TOX - TOX - Wikipedia

TOX
Identifikátory
Aliasy	TOX, TOX1, skupina s vysokou mobilitou spojená s výběrem thymocytů
Externí ID	OMIM: 606863 MGI: 2181659 HomoloGene: 8822 Genové karty: TOX
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 8 (lidský)
Konec	59,119,147 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	6,991,557 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• buněčné jádro;
Biologický proces	• diferenciace lymfocytů; • pozitivní regulace diferenciace přirozených zabijáckých buněk; • vývoj lymfatických uzlin; • Peyerův vývoj patchů; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9760
	252838
	ENSG00000198846
	ENSMUSG00000041272
	O94900
	Q66JW3
	NM_014729
	NM_145711; NM_001377078; NM_001377079
	NP_055544
	NP_663757; NP_001364007; NP_001364008
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Skupinová bílkovina s vysokou mobilitou spojená s výběrem thymocytů TOX je protein že u lidí je kódován TOX gen.^[5]^[6]^[7]

Struktura a funkce

Gen TOX kóduje a protein která patří do velké nadrodiny chromatin asociované proteiny, které sdílejí přibližně 75 aminokyselin DNA vazebný motiv, HMG (skupina s vysokou mobilitou) -box (pojmenovaný podle toho, který byl nalezen u kanonického člena rodiny, protein skupiny s vysokou mobilitou 1). Nějaký skupina s vysokou mobilitou (HMG) box proteiny (např. LEF1 ) obsahují jeden motiv HMG boxu a váží DNA sekvenčně specifickým způsobem, zatímco ostatní členové této rodiny (např. HMGB1 ) mají více boxů HMG a váží DNA sekvenčně nezávislým, ale strukturně závislým způsobem. Zatímco TOX má jediný motiv boxu HMG,^[7] předpokládá se, že se bude vázat na DNA způsobem nezávislým na sekvenci.^[8] TOX je také členem malé podskupiny proteinů (TOX2, TOX3, a TOX4 ), které sdílejí téměř identické sekvence HMG-boxu.^[8] TOX3 byl identifikován jako lokus citlivosti na rakovinu prsu.^[9]^[10] TOX je vysoce vyjádřen v brzlík, místo vývoje T lymfocyty. Vyřazené myši kteří nemají TOX, mají závažnou poruchu ve vývoji určitých podskupin T lymfocytů.^[11]

Role v nemocech

U rakoviny nebo během chronické virové infekce je TOX nezbytný pro perzistenci T buněk, ale také vede k „vyčerpání“ T buněk, což přispívá ke snížení protinádorové nebo antivirové funkce v těchto buňkách^[12]^[13]^[14].

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000198846 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000041272 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (duben 1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XI. Kompletní sekvence 100 nových klonů cDNA z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 5 (5): 277–86. doi:10.1093 / dnares / 5.5.277. PMID 9872452.
^ Wilkinson B, Chen JY, Han P, Rufner KM, Goularte OD, Kaye J (březen 2002). „TOX: boxový protein HMG podílející se na regulaci výběru thymocytů“. Nat Immunol. 3 (3): 272–80. doi:10.1038 / ni767. PMID 11850626. S2CID 19716719.
^ ^A ^b „Entrez Gene: thymocyte selection-associated high mobility group box gen gen TOX“.
^ ^A ^b O'Flaherty E, Kaye J (duben 2003). „TOX definuje konzervovanou podrodinu proteinů HMG-boxu“. BMC Genomics. 4 (1): 13. doi:10.1186/1471-2164-4-13. PMC 155677. PMID 12697058.
^ Easton DF, Pooley KA, Dunning AM a kol. (Červen 2007). „Studie asociace v rámci celého genomu identifikuje nové lokusy náchylnosti k rakovině prsu“. Příroda. 447 (7148): 1087–93. Bibcode:2007 Natur.447.1087E. doi:10.1038 / nature05887. PMC 2714974. PMID 17529967.
^ Stacey SN, Manolescu A, Sulem P a kol. (Červenec 2007). „Běžné varianty chromozomů 2q35 a 16q12 propůjčují náchylnost k rakovině prsu s pozitivním účinkem na estrogenové receptory“. Nat. Genet. 39 (7): 865–9. doi:10.1038 / ng2064. PMID 17529974. S2CID 7346190.
^ Aliahmad, Parinaz; Kaye, Jonathan (2008-01-21). „Vývoj všech linií CD4 T vyžaduje jaderný faktor TOX“. The Journal of Experimental Medicine. 205 (1): 245–256. doi:10.1084 / jem.20071944. ISSN 1540-9538. PMC 2234360. PMID 18195075.
^ Alfei, Francesca; Kanev, Kristiyan; Hofmann, Maike; Wu, Ming; Ghoneim, Hazem E .; Roelli, Patrick; Utzschneider, Daniel T .; von Hoesslin, Madlaina; Cullen, Jolie G. (2019). „TOX posiluje fenotyp a dlouhověkost vyčerpaných T buněk při chronické virové infekci“. Příroda. 571 (7764): 265–269. doi:10.1038 / s41586-019-1326-9. ISSN 1476-4687. PMID 31207605. S2CID 190528786.
^ Khan, Omar; Giles, Josephine R .; McDonald, Sierra; Manne, Sasikanth; Ngiow, Shin Foong; Patel, Kunal P .; Werner, Michael T .; Huang, Alexander C .; Alexander, Katherine A. (2019). „TOX transkripčně a epigeneticky programuje vyčerpání T buněk CD8 +“. Příroda. 571 (7764): 211–218. doi:10.1038 / s41586-019-1325-x. ISSN 1476-4687. PMC 6713202. PMID 31207603.
^ Scott, Andrew C .; Dündar, Friederike; Zumbo, Paul; Chandran, Smita S .; Klebanoff, Christopher A .; Shakiba, Mojdeh; Trivedi, Prerak; Menocal, Laura; Appleby, Heather (2019). „TOX je kritickým regulátorem diferenciace T buněk specifických pro nádor“. Příroda. 571 (7764): 270–274. doi:10.1038 / s41586-019-1324-r. ISSN 1476-4687. PMID 31207604. S2CID 190538130.

Další čtení

Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H a kol. (2003). „Konstrukce klonů cDNA připravených na expresi pro geny KIAA: ruční kurace 330 klonů cDNA KIAA“. DNA Res. 9 (3): 99–106. doi:10.1093 / dnares / 9.3.99. PMID 12168954.
Sebastiani P, Wang L, Nolan VG a kol. (2008). "Fetální hemoglobin u srpkovité anémie: Bayesovské modelování genetických asociací". Dopoledne. J. Hematol. 83 (3): 189–95. doi:10.1002 / ajh.21048. PMID 17918249. S2CID 24667609.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Aliahmad P, O'Flaherty E, Han P a kol. (2004). „TOX poskytuje spojení mezi aktivací kalcineurinu a závazkem linie CD8“. J. Exp. Med. 199 (8): 1089–99. doi:10.1084 / jem.20040051. PMC 2211890. PMID 15078895.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.

Tento článek o gen na lidský chromozom 8 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000198846 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000041272 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9872452-5] Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (duben 1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XI. Kompletní sekvence 100 nových klonů cDNA z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 5 (5): 277–86. doi:10.1093 / dnares / 5.5.277. PMID 9872452.

[pmid11850626-6] Wilkinson B, Chen JY, Han P, Rufner KM, Goularte OD, Kaye J (březen 2002). „TOX: boxový protein HMG podílející se na regulaci výběru thymocytů“. Nat Immunol. 3 (3): 272–80. doi:10.1038 / ni767. PMID 11850626. S2CID 19716719.

[entrez_9760-7] A ^b „Entrez Gene: thymocyte selection-associated high mobility group box gen gen TOX“.

[OFla-8] A ^b O'Flaherty E, Kaye J (duben 2003). „TOX definuje konzervovanou podrodinu proteinů HMG-boxu“. BMC Genomics. 4 (1): 13. doi:10.1186/1471-2164-4-13. PMC 155677. PMID 12697058.

[9] Easton DF, Pooley KA, Dunning AM a kol. (Červen 2007). „Studie asociace v rámci celého genomu identifikuje nové lokusy náchylnosti k rakovině prsu“. Příroda. 447 (7148): 1087–93. Bibcode:2007 Natur.447.1087E. doi:10.1038 / nature05887. PMC 2714974. PMID 17529967.

[10] Stacey SN, Manolescu A, Sulem P a kol. (Červenec 2007). „Běžné varianty chromozomů 2q35 a 16q12 propůjčují náchylnost k rakovině prsu s pozitivním účinkem na estrogenové receptory“. Nat. Genet. 39 (7): 865–9. doi:10.1038 / ng2064. PMID 17529974. S2CID 7346190.

[11] Aliahmad, Parinaz; Kaye, Jonathan (2008-01-21). „Vývoj všech linií CD4 T vyžaduje jaderný faktor TOX“. The Journal of Experimental Medicine. 205 (1): 245–256. doi:10.1084 / jem.20071944. ISSN 1540-9538. PMC 2234360. PMID 18195075.

[12] Alfei, Francesca; Kanev, Kristiyan; Hofmann, Maike; Wu, Ming; Ghoneim, Hazem E .; Roelli, Patrick; Utzschneider, Daniel T .; von Hoesslin, Madlaina; Cullen, Jolie G. (2019). „TOX posiluje fenotyp a dlouhověkost vyčerpaných T buněk při chronické virové infekci“. Příroda. 571 (7764): 265–269. doi:10.1038 / s41586-019-1326-9. ISSN 1476-4687. PMID 31207605. S2CID 190528786.

[13] Khan, Omar; Giles, Josephine R .; McDonald, Sierra; Manne, Sasikanth; Ngiow, Shin Foong; Patel, Kunal P .; Werner, Michael T .; Huang, Alexander C .; Alexander, Katherine A. (2019). „TOX transkripčně a epigeneticky programuje vyčerpání T buněk CD8 +“. Příroda. 571 (7764): 211–218. doi:10.1038 / s41586-019-1325-x. ISSN 1476-4687. PMC 6713202. PMID 31207603.

[14] Scott, Andrew C .; Dündar, Friederike; Zumbo, Paul; Chandran, Smita S .; Klebanoff, Christopher A .; Shakiba, Mojdeh; Trivedi, Prerak; Menocal, Laura; Appleby, Heather (2019). „TOX je kritickým regulátorem diferenciace T buněk specifických pro nádor“. Příroda. 571 (7764): 270–274. doi:10.1038 / s41586-019-1324-r. ISSN 1476-4687. PMID 31207604. S2CID 190538130.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]