KROUŽEK 1 - RING1

KROUŽEK 1
Identifikátory
Aliasy	KROUŽEK 1, RING1A, RNF1, protein prstového prstu 1
Externí ID	OMIM: 602045 MGI: 1101770 HomoloGene: 68283 Genové karty: KROUŽEK 1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	33,212,722 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	34,024,680 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba chromatinu; • vazba kovových iontů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita aktivátoru ubikvitin-protein transferáza; • aktivita transferázy;
Buněčná složka	• jaderná skvrna; • jaderné těleso; • pohlavní chromatin; • komplex ubikvitin ligázy; • nukleoplazma; • PcG proteinový komplex; • buněčné jádro; • cytosol; • Komplex PRC1;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • histon H2A monoubiquitination; • transkripce, chráněná DNA; • ubikvitinace bílkovin; • GO: 0048552 regulace katalytické aktivity; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • ubikvitinace histonu; • kamerová morfogeneze oka; • specifikace předního / zadního vzoru; • negativní regulace přechodu G0 na G1; • organizace chromatinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6015
	19763
ENSG00000235107; ENSG00000231115; ENSG00000204227; ENSG00000226788; ENSG00000228520;
	ENSG00000206287
	ENSMUSG00000024325
	Q06587
	O35730
	NM_002931
	NM_009066
	NP_002922
	NP_033092
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

E3 ubikvitin-protein ligáza RING1 je enzym že u lidí je kódován KROUŽEK 1 gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento gen patří do rodiny prstů RING, jejíž členové kódují proteiny charakterizované a RING doména, motiv vázající zinek týkající se domény zinkových prstů. Genový produkt může vázat DNA a může působit jako transkripční represor. Je asociován s multimerním komplexem proteinu skupiny polycomb. Genový produkt interaguje s proteiny skupiny polycombových skupin BMI1, EDR1 a CBX4 a kolokalizuje s těmito proteiny ve velkých jaderných doménách. Interaguje s proteinem CBX4 prostřednictvím své C-koncové domény bohaté na glycin. Gen se mapuje do oblasti HLA třídy II, kde je souvislý s geny prstů RING FABGL a HKE4.^[6]

Interakce

RING1 bylo prokázáno komunikovat s CBX8,^[7] BMI1^[8]^[9] a RYBP.^[10]^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000231115, ENSG00000204227, ENSG00000226788, ENSG00000228520, ENSG00000206287 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000235107, ENSG00000231115, ENSG00000204227, ENSG00000226788, ENSG00000226788, ENSG00000226788, ENSG00000226788, ENSG00000226788, ENSG00000226788 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024325 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Hanson IM, Poustka A, Trowsdale J (červen 1991). "Nové geny v oblasti třídy II hlavního histokompatibilního komplexu člověka". Genomika. 10 (2): 417–24. doi:10.1016 / 0888-7543 (91) 90327-B. PMID 1906426.
^ ^A ^b „Entrez Gene: RING1 ring finger protein 1“.
^ Bárdos JI, Saurin AJ, Tissot C, Duprez E, Freemont PS (září 2000). „HPC3 je nový lidský polycombový ortolog, který interaguje a sdružuje se s RING1 a Bmi1 a má transkripční represivní vlastnosti“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (37): 28785–92. doi:10,1074 / jbc.M001835200. PMID 10825164.
^ Satijn DP, Gunster MJ, van der Vlag J, Hamer KM, Schul W, Alkema MJ, Saurin AJ, Freemont PS, van Driel R, Otte AP (červenec 1997). „RING1 je spojen s komplexem proteinů skupiny polycombů a působí jako transkripční represor“. Molekulární a buněčná biologie. 17 (7): 4105–13. doi:10,1128 / mcb.17.7.4105. PMC 232264. PMID 9199346.
^ Satijn DP, Otte AP (leden 1999). „RING1 interaguje s více proteiny skupiny Polycomb a vykazuje tumorigenní aktivitu“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (1): 57–68. doi:10,1128 / mcb.19.1.57. PMC 83865. PMID 9858531.
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ García E, Marcos-Gutiérrez C, del Mar Lorente M, Moreno JC, Vidal M (červen 1999). „RYBP, nový represorový protein, který interaguje se složkami savčího komplexu Polycomb a s transkripčním faktorem YY1“. Časopis EMBO. 18 (12): 3404–18. doi:10.1093 / emboj / 18.12.3404. PMC 1171420. PMID 10369680.

Další čtení

Lovering R, Hanson IM, Borden KL, Martin S, O'Reilly NJ, Evan GI, Rahman D, Pappin DJ, Trowsdale J, Freemont PS (březen 1993). „Identifikace a předběžná charakterizace proteinového motivu souvisejícího se zinkovým prstem“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 90 (6): 2112–6. Bibcode:1993PNAS ... 90.2112L. doi:10.1073 / pnas.90.6.2112. PMC 46035. PMID 7681583.
Satijn DP, Gunster MJ, van der Vlag J, Hamer KM, Schul W, Alkema MJ, Saurin AJ, Freemont PS, van Driel R, Otte AP (červenec 1997). „RING1 je spojen s komplexem proteinů skupiny polycombů a působí jako transkripční represor“. Molekulární a buněčná biologie. 17 (7): 4105–13. doi:10,1128 / mcb.17.7.4105. PMC 232264. PMID 9199346.
Kikuti YY, Tamiya G, Ando A, Chen L, Kimura M, Ferreira E, Tsuji K, Trowsdale J, Inoko H (červen 1997). „Fyzické mapování 220 kb centromerní analýzy lidského MHC a DNA sekvence 43kb segmentu včetně genů RING1, HKE6 a HKE4“. Genomika. 42 (3): 422–35. doi:10.1006 / geno.1997.4745. PMID 9205114.
Satijn DP, Otte AP (leden 1999). „RING1 interaguje s více proteiny skupiny Polycomb a vykazuje tumorigenní aktivitu“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (1): 57–68. doi:10,1128 / mcb.19.1.57. PMC 83865. PMID 9858531.
García E, Marcos-Gutiérrez C, del Mar Lorente M, Moreno JC, Vidal M (červen 1999). „RYBP, nový represorový protein, který interaguje se složkami savčího komplexu Polycomb a s transkripčním faktorem YY1“. Časopis EMBO. 18 (12): 3404–18. doi:10.1093 / emboj / 18.12.3404. PMC 1171420. PMID 10369680.
Bárdos JI, Saurin AJ, Tissot C, Duprez E, Freemont PS (září 2000). „HPC3 je nový lidský polycombový ortolog, který interaguje a sdružuje se s RING1 a Bmi1 a má transkripční represivní vlastnosti“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (37): 28785–92. doi:10,1074 / jbc.M001835200. PMID 10825164.
Trimarchi JM, Fairchild B, Wen J, Lees JA (únor 2001). „Transkripční faktor E2F6 je součástí savčího polycombového komplexu obsahujícího Bmi1“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 98 (4): 1519–24. doi:10.1073 / pnas.041597698. PMC 29289. PMID 11171983.
Dahiya A, Wong S, Gonzalo S, Gavin M, Dean DC (září 2001). "Propojení drah Rb a polycombů". Molekulární buňka. 8 (3): 557–69. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00346-X. PMID 11583618.
Ogawa H, Ishiguro K, Gaubatz S, Livingston DM, Nakatani Y (květen 2002). "Komplex s modifikátory chromatinu, který obsazuje geny reagující na E2F a Myc v buňkách G0". Věda. 296 (5570): 1132–6. Bibcode:2002Sci ... 296.1132O. doi:10.1126 / science.1069861. PMID 12004135. S2CID 34863978.
Akasaka T, Takahashi N, Suzuki M, Koseki H, Bodmer R, Koga H (srpen 2002). „MBLR, nový prstový protein RING připomínající savčí genové produkty Polycomb, je regulován fosforylací závislou na buněčném cyklu“ (PDF). Geny do buněk. 7 (8): 835–50. doi:10.1046 / j.1365-2443.2002.00565.x. hdl:2027.42/72663. PMID 12167161. S2CID 23060582.
Levine SS, Weiss A, Erdjument-Bromage H, Shao Z, Tempst P, Kingston RE (září 2002). „Jádro polykombového represivního komplexu je kompozičně a funkčně konzervováno u much a lidí“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (17): 6070–8. doi:10.1128 / MCB.22.17.6070-6078.2002. PMC 134016. PMID 12167701.
Gil J, Bernard D, Martínez D, Beach D (leden 2004). „Polycomb CBX7 má sjednocující roli v životnosti buněk“. Přírodní buněčná biologie. 6 (1): 67–72. doi:10.1038 / ncb1077. PMID 14647293. S2CID 23315124.
Obuse C, Yang H, Nozaki N, Goto S, Okazaki T, Yoda K (únor 2004). „Proteomická analýza komplexu centromér z HeLa mezifázových buněk: UV-poškozený DNA vazebný protein 1 (DDB-1) je součástí komplexu CEN, zatímco BMI-1 je přechodně ko-lokalizován s centromerickou oblastí v mezifázi.“ Geny do buněk. 9 (2): 105–20. doi:10.1111 / j.1365-2443.2004.00705.x. PMID 15009096. S2CID 21813024.
Wang H, Wang L, Erdjument-Bromage H, Vidal M, Tempst P, Jones RS, Zhang Y (říjen 2004). "Role ubikvitinace histonu H2A v umlčování Polycomb". Příroda. 431 (7010): 873–8. Bibcode:2004 Natur.431..873W. doi:10.1038 / nature02985. PMID 15386022. S2CID 4344378.
Qin H, Du D, Zhu Y, Li J, Feng L, Liang Y, Han H (únor 2005). „PcG protein HPC2 inhibuje transkripci zprostředkovanou RBP-J interakcí s LIM proteinem KyoT2“. FEBS Dopisy. 579 (5): 1220–6. doi:10.1016 / j.febslet.2005.01.022. PMID 15710417. S2CID 8214807.

externí odkazy

RING1 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000231115, ENSG00000204227, ENSG00000226788, ENSG00000228520, ENSG00000206287 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000235107, ENSG00000231115, ENSG00000204227, ENSG00000226788, ENSG00000226788, ENSG00000226788, ENSG00000226788, ENSG00000226788, ENSG00000226788 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024325 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1906426-5] Hanson IM, Poustka A, Trowsdale J (červen 1991). "Nové geny v oblasti třídy II hlavního histokompatibilního komplexu člověka". Genomika. 10 (2): 417–24. doi:10.1016 / 0888-7543 (91) 90327-B. PMID 1906426.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: RING1 ring finger protein 1“.

[pmid10825164-7] Bárdos JI, Saurin AJ, Tissot C, Duprez E, Freemont PS (září 2000). „HPC3 je nový lidský polycombový ortolog, který interaguje a sdružuje se s RING1 a Bmi1 a má transkripční represivní vlastnosti“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (37): 28785–92. doi:10,1074 / jbc.M001835200. PMID 10825164.

[pmid9199346-8] Satijn DP, Gunster MJ, van der Vlag J, Hamer KM, Schul W, Alkema MJ, Saurin AJ, Freemont PS, van Driel R, Otte AP (červenec 1997). „RING1 je spojen s komplexem proteinů skupiny polycombů a působí jako transkripční represor“. Molekulární a buněčná biologie. 17 (7): 4105–13. doi:10,1128 / mcb.17.7.4105. PMC 232264. PMID 9199346.

[pmid9858531-9] Satijn DP, Otte AP (leden 1999). „RING1 interaguje s více proteiny skupiny Polycomb a vykazuje tumorigenní aktivitu“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (1): 57–68. doi:10,1128 / mcb.19.1.57. PMC 83865. PMID 9858531.

[pmid16189514-10] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid10369680-11] García E, Marcos-Gutiérrez C, del Mar Lorente M, Moreno JC, Vidal M (červen 1999). „RYBP, nový represorový protein, který interaguje se složkami savčího komplexu Polycomb a s transkripčním faktorem YY1“. Časopis EMBO. 18 (12): 3404–18. doi:10.1093 / emboj / 18.12.3404. PMC 1171420. PMID 10369680.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]