DPF2 - DPF2

DPF2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3IUF
Identifikátory
Aliasy	DPF2, REQ, UBID4, ubi-d4, dvojité prsty PHD 2, CSS7
Externí ID	OMIM: 601671 MGI: 109529 HomoloGene: 21265 Genové karty: DPF2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	65,354,262 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 19 (myš)
Konec	5,913,010 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba kovových iontů; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba nukleové kyseliny; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: Aktivita transkripčního corepresoru 0001106; • aktivita histon acetyltransferázy; • histonová vazba; • H3K9me3 modifikovaná vazba histonu; • vázání histonu na lysin-acetylovaný;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • nukleoplazma; • intracelulární membránou vázaná organela; • centrosome; • nukleární chromatin; • cytoplazma; • cytosol; • komplex histon-acetyltransferáza; • komplex nBAF;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • apoptotická signální cesta; • apoptotický proces; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • organizace chromatinu; • vývoj nervového systému; • acetylace histonů; • negativní regulace transkripce, DNA-šablony; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • negativní regulace diferenciace myeloidních progenitorových buněk;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5977
	19708
	ENSG00000133884
	ENSMUSG00000024826
	Q92785
	Q61103
	NM_006268; NM_001330308
	NM_001291078; NM_011262
	NP_001317237; NP_006259; NP_006259.1
	NP_001278007; NP_035392
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein se zinkovým prstem ubi-d4 je protein že u lidí je kódován DPF2 gen.^[5]^[6]

Protein kódovaný tímto genem je členem rodiny domén d4, která se vyznačuje strukturním motivem podobným zinkovým prstům. Tento protein funguje jako a transkripční faktor který je nezbytný pro apoptotický reakce po zbavení faktorů přežití. Pravděpodobně rychle plní regulační roli krvetvorné růst a obrat buněk. Tento gen je považován za kandidátský gen pro mnohočetná endokrinní neoplazie typu I, zděděný rakovina syndrom zahrnující více příštítná tělíska, enteropankreatické a hypofýza nádory.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000133884 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000024826 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ninkina NN, Mertsalov IB, Kulikova DA, Alimova-Kost MV, Simonova OB, Korochkin LI, Kiselev SL, Buchman VL (únor 2002). "Cerd4, třetí člen rodiny genů d4: exprese a organizace genomového lokusu". Mamm genom. 12 (11): 862–6. doi:10.1007 / s00335-001-3039-1. PMID 11845289. S2CID 2149578.
^ ^A ^b "Entrez Gene: DPF2 D4, zinek a dvojité PHD prsty rodina 2".

Další čtení

Gabig TG, Mantel PL, Rosli R, Crean CD (1994). „Requiem: nový gen zinkového prstu nezbytný pro apoptózu v myeloidních buňkách“. J. Biol. Chem. 269 (47): 29515–9. PMID 7961935.
Chestkov AV, Baka ID, Kost MV a kol. (1997). "Rodina genů d4 v lidském genomu". Genomika. 36 (1): 174–7. doi:10.1006 / geno.1996.0440. PMID 8812431.
Guru SC, Agarwal SK, Manickam P a kol. (1997). „Mapa přepisu pro oblast 2,8 Mb obsahující lokus typu endokrinní neoplazie typu 1“. Genome Res. 7 (7): 725–35. doi:10,1101 / gr. 7.7.725. PMC 310681. PMID 9253601.
Gabig TG, Crean CD, Klenk A a kol. (1998). "Exprese a chromozomální lokalizace genu Requiem". Mamm. Genom. 9 (8): 660–5. doi:10,1007 / s003359900840. PMID 9680388. S2CID 22559464.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H a kol. (2004). "Fyzická a funkční mapa lidské signální transdukční dráhy TNF-alfa / NF-kappa B". Nat. Cell Biol. 6 (2): 97–105. doi:10.1038 / ncb1086. PMID 14743216. S2CID 11683986.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

externí odkazy

DPF2 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000133884 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000024826 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11845289-5] Ninkina NN, Mertsalov IB, Kulikova DA, Alimova-Kost MV, Simonova OB, Korochkin LI, Kiselev SL, Buchman VL (únor 2002). "Cerd4, třetí člen rodiny genů d4: exprese a organizace genomového lokusu". Mamm genom. 12 (11): 862–6. doi:10.1007 / s00335-001-3039-1. PMID 11845289. S2CID 2149578.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: DPF2 D4, zinek a dvojité PHD prsty rodina 2".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]