Transkripční faktor Sp2 - Sp2 transcription factor

SP2
Identifikátory
Aliasy	SP2, Sp2, 4930480I16Rik, mKIAA0048, transkripční faktor Sp2
Externí ID	OMIM: 601801 MGI: 1926162 HomoloGene: 2340 Genové karty: SP2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	47,928,957 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	96,982,959 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • vazba histon-deacetylázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů; • vazba nukleové kyseliny; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 Aktivita transkripčního represoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• buněčné jádro;
Biologický proces	• regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace transkripce, DNA-šablony; • imunitní odpověď; • transkripce, chráněná DNA; • růst mnohobuněčných organismů; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6668
	78912
	ENSG00000167182
	ENSMUSG00000018678
	Q02086; Q9BRW5
	Q9D2H6
	NM_003110
	NM_001080964; NM_030220; NM_001363225; NM_001363226
	NP_003101
	NP_001074433; NP_084496; NP_001350154; NP_001350155
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Transkripční faktor Sp2 je protein že u lidí je kódován SP2 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Tento gen kóduje člena podrodiny Sp transkripčních faktorů Sp / XKLF. Proteiny rodiny Sp jsou sekvenčně specifické proteiny vázající DNA charakterizované amino-terminální trans-aktivační doménou a třemi motivy karboxy-terminálních zinkových prstů. Tento protein obsahuje nejméně konzervovanou doménu vázající DNA v podskupině proteinů Sp a jeho DNA sekvenční specificita se liší od ostatních proteinů Sp. Lokalizuje se primárně v subnukleárních ohniskách spojených s jadernou matricí a může aktivovat nebo v některých případech potlačovat expresi od různých promotorů.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že transkripční faktor Sp2 komunikovat s E2F1.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000167182 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000018678 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Kingsley C, Winoto A (říjen 1992). „Klonování proteinů vázajících GT box: nová multigenní rodina Sp1 regulující expresi genu pro receptor T-buněk“. Mol Cell Biol. 12 (10): 4251–61. doi:10.1128 / mcb.12.10.4251. PMC 360348. PMID 1341900.
^ Scohy S, Van Vooren P, Szpirer C, Szpirer J (říjen 1998). „Přiřazení1 genů Sp krycím chromozomovým pásmům 7q36 (Sp1), 10q31 → q32.1 (Sp2), 3q24 → q31 (Sp3) a 6q33 (Sp4) a genu SP2 lidským chromozomovým pásmům 17q21.3 → q22 in hybridizace situ “. Cytogenet Cell Genet. 81 (3–4): 273–4. doi:10.1159/000015044. PMID 9730617. S2CID 46786094.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SP2 Sp2 transkripční faktor“.
^ Rotheneder H, Geymayer S, Haidweger E (listopad 1999). "Transkripční faktory rodiny Sp1: interakce s E2F a regulace promotoru myší thymidinkinázy". J. Mol. Biol. 293 (5): 1005–15. doi:10.1006 / jmbi.1999.3213. PMID 10547281.

Další čtení

Philipsen S, Suske G (1999). „Příběh tří prstů: rodina savčích transkripčních faktorů Sp / XKLF“. Nucleic Acids Res. 27 (15): 2991–3000. doi:10.1093 / nar / 27.15.2991. PMC 148522. PMID 10454592.
Nomura N, Nagase T, Miyajima N, Sazuka T, Tanaka A, Sato S, Seki N, Kawarabayasi Y, Ishikawa K, Tabata S (1995). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. II. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0041-KIAA0080) odvozené analýzou klonů cDNA z lidské buněčné linie KG-1“. DNA Res. 1 (5): 223–9. doi:10.1093 / dnares / 1.5.223. PMID 7584044.
Rotheneder H, Geymayer S, Haidweger E (2000). "Transkripční faktory rodiny Sp1: interakce s E2F a regulace promotoru myší thymidinkinázy". J. Mol. Biol. 293 (5): 1005–15. doi:10.1006 / jmbi.1999.3213. PMID 10547281.
Moorefield KS, Fry SJ, Horowitz JM (2004). „Sp2 DNA vazebná aktivita a trans-aktivace jsou negativně regulovány v savčích buňkách“. J. Biol. Chem. 279 (14): 13911–24. doi:10,1074 / jbc.M313589200. PMID 14726517.
Phan D, Cheng CJ, Galfione M, Vakar-Lopez F, Tunstead J, Thompson NE, Burgess RR, Najjar SM, Yu-Lee LY, Lin SH (2004). „Identifikace Sp2 jako transkripčního represoru molekuly adheze buněk 1 související s karcinoembryonálním antigenem v tumorigenezi“. Cancer Res. 64 (9): 3072–8. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-03-3730. PMID 15126343.
Phillips RJ, Tyson-Capper Née Pollard AJ, Bailey J, Robson SC, Europe-Finner GN (2005). „Regulace exprese genu pro receptor choriového gonadotropinu / luteinizačního hormonu v lidském myometriu: zapojení specificity proteinu-1 (Sp1), Sp3, Sp4, proteinů podobných Sp a histonových deacetyláz“. J. Clin. Endokrinol. Metab. 90 (6): 3479–90. doi:10.1210 / jc. 2004-1962. PMID 15788387.
Lee YC, Higashi Y, Luu C, Shimizu C, Strott CA (2005). „Prvky Sp1 v promotoru SULT2B1b a 5'-nepřekládaná oblast mRNA: indukce Sp1 / Sp2 a augmentace inhibicí histon-deacetylázy“. FEBS Lett. 579 (17): 3639–45. doi:10.1016 / j.febslet.2005.05.041. PMID 15953604. S2CID 22203267.
Simmons SO, Horowitz JM (2006). „Nkx3.1 váže a negativně reguluje transkripční aktivitu členů rodiny Sp v buňkách získaných z prostaty“. Biochem. J. 393 (Pt 1): 397–409. doi:10.1042 / BJ20051030. PMC 1383699. PMID 16201967.
Moorefield KS, Yin H, Nichols TD, Cathcart C, Simmons SO, Horowitz JM (2006). "Sp2 se lokalizuje do subnukleárních ložisek spojených s jadernou matricí". Mol. Biol. Buňka. 17 (4): 1711–22. doi:10,1091 / mbc.E05-11-1063. PMC 1415311. PMID 16467376.
Das A, Fernandez-Zapico ME, Cao S, Yao J, Fiorucci S, Hebbel RP, Urrutia R, Shah VH (2007). „Pro migraci endoteliálních buněk vyvolanou receptorem farnesoid X je nutné narušení komplexu pro represi SP2 / KLF6 SHP“. J. Biol. Chem. 281 (51): 39105–13. doi:10,1074 / jbc.M607720200. PMID 17071613.

externí odkazy

Sp2 + transkripce + faktor v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
FactorBook SP2

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000167182 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000018678 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1341900-5] Kingsley C, Winoto A (říjen 1992). „Klonování proteinů vázajících GT box: nová multigenní rodina Sp1 regulující expresi genu pro receptor T-buněk“. Mol Cell Biol. 12 (10): 4251–61. doi:10.1128 / mcb.12.10.4251. PMC 360348. PMID 1341900.

[pmid9730617-6] Scohy S, Van Vooren P, Szpirer C, Szpirer J (říjen 1998). „Přiřazení1 genů Sp krycím chromozomovým pásmům 7q36 (Sp1), 10q31 → q32.1 (Sp2), 3q24 → q31 (Sp3) a 6q33 (Sp4) a genu SP2 lidským chromozomovým pásmům 17q21.3 → q22 in hybridizace situ “. Cytogenet Cell Genet. 81 (3–4): 273–4. doi:10.1159/000015044. PMID 9730617. S2CID 46786094.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: SP2 Sp2 transkripční faktor“.

[pmid10547281-8] Rotheneder H, Geymayer S, Haidweger E (listopad 1999). "Transkripční faktory rodiny Sp1: interakce s E2F a regulace promotoru myší thymidinkinázy". J. Mol. Biol. 293 (5): 1005–15. doi:10.1006 / jmbi.1999.3213. PMID 10547281.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]