KCND2 - KCND2

KCND2
Identifikátory
Aliasy	KCND2, KV4.2, RK5, draslíková napěťově řízená kanálová podrodina D člen 2
Externí ID	OMIM: 605410 MGI: 102663 HomoloGene: 40828 Genové karty: KCND2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	120,750,337 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	21,729,805 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita draslíkového kanálu; • vazba kovových iontů; • napěťově řízená aktivita iontového kanálu; • aktivita iontového kanálu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Aktivita draselného kanálu typu A (přechodně směrem ven); • napěťově řízená aktivita draslíkového kanálu; • napěťově řízená aktivita iontového kanálu zapojená do regulace postsynaptického membránového potenciálu;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • perikaryon; • postsynaptická membrána; • buněčná projekce; • membrána; • raft plazmové membrány; • vnitřní složka plazmatické membrány; • komplex draslíkových kanálů s napětím; • buněčná membrána; • dendritická páteř; • synapse; • integrální součást plazmatické membrány; • neuronální buněčná tělesná membrána; • buněčné spojení; • tělo neuronových buněk; • dendrit; • glutamátergická synapse; • GABA-ergická synapse; • integrální součást postsynaptické membrány; • integrální součást postsynaptické specializační membrány; • GO: 0097483, GO: 0097481 postsynaptická hustota;
Biologický proces	• chemický synaptický přenos; • regulace iontového transmembránového transportu; • iontový transport; • transport iontů draslíku; • transmembránová doprava; • transmembránový transport draselných iontů; • akční potenciál; • nocicepce; • homooligomerizace bílkovin; • buněčná odpověď na hypoxii; • neuronový akční potenciál; • pohybový rytmus; • postsynaptický potenciál; • srdeční vedení;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3751
	16508
	ENSG00000184408
	ENSMUSG00000060882
	Q9NZV8
	Q9Z0V2
	NM_012281
	NM_019697
	NP_036413
	NP_062671
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Draslík napěťově řízený kanál podrodiny D člen 2 je protein že u lidí je kódován KCND2 gen.^[5]^[6]^[7] Přispívá k srdeční přechodný vnější proud draslíku (Já_{do 1}), hlavní přispívající proud do repolarizující fáze 1 srdečního akčního potenciálu.^[8]

Popis

Napěťově řízené draselné (Kv) kanály představují nejsložitější třídu napěťově řízených iontových kanálů z funkčního i strukturálního hlediska. Mezi jejich různé funkce patří regulace uvolňování neurotransmiterů, srdeční frekvence, sekrece inzulínu, neuronální excitabilita, transport elektrolytu epitelu, kontrakce hladkého svalstva a objem buněk. V Drosophile byly identifikovány čtyři geny draslíkových kanálů související se sekvencí - třepačka, shaw, shab a shal - a u každého bylo prokázáno, že má lidský homolog (y). Tento gen kóduje člena draslíkového kanálu, napěťově řízenou podrodinu související se šálem, jejíž členové tvoří napěťově aktivované draselné iontové kanály typu A a jsou prominentní ve fázi repolarizace akčního potenciálu. Tento člen zprostředkovává rychle inaktivující vnější proud draslíku typu A, který není pod kontrolou N-konce, jako je tomu v Shakerových kanálech.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že KCND2 komunikovat s FLNC.^[9]

Viz také

Napěťově řízený draslíkový kanál

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000184408 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000060882 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Zhu XR, Wulf A, Schwarz M, Isbrandt D, Pongs O (prosinec 1999). "Charakterizace lidského Kv4.2 zprostředkující rychle inaktivující přechodný napěťově citlivý proud K +". Kanály receptorů. 6 (5): 387–400. PMID 10551270.
^ Gutman GA, Chandy KG, Grissmer S, Lazdunski M, McKinnon D, Pardo LA, Robertson GA, Rudy B, Sanguinetti MC, Stuhmer W, Wang X (prosinec 2005). "International Union of Pharmacology. LIII. Nomenklatura and molekulární vztahy napěťově řízených draslíkových kanálů". Pharmacol Rev. 57 (4): 473–508. doi:10.1124 / pr.57.4.10. PMID 16382104. S2CID 219195192.
^ ^A ^b „Entrez Gene: KCND2 draslíkový napěťově řízený kanál, Shalova podrodina, člen 2“.
^ Oudit GY, Kassiri Z, Sah R, Ramirez RJ, Zobel C, Backx PH (květen 2001). "Molekulární fyziologie srdečního přechodného vnějšího draslíkového proudu (I (do)) v normálním a nemocném myokardu". J. Mol. Buňka. Cardiol. 33 (5): 851–872. doi:10.1006 / jmcc.2001.1376. PMID 11343410. S2CID 829154.
^ Petrecca, K; Miller DM; Shrier A (prosinec 2000). „Lokalizace a zvýšená proudová hustota draselného kanálu Kv4.2 interakcí s aktin-vazebným proteinovým filaminem“. J. Neurosci. 20 (23): 8736–44. doi:10.1523 / JNEUROSCI.20-23-08736.2000. PMC 6773047. PMID 11102480.

Další čtení

Kong W, Po S, Yamagishi T a kol. (1999). „Izolace a charakterizace lidského genu kódujícího Ito: další diverzita alternativním sestřihem mRNA“. Dopoledne. J. Physiol. 275 (6 Pt 2): H1963–70. doi:10.1152 / ajpheart.1998.275.6.H1963. PMID 9843794.
Kikuno R, Nagase T, Ishikawa K a kol. (1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XIV. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 6 (3): 197–205. doi:10.1093 / dnares / 6.3.197. PMID 10470851.
Kurschner C, Yuzaki M (1999). „Neuronální interleukin-16 (NIL-16): protein s dvojí funkcí PDZ domény“. J. Neurosci. 19 (18): 7770–80. doi:10.1523 / JNEUROSCI.19-18-07770.1999. PMC 6782450. PMID 10479680.
WF, Bowlby MR, Betty M a kol. (2000). "Modulace draslíkových kanálů typu A rodinou senzorů vápníku". Příroda. 403 (6769): 553–556. Bibcode:2000Natur.403..553A. doi:10.1038/35000592. PMID 10676964. S2CID 4419472.
Isbrandt D, Leicher T, Waldschütz R a kol. (2000). „Genové struktury a profily exprese tří lidských draselných kanálů KCND (Kv4) zprostředkujících proudy typu A (TO) a I (SA)“. Genomika. 64 (2): 144–154. doi:10,1006 / geno.2000.6117. PMID 10729221. S2CID 1429910.
Postma AV, Bezzina CR, de Vries JF, et al. (2000). "Genomická organizace a chromozomální lokalizace dvou členů rodiny iontových kanálů KCND, KCND2 a KCND3". Hučení. Genet. 106 (6): 614–619. doi:10,1007 / s004390050033. PMID 10942109.
Petrecca K, Miller DM, Shrier A (2001). „Lokalizace a zvýšená proudová hustota draselného kanálu Kv4.2 interakcí s aktin-vazebným proteinovým filaminem“. J. Neurosci. 20 (23): 8736–44. doi:10.1523 / JNEUROSCI.20-23-08736.2000. PMC 6773047. PMID 11102480.
Bähring R, Dannenberg J, Peters HC a kol. (2001). "Zachovaná Kv4 N-terminální doména kritická pro účinky proteinu 2.2 ovlivňujícího Kv kanál na expresi kanálu a hradlování". J. Biol. Chem. 276 (26): 23888–23894. doi:10,1074 / jbc.M101320200. PMID 11287421.
Nakamura TY, Pountney DJ, Ozaita A a kol. (2001). „Role frekvenceinu, proteinu vázajícího Ca2 +, jako regulátoru proudů Kv4 K +“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 98 (22): 12808–12813. Bibcode:2001PNAS ... 9812808N. doi:10.1073 / pnas.221168498. PMC 60135. PMID 11606724.
Morohashi Y, Hatano N, Ohya S a kol. (2002). „Molekulární klonování a charakterizace CALP / KChIP4, nového proteinu EF-ruka interagujícího s presenilinem 2 a podjednotkou Kv4 s draslíkovým kanálem řízeným napětím“. J. Biol. Chem. 277 (17): 14965–14975. doi:10,1074 / jbc.M200897200. PMID 11847232.
Eldstrom J, Doerksen KW, Steele DF, Fedida D (2002). "N-koncová doména vázající PDZ v draselných kanálech Kv1". FEBS Lett. 531 (3): 529–537. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03572-X. PMID 12435606. S2CID 40689829.
Schrader LA, Anderson AE, Mayne A a kol. (2002). „PKA modulace draslíkových kanálů typu A kódovaných Kv4.2 vyžaduje vytvoření supramolekulárního komplexu“. J. Neurosci. 22 (23): 10123–33. doi:10.1523 / JNEUROSCI.22-23-10123.2002. PMC 6758737. PMID 12451113.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–16903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Shin BK, Wang H, Yim AM a kol. (2003). „Globální profilování proteomu buněčného povrchu rakovinných buněk odkrývá nadbytek proteinů s chaperonovou funkcí“. J. Biol. Chem. 278 (9): 7607–7616. doi:10,1074 / jbc.M210455200. PMID 12493773.
Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR a kol. (2003). „Lidský chromozom 7: sekvence DNA a biologie“. Věda. 300 (5620): 767–772. Bibcode:2003Sci ... 300..767S. doi:10.1126 / science.1083423. PMC 2882961. PMID 12690205.
Hillier LW, Fulton RS, Fulton LA a kol. (2003). „Sekvence DNA lidského chromozomu 7“. Příroda. 424 (6945): 157–164. Bibcode:2003 Natur.424..157H. doi:10.1038 / nature01782. PMID 12853948.
Wong W, Schlichter LC (2004). „Diferenční nábor Kv1.4 a Kv4.2 na lipidové rafty pomocí PSD-95“. J. Biol. Chem. 279 (1): 444–452. doi:10,1074 / jbc.M304675200. PMID 14559911.
Kim LA, Furst J, Butler MH a kol. (2004). „Ito kanály jsou oktomerní komplexy se čtyřmi podjednotkami každého Kv4.2 a K + kanálu interagujícího s proteinem 2“. J. Biol. Chem. 279 (7): 5549–5554. doi:10,1074 / jbc.M311332200. PMID 14623880.

externí odkazy

Kv4.2 + draslík + kanál v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
KCND2 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000184408 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000060882 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10551270-5] Zhu XR, Wulf A, Schwarz M, Isbrandt D, Pongs O (prosinec 1999). "Charakterizace lidského Kv4.2 zprostředkující rychle inaktivující přechodný napěťově citlivý proud K +". Kanály receptorů. 6 (5): 387–400. PMID 10551270.

[pmid16382104-6] Gutman GA, Chandy KG, Grissmer S, Lazdunski M, McKinnon D, Pardo LA, Robertson GA, Rudy B, Sanguinetti MC, Stuhmer W, Wang X (prosinec 2005). "International Union of Pharmacology. LIII. Nomenklatura and molekulární vztahy napěťově řízených draslíkových kanálů". Pharmacol Rev. 57 (4): 473–508. doi:10.1124 / pr.57.4.10. PMID 16382104. S2CID 219195192.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: KCND2 draslíkový napěťově řízený kanál, Shalova podrodina, člen 2“.

[oudit-8] Oudit GY, Kassiri Z, Sah R, Ramirez RJ, Zobel C, Backx PH (květen 2001). "Molekulární fyziologie srdečního přechodného vnějšího draslíkového proudu (I (do)) v normálním a nemocném myokardu". J. Mol. Buňka. Cardiol. 33 (5): 851–872. doi:10.1006 / jmcc.2001.1376. PMID 11343410. S2CID 829154.

[pmid11102480-9] Petrecca, K; Miller DM; Shrier A (prosinec 2000). „Lokalizace a zvýšená proudová hustota draselného kanálu Kv4.2 interakcí s aktin-vazebným proteinovým filaminem“. J. Neurosci. 20 (23): 8736–44. doi:10.1523 / JNEUROSCI.20-23-08736.2000. PMC 6773047. PMID 11102480.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]