoru iniciace translace;
Buněčná složka	• komplex transkripčního faktoru TFIIIB; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• transkripce rRNA; • transkripce tRNA; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy III; • transkripce z promotoru RNA polymerázy III; • iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy III; • Sestava transkripčního preiniciačního komplexu s templátem DNA; • Transkripce s templátem DNA, iniciace; • Sestava transkripčního preiniciačního komplexu RNA polymeráza III; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy III; • překladová iniciace;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	2972
	72308
	ENSG00000185024
	ENSMUSG00000011158
	Q92994
	Q8CFK2
NM_001242786; NM_001242787; NM_001242788; NM_001242789; NM_001242790;
	NM_001519; NM_145685; NM_145696
	NM_028193
NP_001229715; NP_001229716; NP_001229717; NP_001229718; NP_001229719;
	NP_001510; NP_663718; NP_663718.1
	NP_082469
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Transkripční faktor IIIB 90 kDa podjednotka je protein že u lidí je kódován BRF1 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Tento gen kóduje jednu ze tří podjednotek RNA polymeráza III transkripce faktorový komplex. Tento komplex hraje ústřední roli při iniciaci transkripce pomocí RNA polymeráza III na genech kódujících tRNA, 5S rRNA a další malé strukturní RNA. Genový produkt patří do rodiny TF2B. Byly identifikovány tři alternativně sestříhané varianty kódující tři různé izoformy, které fungují na různých promotorech transkribovaných RNA polymerázou III. Přepis kódující čtvrtou izoformu dosud nebyl zcela charakterizován.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že BRF1 (gen) komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000185024 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000011158 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Wang Z, Roeder RG (srpen 1995). „Struktura a funkce podjednotky lidského transkripčního faktoru TFIIIB, která je evolučně konzervovaná a obsahuje jak domény související s TFIIB, tak s proteinem s vysokou mobilitou skupiny 2“. Proc Natl Acad Sci U S A. 92 (15): 7026–30. doi:10.1073 / pnas.92.15.7026. PMC 41464. PMID 7624363.
^ Mital R, Kobayashi R, Hernandez N (leden 1997). „Transkripce RNA polymerázy III z humánních promotorů VAI lidského U6 a adenoviru typu 2 má různé požadavky na lidský BRF, podjednotku lidského TFIIIB“. Mol Cell Biol. 16 (12): 7031–42. doi:10.1128 / MCB.16.12.7031. PMC 231706. PMID 8943358.
^ ^A ^b „Entrez Gene: BRF1 BRF1 homolog, podjednotka RNA polymerázy III transkripčního iniciačního faktoru IIIB (S. cerevisiae)“.
^ ^A ^b ^C Sutcliffe JE, Cairns CA, McLees A, Allison SJ, Tosh K, White RJ (červen 1999). „Transkripční faktor RNA polymerázy III IIIB je cílem pro represi kapesními proteiny p107 a p130“. Mol. Buňka. Biol. 19 (6): 4255–61. doi:10,1128 / mcb.19.6.4255. PMC 104385. PMID 10330166.
^ Johnston IM, Allison SJ, Morton JP, Schramm L, Scott PH, White RJ (červen 2002). „CK2 tvoří stabilní komplex s TFIIIB a aktivuje transkripci RNA polymerázy III v lidských buňkách“. Mol. Buňka. Biol. 22 (11): 3757–68. doi:10.1128 / mcb.22.11.3757-3768.2002. PMC 133823. PMID 11997511.
^ McCulloch V, Hardin P, Peng W, Ruppert JM, Lobo-Ruppert SM (srpen 2000). „Alternativně sestříhané varianty hBRF fungují na různých promotorech RNA polymerázy III“. EMBO J.. 19 (15): 4134–43. doi:10.1093 / emboj / 19.15.4134. PMC 306597. PMID 10921893.

Další čtení

Chesnokov I, Chu WM, Botchan MR, Schmid CW (1997). „p53 inhibuje transkripci řízenou RNA polymerázou III způsobem závislým na promotoru“. Mol. Buňka. Biol. 16 (12): 7084–8. doi:10.1128 / MCB.16.12.7084. PMC 231711. PMID 8943363.
Chu WM, Wang Z, Roeder RG, Schmid CW (1997). „RNA polymeráza III transkripce potlačena Rb prostřednictvím svých interakcí s TFIIIB a TFIIIC2“. J. Biol. Chem. 272 (23): 14755–61. doi:10.1074 / jbc.272.23.14755. PMID 9169441.
Wang Z, Roeder RG (1997). „Tři lidské podjednotky specifické pro RNA polymerázu III tvoří subkomplex se selektivní funkcí při specifické iniciaci transkripce“. Genes Dev. 11 (10): 1315–26. doi:10.1101 / gad.11.10.1315. PMID 9171375.
Sutcliffe JE, Cairns CA, McLees A, Allison SJ, Tosh K, White RJ (červen 1999). „Transkripční faktor RNA polymerázy III IIIB je cílem pro represi kapesními proteiny p107 a p130“. Mol. Buňka. Biol. 19 (6): 4255–61. doi:10,1128 / mcb.19.6.4255. PMC 104385. PMID 10330166.
Hsieh YJ, Wang Z, Kovelman R, Roeder RG (1999). „Klonování a charakterizace dvou evolučně konzervovaných podjednotek (TFIIIC102 a TFIIIC63) lidského TFIIIC a jejich zapojení do funkčních interakcí s TFIIIB a RNA polymerázou III“. Mol. Buňka. Biol. 19 (7): 4944–52. doi:10.1128 / MCB.19.7.4944. PMC 84305. PMID 10373544.
Hsieh YJ, Kundu TK, Wang Z, Kovelman R, Roeder RG (listopad 1999). „TFIIIC90 podjednotka TFIIIC interaguje s více složkami mechanismu RNA polymerázy III a obsahuje aktivitu histonově specifické acetyltransferázy“. Mol. Buňka. Biol. 19 (11): 7697–704. doi:10,1128 / mcb.19.11.7697. PMC 84812. PMID 10523658.
McCulloch V, Hardin P, Peng W, Ruppert JM, Lobo-Ruppert SM (srpen 2000). „Alternativně sestříhané varianty hBRF fungují na různých promotorech RNA polymerázy III“. EMBO J.. 19 (15): 4134–43. doi:10.1093 / emboj / 19.15.4134. PMC 306597. PMID 10921893.
Johnston IM, Allison SJ, Morton JP, Schramm L, Scott PH, White RJ (červen 2002). „CK2 tvoří stabilní komplex s TFIIIB a aktivuje transkripci RNA polymerázy III v lidských buňkách“. Mol. Buňka. Biol. 22 (11): 3757–68. doi:10.1128 / MCB.22.11.3757-3768.2002. PMC 133823. PMID 11997511.
Cabart P, Murphy S (2002). „Sestavení lidského komplexu transkripčního faktoru IIIB specifického pro transkripční faktor IIIB de novo a promotor“. J. Biol. Chem. 277 (30): 26831–8. doi:10,1074 / jbc.M203119200. PMID 12016223.
Willis IM (2002). „Univerzální nomenklatura pro podjednotky faktoru iniciace transkripce RNA polymerázy III TFIIIB“. Genes Dev. 16 (11): 1337–8. doi:10,1101 / gad.998102. PMID 12066800.
Stoecklin G, Colombi M, Raineri I, Leuenberger S, Mallaun M, Schmidlin M, Gross B, Lu M, Kitamura T, Moroni C (září 2002). „Funkční klonování BRF1, regulátoru obratu mRNA závislého na ARE“. EMBO J.. 21 (17): 4709–18. doi:10.1093 / emboj / cdf444. PMC 126184. PMID 12198173.
Weser S, Riemann J, Seifart KH, Meissner W (2003). "Sestavení a izolace přechodných kroků transkripčních komplexů vytvořených na lidském genu 5S rRNA". Nucleic Acids Res. 31 (9): 2408–16. doi:10.1093 / nar / gkg345. PMC 154231. PMID 12711686.
Schmidlin M, Lu M, Leuenberger SA, Stoecklin G, Mallaun M, Gross B, Gherzi R, Hess D, Hemmings BA, Moroni C (prosinec 2004). „ARE-dependentní mRNA destabilizující aktivita BRF1 je regulována proteinkinázou B“. EMBO J.. 23 (24): 4760–9. doi:10.1038 / sj.emboj.7600477. PMC 535089. PMID 15538381.

externí odkazy

FactorBook BRF1
Člověk BRF1 umístění genomu a BRF1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 14 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000185024 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000011158 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7624363-5] A ^b Wang Z, Roeder RG (srpen 1995). „Struktura a funkce podjednotky lidského transkripčního faktoru TFIIIB, která je evolučně konzervovaná a obsahuje jak domény související s TFIIB, tak s proteinem s vysokou mobilitou skupiny 2“. Proc Natl Acad Sci U S A. 92 (15): 7026–30. doi:10.1073 / pnas.92.15.7026. PMC 41464. PMID 7624363.

[pmid8943358-6] Mital R, Kobayashi R, Hernandez N (leden 1997). „Transkripce RNA polymerázy III z humánních promotorů VAI lidského U6 a adenoviru typu 2 má různé požadavky na lidský BRF, podjednotku lidského TFIIIB“. Mol Cell Biol. 16 (12): 7031–42. doi:10.1128 / MCB.16.12.7031. PMC 231706. PMID 8943358.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: BRF1 BRF1 homolog, podjednotka RNA polymerázy III transkripčního iniciačního faktoru IIIB (S. cerevisiae)“.

[pmid10330166-8] A ^b ^C Sutcliffe JE, Cairns CA, McLees A, Allison SJ, Tosh K, White RJ (červen 1999). „Transkripční faktor RNA polymerázy III IIIB je cílem pro represi kapesními proteiny p107 a p130“. Mol. Buňka. Biol. 19 (6): 4255–61. doi:10,1128 / mcb.19.6.4255. PMC 104385. PMID 10330166.

[pmid11997511-9] Johnston IM, Allison SJ, Morton JP, Schramm L, Scott PH, White RJ (červen 2002). „CK2 tvoří stabilní komplex s TFIIIB a aktivuje transkripci RNA polymerázy III v lidských buňkách“. Mol. Buňka. Biol. 22 (11): 3757–68. doi:10.1128 / mcb.22.11.3757-3768.2002. PMC 133823. PMID 11997511.

[pmid10921893-10] McCulloch V, Hardin P, Peng W, Ruppert JM, Lobo-Ruppert SM (srpen 2000). „Alternativně sestříhané varianty hBRF fungují na různých promotorech RNA polymerázy III“. EMBO J.. 19 (15): 4134–43. doi:10.1093 / emboj / 19.15.4134. PMC 306597. PMID 10921893.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]