DMAP1 - DMAP1

DMAP1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3HM5, 4IEJ
Identifikátory
Aliasy	DMAP1, DNMAP1, DNMTAP1, EAF2, MEAF2, SWC4, protein spojený s DNA methyltransferázou 1
Externí ID	OMIM: 605077 MGI: 1913483 HomoloGene: 41311 Genové karty: DMAP1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	44,220,681 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	117,682,273 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba transkripčního faktoru potlačující RNA polymerázu II; • GO: Aktivita transkripčního corepresoru 0001106; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • Vazba DNA;
Buněčná složka	• replikační vidlice; • cytoplazma; • Komplex NuA4 histon-acetyltransferáza; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• remodelace chromatinu; • regulace transkripce, DNA-šablony; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA; • Methylace DNA; • regulace růstu; • reakce na ethanol; • Oprava DNA; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • acetylace histonu H4; • acetylace histonu H2A; • organizace chromatinu; • pozitivní regulace importu bílkovin do jádra;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	55929
	66233
	ENSG00000178028
	ENSMUSG00000009640
	Q9NPF5; Q5TG37
	Q9JI44
	NM_001034023; NM_001034024; NM_019100
	NM_023178
	NP_001029195; NP_001029196; NP_061973
	NP_075667
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein asociovaný s DNA methyltransferázou 1 je enzym že u lidí je kódován DMAP1 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Tento gen kóduje podjednotku několika odlišných komplexů podílejících se na represi nebo aktivaci transkripce. Kódovaný protein může nezávisle potlačovat transkripci a je zaměřen na replikační ohniska v celé S fázi interakcí přímo s N-koncem DNA methyltransferázy 1. Během pozdní S fáze je do tohoto komplexu přidána histon-deacetyláza 2, což poskytuje prostředky k deacetylaci histonů transkripčně neaktivní heterochromatin po replikaci. Kódovaný protein je také součástí nukleosomové acetyltransferázy komplexu H4 a interaguje mimo jiné s genem 101 transkripční citlivosti na tumorpresor a s proteinem 6 spojeným s proapoptotickou smrtí. Alternativně byly popsány sestřihové varianty transkriptu kódující stejný protein.^[7]

Interakce

DMAP1 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000178028 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000009640 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Rountree MR, Bachman KE, Baylin SB (srpen 2000). „DNMT1 váže HDAC2 a nový společně represor, DMAP1, za vzniku komplexu v ohniscích replikace“. Nat Genet. 25 (3): 269–77. doi:10.1038/77023. PMID 10888872.
^ Nagase T, Kikuno R, Ishikawa KI, Hirosawa M, Ohara O (duben 2000). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XVI. Kompletní sekvence 150 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 7 (1): 65–73. doi:10.1093 / dnares / 7.1.65. PMID 10718198.
^ ^A ^b „Entrez Gene: DMAP1 DNA methyltransferase 1 associated protein 1“.
^ Delgermaa L, Hayashi N, Dorjsuren D, Nomura T, Thuy le TT, Murakami S (říjen 2004). „Subcelulární lokalizace proteinu zprostředkujícího RPB5 a jeho domnělého funkčního partnera“. Mol. Buňka. Biol. 24 (19): 8556–66. doi:10.1128 / MCB.24.19.8556-8566.2004. PMC 516735. PMID 15367675.
^ Rountree MR, Bachman KE, Baylin SB (červenec 2000). „DNMT1 váže HDAC2 a nový společně represor, DMAP1, za vzniku komplexu v ohniscích replikace“. Nat. Genet. 25 (3): 269–77. doi:10.1038/77023. PMID 10888872.
^ Xin H, Yoon HG, Singh PB, Wong J, Qin J (březen 2004). "Složky dráhy udržující modifikaci histonu a vazbu heterochromatinového proteinu 1 na pericentrický heterochromatin v buňkách savců". J. Biol. Chem. 279 (10): 9539–46. doi:10,1074 / jbc.M311587200. PMID 14665632.
^ Liu Z, Fisher RA (duben 2004). „RGS6 interaguje s DMAP1 a DNMT1 a inhibuje aktivitu transkripčního represoru DMAP1“. J. Biol. Chem. 279 (14): 14120–8. doi:10,1074 / jbc.M309547200. PMID 14734556.

Další čtení

Doyon Y, Côté J (2004). "Vysoce konzervativní a multifunkční komplex NuA4 HAT". Curr. Opin. Genet. Dev. 14 (2): 147–54. doi:10.1016 / j.gde.2004.02.009. PMID 15196461.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Yang CS, Weiner H (2002). „Kvasinkový dvouhybridní screening identifikuje vazebné partnery lidského Tom34, které mají aktivitu ATPázy a tvoří komplex s Tom34 v cytosolu“. Oblouk. Biochem. Biophys. 400 (1): 105–10. doi:10.1006 / abbi.2002.2778. PMID 11913976.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Cai Y, Jin J, Tomomori-Sato C a kol. (2003). "Identifikace nových podjednotek multproteinového savčího komplexu histon-acetyltransferázy obsahujícího TRRAP / TIP60". J. Biol. Chem. 278 (44): 42733–6. doi:10,1074 / jbc.C300389200. PMID 12963728.
Xin H, Yoon HG, Singh PB a kol. (2004). "Složky dráhy udržující modifikaci histonu a vazbu heterochromatinového proteinu 1 na pericentrický heterochromatin v buňkách savců". J. Biol. Chem. 279 (10): 9539–46. doi:10,1074 / jbc.M311587200. PMID 14665632.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Liu Z, Fisher RA (2004). „RGS6 interaguje s DMAP1 a DNMT1 a inhibuje aktivitu transkripčního represoru DMAP1“. J. Biol. Chem. 279 (14): 14120–8. doi:10,1074 / jbc.M309547200. PMID 14734556.
Doyon Y, Selleck W, Lane WS a kol. (2004). "Strukturální a funkční zachování komplexu histon acetyltransferázy NuA4 z kvasinek na člověka". Mol. Buňka. Biol. 24 (5): 1884–96. doi:10.1128 / MCB.24.5.1884-1896.2004. PMC 350560. PMID 14966270.
Muromoto R, Sugiyama K, Takachi A a kol. (2004). „Fyzické a funkční interakce mezi Daxx a proteinem spojeným s DNA methyltransferázou 1, DMAP1“. J. Immunol. 172 (5): 2985–93. doi:10,4049 / jimmunol.172.5.2985. PMID 14978102.
Muromoto R, Sugiyama K, Yamamoto T a kol. (2004). "Fyzické a funkční interakce mezi Daxx a TSG101". Biochem. Biophys. Res. Commun. 316 (3): 827–33. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.02.126. hdl:2115/28120. PMID 15033475.
Ballif BA, Villén J, Beausoleil SA a kol. (2005). „Fosfoproteomická analýza vyvíjejícího se myšího mozku“. Mol. Buňka. Proteomika. 3 (11): 1093–101. doi:10,1074 / mcp.M400085-MCP200. PMID 15345747.
Delgermaa L, Hayashi N, Dorjsuren D a kol. (2004). „Subcelulární lokalizace proteinu zprostředkujícího RPB5 a jeho domnělého funkčního partnera“. Mol. Buňka. Biol. 24 (19): 8556–66. doi:10.1128 / MCB.24.19.8556-8566.2004. PMC 516735. PMID 15367675.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Cai Y, Jin J, Florens L a kol. (2005). „Savčí protein YL1 je společnou podjednotkou komplexů histon-acetyltransferázy a SRCAP TRRAP / TIP60“. J. Biol. Chem. 280 (14): 13665–70. doi:10,1074 / jbc.M500001200. PMID 15647280.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000178028 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000009640 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10888872-5] Rountree MR, Bachman KE, Baylin SB (srpen 2000). „DNMT1 váže HDAC2 a nový společně represor, DMAP1, za vzniku komplexu v ohniscích replikace“. Nat Genet. 25 (3): 269–77. doi:10.1038/77023. PMID 10888872.

[pmid10718198-6] Nagase T, Kikuno R, Ishikawa KI, Hirosawa M, Ohara O (duben 2000). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XVI. Kompletní sekvence 150 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 7 (1): 65–73. doi:10.1093 / dnares / 7.1.65. PMID 10718198.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: DMAP1 DNA methyltransferase 1 associated protein 1“.

[pmid15367675-8] Delgermaa L, Hayashi N, Dorjsuren D, Nomura T, Thuy le TT, Murakami S (říjen 2004). „Subcelulární lokalizace proteinu zprostředkujícího RPB5 a jeho domnělého funkčního partnera“. Mol. Buňka. Biol. 24 (19): 8556–66. doi:10.1128 / MCB.24.19.8556-8566.2004. PMC 516735. PMID 15367675.

[autogenerated1-9] Rountree MR, Bachman KE, Baylin SB (červenec 2000). „DNMT1 váže HDAC2 a nový společně represor, DMAP1, za vzniku komplexu v ohniscích replikace“. Nat. Genet. 25 (3): 269–77. doi:10.1038/77023. PMID 10888872.

[pmid14665632-10] Xin H, Yoon HG, Singh PB, Wong J, Qin J (březen 2004). "Složky dráhy udržující modifikaci histonu a vazbu heterochromatinového proteinu 1 na pericentrický heterochromatin v buňkách savců". J. Biol. Chem. 279 (10): 9539–46. doi:10,1074 / jbc.M311587200. PMID 14665632.

[pmid14734556-11] Liu Z, Fisher RA (duben 2004). „RGS6 interaguje s DMAP1 a DNMT1 a inhibuje aktivitu transkripčního represoru DMAP1“. J. Biol. Chem. 279 (14): 14120–8. doi:10,1074 / jbc.M309547200. PMID 14734556.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]