Sterol regulační prvek vázající protein 2 - Sterol regulatory element-binding protein 2

SREBF2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1 UKL
Identifikátory
Aliasy	SREBF2, SREBP-2, SREBP2, bHLHd2, sterolový regulační prvek vázající transkripční faktor 2
Externí ID	OMIM: 600481 MGI: 107585 HomoloGene: 20966 Genové karty: SREBF2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 22 (lidský)
Konec	41,907,307 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	82,205,379 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Aktivita sterolizomerázy C-8; • Vazba DNA; • aktivita dimerizace bílkovin; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 Aktivita transkripčního represoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • Vazba e-boxu; • vazba na C-konec proteinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• cytoplazma; • integrální součást membrány; • cytosol; • Komplex SREBP-SCAP-Insig; • Golgiho aparát; • membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • Golgiho membrána; • endoplazmatické retikulum; • ER na Golgiho transportní membránu vezikul; • cytoplazmatický váček; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • mitochondrie; • intracelulární membránou vázaná organela;
Biologický proces	• metabolický proces steroidů; • regulace transkripce, DNA-šablony; • pozitivní regulace cílení proteinů na mitochondrie; • metabolismus lipidů; • pozitivní regulace ukládání cholesterolu; • buněčná odpověď na smykové napětí laminární tekutiny; • buněčná odpověď na hladovění; • metabolický proces cholesterolu; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA; • regulace autofagie mitochondrií; • negativní regulace odtoku cholesterolu; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace procesu biosyntézy cholesterolu; • buněčná odpověď na stimul lipoproteinových částic s nízkou hustotou;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6721
	20788
	ENSG00000198911
	ENSMUSG00000022463
	Q12772
	Q3U1N2
	NM_004599
	NM_033218
	NP_004590
	NP_150087
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Sterol regulační prvek vázající protein 2 (SREBP-2) také známý jako sterolový regulační prvek vázající transkripční faktor 2 (SREBF2) je a protein že u lidí je kódován SREBF2 gen.^[5]

Funkce

Tento gen kóduje všudypřítomně exprimovaný transkripční faktor který řídí homeostázu cholesterolu stimulací transkripce genů regulovaných sterolem. Kódovaný protein obsahuje základní leucinový zip helix-loop-helix (bHLH-zip ) doména.^[6]Byly identifikovány různé jednonukleotidové polymorfismy (SNP) SREBF2 a u některých z nich je spojeno s vyšším rizikem kolena artróza. ^[7]

Interakce

SREBF2 bylo prokázáno komunikovat s INSIG1^[8]^[9] a CREB-vazebný protein.^[10]

Viz také

Sterol regulační prvek vázající protein

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000198911 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022463 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Hua X, Yokoyama C, Wu J, Briggs MR, Brown MS, Goldstein JL, Wang X (prosinec 1993). „SREBP-2, druhý protein zipu basic-helix-loop-helix-leucin, který stimuluje transkripci vazbou na regulační prvek sterolu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 90 (24): 11603–7. Bibcode:1993PNAS ... 9011603H. doi:10.1073 / pnas.90.24.11603. PMC 48032. PMID 7903453.
^ „Entrez Gene: SREBF2 sterol regulační prvek vázající transkripční faktor 2“.
^ Qiu XM, Jin CT, Wang W (duben 2014). „Souvislost mezi polymorfizmy jednoho nukleotidu u sterolového regulačního prvku vázajícího gen pro protein 2 a rizikem osteoartrózy kolene v čínské populaci Han“. The Journal of International Medical Research. 42 (2): 320–8. doi:10.1177/0300060513507392. PMID 24496149.
^ Dobrosotskaya IY, Goldstein JL, Brown MS, Rawson RB (září 2003). "Rekonstituce sterolem regulovaného endoplazmatického transportu SREBP-2 na Golgi v buňkách hmyzu společnou expresí savčích SCAP a Insigs". The Journal of Biological Chemistry. 278 (37): 35837–43. doi:10,1074 / jbc.M306476200. PMID 12842885.
^ Yang T, Espenshade PJ, Wright ME, Yabe D, Gong Y, Aebersold R, Goldstein JL, Brown MS (srpen 2002). „Zásadní krok v homeostáze cholesterolu: steroly podporují vazbu SCAP na INSIG-1, membránový protein, který usnadňuje retenci SREBP v ER“. Buňka. 110 (4): 489–500. doi:10.1016 / S0092-8674 (02) 00872-3. PMID 12202038. S2CID 15052132.
^ Oliner JD, Andresen JM, Hansen SK, Zhou S, Tjian R (listopad 1996). „Transkripční aktivita SREBP je zprostředkována interakcí s proteinem vázajícím CREB“. Geny a vývoj. 10 (22): 2903–11. doi:10.1101 / gad.10.22.2903. PMID 8918891.

Další čtení

Osborne TF (srpen 2001). „VYTVOŘENÍ jater bez SCAP udržuje SREBP v membráně ER a zabraňuje zvýšené syntéze lipidů v reakci na nízký cholesterol a vysoký inzulín“. Geny a vývoj. 15 (15): 1873–8. doi:10,1101 / gad. 916601. PMID 11485982.
Szolkiewicz M, Chmielewski M, Nogalska A, Stelmanska E, Swierczynski J, Rutkowski B (leden 2007). „Potenciální role transkripčních faktorů proteinu vázajících regulační prvek sterolu při poškození ledvin“. Journal of Renal Nutrition. 17 (1): 62–5. doi:10.1053 / j.jrn.2006.10.009. PMID 17198935.
Hua X, Wu J, Goldstein JL, Brown MS, Hobbs HH (únor 1995). "Struktura lidského genu kódujícího sterolový regulační prvek vázající protein-1 (SREBF1) a lokalizace SREBF1 a SREBF2 na chromozomy 17p11.2 a 22q13". Genomika. 25 (3): 667–73. doi:10.1016 / 0888-7543 (95) 80009-B. PMID 7759101.
Yokoyama C, Wang X, Briggs MR, Admon A, Wu J, Hua X, Goldstein JL, Brown MS (říjen 1993). „SREBP-1, protein se zipem basic-helix-loop-helix-leucin, který řídí transkripci genu pro lipoproteinový receptor s nízkou hustotou“. Buňka. 75 (1): 187–97. doi:10.1016 / S0092-8674 (05) 80095-9. PMID 8402897. S2CID 2784016.
Wang X, Zelenski NG, Yang J, Sakai J, Brown MS, Goldstein JL (březen 1996). „Štěpení proteinů vázajících regulační prvek sterolu (SREBP) pomocí CPP32 během apoptózy“. Časopis EMBO. 15 (5): 1012–20. doi:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00438.x. PMC 449996. PMID 8605870.
Hua X, Sakai J, Brown MS, Goldstein JL (duben 1996). „Regulované štěpení proteinů vázajících regulační prvek sterolu vyžaduje sekvence na obou stranách membrány endoplazmatického retikula“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (17): 10379–84. doi:10.1074 / jbc.271.17.10379. PMID 8626610.
Pai JT, Brown MS, Goldstein JL (květen 1996). „Čištění a klonování cDNA druhé cysteinové proteázy související s apoptózou, která štěpí a aktivuje proteiny vázající regulační prvek sterolu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (11): 5437–42. Bibcode:1996PNAS ... 93.5437P. doi:10.1073 / pnas.93.11.5437. PMC 39264. PMID 8643593.
Sato R, Inoue J, Kawabe Y, Kodama T, Takano T, Maeda M (říjen 1996). "Sterol-dependentní transkripční regulace sterolového regulačního prvku vázajícího proteinu-2". The Journal of Biological Chemistry. 271 (43): 26461–4. doi:10.1074 / jbc.271.43.26461. PMID 8900111.
Oliner JD, Andresen JM, Hansen SK, Zhou S, Tjian R (listopad 1996). „Transkripční aktivita SREBP je zprostředkována interakcí s proteinem vázajícím CREB“. Geny a vývoj. 10 (22): 2903–11. doi:10.1101 / gad.10.22.2903. PMID 8918891.
Miserez AR, Cao G, Probst LC, Hobbs HH (únor 1997). "Struktura lidského genu kódujícího sterolový regulační prvek vázající protein 2 (SREBF2)". Genomika. 40 (1): 31–40. doi:10.1006 / geno.1996.4525. PMID 9070916.
Duncan EA, Brown MS, Goldstein JL, Sakai J (květen 1997). "Místo štěpení pro sterolem regulovanou proteázu lokalizovanou na leu-Ser vazbě v lumenální smyčce proteinu-2 vázajícího regulační prvek sterolu". The Journal of Biological Chemistry. 272 (19): 12778–85. doi:10.1074 / jbc.272.19.12778. PMID 9139737.
Harris IR, Farrell AM, Holleran WM, Jackson S, Grunfeld C, Elias PM, Feingold KR (únor 1998). "Paralelní regulace sterolového regulačního prvku vázajícího protein-2 a enzymy syntézy cholesterolu a mastných kyselin, ale ne syntéza ceramidu v kultivovaných lidských keratinocytech a myší epidermis". Journal of Lipid Research. 39 (2): 412–22. PMID 9508001.
Kan HY, Pissios P, Chambaz J, Zannis VI (únor 1999). „DNA vazebná specificita a transaktivační vlastnosti SREBP-2 vázaného na více míst na lidském promotoru apoA-II“. Výzkum nukleových kyselin. 27 (4): 1104–17. doi:10.1093 / nar / 27.4.1104. PMC 148292. PMID 9927745.
Seidah NG, Mowla SJ, Hamelin J, Mamarbachi AM, Benjannet S, Touré BB, Basak A, Munzer JS, Marcinkiewicz J, Zhong M, Barale JC, Lazure C, Murphy RA, Chrétien M, Marcinkiewicz M (únor 1999). „Savčí subtilisin / kexin isozym SKI-1: široce exprimovaná proproteinová konvertáza s jedinečnou specificitou štěpení a buněčnou lokalizací“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 96 (4): 1321–6. Bibcode:1999PNAS ... 96.1321S. doi:10.1073 / pnas.96.4.1321. PMC 15461. PMID 9990022.
Nagoshi E, Imamoto N, Sato R, Yoneda Y (červenec 1999). „Jaderný import proteinu-2 vázajícího regulační prvek, což je základní transkripční faktor obsahující helix-loop-helix-leucin (bHLH-Zip), nastává přímou interakcí importinu beta s HLH-Zip“. Molekulární biologie buňky. 10 (7): 2221–33. doi:10,1091 / mbc. 10.7.2221. PMC 25438. PMID 10397761.
Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN „Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (prosinec 1999). „Sekvence DNA lidského chromozomu 22“. Příroda. 402 (6761): 489–95. Bibcode:1999 Natur.402..489D. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.
DeBose-Boyd RA, Brown MS, Li WP, Nohturfft A, Goldstein JL, Espenshade PJ (prosinec 1999). „Proteolýza SREBP závislá na transportu: přemístění proteázy místa 1 z Golgi do ER odstraňuje potřebu transportu SREBP do Golgi“. Buňka. 99 (7): 703–12. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81668-2. PMID 10619424.
Kotzka J, Müller-Wieland D, Roth G, Kremer L, Munck M, Schürmann S, Knebel B, Krone W (leden 2000). „Sterolové regulační prvky vázající proteiny (SREBP) -1a a SREBP-2 jsou spojeny s MAP-kinázovou kaskádou“. Journal of Lipid Research. 41 (1): 99–108. PMID 10627507.
Yang T, Goldstein JL, Brown MS (září 2000). „Nadměrná exprese membránové domény SCAP brání sterolům v inhibici výstupu SCAP.SREBP z endoplazmatického retikula“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (38): 29881–6. doi:10,1074 / jbc.M005439200. PMID 10896675.

externí odkazy

SREBF2 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
FactorBook SREBP2

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000198911 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022463 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7903453-5] Hua X, Yokoyama C, Wu J, Briggs MR, Brown MS, Goldstein JL, Wang X (prosinec 1993). „SREBP-2, druhý protein zipu basic-helix-loop-helix-leucin, který stimuluje transkripci vazbou na regulační prvek sterolu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 90 (24): 11603–7. Bibcode:1993PNAS ... 9011603H. doi:10.1073 / pnas.90.24.11603. PMC 48032. PMID 7903453.

[entrez-6] „Entrez Gene: SREBF2 sterol regulační prvek vázající transkripční faktor 2“.

[pmid_=_24496149-7] Qiu XM, Jin CT, Wang W (duben 2014). „Souvislost mezi polymorfizmy jednoho nukleotidu u sterolového regulačního prvku vázajícího gen pro protein 2 a rizikem osteoartrózy kolene v čínské populaci Han“. The Journal of International Medical Research. 42 (2): 320–8. doi:10.1177/0300060513507392. PMID 24496149.

[pmid12842885-8] Dobrosotskaya IY, Goldstein JL, Brown MS, Rawson RB (září 2003). "Rekonstituce sterolem regulovaného endoplazmatického transportu SREBP-2 na Golgi v buňkách hmyzu společnou expresí savčích SCAP a Insigs". The Journal of Biological Chemistry. 278 (37): 35837–43. doi:10,1074 / jbc.M306476200. PMID 12842885.

[pmid12202038-9] Yang T, Espenshade PJ, Wright ME, Yabe D, Gong Y, Aebersold R, Goldstein JL, Brown MS (srpen 2002). „Zásadní krok v homeostáze cholesterolu: steroly podporují vazbu SCAP na INSIG-1, membránový protein, který usnadňuje retenci SREBP v ER“. Buňka. 110 (4): 489–500. doi:10.1016 / S0092-8674 (02) 00872-3. PMID 12202038. S2CID 15052132.

[pmid8918891-10] Oliner JD, Andresen JM, Hansen SK, Zhou S, Tjian R (listopad 1996). „Transkripční aktivita SREBP je zprostředkována interakcí s proteinem vázajícím CREB“. Geny a vývoj. 10 (22): 2903–11. doi:10.1101 / gad.10.22.2903. PMID 8918891.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]