NFATC1 - NFATC1

NFATC1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1A66, 1 NFA
Identifikátory
Aliasy	NFATC1, NF-ATC, NFAT2, NFATc, NF-ATc1.2, jaderný faktor aktivovaných T-buněk 1, jaderný faktor aktivovaných T buněk 1
Externí ID	OMIM: 600489 MGI: 102469 HomoloGene: 32336 Genové karty: NFATC1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 18 (lidský)
Konec	79,529,325 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 18 (myš)
Konec	80,713,071 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • Vazba transkripčního faktoru RNA polymerázy II; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • mitogenem aktivovaná proteinová kináza p38; • Vazba FK506; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita transkripčního faktoru, vazba specifická pro sekvenci distálního zesilovače RNA polymerázy II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • Vazba transkripčního koaktivátoru RNA polymerázy II; • vazba chromatinu; • vazba transkripčního faktoru;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • nukleární chromatin; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • jaderné těleso; • komplex regulátoru transkripce;
Biologický proces	• GO: 0007243 transdukce intracelulárního signálu; • regulace transkripce, DNA-šablony; • kalcineurin-NFAT signalizační kaskáda; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • Signální dráha receptoru Fc-epsilon; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • Signální dráha Wnt, dráha modulující vápník; • negativní regulace signální dráhy Wnt; • negativní regulace diferenciace buněk hladkého svalstva cév; • produkce cytokinů; • morfogeneze aortální chlopně; • morfogeneze plicní chlopně;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4772
	18018
	ENSG00000131196
	ENSMUSG00000033016
	O95644
	O88942
NM_172390; NM_001278669; NM_001278670; NM_001278672; NM_001278673;
	NM_001278675; NM_006162; NM_172387; NM_172388; NM_172389
NM_001164109; NM_001164110; NM_001164111; NM_001164112; NM_016791;
	NM_198429
NP_001265598; NP_001265599; NP_001265601; NP_001265602; NP_001265604;
	NP_006153; NP_765975; NP_765976; NP_765977; NP_765978
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Jaderný faktor aktivovaných T-buněk, cytoplazmatický 1 je protein že u lidí je kódován NFATC1 gen.^[5]

Funkce

Produkt tohoto genu je složkou jaderného faktoru aktivovaných transkripčních komplexů vázajících DNA na DNA. Tento komplex se skládá z alespoň dvou složek: již existující cytosolické složky, která se po stimulaci receptoru T-buněk (TCR) translokáuje do jádra, a indukovatelné jaderné složky. Proteiny patřící do této rodiny transkripčních faktorů hrají ústřední roli v transkripci indukovatelného genu během imunitní odpovědi. Produktem tohoto genu je indukovatelná jaderná složka. Funguje jako hlavní molekulární cíl pro imunosupresivní léky, jako je cyklosporin. Pro tento gen bylo identifikováno pět variant transkriptu kódujících odlišné izoformy. Různé izoformy tohoto proteinu mohou regulovat indukovatelnou expresi různých genů pro cytokiny.^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že NFATC1 komunikovat s PIM1.^[7]

Viz také

NFAT

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000131196 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033016 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Northrop JP, Ho SN, Chen L, Thomas DJ, Timmerman LA, Nolan GP, Admon A, Crabtree GR (červen 1994). "NF-AT komponenty definují rodinu transkripčních faktorů cílených na aktivaci T-buněk". Příroda. 369 (6480): 497–502. Bibcode:1994Natur.369..497N. doi:10.1038 / 369497a0. PMID 8202141. S2CID 9920546.
^ "Entrez Gene: NFATC1 nukleární faktor aktivovaných T-buněk, cytoplazmatický, na kalcineurinu závislý 1".
^ Rainio EM, Sandholm J, Koskinen PJ (únor 2002). „Špička: Transkripční aktivita NFATc1 je zvýšena kinázou Pim-1“. Journal of Immunology. 168 (4): 1524–7. doi:10,4049 / jimmunol.168.4.1524. PMID 11823475.

Další čtení

Rao A, Luo C, Hogan PG (1997). "Transkripční faktory rodiny NFAT: regulace a funkce". Výroční přehled imunologie. 15: 707–47. doi:10.1146 / annurev.immunol.15.1.707. PMID 9143705.
Crabtree GR (březen 1999). "Obecné signály a specifické výsledky: signalizace přes Ca2 +, kalcineurin a NF-AT". Buňka. 96 (5): 611–4. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80571-1. PMID 10089876. S2CID 8817053.
Horsley V, Pavlath GK (březen 2002). „NFAT: všudypřítomný regulátor buněčné diferenciace a adaptace“. The Journal of Cell Biology. 156 (5): 771–4. doi:10.1083 / jcb.200111073. PMC 2173310. PMID 11877454.
Tolstrup M, Ostergaard L, Laursen AL, Pedersen SF, Duch M (duben 2004). „Únik HIV / SIV z imunitního dohledu: zaměření na Nefa“. Současný výzkum HIV. 2 (2): 141–51. doi:10.2174/1570162043484924. PMID 15078178.
Li X, Ho SN, Luna J, Giacalone J, Thomas DJ, Timmerman LA, Crabtree GR, Francke U (1995). "Klonování a chromozomální lokalizace lidských a myších genů pro transkripční faktory T-buněk NFATc a NFATp". Cytogenetika a buněčná genetika. 68 (3–4): 185–91. doi:10.1159/000133910. PMID 7842733.
Jabado N, Le Deist F, Fisher A, Hivroz C (listopad 1994). „Interakce HIV gp120 a anti-CD4 protilátek s molekulou CD4 na lidských CD4 + T buňkách inhibuje vazebnou aktivitu NF-AT, NF-kappa B a AP-1, tří jaderných faktorů regulujících aktivitu zesilovače genu interleukinu-2“. European Journal of Immunology. 24 (11): 2646–52. doi:10.1002 / eji.1830241112. PMID 7957556.
Vacca A, Farina M, Maroder M, Alesse E, Screpanti I, Frati L, Gulino A (listopad 1994). „Virus lidské imunodeficience typu 1 zvyšuje aktivitu promotoru interleukinu-2 prostřednictvím synergismu s forbolesterem a vápníkem zprostředkovanou aktivací NF-AT cis-regulačního motivu“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 205 (1): 467–74. doi:10.1006 / bbrc.1994.2689. PMID 7999066.
Park J, Takeuchi A, Sharma S (srpen 1996). "Charakterizace nové izoformy člena rodiny genů NFAT (nukleární faktor aktivovaných T buněk) NFATc". The Journal of Biological Chemistry. 271 (34): 20914–21. doi:10.1074 / jbc.271.34.20914. PMID 8702849.
Di Somma MM, Majolini MB, Burastero SE, Telford JL, Baldari CT (září 1996). „Cyklosporin Citlivost dlouhého terminálního opakování HIV-1 identifikuje odlišné dráhy závislé na p56lck aktivované spouštěním CD4“. European Journal of Immunology. 26 (9): 2181–8. doi:10.1002 / eji.1830260933. PMID 8814265.
Beals CR, Sheridan CM, Turck CW, Gardner P, Crabtree GR (březen 1997). „Jaderný export NF-ATc zvýšený glykogen syntázovou kinázou-3“. Věda. 275 (5308): 1930–4. doi:10.1126 / science.275.5308.1930. PMID 9072970. S2CID 22590899.
Kinoshita S, Su L, Amano M, Timmerman LA, Kaneshima H, Nolan GP (březen 1997). „Aktivační faktor T buněk NF-ATc pozitivně reguluje replikaci HIV-1 a genovou expresi v T buňkách“. Imunita. 6 (3): 235–44. doi:10.1016 / S1074-7613 (00) 80326-X. PMID 9075924.
Zhou P, Sun LJ, Dötsch V, Wagner G, Verdine GL (březen 1998). "Struktura řešení jádra komplexu NFATC1 / DNA". Buňka. 92 (5): 687–96. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81136-8. PMID 9506523. S2CID 16009648.
Kinoshita S, Chen BK, Kaneshima H, Nolan GP (listopad 1998). „Hostitelská kontrola parazitismu na HIV-1 v T buňkách jaderným faktorem aktivovaných T buněk“. Buňka. 95 (5): 595–604. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81630-X. PMID 9845362. S2CID 17954556.
Chuvpilo S, Zimmer M, Kerstan A, Glöckner J, Avots A, Escher C, Fischer C, Inashkina I, Jankevics E, Berberich-Siebelt F, Schmitt E, Serfling E (únor 1999). „Alternativní polyadenylační události přispívají k indukci NF-ATc v efektorových T buňkách“. Imunita. 10 (2): 261–9. doi:10.1016 / S1074-7613 (00) 80026-6. PMID 10072078.
Chuvpilo S, Avots A, Berberich-Siebelt F, Glöckner J, Fischer C, Kerstan A, Escher C, Inashkina I, Hlubek F, Jankevics E, Brabletz T, Serfling E (červen 1999). „V T lymfocytech je syntetizováno více izoforem NF-ATc s individuálními transkripčními vlastnostmi“. Journal of Immunology. 162 (12): 7294–301. PMID 10358178.
Wang JK, Kiyokawa E, Verdin E, Trono D (leden 2000). "Nef protein HIV-1 se asociuje s rafty a připravuje T buňky pro aktivaci". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (1): 394–9. Bibcode:2000PNAS ... 97..394W. doi:10.1073 / pnas.97.1.394. PMC 26674. PMID 10618429.
Porter CM, Havens MA, Clipstone NA (únor 2000). „Identifikace aminokyselinových zbytků a proteinových kináz podílejících se na regulaci subcelulární lokalizace NFATc“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (5): 3543–51. doi:10.1074 / jbc.275.5.3543. PMID 10652349.