HVCN1 - HVCN1 - Wikipedia

HVCN1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3A2A
Identifikátory
Aliasy	HVCN1, HV1, VSOP, kanál vodíku s hradlem 1
Externí ID	OMIM: 611227 MGI: 1921346 HomoloGene: 12535 Genové karty: HVCN1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	110,704,950 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	122,242,297 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita iontového kanálu; • aktivita napěťově řízeného kationtového kanálu; • napěťově řízená aktivita iontového kanálu; • napěťově řízená aktivita protonového kanálu; • identická vazba na protein;
Buněčná složka	• membrána; • integrální součást membrány; • buněčná membrána; • sekreční granulovaná membrána; • specifická granulovaná membrána; • integrální součást plazmatické membrány; • membrána fagocytických vezikul;
Biologický proces	• transmembránová doprava; • regulace iontového transmembránového transportu; • buněčná odpověď na pH; • reakce na iont zinku; • iontový transport; • buněčná odpověď na iont zinku; • rozpoznání spermie-vajíčka; • reakce na pH; • degranulace neutrofilů; • transmembránový transport vodíkových iontů; • redoxní homeostáza buněk;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	84329
	74096
	ENSG00000122986
	ENSMUSG00000064267
	Q96D96
	Q3U2S8
	NM_001040107; NM_001256413; NM_032369
	NM_001042489; NM_028752; NM_001359454
	NP_001035196; NP_001243342; NP_115745
	NP_001035954; NP_083028; NP_001346383
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Vodíkový kanál napěťově řízený 1 je protein že u lidí je kódován HVCN1 gen.

Vodíkový kanál 1 řízený napětím je a napěťově řízený protonový kanál to bylo prokázáno, že umožňuje transport protonů do fagozomy^[5]^[6] az mnoha typů buněk včetně spermie, elektricky vzrušující buňky a respirační epitel buňky.^[7] Kanál HVCN1, který vede proton, má pouze transmembránové domény odpovídající doménám pro snímání napětí S1-S4 (VSD) napěťově řízené draslíkové kanály a napěťově řízené sodíkové kanály.^[8] Molekulární simulace je v souladu s póry naplněnými vodou, které mohou fungovat jakovodní drát "pro umožnění vodíkové vazby H⁺ překročit membránu.^[9]^[10] Mutace Asp112 v lidském Hv1 však vede k prostupu aniontu, což naznačuje, že povinná protonace Asp produkuje protonovou selektivitu.^[11] Kvantové mechanické výpočty ukazují, že interakce Asp-Arg může vyvolat protonově selektivní permeaci.^[12] Ukázalo se, že protein HVCN1 existuje jako dimer se dvěma funkčními póry.^[13]^[14] Stejně jako ostatní kanály VSD, kanály HVCN1 vedou ionty asi 1000krát pomaleji než kanály tvořené tetramerickými centrálními póry S5-S6.^[15]

Jako drogový cíl

Malá molekula Inhibitory kanálu HVCN1 jsou vyvíjeny jako chemoterapeutika a protizánětlivý agenti.^[16]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000122986 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000064267 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Murphy R, DeCoursey TE (srpen 2006). „Kompenzace poplatku během dechu fagocytů“. Biochim. Biophys. Acta. 1757 (8): 996–1011. doi:10.1016 / j.bbabio.2006.01.005. PMID 16483534.
^ Capasso M, Bhamrah MK, Henley T, Boyd RS, Langlais C, Cain K, Dinsdale D, Pulford K, Khan M, Musset B, Cherny VV, Morgan D, Gascoyne RD, Vigorito E, DeCoursey TE, MacLennan IC, Dyer MJ (Březen 2010). „HVCN1 moduluje sílu signálu BCR regulací BCR-závislé generace reaktivních forem kyslíku“. Nat. Immunol. 11 (3): 265–72. doi:10.1038 / ni.1843. PMC 3030552. PMID 20139987.
^ Capasso M, DeCoursey TE, Dyer MJ (leden 2011). „Regulace pH a další: neočekávané funkce pro napěťově řízený protonový kanál, HVCN1“. Trends Cell Biol. 21 (1): 20–8. doi:10.1016 / j.tcb.2010.09.006. PMC 3014425. PMID 20961760.
^ Lee SY, Letts JA, MacKinnon R (duben 2009). "Funkční rekonstituce purifikovaných lidských Hv1 H + kanálů". J. Mol. Biol. 387 (5): 1055–60. doi:10.1016 / j.jmb.2009.02.034. PMC 2778278. PMID 19233200.
^ Wood ML, Schow EV, Freites JA, White SH, Tombola F, Tobias DJ (únor 2012). „Vodní dráty v atomistických modelech protonového kanálu Hv1“. Biochim. Biophys. Acta. 1818 (2): 286–93. doi:10.1016 / j.bbamem.2011.07.045. PMC 3245885. PMID 21843503.
^ Ramsey IS, Mokrab Y, Carvacho I, Sands ZA, Sansom MS, Clapham DE (červenec 2010). „Vodná cesta prostupnosti H + v napěťově řízeném protonovém kanálu Hv1“. Nat. Struct. Mol. Biol. 17 (7): 869–75. doi:10.1038 / nsmb.1826. PMC 4035905. PMID 20543828.
^ Musset, B; Smith, SM; Rajan, S; Morgan, D; Cherny, VV; Decoursey, TE (23. října 2011). „Aspartát 112 je selektivní filtr protonového kanálu řízeného lidským napětím“. Příroda. 480 (7376): 273–7. doi:10.1038 / příroda10557. PMC 3237871. PMID 22020278.
^ Dudev, T; Musset, B; Morgan, D; Cherny, VV; Smith, SM; Mazmanian, K; DeCoursey, TE; Lim, C (8. května 2015). „Selektivní mechanismus napěťově řízeného protonového kanálu, HV1“. Vědecké zprávy. 5: 10320. doi:10.1038 / srep10320. PMC 4429351. PMID 25955978.
^ Gonzalez C, Koch HP, Drum BM, Larsson HP (leden 2010). "Silná spolupráce mezi podjednotkami v napěťově řízených protonových kanálech". Nat. Struct. Mol. Biol. 17 (1): 51–6. doi:10.1038 / nsmb.1739. PMC 2935852. PMID 20023639.
^ Tombola F, Ulbrich MH, Kohout SC, Isacoff EY (leden 2010). „Otevření dvou pórů napěťově řízeného protonového kanálu Hv1 je vyladěno kooperativitou“. Nat. Struct. Mol. Biol. 17 (1): 44–50. doi:10.1038 / nsmb.1738. PMC 2925041. PMID 20023640.
^ DeCoursey TE (listopad 2008). „Napěťově řízené protonové kanály: co dál?“. J. Physiol. 586 (Pt 22): 5305–24. doi:10.1113 / jphysiol.2008.161703. PMC 2655391. PMID 18801839.
^ Hong L, Pathak MM, Kim IH, Ta D, Tombola F (leden 2013). "Doména snímající napětí napěťově řízeného protonového kanálu Hv1 sdílí mechanismus bloku s doménami pórů". Neuron. 77 (2): 274–87. doi:10.1016 / j.neuron.2012.11.013. PMC 3559007. PMID 23352164.

Další čtení

Li SJ, Zhao Q, Zhou Q a kol. (2010). „Role a struktura karboxylové koncové domény lidského napěťově řízeného protonového kanálu Hv1“. J. Biol. Chem. 285 (16): 12047–54. doi:10.1074 / jbc.M109.040360. PMC 2852942. PMID 20147290.
Musset B, Smith SM, Rajan S a kol. (2010). "Oligomerizace napěťově řízeného protonového kanálu". Kanály (Austin). 4 (4): 260–5. doi:10,4161 / kan.4.4.12789. PMC 3025757. PMID 20676047.
Lishko PV, Botchkina IL, Fedorenko A, Kirichok Y (2010). „Vytlačování kyselin z lidských spermií je zprostředkováno bičíkovým napěťově řízeným protonovým kanálem“. Buňka. 140 (3): 327–37. doi:10.1016 / j.cell.2009.12.053. PMID 20144758. S2CID 7952753.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Musset B, Capasso M, Cherny VV a kol. (2010). „Identifikace Thr29 jako kritického fosforylačního místa, které aktivuje lidský protonový kanál Hvcn1 v leukocytech“. J. Biol. Chem. 285 (8): 5117–21. doi:10.1074 / jbc.C109.082727. PMC 2820736. PMID 20037153.
Petheo GL, Orient A, Baráth M a kol. (2010). "Molekulární a funkční charakterizace protonového kanálu Hv1 v lidských granulocytech". PLOS ONE. 5 (11): e14081. doi:10.1371 / journal.pone.0014081. PMC 2990768. PMID 21124855.
Sasaki M, Takagi M, Okamura Y (2006). "Napěťový senzorový doménový protein je napěťově řízený protonový kanál". Věda. 312 (5773): 589–92. doi:10.1126 / science.1122352. PMID 16556803. S2CID 10259815.
Lee SY, Letts JA, Mackinnon R (2008). „Dimerická podjednotka stechiometrie lidského napěťově závislého protonového kanálu Hv1“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 105 (22): 7692–5. doi:10.1073 / pnas.0803277105. PMC 2409406. PMID 18509058.
Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M a kol. (2004). „Porovnání sekvencí lidských a myších genů odhaluje homologní blokovou strukturu v promotorových oblastech“. Genome Res. 14 (9): 1711–8. doi:10,1101 / gr. 2435604. PMC 515316. PMID 15342556.
Li SJ, Zhao Q, Zhou Q, Zhai Y (2009). „Exprese, čištění, krystalizace a předběžná krystalografická studie karboxylové koncové domény lidského napěťově řízeného protonového kanálu Hv1“. Acta Crystallographica oddíl F. 65 (Pt 3): 279–81. doi:10.1107 / S1744309109003777. PMC 2650464. PMID 19255483.
Suenaga T, Arase H, Yamasaki S a kol. (2007). "Klonování membránově specifické membránové tetraspanningové molekuly BTS mající inhibiční funkci pro proliferaci B buněk". Eur. J. Immunol. 37 (11): 3197–207. doi:10.1002 / eji.200737052. PMID 17948262. S2CID 25376411.
Iovannisci D, Illek B, Fischer H (2010). „Funkce protonového kanálu HVCN1 v epitelu dýchacích cest a přirozeně se vyskytující mutace, M91T“. J. Gen. Physiol. 136 (1): 35–46. doi:10.1085 / jgp.200910379. PMC 2894549. PMID 20548053.
Clark HF, Gurney AL, Abaya E a kol. (2003). „Iniciativa pro objevování vylučovaných proteinů (SPDI), rozsáhlé úsilí o identifikaci nových lidských vylučovaných a transmembránových proteinů: hodnocení bioinformatiky“. Genome Res. 13 (10): 2265–70. doi:10,1101 / gr. 1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
Musset B, Cherny VV, Morgan D a kol. (2008). "Podrobné srovnání vyjádřených a nativních napěťově řízených proudů protonového kanálu". J. Physiol. 586 (10): 2477–86. doi:10.1113 / jphysiol.2007.149427. PMC 2464343. PMID 18356202.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2002). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ramsey IS, Moran MM, Chong JA, Clapham DE (2006). „Napěťově řízený protonově selektivní kanál postrádající doménu pórů“. Příroda. 440 (7088): 1213–6. doi:10.1038 / nature04700. PMC 4084761. PMID 16554753.
Sakata S, Kurokawa T, Nørholm MH, et al. (2010). "Funkčnost napěťově řízeného protonového kanálu zkráceného v S4". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 107 (5): 2313–8. doi:10.1073 / pnas.0911868107. PMC 2836681. PMID 20018719.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000122986 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000064267 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid16483534-5] Murphy R, DeCoursey TE (srpen 2006). „Kompenzace poplatku během dechu fagocytů“. Biochim. Biophys. Acta. 1757 (8): 996–1011. doi:10.1016 / j.bbabio.2006.01.005. PMID 16483534.

[pmid20139987-6] Capasso M, Bhamrah MK, Henley T, Boyd RS, Langlais C, Cain K, Dinsdale D, Pulford K, Khan M, Musset B, Cherny VV, Morgan D, Gascoyne RD, Vigorito E, DeCoursey TE, MacLennan IC, Dyer MJ (Březen 2010). „HVCN1 moduluje sílu signálu BCR regulací BCR-závislé generace reaktivních forem kyslíku“. Nat. Immunol. 11 (3): 265–72. doi:10.1038 / ni.1843. PMC 3030552. PMID 20139987.

[pmid20961760-7] Capasso M, DeCoursey TE, Dyer MJ (leden 2011). „Regulace pH a další: neočekávané funkce pro napěťově řízený protonový kanál, HVCN1“. Trends Cell Biol. 21 (1): 20–8. doi:10.1016 / j.tcb.2010.09.006. PMC 3014425. PMID 20961760.

[pmid19233200-8] Lee SY, Letts JA, MacKinnon R (duben 2009). "Funkční rekonstituce purifikovaných lidských Hv1 H + kanálů". J. Mol. Biol. 387 (5): 1055–60. doi:10.1016 / j.jmb.2009.02.034. PMC 2778278. PMID 19233200.

[pmid21843503-9] Wood ML, Schow EV, Freites JA, White SH, Tombola F, Tobias DJ (únor 2012). „Vodní dráty v atomistických modelech protonového kanálu Hv1“. Biochim. Biophys. Acta. 1818 (2): 286–93. doi:10.1016 / j.bbamem.2011.07.045. PMC 3245885. PMID 21843503.

[pmid20543828-10] Ramsey IS, Mokrab Y, Carvacho I, Sands ZA, Sansom MS, Clapham DE (červenec 2010). „Vodná cesta prostupnosti H + v napěťově řízeném protonovém kanálu Hv1“. Nat. Struct. Mol. Biol. 17 (7): 869–75. doi:10.1038 / nsmb.1826. PMC 4035905. PMID 20543828.

[11] Musset, B; Smith, SM; Rajan, S; Morgan, D; Cherny, VV; Decoursey, TE (23. října 2011). „Aspartát 112 je selektivní filtr protonového kanálu řízeného lidským napětím“. Příroda. 480 (7376): 273–7. doi:10.1038 / příroda10557. PMC 3237871. PMID 22020278.

[12] Dudev, T; Musset, B; Morgan, D; Cherny, VV; Smith, SM; Mazmanian, K; DeCoursey, TE; Lim, C (8. května 2015). „Selektivní mechanismus napěťově řízeného protonového kanálu, HV1“. Vědecké zprávy. 5: 10320. doi:10.1038 / srep10320. PMC 4429351. PMID 25955978.

[pmid20023639-13] Gonzalez C, Koch HP, Drum BM, Larsson HP (leden 2010). "Silná spolupráce mezi podjednotkami v napěťově řízených protonových kanálech". Nat. Struct. Mol. Biol. 17 (1): 51–6. doi:10.1038 / nsmb.1739. PMC 2935852. PMID 20023639.

[pmid20023640-14] Tombola F, Ulbrich MH, Kohout SC, Isacoff EY (leden 2010). „Otevření dvou pórů napěťově řízeného protonového kanálu Hv1 je vyladěno kooperativitou“. Nat. Struct. Mol. Biol. 17 (1): 44–50. doi:10.1038 / nsmb.1738. PMC 2925041. PMID 20023640.

[pmid18801839-15] DeCoursey TE (listopad 2008). „Napěťově řízené protonové kanály: co dál?“. J. Physiol. 586 (Pt 22): 5305–24. doi:10.1113 / jphysiol.2008.161703. PMC 2655391. PMID 18801839.

[pmid23352164-16] Hong L, Pathak MM, Kim IH, Ta D, Tombola F (leden 2013). "Doména snímající napětí napěťově řízeného protonového kanálu Hv1 sdílí mechanismus bloku s doménami pórů". Neuron. 77 (2): 274–87. doi:10.1016 / j.neuron.2012.11.013. PMC 3559007. PMID 23352164.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]