RBBP8 - RBBP8
Protein vázající retinoblastom 8 je protein že u lidí je kódován RBBP8 gen.[5][6][7]
Funkce
Protein kódovaný tímto genem je všudypřítomně exprimovaný jaderný protein. Nachází se mezi několika proteiny, které se vážou přímo na protein retinoblastomu, který reguluje proliferaci buněk. Tento protein se komplexuje s transkripčním korepresorem CTBP. Je také spojován s BRCA1 a předpokládá se, že moduluje funkce BRCA1 při regulaci transkripce, opravě DNA a / nebo kontrole kontrolního bodu buněčného cyklu. Předpokládá se, že tento gen může být sám o sobě nádorovým supresorem působícím stejnou cestou jako BRCA1. Pro tento gen byly nalezeny tři varianty transkriptu kódující dvě různé izoformy. Existuje více variant přepisu, ale jejich celovečerní povaha nebyla stanovena.[7]
Interakce
RBBP8 bylo prokázáno komunikovat s:
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000101773 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000041238 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b C d Fusco C, Reymond A, Zervos AS (říjen 1998). "Molekulární klonování a charakterizace nového proteinu vázajícího se na retinoblastom". Genomika. 51 (3): 351–8. doi:10.1006 / geno.1998.5368. PMID 9721205.
- ^ Sartori AA, Lukas C, Coates J, Mistrik M, Fu S, Bartek J, Baer R, Lukas J, Jackson SP (listopad 2007). „Lidský CtIP podporuje resekci konce DNA“. Příroda. 450 (7169): 509–14. doi:10.1038 / nature06337. PMC 2409435. PMID 17965729.
- ^ A b „Entrez Gene: RBBP8 retinoblastoma binding protein 8“.
- ^ A b Li S, Ting NS, Zheng L, Chen PL, Ziv Y, Shiloh Y, Lee EY, Lee WH (červenec 2000). "Funkční spojení BRCA1 a produktu genového ataxie telangiektázie v reakci na poškození DNA". Příroda. 406 (6792): 210–5. doi:10.1038/35018134. PMID 10910365. S2CID 3266654.
- ^ Kim ST, Lim DS, Canman CE, Kastan MB (prosinec 1999). "Specifičnost substrátu a identifikace domnělých substrátů členů rodiny ATM kináz". J. Biol. Chem. 274 (53): 37538–43. doi:10.1074 / jbc.274.53.37538. PMID 10608806.
- ^ A b Li S, Chen PL, Subramanian T, Chinnadurai G, Tomlinson G, Osborne CK, Sharp ZD, Lee WH (duben 1999). „Vazba CtIP na BRCT repetice BRCA1 zapojené do regulace transkripce p21 je narušena při poškození DNA“. J. Biol. Chem. 274 (16): 11334–8. doi:10.1074 / jbc.274.16.11334. PMID 10196224.
- ^ Rodriguez M, Yu X, Chen J, Songyang Z (prosinec 2003). "Fosfopeptidové vazebné specificity BRCA1 koncových domén COOH (BRCT)". J. Biol. Chem. 278 (52): 52914–8. doi:10,1074 / jbc.C300407200. PMID 14578343.
- ^ Wong AK, Ormonde PA, Pero R, Chen Y, Lian L, Salada G, Berry S, Lawrence Q, Dayananth P, Ha P, Tavtigian SV, Teng DH, Bartel PL (listopad 1998). "Charakterizace proteinu interagujícího s karboxy-terminálním BRCA1". Onkogen. 17 (18): 2279–85. doi:10.1038 / sj.onc.1202150. PMID 9811458.
- ^ Wu-Baer F, Baer R (listopad 2001). "Vliv poškození DNA na komplex BRCA1". Příroda. 414 (6859): 36. doi:10.1038/35102118. PMID 11689934. S2CID 4329675.
- ^ Yu X, Wu LC, Bowcock AM, Aronheim A, Baer R (září 1998). „C-koncové (BRCT) domény BRCA1 interagují in vivo s CtIP, proteinem zapojeným do CtBP dráhy transkripční represe“. J. Biol. Chem. 273 (39): 25388–92. doi:10.1074 / jbc.273.39.25388. PMID 9738006.
- ^ Yu X, Baer R (červen 2000). „Nukleární lokalizace a specifická exprese buněčného cyklu CtIP, proteinu, který se asociuje s nádorovým supresorem BRCA1“. J. Biol. Chem. 275 (24): 18541–9. doi:10,1074 / jbc.M909494199. PMID 10764811.
- ^ Schaeper U, Subramanian T, Lim L, Boyd JM, Chinnadurai G (duben 1998). „Interakce mezi buněčným proteinem, který se váže na C-koncovou oblast adenoviru E1A (CtBP) a novým buněčným proteinem, je narušena E1A prostřednictvím konzervovaného motivu PLDLS“. J. Biol. Chem. 273 (15): 8549–52. doi:10.1074 / jbc.273.15.8549. PMID 9535825.
- ^ Sum EY, Peng B, Yu X, Chen J, Byrne J, Lindeman GJ, Visvader JE (březen 2002). „Protein LMO4 domény LIM interaguje s kofaktorem CtIP a supresorem nádoru BRCA1 a inhibuje aktivitu BRCA1“. J. Biol. Chem. 277 (10): 7849–56. doi:10,1074 / jbc.M110603200. PMID 11751867.
- ^ Sutherland KD, Visvader JE, Choong DY, Sum EY, Lindeman GJ, Campbell IG (říjen 2003). „Mutační analýza genu LMO4 kódující protein interagující s BRCA1 v karcinomech prsu“. Int. J. Cancer. 107 (1): 155–8. doi:10.1002 / ijc.11343. PMID 12925972. S2CID 20908722.
- ^ Dick FA, Sailhamer E, Dyson NJ (květen 2000). „Mutageneze kapsy pRB ukazuje, že funkce zastavování buněčného cyklu jsou oddělitelné od vazby na virové onkoproteiny“. Mol. Buňka. Biol. 20 (10): 3715–27. doi:10.1128 / mcb.20.10.3715-3727.2000. PMC 85672. PMID 10779361.
- ^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- ^ Meloni AR, Smith EJ, Nevins JR (srpen 1999). „Mechanismus transkripce zprostředkované Rb / p130 zahrnující nábor CtBP corepressoru“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 96 (17): 9574–9. doi:10.1073 / pnas.96.17.9574. PMC 22250. PMID 10449734.
- ^ Germani A, Prabel A, Mourah S, poslanec Podgorniak, Di Carlo A, Ehrlich R, Gisselbrecht S, Varin-Blank N, Calvo F, Bruzzoni-Giovanelli H (prosinec 2003). „SIAH-1 interaguje s CtIP a podporuje jeho degradaci proteazomovou cestou“. Onkogen. 22 (55): 8845–51. doi:10.1038 / sj.onc.1206994. PMID 14654780.
Další čtení
- Deng CX, Brodie SG (2000). "Role BRCA1 a jeho interagujících proteinů". BioEssays. 22 (8): 728–37. doi:10.1002 / 1521-1878 (200008) 22: 8 <728 :: AID-BIES6> 3.0.CO; 2-B. PMID 10918303.
- Matoba R, Okubo K, Hori N, Fukushima A, Matsubara K (1994). "Přidání 5'-kódujících informací do 3'-směrované cDNA knihovny zlepšuje analýzu genové exprese." Gen. 146 (2): 199–207. doi:10.1016/0378-1119(94)90293-3. PMID 8076819.
- Schaeper U, Subramanian T, Lim L, Boyd JM, Chinnadurai G (1998). „Interakce mezi buněčným proteinem, který se váže na C-koncovou oblast adenoviru E1A (CtBP) a novým buněčným proteinem, je narušena E1A prostřednictvím konzervovaného motivu PLDLS“. J. Biol. Chem. 273 (15): 8549–52. doi:10.1074 / jbc.273.15.8549. PMID 9535825.
- Yu X, Wu LC, Bowcock AM, Aronheim A, Baer R (1998). „C-koncové (BRCT) domény BRCA1 interagují in vivo s CtIP, proteinem zapojeným do CtBP dráhy transkripční represe“. J. Biol. Chem. 273 (39): 25388–92. doi:10.1074 / jbc.273.39.25388. PMID 9738006.
- Wong AK, Ormonde PA, Pero R, Chen Y, Lian L, Salada G, Berry S, Lawrence Q, Dayananth P, Ha P, Tavtigian SV, Teng DH, Bartel PL (1998). "Charakterizace proteinu interagujícího s karboxy-terminálním BRCA1". Onkogen. 17 (18): 2279–85. doi:10.1038 / sj.onc.1202150. PMID 9811458.
- Li S, Chen PL, Subramanian T, Chinnadurai G, Tomlinson G, Osborne CK, Sharp ZD, Lee WH (1999). „Vazba CtIP na BRCT repetice BRCA1 zapojené do regulace transkripce p21 je narušena při poškození DNA“. J. Biol. Chem. 274 (16): 11334–8. doi:10.1074 / jbc.274.16.11334. PMID 10196224.
- Meloni AR, Smith EJ, Nevins JR (1999). „Mechanismus transkripce zprostředkované Rb / p130 zahrnující nábor CtBP corepressoru“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 96 (17): 9574–9. doi:10.1073 / pnas.96.17.9574. PMC 22250. PMID 10449734.
- Kim ST, Lim DS, Canman CE, Kastan MB (2000). "Specifičnost substrátu a identifikace domnělých substrátů členů rodiny ATM kináz". J. Biol. Chem. 274 (53): 37538–43. doi:10.1074 / jbc.274.53.37538. PMID 10608806.
- Yu X, Baer R (2000). „Nukleární lokalizace a specifická exprese buněčného cyklu CtIP, proteinu, který se asociuje s nádorovým supresorem BRCA1“. J. Biol. Chem. 275 (24): 18541–9. doi:10,1074 / jbc.M909494199. PMID 10764811.
- Dick FA, Sailhamer E, Dyson NJ (2000). „Mutageneze kapsy pRB odhaluje, že funkce zadržování buněčného cyklu jsou oddělitelné od vazby na virové onkoproteiny“. Mol. Buňka. Biol. 20 (10): 3715–27. doi:10.1128 / MCB.20.10.3715-3727.2000. PMC 85672. PMID 10779361.
- Fanciulli M, Bruno T, Di Padova M, De Angelis R, Iezzi S, Iacobini C, Floridi A, Passananti C (2000). "Identifikace nového partnera RNA polymerázy II podjednotky 11, Che-1, který interaguje s a ovlivňuje funkci potlačení růstu Rb". FASEB J.. 14 (7): 904–12. doi:10.1096 / fasebj.14.7.904. PMID 10783144. S2CID 43175069.
- Li S, Ting NS, Zheng L, Chen PL, Ziv Y, Shiloh Y, Lee EY, Lee WH (2000). "Funkční spojení BRCA1 a produktu genového ataxie telangiektázie v reakci na poškození DNA". Příroda. 406 (6792): 210–5. doi:10.1038/35018134. PMID 10910365. S2CID 3266654.
- Zheng L, Pan H, Li S, Flesken-Nikitin A, Chen PL, Boyer TG, Lee WH (2000). „Sekvenčně specifická funkce transkripčního corepresoru pro BRCA1 prostřednictvím nového proteinu se zinkovým prstem, ZBRK1“. Mol. Buňka. 6 (4): 757–68. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 00075-7. PMID 11090615.
- Izutsu K, Kurokawa M, Imai Y, Maki K, Mitani K, Hirai H (2001). „Corepressor CtBP interaguje s Evi-1, aby potlačil signalizaci beta transformujícího růstového faktoru“. Krev. 97 (9): 2815–22. doi:10,1182 / krev. V97.9.2815. PMID 11313276.
- Melhuish TA, Gallo CM, Wotton D (2001). „TGIF2 interaguje s histon-deacetylázou 1 a potlačuje transkripci“. J. Biol. Chem. 276 (34): 32109–14. doi:10,1074 / jbc.M103377200. PMID 11427533.
- Wu-Baer F, Baer R (2001). "Vliv poškození DNA na komplex BRCA1". Příroda. 414 (6859): 36. doi:10.1038/35102118. PMID 11689934. S2CID 4329675.
- Sum EY, Peng B, Yu X, Chen J, Byrne J, Lindeman GJ, Visvader JE (2002). „Protein LMO4 domény LIM interaguje s kofaktorem CtIP a tumor supresorem BRCA1 a inhibuje aktivitu BRCA1“. J. Biol. Chem. 277 (10): 7849–56. doi:10,1074 / jbc.M110603200. PMID 11751867.
- Koipally J, Georgopoulos K (2002). „Interakce Ikaros-CtIP nevyžadují C-terminální vazebný protein a účastní se represe nezávislé na deacetyláze“. J. Biol. Chem. 277 (26): 23143–9. doi:10,1074 / jbc.M202079200. PMID 11959865.