HMG20B - HMG20B

HMG20B
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2CRJ
Identifikátory
Aliasy	HMG20B, BRAF25, BRAF35, HMGX2, HMGXB2, PP7706, SMARCE1r, SOXL, pp8857, skupina s vysokou mobilitou 20B
Externí ID	OMIM: 605535 MGI: 1341190 HomoloGene: 74949 Genové karty: HMG20B
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	3,579,088 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	81,350,480 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita heterodimerizace proteinu; • Vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita histon-deacetylázy; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • nukleoplazma; • chromozóm; • jaderné těleso;
Biologický proces	• diferenciace buněk kosterního svalstva; • buněčný cyklus; • negativní regulace sumoylace proteinů; • srážení krve; • regulace transkripce, DNA-šablony; • pozitivní regulace neuronové diferenciace; • transkripce, chráněná DNA; • histonová deacetylace; • organizace chromatinu; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10362
	15353
	ENSG00000064961
	ENSMUSG00000020232
	Q9P0W2
	Q9Z104
	NM_006339
	NM_001163165; NM_001163166; NM_010440
	NP_006330
	NP_001156637; NP_001156638; NP_034570
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Regulátor související s aktinem související se SWI / SNF s aktinem související s chromatinovou podrodinou E související s členem 1 je protein že u lidí je kódován HMG20B gen.^[5]^[6]

Interakce

HMG20B bylo prokázáno, že komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000064961 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020232 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Sumoy L, Carim L, Escarceller M, Nadal M, Gratacòs M, Pujana MA, Estivill X, Peral B (červen 2000). „HMG20A a HMG20B se mapují na lidské chromozomy 15q24 a 19p13.3 a tvoří odlišnou třídu genů HMG-box se všudypřítomnou expresí“. Cytogenetika a genetika buněk. 88 (1–2): 62–7. doi:10.1159/000015486. PMID 10773667. S2CID 22921110.
^ „Entrez Gene: HMG20B high-mobility group 20B“.
^ ^A ^b ^C ^d ^E Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J, Lane WS, Mandel G, Shiekhattar R (květen 2002). „Komplex jádro-BRAF35 obsahující histon-deacetylázu zprostředkovává represi neuronově specifických genů“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 99 (11): 7420–5. doi:10.1073 / pnas.112008599. PMC 124246. PMID 12032298.
^ Marmorstein LY, Kinev AV, Chan GK, Bochar DA, Beniya H, Epstein JA, Yen TJ, Shiekhattar R (leden 2001). „Lidský komplex BRCA2 obsahující strukturní složku vázající DNA ovlivňuje progresi buněčného cyklu“. Buňka. 104 (2): 247–57. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00209-4. PMID 11207365. S2CID 5822368.
^ Hakimi MA, Dong Y, Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R (únor 2003). „Kandidátský gen pro mentální retardaci vázaný na X je součástí nové rodiny komplexů obsahujících histon-deacetylázu“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (9): 7234–9. doi:10,1074 / jbc.M208992200. PMID 12493763.
^ Lee YM, Kim W (září 2003). „Sdružení bílého člena nadrodiny lidského kinesinu 4 s faktorem 35 spojeným s BRCA2“. The Biochemical Journal. 374 (Pt 2): 497–503. doi:10.1042 / BJ20030452. PMC 1223617. PMID 12809554.
^ Iwase S, Januma A, Miyamoto K, Shono N, Honda A, Yanagisawa J, Baba T (září 2004). "Charakterizace BHC80 v komplexu BRAF-HDAC, podílející se na neuronově specifické genové represi". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 322 (2): 601–8. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.07.163. PMID 15325272.

Další čtení

Wattler F, Wattler S, Kelly M, Skinner HB, Nehls M (září 1999). „Klonování, chromozomální umístění a analýza exprese myšího druhu Smarce1, nového člena rodiny genů skupiny 365 s vysokou mobilitou“. Genomika. 60 (2): 172–8. doi:10.1006 / geno.1999.5913. PMID 10486208.
Marmorstein LY, Kinev AV, Chan GK, Bochar DA, Beniya H, Epstein JA, Yen TJ, Shiekhattar R (leden 2001). „Lidský komplex BRCA2 obsahující strukturní složku vázající DNA ovlivňuje progresi buněčného cyklu“. Buňka. 104 (2): 247–57. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00209-4. PMID 11207365. S2CID 5822368.
Lee YM, Shin H, Choi W, Ahn S, Kim W (duben 2002). "Charakterizace lidského proteinu skupiny SMARCE1r s vysokou mobilitou". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - genová struktura a exprese. 1574 (3): 269–76. doi:10.1016 / s0167-4781 (01) 00373-6. PMID 11997092.
Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J, Lane WS, Mandel G, Shiekhattar R (květen 2002). „Komplex jádro-BRAF35 obsahující histon-deacetylázu zprostředkovává represi neuronově specifických genů“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 99 (11): 7420–5. doi:10.1073 / pnas.112008599. PMC 124246. PMID 12032298.
Wang C, McCarty IM, Balazs L, Li Y, Steiner MS (červenec 2002). „Klonování cDNA kódující alternativně sestřižený protein BRCA2 asociovaného faktoru 35“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 295 (1): 129–35. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 00624-1. PMID 12083779.
Wang C, McCarty IM, Balazs L, Li Y, Steiner MS (červenec 2002). "Imunohistologická detekce BRAF25 ve vzorcích lidského nádoru prostaty a rakoviny". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 295 (1): 136–41. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 00625-3. PMID 12083780.
Hakimi MA, Dong Y, Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R (únor 2003). „Kandidátský gen pro mentální retardaci vázaný na X je součástí nové rodiny komplexů obsahujících histon-deacetylázu“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (9): 7234–9. doi:10,1074 / jbc.M208992200. PMID 12493763.
Lee YM, Kim W (září 2003). „Sdružení bílého člena nadrodiny lidského kinesinu 4 s faktorem 35 spojeným s BRCA2“. The Biochemical Journal. 374 (Pt 2): 497–503. doi:10.1042 / BJ20030452. PMC 1223617. PMID 12809554.
Iwase S, Januma A, Miyamoto K, Shono N, Honda A, Yanagisawa J, Baba T (září 2004). "Charakterizace BHC80 v komplexu BRAF-HDAC, podílející se na neuronově specifické genové represi". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 322 (2): 601–8. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.07.163. PMID 15325272.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

externí odkazy

HMG20B umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
HMG20B podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000064961 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020232 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10773667-5] Sumoy L, Carim L, Escarceller M, Nadal M, Gratacòs M, Pujana MA, Estivill X, Peral B (červen 2000). „HMG20A a HMG20B se mapují na lidské chromozomy 15q24 a 19p13.3 a tvoří odlišnou třídu genů HMG-box se všudypřítomnou expresí“. Cytogenetika a genetika buněk. 88 (1–2): 62–7. doi:10.1159/000015486. PMID 10773667. S2CID 22921110.

[entrez-6] „Entrez Gene: HMG20B high-mobility group 20B“.

[pmid12032298-7] A ^b ^C ^d ^E Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J, Lane WS, Mandel G, Shiekhattar R (květen 2002). „Komplex jádro-BRAF35 obsahující histon-deacetylázu zprostředkovává represi neuronově specifických genů“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 99 (11): 7420–5. doi:10.1073 / pnas.112008599. PMC 124246. PMID 12032298.

[pmid11207365-8] Marmorstein LY, Kinev AV, Chan GK, Bochar DA, Beniya H, Epstein JA, Yen TJ, Shiekhattar R (leden 2001). „Lidský komplex BRCA2 obsahující strukturní složku vázající DNA ovlivňuje progresi buněčného cyklu“. Buňka. 104 (2): 247–57. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00209-4. PMID 11207365. S2CID 5822368.

[pmid12493763-9] Hakimi MA, Dong Y, Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R (únor 2003). „Kandidátský gen pro mentální retardaci vázaný na X je součástí nové rodiny komplexů obsahujících histon-deacetylázu“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (9): 7234–9. doi:10,1074 / jbc.M208992200. PMID 12493763.

[pmid12809554-10] Lee YM, Kim W (září 2003). „Sdružení bílého člena nadrodiny lidského kinesinu 4 s faktorem 35 spojeným s BRCA2“. The Biochemical Journal. 374 (Pt 2): 497–503. doi:10.1042 / BJ20030452. PMC 1223617. PMID 12809554.

[pmid15325272-11] Iwase S, Januma A, Miyamoto K, Shono N, Honda A, Yanagisawa J, Baba T (září 2004). "Charakterizace BHC80 v komplexu BRAF-HDAC, podílející se na neuronově specifické genové represi". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 322 (2): 601–8. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.07.163. PMID 15325272.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]