HLA-DRA - HLA-DRA

HLA-DRA
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1A6A, 1AQD, 1BX2, 1D5M, 1D5X, 1D5Z, 1D6E, 1DLH, 1FV1, 1FYT, 1H15, 1HXY, 1J8H, 1JWM, 1JWS, 1JWU, 1KG0, 1KLG, 1KLU, 1LO5, 1 PYW, 1R5I, 1 SEB, 1SJE, 1SJH, 1T5W, 1T5X, 1 rok, 1ZGL, 2FSE, 2G9H, 2IAM, 2IAN, 2ICW, 2IPK, 2OJE, 2Q6W, 2WBJ, 2XN9, 3C5J, 3L6F, 3O6F, 3PDO, 3PGC, 3PGD, 3QXA, 3QXD, 3S4S, 3S5L, 3T0E, 4AEN, 4AH2, 4E41, 4FQX, 4 GBX, 4H1L, 4C56, 4H25, 4H26, 4I5B, 4IS6, 4MCY, 4MCZ, 4MD0, 4MD4, 4MD5, 4MDI, 4MDJ, 4OV5, 4Y19, 4Y1A, 4X5X, 4X5W
Identifikátory
Aliasy	HLA-DRA, HLA-DRA1, MLRW, hlavní histokompatibilní komplex, třída II, DR alfa
Externí ID	OMIM: 142860 MGI: 95900 HomoloGene: 7751 Genové karty: HLA-DRA
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	32,445,046 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	34,344,645 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba peptidového antigenu; • Aktivita receptoru MHC třídy II; • Vazba proteinového komplexu MHC třídy II; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána endocytických váčků; • membrána endocytických váčků potažená klatrinem; • endozom; • Golgiho aparát; • trans-Golgiho síťová membrána; • membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • membrána pozdního endozomu; • Golgiho membrána; • buněčná membrána; • transportní vezikulární membrána; • integrální součást plazmatické membrány; • povrch buňky; • lysozomální membrána; • endoplazmatické retikulum; • ER na Golgiho transportní membránu vezikul; • lysozom; • integrální součást lumenální strany membrány endoplazmatického retikula; • endosomová membrána; • extracelulární exosom; • MHC proteinový komplex třídy II;
Biologický proces	• zpracování a prezentace antigenu; • zpracování antigenu a prezentace exogenního peptidového antigenu prostřednictvím MHC třídy II; • poznání; • interferon-gama zprostředkovaná signální dráha; • proces imunitního systému; • Kostimulace T buněk; • zpracování antigenu a prezentace peptidového nebo polysacharidového antigenu prostřednictvím MHC třídy II; • imunitní odpověď; • sestava peptidového antigenu s proteinovým komplexem MHC třídy II; • GO: virový proces 0022415; • Signální dráha receptoru T buněk; • adaptivní imunitní odpověď;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3122
	100504404
ENSG00000206308; ENSG00000228987; ENSG00000230726; ENSG00000204287; ENSG00000227993;
	ENSG00000226260; ENSG00000234794
	ENSMUSG00000036322
	P01903
	P04224; P01904
	NM_019111
	NM_010381
	NP_061984
	NP_034511
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

HLA třída II histokompatibilního antigenu, DR alfa řetězec je protein že u lidí je kódován HLA-DRA gen.^[5] HLA-DRA kóduje alfa podjednotku HLA-DR. Na rozdíl od alfa řetězců jiných molekul lidské MHC třídy II je alfa podjednotka prakticky neměnná. Může se však spárovat s libovolným řetězcem beta ze 3 různých lokusů DR beta, DRB1 a dva z nich DRB3, DRB4 nebo DRB5 alely. Existuje tedy potenciál, že kterýkoli daný jedinec může tvořit 4 různé izoformy HLA-DR (2 alely DRB1 a dvě alely z DRB3, DRB4 nebo DRB5).

Funkce

The polypeptid podjednotka kódovaný tímto genem patří do HLA třída II alfa řetězec paralogy. Protein třídy II je heterodimer skládající se z alfa (DRα) a beta řetězce (DRβ), oba zakotvené v membráně. Hraje ústřední roli v imunitní systém prezentací peptidů odvozených od extracelulárních proteinů. Molekuly třídy II jsou exprimovány v buňky prezentující antigen (APC: B lymfocyty, dendritické buňky, makrofágy).^[5]

Genová struktura a polymorfismy

Alfa řetězec má přibližně 33-35 kDa a jeho gen obsahuje 5 exony. Exon 1 kóduje vedoucí peptid, exony 2 a 3 kódují dva extracelulární domén a exon 4 kóduje transmembránový doména a cytoplazmatický ocas. DRA nemá polymorfismy v části vázající peptid a působí jako jediný alfa řetězec DRB1, DRB3, DRB4 a DRB5.^[5]

Alely

V lidské populaci existují dva různé řetězce HLA-DRA kódované třemi různými alelami DRA:

DRA * 01: 01 DRA * 01: 02: 01 DRA * 01: 02: 02

Viz také

HLA-DR

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000228987, ENSG00000230726, ENSG00000204287, ENSG00000227993, ENSG00000226260, ENSG00000234794 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000206308, ENSG00000228987, ENSG00000230700, ENSG00000230700, ENSG00000230700, ENSG00000230700, ENSG00000230700, - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000036322 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b ^C „Entrez Gene: HLA-DRA major histocompatibility complex, class II, DR alpha“.

Další čtení

Bénichou S, Benmerah A (2003). „[Proteiny HIV nef a proteiny K3 / K5 spojené s virem Kaposiho sarkomu:„ paraziti “dráhy endocytózy]“. Med Sci (Paříž). 19 (1): 100–6. doi:10.1051 / medsci / 2003191100. PMID 12836198.
Tolstrup M, Ostergaard L, Laursen AL a kol. (2004). „Únik HIV / SIV z imunitního dohledu: zaměření na Nefa“. Curr. HIV Res. 2 (2): 141–51. doi:10.2174/1570162043484924. PMID 15078178.
Anderson JL, Hope TJ (2005). "HIV doplňkové proteiny a přežití hostitelské buňky". Aktuální zprávy o HIV / AIDS. 1 (1): 47–53. doi:10.1007 / s11904-004-0007-x. PMID 16091223. S2CID 34731265.
Li L, Li HS, Pauza CD a kol. (2006). "Role pomocných proteinů HIV-1 ve virové patogenezi a interakcích hostitel-patogen". Cell Res. 15 (11–12): 923–34. doi:10.1038 / sj.cr.7290370. PMID 16354571.
Sporák V, Verhasselt B (2006). "Modelování brzlíkových účinků HIV-1 Nef". Curr. HIV Res. 4 (1): 57–64. doi:10.2174/157016206775197583. PMID 16454711.
Matsushima GK, Itoh-Lindstrom Y, Ting JP (1992). „Aktivace genu HLA-DRA v primárních lidských T lymfocytech: nové využití TATA a X a Y promotorových prvků“. Mol. Buňka. Biol. 12 (12): 5610–9. doi:10.1128 / MCB.12.12.5610. PMC 360500. PMID 1448091.
Schaiff WT, Hruska KA, McCourt DW a kol. (1992). „HLA-DR se asociuje se specifickými stresovými proteiny a je zadržován v endoplazmatickém retikulu v negativních buňkách invariantního řetězce“. J. Exp. Med. 176 (3): 657–66. doi:10.1084 / jem.176.3.657. PMC 2119345. PMID 1512535.
Piatier-Tonneau D, Gastinel LN, Amblard F a kol. (1991). "Interakce CD4 s antigeny HLA třídy II a HIV gp120". Imunogenetika. 34 (2): 121–8. doi:10.1007 / BF00211424. PMID 1869305. S2CID 10116507.
Nong Y, Kandil O, Tobin EH a kol. (1991). „Základní protein HIV p24 inhibuje interferonem-gama indukované zvýšení hladin mRNA těžkého řetězce HLA-DR a cytochromu b v lidské monocytové buněčné linii THP1“. Buňka. Immunol. 132 (1): 10–6. doi:10.1016 / 0008-8749 (91) 90002-S. PMID 1905983.
Rosenstein Y, Burakoff SJ, Herrmann SH (1990). „HIV-gp120 může blokovat adhezi zprostředkovanou MHC třídy II MHC“. J. Immunol. 144 (2): 526–31. PMID 1967269.
Callahan KM, Fort MM, Obah EA a kol. (1990). „Genetická variabilita HIV-1 gp120 ovlivňuje interakce s molekulami HLA a receptorem T buněk“. J. Immunol. 144 (9): 3341–6. PMID 1970352.
Bowman MR, MacFerrin KD, Schreiber SL, Burakoff SJ (1991). „Identifikace a strukturní analýza zbytků v oblasti V1 CD4 podílejících se na interakci s obalovým glykoproteinem gp120 viru lidské imunodeficience a hlavními molekulami histokompatibilního komplexu třídy II“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 87 (22): 9052–6. doi:10.1073 / pnas.87.22.9052. PMC 55099. PMID 1978941.
Koppelman B, Cresswell P (1990). „Rychlá nelysozomální degradace sestavených glykoproteinů třídy II HLA zahrnujících mutantní DR alfa řetězec“. J. Immunol. 145 (8): 2730–6. PMID 2212658.
Clayton LK, Sieh M, Pious DA, Reinherz EL (1989). "Identifikace lidských zbytků CD4 ovlivňujících MHC třídy II versus vazba HIV-1 gp120". Příroda. 339 (6225): 548–51. Bibcode:1989 Natur.339..548C. doi:10.1038 / 339548a0. PMID 2543930. S2CID 4246781.
Diamond DC, Sleckman BP, Gregory T a kol. (1988). "Inhibice funkce CD4 + T buněk pomocí HIV obalového proteinu, gp120". J. Immunol. 141 (11): 3715–7. PMID 2846691.
Tjernlund U, Scheynius A, Johansson C a kol. (1989). „Reakce T-buněk na purifikovaný proteinový derivát po odstranění Langerhansových buněk ze suspenzí epidermálních buněk obsahujících keratinocyty exprimující transplantační antigeny třídy II“. Scand. J. Immunol. 28 (6): 667–73. doi:10.1111 / j.1365-3083.1988.tb01500.x. PMID 3266023. S2CID 25824282.
Andrieu JM, Even P, Venet A (1986). „AIDS a příbuzné syndromy jako autoimunitní onemocnění imunitního systému vyvolané viry: porucha anti-MHC II. Terapeutické důsledky“. Výzkum AIDS. 2 (3): 163–74. doi:10.1089 / podpora.1.1986.2.163. PMID 3489470.
Das HK, Lawrance SK, Weissman SM (1983). "Struktura a nukleotidová sekvence genu těžkého řetězce HLA-DR". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 80 (12): 3543–7. Bibcode:1983PNAS ... 80,3543D. doi:10.1073 / pnas.80.12.3543. PMC 394085. PMID 6304715.
Schamboeck A, Korman AJ, Kamb A, Strominger JL (1984). "Organizace transkripční jednotky antigenu histokompatibility lidské třídy II: těžký řetězec HLA-DR". Nucleic Acids Res. 11 (24): 8663–75. doi:10.1093 / nar / 11.24.8663. PMC 326615. PMID 6324094.
Das HK, Biro PA, Cohen SN a kol. (1983). „Použití syntetických oligonukleotidových sond komplementárních s geny pro lidský HLA-DR alfa a beta jako extenzní primery pro izolaci 5'-specifických genomových klonů“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 80 (6): 1531–5. Bibcode:1983PNAS ... 80.1531D. doi:10.1073 / pnas.80.6.1531. PMC 393635. PMID 6403940.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000228987, ENSG00000230726, ENSG00000204287, ENSG00000227993, ENSG00000226260, ENSG00000234794 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000206308, ENSG00000228987, ENSG00000230700, ENSG00000230700, ENSG00000230700, ENSG00000230700, ENSG00000230700, - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000036322 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[Entrez_Gene_3122-5] A ^b ^C „Entrez Gene: HLA-DRA major histocompatibility complex, class II, DR alpha“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

Hlavní komplex histokompatibility třídy
MHC třída I	HLA-A HLA-B HLA-C HLA-E HLA-F HLA-G
MHC třídy II	HLA-DM α β HLA-DO α β HLA-DP α1 β1 HLA-DQ α1 α2 β1 β2 β3 HLA-DR α β1 β3 β4 β5
jiný	Lidský leukocytový antigen Drobný histokompatibilní antigen Krevní transfúze Arrestin Calgranulin Systémy lidských krevních skupin Molekuly buněčné adheze Shluk diferenciace