TCEA1 - TCEA1 - Wikipedia

TCEA1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1TFI, 3NDQ, 5IY7, 5IYA, 5IY6, 5IYB, 5IY8, 5IYC
Identifikátory
Aliasy	TCEA1, GTF2S, SII, TCEA, TF2S, TFIIS, faktor prodloužení transkripce A1
Externí ID	OMIM: 601425 MGI: 1196624 HomoloGene: 55984 Genové karty: TCEA1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 8 (lidský)
Konec	54,022,456 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	4,897,909 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • vazba iontů zinku; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů; • vazba nukleové kyseliny;
Buněčná složka	• jádro; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • transkripční faktor TFIID komplex;
Biologický proces	• prodloužení transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • oprava nukleotidů excizí spojená s transkripcí; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace aktivity exoribonukleázy; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6917
	21399
	ENSG00000187735
	ENSMUSG00000033813
	P23193
	P10711
	NM_006756; NM_201437
	NM_001159750; NM_001159751; NM_011541
	NP_006747; NP_958845
	NP_001153222; NP_001153223; NP_035671
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein pro prodloužení transkripce A protein 1 je protein že u lidí je kódován TCEA1 gen.^[5]^[6]^[7]

V jiných organismech je tento gen známější jako transkripční elongační faktor II S (TFIIS). Pomáhá hlavně řešit zpětně tažené elongační komplexy indukcí řezu v aktivním místě RNAP, takže reakce je opět možná. Vyskytuje se také v eukaryotice transkripční preiniciační komplex.^[8] Homolog v archaea plní stejný hlavní úkol, zatímco bakterie používají nehomologní Gre.^[9]

Interakce

Bylo prokázáno, že TCEA1 komunikovat s GTF2H1^[10]^[11] a POLR2A.^[10]^[11]^[12]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000187735 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033813 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ DiMarco SP, Glover TW, Miller DE, Reines D, Warren ST (srpen 1996). "Transkripční elongační faktor SII (TCEA) se mapuje na lidský chromozom 3p22 -> p21.3". Genomika. 36 (1): 185–8. doi:10.1006 / geno.1996.0443. PMID 8812434.
^ Park H, Baek K, Jeon C, Agarwal K, Yoo O (únor 1994). "Charakterizace genu kódujícího lidský transkripční elongační faktor TFIIS". Gen. 139 (2): 263–7. doi:10.1016/0378-1119(94)90767-6. PMID 8112616.
^ „Entrez Gene: TCEA1 transkripční elongační faktor A (SII), 1“.
^ Kim B, Nesvizhskii AI, Rani PG, Hahn S, Aebersold R, Ranish JA (říjen 2007). „Faktor transkripce elongace TFIIS je složkou preiniciačních komplexů RNA polymerázy II“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 104 (41): 16068–73. doi:10.1073 / pnas.0704573104. PMC 2042163. PMID 17913884.
^ Robinson, Nicholas P .; Fouqueau, Thomas; Blombach, Fabian; Cackett, Gwenny; Carty, Alice E .; Matelska, Dorota M .; Ofer, Sapir; Pilotto, Simona; Phung, Duy Khanh; Werner, Fin (14. prosince 2018). „Špička archaeal transkripce“. Nová témata v biologických vědách. 2 (4): 517–533. doi:10.1042 / ETLS20180014.
^ ^A ^b Archambault J, Pan G, Dahmus GK, Cartier M, Marshall N, Zhang S a kol. (Říjen 1998). „FCP1, podjednotka interagující s RAP74 lidské proteinové fosfatázy, která defosforyluje karboxylterminální doménu RNA polymerázy IIO“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (42): 27593–601. doi:10.1074 / jbc.273.42.27593. PMID 9765293.
^ ^A ^b Pan G, Aso T, Greenblatt J (září 1997). „Interakce elongačních faktorů TFIIS a elonginu A s holoenzymem lidské RNA polymerázy II schopným iniciace specifické pro promotor a reagující na transkripční aktivátory“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (39): 24563–71. doi:10.1074 / jbc.272.39.24563. PMID 9305922.
^ Kettenberger H, Armache KJ, Cramer P (srpen 2003). „Architektura komplexu RNA polymeráza II-TFIIS a důsledky pro štěpení mRNA“. Buňka. 114 (3): 347–57. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00598-1. hdl:11858 / 00-001M-0000-0015-8647-8. PMID 12914699. S2CID 17184533.

Další čtení

Chen HC, England L, Kane CM (červenec 1992). "Charakterizace klonu HeLa cDNA kódujícího lidský protein SII, elongační faktor pro RNA polymerázu II". Gen. 116 (2): 253–8. doi:10.1016 / 0378-1119 (92) 90522-Q. PMID 1378807.
Kato H, Sumimoto H, Pognonec P, Chen CH, Rosen CA, Roeder RG (duben 1992). „HIV-1 Tat působí in vitro ve spojení s faktory prodlužování buněk jako faktor procesivity“. Geny a vývoj. 6 (4): 655–66. doi:10,1101 / gad. 6.4.455. PMID 1559613.
Yoo OJ, Yoon HS, Baek KH, Jeon CJ, Miyamoto K, Ueno A, Agarwal K (březen 1991). „Klonování, exprese a charakterizace faktoru prodloužení transkripce člověka, TFIIS“. Výzkum nukleových kyselin. 19 (5): 1073–9. doi:10.1093 / nar / 19.5.1073. PMC 333783. PMID 1708494.
Reines D, Chamberlin MJ, Kane CM (červen 1989). „Faktor transkripce elongace SII (TFIIS) umožňuje RNA polymeráze II protáhnout se blokem k transkripci v lidském genu in vitro“. The Journal of Biological Chemistry. 264 (18): 10799–809. PMID 2471707.
Qian X, Jeon C, Yoon H, Agarwal K, Weiss MA (září 1993). "Struktura nového motivu vázajícího nukleové kyseliny v eukaryotickém transkripčním elongačním faktoru TFIIS". Příroda. 365 (6443): 277–9. doi:10.1038 / 365277a0. PMID 7626141. S2CID 4367997.
Yeh CH, Shatkin AJ (červen 1994). „He21 buňka kódovaná p21 je homologní s transkripčním elongačním faktorem SII“. Gen. 143 (2): 285–7. doi:10.1016/0378-1119(94)90112-0. PMID 8206389.
Umehara T, Kida S, Yamamoto T, Horikoshi M (prosinec 1995). "Izolace a charakterizace cDNA kódující nový typ lidského transkripčního elongačního faktoru S-II". Gen. 167 (1–2): 297–302. doi:10.1016/0378-1119(95)00634-6. PMID 8566795.
Powell W, Bartholomew B, Reines D (září 1996). „Elongační faktor SII kontaktuje 3'-konec RNA v elongačním komplexu RNA polymerázy II“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (37): 22301–4. doi:10.1074 / jbc.271.37.22301. PMC 3371613. PMID 8798387.
Pan G, Aso T, Greenblatt J (září 1997). „Interakce elongačních faktorů TFIIS a elonginu A s holoenzymem lidské RNA polymerázy II schopným iniciace specifické pro promotor a reagující na transkripční aktivátory“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (39): 24563–71. doi:10.1074 / jbc.272.39.24563. PMID 9305922.
Li XY, Green MR (říjen 1998). „Buněčný koaktivátor Tat-SF1 HIV-1 Tat je obecným faktorem prodloužení transkripce“. Geny a vývoj. 12 (19): 2992–6. doi:10.1101 / gad.12.19.2992. PMC 317190. PMID 9765201.
Archambault J, Pan G, Dahmus GK, Cartier M, Marshall N, Zhang S a kol. (Říjen 1998). „FCP1, podjednotka interagující s RAP74 lidské proteinové fosfatázy, která defosforyluje karboxylterminální doménu RNA polymerázy IIO“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (42): 27593–601. doi:10.1074 / jbc.273.42.27593. PMID 9765293.
Suzuki H, Fukunishi Y, Kagawa I, Saito R, Oda H, Endo T a kol. (Říjen 2001). „Panel interakce protein-protein využívající myší plné délky cDNA“. Výzkum genomu. 11 (10): 1758–65. doi:10,1101 / gr. 180101. PMC 311163. PMID 11591653.
Saso K, Ito T, Natori S, Sekimizu K (duben 2003). „Identifikace nového tkáňově specifického transkripčního aktivátoru FESTA jako proteinu, který interaguje s transkripčním elongačním faktorem S-II“. Journal of Biochemistry. 133 (4): 493–500. doi:10.1093 / jb / mvg065. PMID 12761297.
Imabayashi H, Mori T, Gojo S, Kiyono T, Sugiyama T, Irie R a kol. (Srpen 2003). „Rediferenciace dediferencovaných chondrocytů a chondrogeneze lidských stromálních buněk kostní dřeně prostřednictvím tvorby chondrosféry s profilováním exprese analýzou cDNA ve velkém měřítku“. Experimentální výzkum buněk. 288 (1): 35–50. doi:10.1016 / S0014-4827 (03) 00130-7. PMID 12878157.
Kettenberger H, Armache KJ, Cramer P (srpen 2003). „Architektura komplexu RNA polymeráza II-TFIIS a důsledky pro štěpení mRNA“. Buňka. 114 (3): 347–57. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00598-1. hdl:11858 / 00-001M-0000-0015-8647-8. PMID 12914699. S2CID 17184533.
Tamura K, Miyata K, Sugahara K, Onishi S, Shuin T, Aso T (září 2003). „Identifikace EloA-BP1, nového proteinu vázajícího elongin A s doménou homologie exonukleázy“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 309 (1): 189–95. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 01556-0. PMID 12943681.
Zhang C, Yan H, Burton ZF (prosinec 2003). „Kombinatorická kontrola pozastavení lidské RNA polymerázy II (RNAP II) a štěpení transkripce transkripčním faktorem IIF, antigenem hepatitidy delta a stimulačním faktorem II“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (50): 50101–11. doi:10,1074 / jbc.M307590200. PMID 14506279.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000187735 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033813 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8812434-5] DiMarco SP, Glover TW, Miller DE, Reines D, Warren ST (srpen 1996). "Transkripční elongační faktor SII (TCEA) se mapuje na lidský chromozom 3p22 -> p21.3". Genomika. 36 (1): 185–8. doi:10.1006 / geno.1996.0443. PMID 8812434.

[pmid8112616-6] Park H, Baek K, Jeon C, Agarwal K, Yoo O (únor 1994). "Charakterizace genu kódujícího lidský transkripční elongační faktor TFIIS". Gen. 139 (2): 263–7. doi:10.1016/0378-1119(94)90767-6. PMID 8112616.

[entrez-7] „Entrez Gene: TCEA1 transkripční elongační faktor A (SII), 1“.

[8] Kim B, Nesvizhskii AI, Rani PG, Hahn S, Aebersold R, Ranish JA (říjen 2007). „Faktor transkripce elongace TFIIS je složkou preiniciačních komplexů RNA polymerázy II“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 104 (41): 16068–73. doi:10.1073 / pnas.0704573104. PMC 2042163. PMID 17913884.

[edge-9] Robinson, Nicholas P .; Fouqueau, Thomas; Blombach, Fabian; Cackett, Gwenny; Carty, Alice E .; Matelska, Dorota M .; Ofer, Sapir; Pilotto, Simona; Phung, Duy Khanh; Werner, Fin (14. prosince 2018). „Špička archaeal transkripce“. Nová témata v biologických vědách. 2 (4): 517–533. doi:10.1042 / ETLS20180014.

[pmid9765293-10] A ^b Archambault J, Pan G, Dahmus GK, Cartier M, Marshall N, Zhang S a kol. (Říjen 1998). „FCP1, podjednotka interagující s RAP74 lidské proteinové fosfatázy, která defosforyluje karboxylterminální doménu RNA polymerázy IIO“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (42): 27593–601. doi:10.1074 / jbc.273.42.27593. PMID 9765293.

[pmid9305922-11] A ^b Pan G, Aso T, Greenblatt J (září 1997). „Interakce elongačních faktorů TFIIS a elonginu A s holoenzymem lidské RNA polymerázy II schopným iniciace specifické pro promotor a reagující na transkripční aktivátory“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (39): 24563–71. doi:10.1074 / jbc.272.39.24563. PMID 9305922.

[pmid12914699-12] Kettenberger H, Armache KJ, Cramer P (srpen 2003). „Architektura komplexu RNA polymeráza II-TFIIS a důsledky pro štěpení mRNA“. Buňka. 114 (3): 347–57. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00598-1. hdl:11858 / 00-001M-0000-0015-8647-8. PMID 12914699. S2CID 17184533.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]