CDC5L - CDC5L

CDC5L
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2DIM, 2DIN
Identifikátory
Aliasy	CDC5L, CDC5, CDC5-LIKE, CEF1, PCDC5RP, dJ319D22.1, cyklus dělení buněk 5 jako
Externí ID	OMIM: 602868 MGI: 1918952 HomoloGene: 13291 Genové karty: CDC5L
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	44,450,425 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	45,433,737 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • vazba proteinové fosfatázy 1; • vazba domény leucinového zipu; • Vazba domény WD40-repeat; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • transkripční vazba na jádrový kompresor; • vazba protein kinázy; • sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • Vazba RNA; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• cytoplazma; • jaderná skvrna; • katalytický krok 2 spliceosom; • membrána; • Prp19 komplex; • nukleoplazma; • komplex protein-DNA; • perinukleární oblast cytoplazmy; • Komplex faktoru replikace DNA; • spliceosomální komplex; • buněčné jádro; • Spliceosom katalytického kroku 2 typu U2;
Biologický proces	• Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu; • buněčná odpověď na stimul nervového růstového faktoru; • regulace transkripce, DNA-šablony; • Zpracování mRNA; • buněčná odpověď na stimul fibroblastového růstového faktoru; • transkripce, chráněná DNA; • buněčná odpověď na interleukin-2; • buněčná odpověď na prolaktin; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • signální transdukce zapojená do kontrolního bodu poškození DNA; • buněčná odpověď na wortmannin; • GO: 0007067 mitotický buněčný cyklus; • buněčný cyklus; • Oprava DNA; • diferenciace buněk; • Sestřih RNA; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	988
	71702
	ENSG00000096401
	ENSMUSG00000023932
	Q99459
	Q6A068
	NM_001253
	NM_152810
	NP_001244
	NP_690023
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Cyklus buněčného dělení 5-jako protein je protein že u lidí je kódován CDC5L gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem má významnou podobnost s Schizosaccharomyces pombe cdc5 genový produkt, který je a buněčný cyklus regulátor důležitý pro G₂ /M přechod. Bylo prokázáno, že tento protein působí jako pozitivní regulátor buněčného cyklu G.₂/ M progrese. Bylo také zjištěno, že je podstatnou složkou non-snRNA spliceosomu, který obsahuje alespoň pět dalších proteinových faktorů a je vyžadován pro druhý katalytický krok sestřihu pre-mRNA.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že CDC5L komunikovat s:

ASF / SF2,^[8]
BZW1,^[8]
CWC15,^[8]
DNA-PKcs,^[8]
DYNC1H1,^[8]
GCN1L1,^[8]
HSPA8,^[8]
ILF2,^[8]
PLRG1,^[8]^[9]^[10]^[11]
PPM1D,^[8]
PPP1CA,^[8]
PRPF19,^[8]
RBMX^[8] a
RPL12,^[8]
RPL13,^[8]
RPS16,^[8]
RPS25,^[8]
SF3A1,^[8]
SF3B1,^[8]
SF3B2,^[8]
SF3B4,^[8]
SFPQ,^[8]
SFRS2,^[8]
SNRPA1,^[8]
SNRPD3,^[8]
SRRM1,^[8]
Malý nukleární ribonukleoprotein D1,^[8]
Malý nukleární ribonukleoprotein D2,^[8]
Malý nukleární ribonukleoproteinový polypeptid A,^[8]
TOP2A,^[8] a
TTF2.^[12]

Viz také

Kontrolní bod G2 / M

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000096401 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000023932 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Groenen PM, Vanderlinden G, Devriendt K, Fryns JP, Van de Ven WJ (duben 1998). „Přesmyk lidského genu CDC5L pomocí t (6; 19) (p21; q13.1) u pacienta s multicystickou renální dysplazií“. Genomika. 49 (2): 218–29. doi:10.1006 / geno.1998.5254. PMID 9598309.
^ Bernstein HS, Coughlin SR (únor 1997). "Protein související s Pombe Cdc5. Předpokládaný lidský transkripční faktor zapojený do signalizace aktivované mitogenem". The Journal of Biological Chemistry. 272 (9): 5833–7. doi:10.1074 / jbc.272.9.5833. PMID 9038199.
^ ^A ^b "Entrez Gene: CDC5L CDC5 cyklus buněčného dělení podobný 5 (S. pombe)".
^ ^A ^b ^C ^d ^E ^F ^G ^h ⁱ ^j ^k ^l ^m ⁿ ^Ó ^p ^q ^r ^s ^t ^u ^proti ^w ^X ^y ^z ^aa ^ab ^ac ^inzerát Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (prosinec 2000). „Funkční analýza lidského komplexu CDC5L a identifikace jeho složek hmotnostní spektrometrií“. Časopis EMBO. 19 (23): 6569–81. doi:10.1093 / emboj / 19.23.6569. PMC 305846. PMID 11101529.
^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3: 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
^ Ajuh P, Lamond AI (listopad 2003). „Identifikace peptidových inhibitorů sestřihu pre-mRNA odvozených od základních interakčních domén CDC5L a PLRG1“. Výzkum nukleových kyselin. 31 (21): 6104–16. doi:10.1093 / nar / gkg 817. PMC 275459. PMID 14576297.
^ Ajuh P, Sleeman J, Chusainow J, Lamond AI (listopad 2001). „Přímá interakce mezi karboxylovou koncovou oblastí CDC5L a doménou WD40 PLRG1 je nezbytná pro sestřih pre-mRNA“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (45): 42370–81. doi:10,1074 / jbc.M105453200. PMID 11544257.
^ Leonard D, Ajuh P, Lamond AI, Legerski RJ (září 2003). „hLodestar / HuF2 interaguje s CDC5L a podílí se na sestřihu pre-mRNA“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 308 (4): 793–801. CiteSeerX 10.1.1.539.8359. doi:10.1016 / s0006-291x (03) 01486-4. PMID 12927788.

Další čtení

Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H, Kikuno R, Ohara O, Nagase T (červen 2002). „Konstrukce klonů cDNA připravených na expresi pro geny KIAA: ruční kurace 330 klonů cIANA KIAA“. Výzkum DNA. 9 (3): 99–106. CiteSeerX 10.1.1.500.923. doi:10.1093 / dnares / 9.3.99. PMID 12168954.
Heaney JP, Jacobson A (srpen 1975). "Zjednodušené ovládání krvácení do horní části břicha z duté žíly". Chirurgická operace. 78 (2): 138–41. PMID 1154257.
Hirayama T, Shinozaki K (listopad 1996). „Homolog cdc5 + vyšší rostliny, Arabidopsis thaliana“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (23): 13371–6. doi:10.1073 / pnas.93.23.13371. PMC 24100. PMID 8917598.
Ishikawa K, Nagase T, Nakajima D, Seki N, Ohira M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (říjen 1997). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. VIII. 78 nových klonů cDNA z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. Výzkum DNA. 4 (5): 307–13. doi:10.1093 / dnares / 4.5.307. PMID 9455477.
Bernstein HS, Coughlin SR (únor 1998). "Savčí homolog štěpných kvasinek Cdc5 reguluje progresi G2 a mitotický vstup". The Journal of Biological Chemistry. 273 (8): 4666–71. doi:10.1074 / jbc.273.8.4666. PMID 9468527.
Ohi R, Feoktistova A, McCann S, Valentine V, Look AT, Lipsick JS, Gould KL (červenec 1998). „Myb příbuzné Schizosaccharomyces pombe cdc5p je strukturně a funkčně konzervováno u eukaryot“. Molekulární a buněčná biologie. 18 (7): 4097–108. doi:10,1128 / mcb.18.7.4097. PMC 108994. PMID 9632794.
Neubauer G, král A, Rappsilber J, Calvio C, Watson M, Ajuh P, Sleeman J, Lamond A, Mann M (září 1998). „Hmotnostní spektrometrie a vyhledávání v databázi EST umožňuje charakterizaci komplexu víceproteinových spliceosomů“. Genetika přírody. 20 (1): 46–50. doi:10.1038/1700. PMID 9731529. S2CID 585778.
Burns CG, Ohi R, Krainer AR, Gould KL (listopad 1999). „Důkazy, že pro sestřih pre-mRNA jsou vyžadovány proteiny CDC5 související s Myb“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 96 (24): 13789–94. doi:10.1073 / pnas.96.24.13789. PMC 24143. PMID 10570151.
Boudrez A, Beullens M, Groenen P, Van Eynde A, Vulsteke V, Jagiello I, Murray M, Krainer AR, Stalmans W, Bollen M (srpen 2000). „Interakce proteinové fosfatázy-1 zprostředkovaná NIPP1 s CDC5L, regulátorem sestřihu pre-mRNA a mitotického vstupu“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (33): 25411–7. doi:10,1074 / jbc.M001676200. PMID 10827081.
Lei XH, Shen X, Xu XQ, Bernstein HS (prosinec 2000). „Human Cdc5, regulátor mitotického vstupu, může působit jako místně specifický protein vázající DNA“. Journal of Cell Science. 113. 113 (24): 4523–31. PMID 11082045.
Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (prosinec 2000). „Funkční analýza lidského komplexu CDC5L a identifikace jeho složek hmotnostní spektrometrií“. Časopis EMBO. 19 (23): 6569–81. doi:10.1093 / emboj / 19.23.6569. PMC 305846. PMID 11101529.
Harrington JJ, Sherf B, Rundlett S, Jackson PD, Perry R, Cain S, Leventhal C, Thornton M, Ramachandran R, Whittington J, Lerner L, Costanzo D, McElligott K, Boozer S, Mays R, Smith E, Veloso N , Klika A, Hess J, Cothren K, Lo K, Offenbacher J, Danzig J, Ducar M (květen 2001). "Vytvoření knihoven exprese proteinů v celém genomu pomocí náhodné aktivace genové exprese". Přírodní biotechnologie. 19 (5): 440–5. doi:10.1038/88107. PMID 11329013. S2CID 25064683.
Ajuh P, Sleeman J, Chusainow J, Lamond AI (listopad 2001). „Přímá interakce mezi karboxylovou koncovou oblastí CDC5L a doménou WD40 PLRG1 je nezbytná pro sestřih pre-mRNA“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (45): 42370–81. doi:10,1074 / jbc.M105453200. PMID 11544257.
Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, Grigorieff N, Moore MJ (duben 2002). „Čištění a charakterizace nativních spliceosomů vhodných pro trojrozměrnou strukturní analýzu“. RNA. 8 (4): 426–39. doi:10.1017 / S1355838202021088. PMC 1370266. PMID 11991638.
Leonard D, Ajuh P, Lamond AI, Legerski RJ (září 2003). „hLodestar / HuF2 interaguje s CDC5L a podílí se na sestřihu pre-mRNA“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 308 (4): 793–801. CiteSeerX 10.1.1.539.8359. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 01486-4. PMID 12927788.
Liu L, Gräub R, Hlaing M, Epting CL, Turck CW, Xu XQ, Zhang L, Bernstein HS (2004). "Zřetelné domény lidského CDC5 řídí jeho jaderný import a asociaci s spliceosomem". Buněčná biochemie a biofyzika. 39 (2): 119–32. doi:10,1385 / CBB: 39: 2: 119. PMID 14515018. S2CID 22472390.

externí odkazy

Člověk CDC5L umístění genomu a CDC5L stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000096401 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000023932 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9598309-5] Groenen PM, Vanderlinden G, Devriendt K, Fryns JP, Van de Ven WJ (duben 1998). „Přesmyk lidského genu CDC5L pomocí t (6; 19) (p21; q13.1) u pacienta s multicystickou renální dysplazií“. Genomika. 49 (2): 218–29. doi:10.1006 / geno.1998.5254. PMID 9598309.

[pmid9038199-6] Bernstein HS, Coughlin SR (únor 1997). "Protein související s Pombe Cdc5. Předpokládaný lidský transkripční faktor zapojený do signalizace aktivované mitogenem". The Journal of Biological Chemistry. 272 (9): 5833–7. doi:10.1074 / jbc.272.9.5833. PMID 9038199.

[entrez-7] A ^b "Entrez Gene: CDC5L CDC5 cyklus buněčného dělení podobný 5 (S. pombe)".

[pmid11101529-8] A ^b ^C ^d ^E ^F ^G ^h ⁱ ^j ^k ^l ^m ⁿ ^Ó ^p ^q ^r ^s ^t ^u ^proti ^w ^X ^y ^z ^aa ^ab ^ac ^inzerát Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (prosinec 2000). „Funkční analýza lidského komplexu CDC5L a identifikace jeho složek hmotnostní spektrometrií“. Časopis EMBO. 19 (23): 6569–81. doi:10.1093 / emboj / 19.23.6569. PMC 305846. PMID 11101529.

[pmid17353931-9] Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3: 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

[pmid14576297-10] Ajuh P, Lamond AI (listopad 2003). „Identifikace peptidových inhibitorů sestřihu pre-mRNA odvozených od základních interakčních domén CDC5L a PLRG1“. Výzkum nukleových kyselin. 31 (21): 6104–16. doi:10.1093 / nar / gkg 817. PMC 275459. PMID 14576297.

[pmid11544257-11] Ajuh P, Sleeman J, Chusainow J, Lamond AI (listopad 2001). „Přímá interakce mezi karboxylovou koncovou oblastí CDC5L a doménou WD40 PLRG1 je nezbytná pro sestřih pre-mRNA“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (45): 42370–81. doi:10,1074 / jbc.M105453200. PMID 11544257.

[pmid12927788-12] Leonard D, Ajuh P, Lamond AI, Legerski RJ (září 2003). „hLodestar / HuF2 interaguje s CDC5L a podílí se na sestřihu pre-mRNA“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 308 (4): 793–801. CiteSeerX 10.1.1.539.8359. doi:10.1016 / s0006-291x (03) 01486-4. PMID 12927788.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]