NFX1 - NFX1

NFX1
Identifikátory
Aliasy	NFX1, NFX2, TEG-42, Tex42, nukleární transkripční faktor, vazba X-boxu 1
Externí ID	OMIM: 603255 MGI: 1921414 HomoloGene: 1875 Genové karty: NFX1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	33,371,157 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	41,025,993 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • Vazba DNA; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 Aktivita transkripčního represoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • vazba iontů zinku; • ligázová aktivita; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • vazba kovových iontů; • vazba nukleové kyseliny; • Vazba RNA; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • aktivita transferázy; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy;
Buněčná složka	• buněčná membrána; • jádro; • buněčné jádro; • cytosol;
Biologický proces	• zánětlivá reakce; • GO: virový proces 0022415; • regulace transkripce, DNA-šablony; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • negativní regulace procesu biosyntézy MHC třídy II; • transkripce, chráněná DNA; • ubikvitinace bílkovin;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4799
	74164
	ENSG00000086102
	ENSMUSG00000028423
	Q12986
	B1AY10
	NM_002504; NM_147133; NM_147134; NM_001318758
	NM_001290448; NM_001290449; NM_023739
	NP_001305687; NP_002495; NP_667345
	NP_001277377; NP_001277378; NP_076228
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Transkripční represor NF-X1 je protein že u lidí je kódován NFX1 gen.^[5]^[6]^[7]

MHC třídy II genová exprese je řízena primárně na úrovni transkripce pomocí transkripční faktory které se vážou na boxy X a Y, dva vysoce konzervované prvky v proximálním promotoru genů MHC třídy II. Protein kódovaný tímto genem je transkripční represor schopné vázat se na konzervovaný motiv X boxu z HLA-DRA a další geny MHC třídy II in vitro. Protein může hrát roli v regulaci trvání zánětlivé odpovědi omezením období, ve kterém jsou molekuly MHC třídy II indukovány IFN-y. Tři alternativy varianty spoje, z nichž každý kóduje jiný izoforma, byl identifikován.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000086102 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028423 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Song Z, Krishna S, Thanos D, Strominger JL, Ono SJ (prosinec 1994). „Nový na cystein bohatý na sekvenčně specifický protein vázající DNA interaguje s konzervovaným motivem X-box genů lidského hlavního histokompatibilního komplexu třídy II prostřednictvím opakované domény Cys-His a funguje jako transkripční represor“. J Exp Med. 180 (5): 1763–74. doi:10.1084 / jem.180.5.1763. PMC 2191754. PMID 7964459.
^ Hume CR, Lee JS (leden 1990). „Vrozené imunodeficience spojené s absencí antigenů HLA třídy II na lymfocytech vyplývají z odlišných mutací v trans-působících faktorech“. Hum Immunol. 26 (4): 288–309. doi:10.1016/0198-8859(89)90007-4. PMID 2511169.
^ Arlotta P, Miyazaki D, Copeland NG, Gilbert DJ, Jenkins NA, Ono SJ (červen 2002). „Murine NFX.1: izolace a charakterizace jeho messengerové RNA, mapování jeho chromozomální polohy a hodnocení jeho vývojové exprese“. Imunologie. 106 (2): 173–81. doi:10.1046 / j.1365-2567.2002.01416.x. PMC 1782705. PMID 12047746.
^ „Entrez Gene: nukleární transkripční faktor NFX1, vazba X-boxu 1“.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Lorick KL, Jensen JP, Fang S a kol. (1999). „Prsteny RING zprostředkují ubikvitin-dependentní enzym (E2) závislý na ubikvitinu“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 96 (20): 11364–9. Bibcode:1999PNAS ... 9611364L. doi:10.1073 / pnas.96.20.11364. PMC 18039. PMID 10500182.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Saito K, Fujiwara T, Katahira J a kol. (2004). „TAP / NXF1, primární exportní receptor mRNA, specificky interaguje s proteinem HuD vázajícím se na neuronovou RNA“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 321 (2): 291–7. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.06.140. PMID 15358174.
Gewin L, Myers H, Kiyono T, Galloway DA (2004). „Identifikace nového represoru telomerázy, který interaguje s komplexem lidského papilomaviru typu 16 E6 / E6-AP“. Genes Dev. 18 (18): 2269–82. doi:10.1101 / gad.1214704. PMC 517520. PMID 15371341.
Katzenellenbogen RA, Egelkrout EM, Vliet-Gregg P a kol. (2007). „NFX1-123 a poly (A) vazebné proteiny synergicky zvyšují aktivaci telomerázy v buňkách exprimujících E6 lidského papilomaviru typu 16“. J. Virol. 81 (8): 3786–96. doi:10.1128 / JVI.02007-06. PMC 1866132. PMID 17267499.

externí odkazy

NFX1 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek o gen na lidský chromozom 9 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000086102 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028423 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7964459-5] Song Z, Krishna S, Thanos D, Strominger JL, Ono SJ (prosinec 1994). „Nový na cystein bohatý na sekvenčně specifický protein vázající DNA interaguje s konzervovaným motivem X-box genů lidského hlavního histokompatibilního komplexu třídy II prostřednictvím opakované domény Cys-His a funguje jako transkripční represor“. J Exp Med. 180 (5): 1763–74. doi:10.1084 / jem.180.5.1763. PMC 2191754. PMID 7964459.

[pmid2511169-6] Hume CR, Lee JS (leden 1990). „Vrozené imunodeficience spojené s absencí antigenů HLA třídy II na lymfocytech vyplývají z odlišných mutací v trans-působících faktorech“. Hum Immunol. 26 (4): 288–309. doi:10.1016/0198-8859(89)90007-4. PMID 2511169.

[pmid12047746-7] Arlotta P, Miyazaki D, Copeland NG, Gilbert DJ, Jenkins NA, Ono SJ (červen 2002). „Murine NFX.1: izolace a charakterizace jeho messengerové RNA, mapování jeho chromozomální polohy a hodnocení jeho vývojové exprese“. Imunologie. 106 (2): 173–81. doi:10.1046 / j.1365-2567.2002.01416.x. PMC 1782705. PMID 12047746.

[entrez-8] „Entrez Gene: nukleární transkripční faktor NFX1, vazba X-boxu 1“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]