NEUROD1 - NEUROD1 - Wikipedia

NEUROD1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2QL2
Identifikátory
Aliasy	NEUROD1, BETA2, BHF-1, MODY6, NEUROD, bHLHa3, neuronová diferenciace 1
Externí ID	OMIM: 601724 MGI: 1339708 HomoloGene: 1871 Genové karty: NEUROD1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	181,680,876 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	79,456,751 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: Aktivita transkripčního koaktivátoru 0001105; • Vazba DNA; • aktivita dimerizace bílkovin; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • vazba transkripčního faktoru; • vazba chromatinu; • Aktivace transkripčního faktoru aktivující RNA polymerázu II; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba e-boxu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita heterodimerizace proteinu; • dvouřetězcová vazba DNA; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• cytoplazma; • intracelulární; • nukleoplazma; • Komplex transkripčních faktorů RNA polymerázy II; • buněčné jádro;
Biologický proces	• pozitivní regulace transkripce regulační oblasti vázání DNA; • regulace neuronové diferenciace; • neurogeneze; • diferenciace buněk; • závazek osudu buňky; • regulace transkripce, DNA-šablony; • závazek osudu PP buněk pankreatu; • homeostáza glukózy; • regulace sekrece inzulínu; • diferenciace enteroendokrinních buněk; • vývoj zubatého gyrusu; • signální transdukce zapojená do regulace genové exprese; • vývoj neuronů; • sekrece inzulínu; • pozitivní regulace aktivity sekvenčně specifického transkripčního faktoru vázajícího DNA; • reakce na glukózu; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • morfogeneze embryonálních orgánů; • vývoj mozečku; • transkripce, chráněná DNA; • vývoj nervového systému; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • vývoj mnohobuněčných organismů; • vývoj zadního mozku; • nukleocytoplazmatický transport; • pozitivní regulace neuronové diferenciace; • pozitivní regulace buněčné diferenciace; • přenos signálu zprostředkovaný oxidem dusnatým; • pozitivní regulace apoptotického procesu; • regulace udržování struktury střevního epitelu; • vývoj vnitřního ucha; • vývoj očí typu kamery; • pankreatický závazek k osudu buněk; • diferenciace amakrinních buněk; • regulace zástavy buněčného cyklu; • negativní regulace apoptotického procesu pankreatických buněk typu B.; • reakce na drogu; • buněčná odpověď na stimul glukózy; • specifikace předního / zadního vzoru; • vývoj endokrinního pankreatu; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • negativní regulace kaskády JAK-STAT;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4760
	18012
	ENSG00000162992
	ENSMUSG00000034701
	Q13562
	Q60867
	NM_002500
	NM_010894
	NP_002491
	NP_035024
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Neurogenní diferenciace 1 (NeuroD1), také zvaný β2,^[5] je transkripční faktor z NeuroD -typ. Je kódován lidským genem NEUROD1.

Je členem rodiny NeuroD základní šroubovice-smyčka-šroubovice (bHLH) transkripční faktory. Protein tvoří heterodimery s jinými bHLH proteiny a aktivuje transkripci genů, které obsahují specifickou sekvenci DNA známou jako E-box. Reguluje výraz gen inzulínu a výsledkem jsou mutace v tomto genu diabetes mellitus typu II.^[6]

Bylo zjištěno, že NeuroD1 převádí reaktivní gliové buňky na funkční neurony v myším mozku in vivo^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že NEUROD1 komunikovat s MAP3K10,^[8] MAFA^[9] a Cyklin D1.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162992 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034701 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Poulin G, Turgeon B, Drouin J (listopad 1997). „NeuroD1 / beta2 přispívá k buněčně specifické transkripci genu proopiomelanokortinu“. Molekulární a buněčná biologie. 17 (11): 6673–82. doi:10,1128 / mcb.17.11.6673. PMC 232521. PMID 9343431.
^ "Entrez Gene: NEUROD1 neurogenní diferenciace 1".
^ Guo Z, Zhang L, Wu Z, Chen Y, Wang F, Chen G (únor 2014). „In vivo přímé přeprogramování reaktivních gliových buněk na funkční neurony po poranění mozku a v modelu Alzheimerovy choroby“. Buňková kmenová buňka. 14 (2): 188–202. doi:10.1016 / j.stem.2013.12.001. PMC 3967760. PMID 24360883.
^ Marcora E, Gowan K, Lee JE (srpen 2003). „Stimulace aktivity NeuroD pomocí huntingtinu a proteinů HAP1 a MLK2 asociovaných s huntingtinem“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (16): 9578–83. Bibcode:2003PNAS..100,9578 mil. doi:10.1073 / pnas.1133382100. PMC 170960. PMID 12881483.
^ Zhao L, Guo M, Matsuoka TA, Hagman DK, Parazzoli SD, Poitout V, Stein R (březen 2005). „Aktivátor MafA obohacený o ostrůvky beta buňkami je klíčovým regulátorem transkripce genu pro inzulín“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (12): 11887–94. doi:10,1074 / jbc.M409475200. PMID 15665000.
^ Ratineau C, Petry MW, Mutoh H, Leiter AB (březen 2002). „Cyclin D1 potlačuje základní transkripční faktor helix-loop-helix, BETA2 / NeuroD“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (11): 8847–53. doi:10,1074 / jbc.M110747200. PMID 11788592.

Další čtení

Fajans SS, Bell GI, Polonsky KS (září 2001). „Molekulární mechanismy a klinická patofyziologie diabetu mladých lidí s nástupem dospělosti“. The New England Journal of Medicine. 345 (13): 971–80. doi:10.1056 / NEJMra002168. PMID 11575290.
Cho JH, Tsai MJ (srpen 2004). "Role BETA2 / NeuroD1 ve vývoji nervového systému". Molekulární neurobiologie. 30 (1): 35–47. doi:10,1385 / MN: 30: 1: 035. PMID 15247487. S2CID 19923393.
Chae JH, Stein GH, Lee JE (prosinec 2004). "NeuroD: předvídané a překvapivé". Molekuly a buňky. 18 (3): 271–88. PMID 15650322.
Tamimi R, Steingrimsson E, Copeland NG, Dyer-Montgomery K, Lee JE, Hernandez R, Jenkins NA, Tapscott SJ (červen 1996). "NEUROD gen se mapuje na lidský chromozom 2q32 a myší chromozom 2". Genomika. 34 (3): 418–21. doi:10.1006 / geno.1996.0306. PMID 8786144.
Yokoyama M, Nishi Y, Miyamoto Y, Nakamura M, Akiyama K, Matsubara K, Okubo K (listopad 1996). "Molekulární klonování lidského neuroD z neuroblastomové buněčné linie specificky exprimované ve fetálním mozku a mozečku dospělého". Výzkum mozku. Molekulární výzkum mozku. 42 (1): 135–9. doi:10.1016 / S0169-328X (96) 00154-4. PMID 8915591.
Yokoyama M, Nishi Y, Yoshii J, Okubo K, Matsubara K (říjen 1996). „Identifikace a klonování genů specifických pro neuroblastom a specifické pro nervovou tkáň prostřednictvím kompilovaných profilů exprese“. Výzkum DNA. 3 (5): 311–20. doi:10.1093 / dnares / 3.5.311. PMID 9039501.
Acharya HR, Dooley CM, Thoreson WB, Ahmad I (duben 1997). "cDNA klonování a analýza exprese NeuroD mRNA v lidské sítnici". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 233 (2): 459–63. doi:10.1006 / bbrc.1997.6483. PMID 9144558.
Poulin G, Turgeon B, Drouin J (listopad 1997). „NeuroD1 / beta2 přispívá k buněčně specifické transkripci genu proopiomelanokortinu“. Molekulární a buněčná biologie. 17 (11): 6673–82. doi:10,1128 / mcb.17.11.6673. PMC 232521. PMID 9343431.
Furuta H, Horikawa Y, Iwasaki N, Hara M, Sussel L, Le Beau MM, Davis EM, Ogata M, Iwamoto Y, německá MS, Bell GI (srpen 1998). „Faktory transkripce beta-buněk a cukrovka: mutace v kódující oblasti genů BETA2 / NeuroD1 (NEUROD1) a Nkx2.2 (NKX2B) nejsou v japonštině spojovány s diabetem mladých lidí s počátkem dospělosti.“ Cukrovka. 47 (8): 1356–8. doi:10.2337 / diabetes.47.8.1356. PMID 9703340.
Yoon YS, Noma T, Yamashiro Y, Ito H, Nakazawa A (červenec 1998). "Molekulární klonování a charakterizace genu kódujícího lidský NeuroD". Neurovědy Dopisy. 251 (1): 17–20. doi:10.1016 / S0304-3940 (98) 00490-X. PMID 9714454. S2CID 39872130.
Miyachi T, Maruyama H, Kitamura T, Nakamura S, Kawakami H (červen 1999). "Struktura a regulace lidského genu NeuroD (BETA2 / BHF1)". Výzkum mozku. Molekulární výzkum mozku. 69 (2): 223–31. doi:10.1016 / S0169-328X (99) 00112-6. PMID 10366743.
Noma T, Yoon YS, Yamashiro Y, Fujisawa K, Nakazawa A (září 1999). "Regulace exprese NeuroD aktivací dráhy proteinkinázy-C v buňkách Y79 lidského retinoblastomu". Neurovědy Dopisy. 272 (1): 45–8. doi:10.1016 / S0304-3940 (99) 00569-8. PMID 10507539. S2CID 3158332.
Malecki MT, Jhala USA, Antonellis A, Fields L, Doria A, Orban T, Saad M, Warram JH, Montminy M, Krolewski AS (listopad 1999). „Mutace v NEUROD1 jsou spojeny s vývojem diabetes mellitus 2. typu“. Genetika přírody. 23 (3): 323–8. doi:10.1038/15500. PMID 10545951. S2CID 3216136.
Glick E, Leshkowitz D, Walker MD (leden 2000). „Transkripční faktor BETA2 působí společně s E2A a PDX1 k aktivaci promotoru genu pro inzulin“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (3): 2199–204. doi:10.1074 / jbc.275.3.2199. PMID 10636926.
Cibule J, Hermann S, Grundström T (duben 2000). "Nový typ interakce kalmodulinu při inhibici základních transkripčních faktorů helix-loop-helix". Biochemie. 39 (15): 4366–74. doi:10.1021 / bi992533u. PMID 10757985.
Mochizuki M, Amemiya S, Kobayashi K, Kobayashi K, Ishihara T, Aya M, Kato K, Kasuga A, Nakazawa S (leden 2002). „Sdružení polymorfismu Ala45Thr v NeuroD s diabetem typu 1a v Japonsku v dětství“. Výzkum diabetu a klinická praxe. 55 (1): 11–7. doi:10.1016 / S0168-8227 (01) 00242-X. PMID 11755474.
Ratineau C, Petry MW, Mutoh H, Leiter AB (březen 2002). „Cyclin D1 potlačuje základní transkripční faktor helix-loop-helix, BETA2 / NeuroD“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (11): 8847–53. doi:10,1074 / jbc.M110747200. PMID 11788592.
Westerman BA, Poutsma A, Maruyama K, Schrijnemakers HF, van Wijk IJ, Oudejans CB (duben 2002). „Předpřirozené geny NEUROD1 a NEUROD2 jsou exprimovány během lidské invaze trofoblastů“. Mechanismy rozvoje. 113 (1): 85–90. doi:10.1016 / S0925-4773 (01) 00665-7. PMID 11900979. S2CID 11607202.
Kanatsuka A, Tokuyama Y, Nozaki O, Matsui K, Egashira T (září 2002). „Dysfunkce beta-buněk u diabetiků s pozdním nástupem nesoucích homozygotní mutaci v transkripčních faktorech NeuroD1 a Pax4“. Metabolismus. 51 (9): 1161–5. doi:10.1053 / meta.2002.34707. PMID 12200761.

externí odkazy

NEUROD1 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162992 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034701 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[5] Poulin G, Turgeon B, Drouin J (listopad 1997). „NeuroD1 / beta2 přispívá k buněčně specifické transkripci genu proopiomelanokortinu“. Molekulární a buněčná biologie. 17 (11): 6673–82. doi:10,1128 / mcb.17.11.6673. PMC 232521. PMID 9343431.

[entrez-6] "Entrez Gene: NEUROD1 neurogenní diferenciace 1".

[7] Guo Z, Zhang L, Wu Z, Chen Y, Wang F, Chen G (únor 2014). „In vivo přímé přeprogramování reaktivních gliových buněk na funkční neurony po poranění mozku a v modelu Alzheimerovy choroby“. Buňková kmenová buňka. 14 (2): 188–202. doi:10.1016 / j.stem.2013.12.001. PMC 3967760. PMID 24360883.

[pmid12881483-8] Marcora E, Gowan K, Lee JE (srpen 2003). „Stimulace aktivity NeuroD pomocí huntingtinu a proteinů HAP1 a MLK2 asociovaných s huntingtinem“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (16): 9578–83. Bibcode:2003PNAS..100,9578 mil. doi:10.1073 / pnas.1133382100. PMC 170960. PMID 12881483.

[pmid15665000-9] Zhao L, Guo M, Matsuoka TA, Hagman DK, Parazzoli SD, Poitout V, Stein R (březen 2005). „Aktivátor MafA obohacený o ostrůvky beta buňkami je klíčovým regulátorem transkripce genu pro inzulín“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (12): 11887–94. doi:10,1074 / jbc.M409475200. PMID 15665000.

[pmid11788592-10] Ratineau C, Petry MW, Mutoh H, Leiter AB (březen 2002). „Cyclin D1 potlačuje základní transkripční faktor helix-loop-helix, BETA2 / NeuroD“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (11): 8847–53. doi:10,1074 / jbc.M110747200. PMID 11788592.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]