BAZ1B - BAZ1B
Tyrosin-protein kinázanebo Bromodoména sousedící s zinkový prst doména, 1B (BAZ1B) je enzym že u lidí je kódován BAZ1B gen.[5][6][7]
Funkce
Tento gen kóduje člena bromodoména rodina bílkovin. Bromodoména je strukturní motiv charakteristický pro proteiny, kterých se účastní chromatin -závislá regulace transkripce. Tento gen je odstraněn v Williams-Beurenův syndrom, a vývojová porucha způsobeno delecí více genů v 7q11.23.[7]
Bylo zjištěno, že BAZ1B ovlivňuje aktivitu 448 dalších genů a je velmi důležitý pro vývoj neurální lišta a tvář. Výzkum naznačuje, že změny v BAZ1B mohly být zahrnuty do „domestikační „lidé.[8][9]
Zvířecí modely
Modelové organismy byly použity při studiu BAZ1B funkce. A podmiňovací způsob knockout myš linka, tzv Baz1btm2a (KOMP) Wtsi,[10] byl vygenerován jako součást International Knockout Mouse Consortium program - vysoká propustnost mutageneze projekt generování a distribuce zvířecích modelů nemocí zainteresovaným vědcům - na Wellcome Trust Sanger Institute.[11][12][13]
Samci a samice prošli standardizací fenotypová obrazovka k určení účinků vypuštění.[13][14][15][16]
| Charakteristický | Abnormální |
|---|---|
| Homozygot životaschopnost | Ano[17] |
| Tělesná hmotnost | Ano[18] |
| Vlasový kořínek cyklistika | Ne |
| Úzkost | Ne |
| Upraveno SHIRPA | Ne |
| Síla úchopu | Ne |
| Dysmorfologie | Ne |
| Nepřímá kalorimetrie | Ano[19] |
| Zkouška tolerance glukózy | Ne |
| Sluchová odezva mozkového kmene | Ne |
| DEXA | Ano[20] |
| Radiografie | Ano[21] |
| Tělesná teplota | Ne |
| Oko morfologie | Ne |
| Váha srdce | Ne |
| Histologie srdce | Ne |
| Histologie | Ne |
| Klinická chemie | Ne |
| Plazma imunoglobuliny | Ne |
| Hematologie | Ne |
| Lymfocyty periferní krve | Ne |
| Mikrojaderný test | Ne |
| Salmonella infekce | Ano[22] |
| Citrobacter infekce | Ne |
| Všechny testy a analýzy od [14][15][16] | |
Šest významných fenotypy byly hlášeny:[16]
- Méně homozygotní mutantní myši přežily do odstavení než se očekávalo.
- Mutant myši poklesly tělesné hmotnosti ve srovnání s divoký typ kontrolní myši.
- Mutantní myši vykazovaly zvýšenou aktivitu, VO2 a energetický výdej, určeno nepřímá kalorimetrie.
- Radiografie zjistila abnormality zubů.
- Duální energie rentgenové absorpciometrie (DEXA) ukázal, že mutované samice myší měly pokles kostní minerál hustota a obsah.
- Samci heterozygotních myší měli poté vyšší počet bakterií Salmonella infekce.
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000009954 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000002748 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Peoples RJ, Cisco MJ, Kaplan P, Francke U (únor 1999). „Identifikace genu WBSCR9 kódujícího nový transkripční regulátor při deleci syndromu Williams-Beuren v 7q11.23“. Cytogenetika a genetika buněk. 82 (3–4): 238–46. doi:10.1159/000015110. PMID 9858827. S2CID 46824270.
- ^ Lu X, Meng X, Morris CA, Keating MT (prosinec 1998). "Nový lidský gen, WSTF, je odstraněn u Williamsova syndromu". Genomika. 54 (2): 241–9. doi:10.1006 / geno.1998.5578. PMID 9828126.
- ^ A b „Entrez Gene: BAZ1B bromodoména sousedící s doménou se zinkovým prstem, 1B“.
- ^ Zanella M, Vitriolo A, Andirko A, Martins PT, Sturm S, O'Rourke T a kol. (Prosinec 2019). „Dávkovací analýza oblasti 7q11. 23 Williams identifikuje BAZ1B jako hlavní lidský gen, který je vzorem moderní lidské tváře a základní domestikace“. Vědecké zálohy. 5 (12): eaaw7908. Bibcode:2019SciA .... 5.7908Z. doi:10.1126 / sciadv.aaw7908. PMC 6892627. PMID 31840056.
- ^ Marshall M (14. prosince 2019). „Jediný gen řídí, jak se naše tváře vyvíjejí, když jsme mladí“. Nový vědec.
- ^ KOMP. „Baz1btm2a (KOMP) Wtsi". knockoutmouse.org. Archivovány od originál dne 05.10.2011. Citováno 2011-06-28.
- ^ Dolgin E (červen 2011). „Knihovna myší je vyřazena“. Příroda. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.
- ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (leden 2007). "Myš ze všech důvodů". Buňka. 128 (1): 9–13. doi:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
- ^ A b van der Weyden L, White JK, Adams DJ, Logan DW (červen 2011). „Sada nástrojů pro genetiku myší: odhalení funkce a mechanismu“. Genome Biology. 12 (6): 224. doi:10.1186 / gb-2011-12-6-224. PMC 3218837. PMID 21722353.
- ^ A b Karp NA, Baker LA, Gerdin AK, Adams NC, Ramírez-Solis R, White JK (říjen 2010). „Optimalizace experimentálního designu pro vysoce výkonné fenotypování u myší: případová studie“. Savčí genom. 21 (9–10): 467–76. doi:10.1007 / s00335-010-9279-1. PMC 2974211. PMID 20799038.
- ^ A b Gardin A, White J (2010). „Genetický program Sanger Mouse: vysoká propustnost charakterizace knockoutovaných myší“. Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
- ^ A b C Wellcome Trust Sanger Institute. "MGP fenotypizace Baz1btm2a (KOMP) Wtsi". Portál myších zdrojů. sanger.ac.uk.
- ^ Wellcome Trust Sanger Institute. „Životaschopnost při odstavování dat pro Baz1b“. Portál myších zdrojů. sanger.ac.uk.
- ^ Wellcome Trust Sanger Institute. „Údaje o hmotnostních křivkách pro Baz1b“. Portál myších zdrojů. sanger.ac.uk.
- ^ Wellcome Trust Sanger Institute. „Data nepřímé kalorimetrie pro Baz1b“. Portál myších zdrojů. sanger.ac.uk.
- ^ Wellcome Trust Sanger Institute. „Data o složení těla (DEXA) pro Baz1b“. Portál myších zdrojů. sanger.ac.uk.
- ^ Wellcome Trust Sanger Institute. „Rentgenová zobrazovací data pro Baz1b“. Portál myších zdrojů. sanger.ac.uk.
- ^ Wellcome Trust Sanger Institute. „Data výzvy Salmonella pro Baz1b“. Portál myších zdrojů. sanger.ac.uk.
Další čtení
- Washington University Genome Sequencing Cente (listopad 1998). „Směrem k úplné sekvenci lidského genomu“. Výzkum genomu. 8 (11): 1097–108. doi:10.1101 / gr.8.11.1097. PMID 9847074.
- Jones MH, Hamana N, Nezu J, Shimane M (leden 2000). "Nová rodina genů bromodomény". Genomika. 63 (1): 40–5. doi:10.1006 / geno.1999,6071. PMID 10662543.
- Pascual J, Martinez-Yamout M, Dyson HJ, Wright PE (prosinec 2000). "Struktura PHD zinkového prstu z transkripčního faktoru lidského Williams-Beurenova syndromu". Journal of Molecular Biology. 304 (5): 723–9. doi:10.1006 / jmbi.2000.4308. PMID 11124022.
- Bozhenok L, Wade PA, Varga-Weisz P (květen 2002). „Komplex remodelace chromatinu WSTF-ISWI cílí na heterochromatická replikační ohniska“. Časopis EMBO. 21 (9): 2231–41. doi:10.1093 / emboj / 21.9.2231. PMC 125993. PMID 11980720.
- Kitagawa H, Fujiki R, Yoshimura K, Mezaki Y, Uematsu Y, Matsui D a kol. (Červen 2003). „Komplex WINAC remodelační komplex WINAC se zaměřuje na jaderný receptor na promotory a je narušen Williamsovým syndromem“. Buňka. 113 (7): 905–17. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00436-7. PMID 12837248.
- Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J a kol. (Srpen 2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004PNAS..10112130B. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
- Poot RA, Bozhenok L, van den Berg DL, Steffensen S, Ferreira F, Grimaldi M a kol. (Prosinec 2004). „Transkripční faktor Williamsova syndromu interaguje s PCNA a cílí na remodelaci chromatinu pomocí ISWI na replikační ložiska“. Přírodní buněčná biologie. 6 (12): 1236–44. doi:10.1038 / ncb1196. PMID 15543136. S2CID 23842462.
- Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (leden 2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. Bibcode:2005 Natur.433 ... 77A. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
- Fujiki R, Kim MS, Sasaki Y, Yoshimura K, Kitagawa H, Kato S (listopad 2005). "Ligandem indukovaná transreprese pomocí VDR prostřednictvím asociace WSTF s acetylovanými histony". Časopis EMBO. 24 (22): 3881–94. doi:10.1038 / sj.emboj.7600853. PMC 1283952. PMID 16252006.
- Percipalle P, Fomproix N, Cavellán E, Voit R, Reimer G, Krüger T a kol. (Květen 2006). „Komplex remodelace chromatinu WSTF-SNF2h interaguje s nukleárním myosinem 1 a hraje roli v transkripci RNA polymerázy I“. Zprávy EMBO. 7 (5): 525–30. doi:10.1038 / sj.embor.7400657. PMC 1479564. PMID 16514417.
- Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, Nigg EA, Körner R (duben 2006). „Fosfoproteomová analýza lidského mitotického vřetena“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 103 (14): 5391–6. Bibcode:2006PNAS..103.5391N. doi:10.1073 / pnas.0507066103. PMC 1459365. PMID 16565220.
- Cavellán E, Asp P, Percipalle P, Farrant AK (červen 2006). „Komplex remodelace chromatinu WSTF-SNF2h interaguje s několika jadernými proteiny v transkripci“. The Journal of Biological Chemistry. 281 (24): 16264–71. doi:10,1074 / jbc.M600233200. PMID 16603771.
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (listopad 2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
externí odkazy
- BAZ1B + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
- Člověk BAZ1B umístění genomu a BAZ1B stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.
Galerie PDB | |
|---|---|
|
