CTDP1 - CTDP1
RNA polymeráza II podjednotka C-koncová doménová fosfatáza je enzym že u lidí je kódován CTDP1 gen.[5][6][7]
Tento gen kóduje protein, který interaguje s karboxy-koncem transkripčního iniciačního faktoru TFIIF, transkripční faktor, který reguluje prodloužení i iniciaci RNA polymerázou II. Protein může také představovat složku komplexu holoenzymu RNA polymerázy II. Alternativní sestřih tohoto genu vede ke dvěma variantám transkriptu kódujícím 2 různé izoformy.[7]
Interakce
CTDP1 bylo prokázáno komunikovat s WD protein obsahující opakování 77,[8] GTF2F1[6] a POLR2A.[9]
Reference
- ^ A b C ENSG00000060069 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000282752, ENSG00000060069 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033323 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Archambault J, Chambers RS, Kobor MS, Ho Y, Cartier M, Bolotin D, Andrews B, Kane CM, Greenblatt J (únor 1998). „Základní složka fosfatázy na C-koncové doméně, která interaguje s transkripčním faktorem IIF v Saccharomyces cerevisiae“. Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (26): 14300–5. Bibcode:1997PNAS ... 9414300A. doi:10.1073 / pnas.94.26.14300. PMC 24951. PMID 9405607.
- ^ A b Archambault J, Pan G, Dahmus GK, Cartier M, Marshall N, Zhang S, Dahmus ME, Greenblatt J (listopad 1998). „FCP1, podjednotka interagující s RAP74 lidské proteinové fosfatázy, která defosforyluje karboxylterminální doménu RNA polymerázy IIO“. J Biol Chem. 273 (42): 27593–601. doi:10.1074 / jbc.273.42.27593. PMID 9765293.
- ^ A b „Entrez Gene: CTDP1 CTD (karboxy-terminální doména, RNA polymeráza II, polypeptid A) fosfatáza, podjednotka 1“.
- ^ Licciardo, Paolo; Amente Stefano; Ruggiero Luca; Monti Maria; Pucci Piero; Lania Luigi; Majello Barbara (únor 2003). „Fosfatáza FCP1 interaguje s RNA polymerázou II a s MEP50, složkou methylosomového komplexu podílejícího se na sestavování snRNP“. Nucleic Acids Res. Anglie. 31 (3): 999–1005. doi:10.1093 / nar / gkg197. PMC 149217. PMID 12560496.
- ^ Scullyová, R; Anderson SF; Chao D M; Wei W; Ye L; Young RA; Livingston D M; Parvin J D (květen 1997). „BRCA1 je složkou holoenzymu RNA polymerázy II“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA SPOJENÉ STÁTY. 94 (11): 5605–10. Bibcode:1997PNAS ... 94.5605S. doi:10.1073 / pnas.94.11.5605. ISSN 0027-8424. PMC 20825. PMID 9159119.
externí odkazy
- Člověk CTDP1 umístění genomu a CTDP1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Další čtení
- Scully R, Anderson SF, Chao DM a kol. (1997). „BRCA1 je složkou holoenzymu RNA polymerázy II“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (11): 5605–10. Bibcode:1997PNAS ... 94.5605S. doi:10.1073 / pnas.94.11.5605. PMC 20825. PMID 9159119.
- Marshall NF, Dahmus GK, Dahmus ME (1998). „Regulace fosfatázy na karboxylové koncové doméně proteinem HIV-1 tat“. J. Biol. Chem. 273 (48): 31726–30. doi:10.1074 / jbc.273.48.31726. PMID 9822634.
- Cho H, Kim TK, Mancebo H a kol. (1999). „Proteinová fosfatáza funguje k recyklaci RNA polymerázy II“. Genes Dev. 13 (12): 1540–52. doi:10.1101 / gad.13.12.1540. PMC 316795. PMID 10385623.
- Angelicheva D, Turnev I, Dye D a kol. (1999). „Syndrom vrozené katarakty s neuropatií obličejového dysmorfismu (CCFDN): nová vývojová porucha u Gypsies mapuje na 18qter“. Eur. J. Hum. Genet. 7 (5): 560–6. doi:10.1038 / sj.ejhg.5200319. PMID 10439962.
- Marshall NF, Dahmus ME (2000). "Citlivost na C-koncovou doménu k fosfatáze RNA polymerázy II v komplexech pro rané prodloužení na HIV-1 a adenoviru 2 hlavní pozdní šablony". J. Biol. Chem. 275 (42): 32430–7. doi:10,1074 / jbc.M005898200. PMID 10938286.
- Licciardo P, Napolitano G, Majello B, Lania L (2001). "Inhibice transaktivace Tat pomocí RNA polymerázy II CTD-fosfatázy FCP1". AIDS. 15 (3): 301–7. doi:10.1097/00002030-200102160-00002. PMID 11273209. S2CID 33054695.
- Bharucha DC, Zhou M, Nekhai S a kol. (2002). „Proteinová fosfatáza z lidských T buněk zvyšuje transaktivaci dlouhého terminálního opakování viru lidské imunodeficience typu 1“. Virologie. 296 (1): 6–16. doi:10.1006 / viro.2002.1438. PMID 12036313.
- Washington K, Ammosova T, Beullens M a kol. (2002). „Protein fosfatáza-1 defosforyluje C-koncovou doménu RNA polymerázy-II“. J. Biol. Chem. 277 (43): 40442–8. doi:10,1074 / jbc.M205687200. PMID 12185079.
- Mandal SS, Cho H, Kim S a kol. (2002). „FCP1, fosfatáza specifická pro heptapeptidovou repetici největší podjednotky RNA polymerázy II, stimuluje prodloužení transkripce“. Mol. Buňka. Biol. 22 (21): 7543–52. doi:10.1128 / MCB.22.21.7543-7552.2002. PMC 135672. PMID 12370301.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Licciardo P, Amente S, Ruggiero L a kol. (2003). „Fosfatáza FCP1 interaguje s RNA polymerázou II a s MEP50, složkou methylosomového komplexu zapojeného do sestavování snRNP“. Nucleic Acids Res. 31 (3): 999–1005. doi:10.1093 / nar / gkg197. PMC 149217. PMID 12560496.
- Nguyen BD, Chen HT, Kobor MS a kol. (2003). „Struktura řešení karboxylové koncové domény RAP74 a NMR charakterizace vazebných míst FCP1 pro RAP74 a lidský TFIIB.“. Biochemie. 42 (6): 1460–9. doi:10.1021 / bi0265473. PMID 12578358.
- Friedl EM, Lane WS, Erdjument-Bromage H a kol. (2003). „Fosfatáza na C-koncové doméně a prodloužení transkripce FCP1 jsou regulovány fosforylací“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (5): 2328–33. Bibcode:2003PNAS..100.2328F. doi:10.1073 / pnas.2628049100. PMC 151340. PMID 12591939.
- Kamada K, Roeder RG, Burley SK (2003). „Molekulární mechanismus náboru TFIIF-asociované RNA polymerázy C-terminální doménová fosfatáza (FCP1) transkripčním faktorem IIF“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (5): 2296–9. Bibcode:2003PNAS..100.2296K. doi:10.1073 / pnas.262798199. PMC 151334. PMID 12591941.
- Nguyen BD, Abbott KL, Potempa K a kol. (2003). „NMR struktura komplexu obsahujícího TFIIF podjednotku RAP74 a RNA polymerázu II karboxyl-terminální doména fosfatáza FCP1“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (10): 5688–93. Bibcode:2003PNAS..100,5688N. doi:10.1073 / pnas.1031524100. PMC 156262. PMID 12732728.
- Varon R, Gooding R, Steglich C a kol. (2003). „Částečný nedostatek fosfatázy C-terminální domény RNA polymerázy II je spojen s vrozeným kataraktem syndromem neuropatie obličejového dysmorfismu“. Nat. Genet. 35 (2): 185–9. doi:10.1038 / ng1243. PMID 14517542. S2CID 22461437.
- Yu X, Chini CC, He M a kol. (2003). „BRCT doména je doména vázající fosfo-protein.“ Věda. 302 (5645): 639–42. Bibcode:2003Sci ... 302..639Y. doi:10.1126 / science.1088753. PMID 14576433. S2CID 29407635.
- Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004PNAS..10112130B. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
![]() | Tento článek o gen na lidský chromozom 18 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |