GRIN1 - GRIN1

GRIN1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2HQW, 2NR1, 3BYA, 5H8N, 5H8H, 5H8Q, 5H8F, 5I2N, 5I2K, 5KCJ, 5KDT
Identifikátory
Aliasy	GRIN1, GluN1, MRD8, NMDA1, NMDAR1, NR1, NMD-R1, glutamátový ionotropní receptor podjednotky typu NMDA 1, NDHMSR, NDHMSD
Externí ID	OMIM: 138249 MGI: 95819 HomoloGene: 7187 Genové karty: GRIN1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	137,168,756 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	25,319,187 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů vápníku; • vazba na receptory; • vazba glycinu; • kalmodulinová vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita kationového kanálu; • aktivita iontového kanálu řízená extracelulárním glutamátem; • glutamátová vazba; • aktivita vápníkového kanálu; • Aktivita NMDA glutamátového receptoru; • aktivita iontového kanálu; • aktivita ionotropního glutamátového receptoru; • vazba neurotransmiteru; • Aktivita faktoru výměny ras guanyl-nukleotidů; • aktivita iontového kanálu řízená vysílačem zapojená do regulace potenciálu postsynaptické membrány; • vazba amyloid-beta; • aktivita vápníkového iontového kanálu řízená glutamátem; • aktivita signálního receptoru; • GO: 0032403 vazba makromolekulárního komplexu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • postsynaptická membrána; • membrána; • synapse; • NMDA selektivní komplex glutamátového receptoru; • neuronová projekce; • synaptický váček; • dendritická páteř; • povrch buňky; • endoplazmatické retikulum; • integrální součást membrány; • buněčná membrána; • GO: 0097483, GO: 0097481 postsynaptická hustota; • integrální součást plazmatické membrány; • excitační synapse; • buněčné spojení; • dendrit; • synaptická štěrbina; • terminální tlačítko; • membrána postsynaptické hustoty; • synaptická membrána; • glutamátergická synapse; • integrální součást membrány postsynaptické hustoty;
Biologický proces	• negativní regulace neuronového apoptotického procesu; • zrání pons; • synaptický přenos, glutamatergický; • regulace respirační plynné výměny; • reakce na amfetamin; • regulace membránového potenciálu; • regulace sestavy synapsí; • učení se; • pozitivní regulace excitačního postsynaptického potenciálu; • reakce na ethanol; • transport iontů vápníku; • kojenecké chování; • inhibice prepulzu; • mužské chování při páření; • regulace dlouhodobé neuronální synaptické plasticity; • pohybové chování dospělých; • regulace apoptotického procesu neuronů; • iontový transport; • Paměť; • regulace axonogeneze; • neuromuskulární proces; • signální dráha ionotropního glutamátového receptoru; • excitační postsynaptický potenciál; • učení nebo paměť; • chování sociálního organismu; • regulace neuronální synaptické plasticity; • asociativní učení; • překvapivá odpověď; • homeostáza iontů vápníku; • transport kationů; • buněčná homeostáza iontů vápníku; • kationová transmembránová doprava; • respirační plynná výměna; • regulace synaptické plasticity; • reakce na morfin; • metabolický proces propylenu; • podmíněná averze k chuti; • vývoj mozkové kůry; • doprava; • nocicepce; • čichové učení; • regulace buněčné komunikace; • vizuální učení; • signální dráha receptoru efrinu; • Kaskáda MAPK; • regulace morfogeneze dendritů; • iontový transmembránový transport; • dlouhodobá paměť; • pozitivní regulace apoptotického procesu; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 pozitivní regulace aktivity GTPázy; • transmembránový transport vápenatých iontů; • regulace iontového transmembránového transportu; • vývoj mozku; • pozitivní regulace transportu iontů vápníku do cytosolu; • vápníkem zprostředkovaná signalizace; • heterotetramerizace proteinů; • transmembránový dovoz vápenatých iontů do cytosolu; • excitační chemický synaptický přenos; • pozitivní regulace procesu biosyntézy reaktivních forem kyslíku; • lokalizace proteinu na postsynaptickou membránu; • buněčná odpověď na amyloid-beta; • reakce na glycin; • pozitivní regulace aktivity endopeptidázy cysteinového typu; • regulace aktivity NMDA receptoru;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	2902
	14810
	ENSG00000176884
	ENSMUSG00000026959
	Q05586
	P35438
	NM_000832; NM_001185090; NM_001185091; NM_007327; NM_021569
NM_001177656; NM_001177657; NM_008169; NM_001372558; NM_001372559;
	NM_001372560; NM_001372561; NM_001372562
	NP_000823; NP_001172019; NP_001172020; NP_015566; NP_067544
NP_001171127; NP_001171128; NP_032195; NP_001359487; NP_001359488;
	NP_001359489; NP_001359490; NP_001359491
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Podjednotka receptoru glutamátu [NMDA] zeta-1 je protein že u lidí je kódován GRIN1 gen.^[5]^[6]

Protein kódovaný tímto genem je kritickou podjednotkou N-methyl-D-aspartátové receptory, členové glutamátový receptor kanálová nadrodina, což jsou heteromerní proteinové komplexy s více podjednotkami uspořádanými tak, aby tvořily iontový kanál řízený ligandem. Tyto podjednotky hrají klíčovou roli v plasticita z synapse, o kterém se věří, že je základem paměti a učení. Gen se skládá z 21 exony a je alternativně sestříhaný, produkující varianty transkriptu lišící se na C-konci. Ačkoli je sekvence exonu 5 u člověka a potkana identická, alternativní sestřih exonu 5 u potkana ještě nebyl prokázán u člověka. Předpokládá se, že buněčně specifické faktory řídí expresi různých izoformy, případně přispívající k funkční rozmanitosti podjednotek.^[6]

Viz také

NMDA receptor

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000176884 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026959 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Monyer H, Sprengel R, Schoepfer R, Herb A, Higuchi M, Lomeli H, Burnashev N, Sakmann B, Seeburg PH (červen 1992). "Heteromerní NMDA receptory: molekulární a funkční rozlišení podtypů". Věda. 256 (5060): 1217–21. doi:10.1126 / science.256.5060.1217. PMID 1350383. S2CID 989677.
^ ^A ^b „Entrez Gene: glutamátový receptor GRIN1, ionotropní, N-methyl D-aspartát 1“.

Další čtení

Lin JW, Wyszynski M, Madhavan R a kol. (1998). „Yotiao, nový protein neuromuskulárního spojení a mozku, který interaguje se specifickými sestřihovými variantami podjednotky NMDA receptoru NR1“. J. Neurosci. 18 (6): 2017–27. doi:10.1523 / JNEUROSCI.18-06-02017.1998. PMC 6792910. PMID 9482789.
Schröder HC, Perovic S, Kavsan V, et al. (1998). "Mechanismy prionSc- a HIV-1 gp120 vyvolaly smrt neuronových buněk". Neurotoxikologie. 19 (4–5): 683–8. PMID 9745929.
Adriani W, Felici A, Sargolini F a kol. (1999). „N-methyl-D-aspartátový a dopaminový receptor se účastní modulace pohybové aktivity a paměťových procesů“. Experimentální výzkum mozku. Experimentelle Hirnforschung. Experimentační cérébrale. 123 (1–2): 52–9. doi:10,1007 / s002210050544. PMID 9835392. S2CID 8388670.
Dingledine R, Borges K, Bowie D, Traynelis SF (1999). "Iontové kanály glutamátového receptoru". Pharmacol. Rev. 51 (1): 7–61. PMID 10049997.
Král JE, Eugenin EA, Buckner CM, Berman JW (2006). „HIV tat a neurotoxicita“. Mikroby jsou infikovány. 8 (5): 1347–57. doi:10.1016 / j.micinf.2005.11.014. PMID 16697675.
Zimmer M, Fink TM, Franke Y a kol. (1995). "Klonování a struktura genu kódujícího lidský N-methyl-D-aspartátový receptor (NMDAR1)". Gen. 159 (2): 219–23. doi:10.1016/0378-1119(95)00044-7. PMID 7622053.
Karp SJ, Masu M, Eki T a kol. (1993). "Molekulární klonování a chromozomální lokalizace klíčové podjednotky lidského N-methyl-D-aspartátového receptoru". J. Biol. Chem. 268 (5): 3728–33. PMID 7679115.
Younkin DP, Tang CM, Hardy M a kol. (1993). "Indukovatelná exprese kanálů receptoru neuronového glutamátu v lidské buněčné linii NT2". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 90 (6): 2174–8. doi:10.1073 / pnas.90.6.2174. PMC 46048. PMID 7681588.
Planells-Cases R, Sun W, Ferrer-Montiel AV, Montal M (1993). „Molekulární klonování, funkční exprese a farmakologická charakterizace podjednotky receptoru N-methyl-D-aspartátu z lidského mozku“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 90 (11): 5057–61. doi:10.1073 / pnas.90.11.5057. PMC 46653. PMID 7685113.
Magnuson DS, Knudsen BE, Geiger JD a kol. (1995). „Virus lidské imunodeficience typu 1 aktivuje receptory excitačních aminokyselin jiných než N-methyl-D-aspartát a způsobuje neurotoxicitu“. Ann. Neurol. 37 (3): 373–80. doi:10,1002 / ana 410370314. PMID 7695237. S2CID 24405132.
Foldes RL, Rampersad V, Kamboj RK (1994). "Klonování a sekvenční analýza dalších variant sestřihu kódujících podjednotky lidského receptoru N-methyl-D-aspartátu (hNR1)". Gen. 147 (2): 303–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90089-2. PMID 7926821.
Sheng M, Cummings J, Roldan LA a kol. (1994). "Měnící se podjednotkové složení heteromerních NMDA receptorů během vývoje mozkové kůry krysy". Příroda. 368 (6467): 144–7. doi:10.1038 / 368144a0. PMID 8139656. S2CID 4332025.
Tingley WG, Roche KW, Thompson AK, Huganir RL (1993). "Regulace fosforylace NMDA receptoru alternativním sestřihem C-terminální domény". Příroda. 364 (6432): 70–3. doi:10.1038 / 364070a0. PMID 8316301. S2CID 4322831.
Foldes RL, Rampersad V, Kamboj RK (1993). „Klonování a sekvenční analýza cDNA kódujících podjednotky receptoru lidského hipokampu N-methyl-D-aspartátu: důkaz alternativního sestřihu RNA“. Gen. 131 (2): 293–8. doi:10.1016 / 0378-1119 (93) 90309-Q. PMID 8406025.
Collins C, Duff C, Duncan AM a kol. (1993). "Mapování lidské podjednotky NMDA receptoru (NMDAR1) a navrhované podjednotky vázající glutamátový receptor NMDA (NMDARA1) na chromozomy 9q34.3, respektive chromozom 8". Genomika. 17 (1): 237–9. doi:10.1006 / geno.1993.1311. PMID 8406459.
Lannuzel A, Lledo PM, Lamghitnia HO a kol. (1996). „Obalové proteiny HIV-1 gp120 a gp160 potencují zvýšení [Ca2 +] i indukované NMDA, alteraci [Ca2 +] i homeostázy a indukci neurotoxicity v lidských embryonálních neuronech“. Eur. J. Neurosci. 7 (11): 2285–93. doi:10.1111 / j.1460-9568.1995.tb00649.x. PMID 8563977. S2CID 27201873.
Corasaniti MT, Melino G, Navarra M a kol. (1996). „Smrti kultivovaných buněk lidského neuroblastomu vyvolané HIV-1 gp120 zabraňují antagonisté NMDA receptorů a inhibitory oxidu dusnatého a cyklooxygenázy.“ Neurodegenerace: Časopis pro neurodegenerativní poruchy, neuroprotekci a neuroregeneraci. 4 (3): 315–21. doi:10.1016/1055-8330(95)90021-7. PMID 8581564.
Ehlers MD, Zhang S, Bernhadt JP, Huganir RL (1996). "Inaktivace NMDA receptorů přímou interakcí kalmodulinu s podjednotkou NR1". Buňka. 84 (5): 745–55. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81052-1. PMID 8625412. S2CID 1376853.
Pittaluga A, Pattarini R, Severi P, Raiteri M (1996). „Lidské mozkové receptory N-methyl-D-aspartátu regulující uvolňování noradrenalinu jsou pozitivně modulovány HIV-1 obalovým proteinem gp120“. AIDS. 10 (5): 463–8. doi:10.1097/00002030-199605000-00003. PMID 8724036. S2CID 1669986.

Tento transmembránový receptor související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000176884 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026959 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1350383-5] Monyer H, Sprengel R, Schoepfer R, Herb A, Higuchi M, Lomeli H, Burnashev N, Sakmann B, Seeburg PH (červen 1992). "Heteromerní NMDA receptory: molekulární a funkční rozlišení podtypů". Věda. 256 (5060): 1217–21. doi:10.1126 / science.256.5060.1217. PMID 1350383. S2CID 989677.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: glutamátový receptor GRIN1, ionotropní, N-methyl D-aspartát 1“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]